Transkription genauer (VL 6) Flashcards
Schritte der Genexpression
Grundsätzlich:
Dna im Zellkern ->
wird transkribiert, dadurch in Rna überführt vom template Dna ->
wird prozessiert
reife DNA wird translatiert, wenn sie etwas kodiert
Protein wird normalerweise noch prozessiert (zB Phosphoryliert)
Protein wird in der Zelle an den richtigen Ort transportiert
Aufbau der RNA Polymerase
Kernenzym aus 2 alpha und 2 beta UE
+sigma Faktor= Holoenzym
alpha sorgt für Kernaffinität für die DNA
beta &beta`haben katalytische Eigenschaften&polymerisieren
sigma: erkennt Promoter
Regulation der Genexpression
über Sigmafaktoren
untersch. Sigmafaktoren haben unter. Sequenzpräferenzen -> schalten andere Gene für Transkription an
werden zu untersch. Bedingungen exprimiert, ZB bei Hitzeschock
RNA
Polymerase
Vergleich zwischen Pro-&Eukaryoten
+ Grund der Unterschiede
Eukaryoten:
viel mehr Untereinheiten
(3 Rna Polymerasen mit untersch. Funktionen)
wieso muss die RNA Polymerase der Eukaryoten so viel mehr Untereinheiten haben?
-> es gibt viele untersch. Promotoren (Tata, kein Tata, etc), die alle abgelesen werden wollen
Transkriptionsinitiation
in Prokaryoten
Bindung der RNA Polymerase
Aufschmelzen der DNA
Abortive Initiation
Entlassen der Sigma Untereinheit
Elongation.
2
Initiation in
Eukaryoten
Transkriptionsfaktor gleitet unspezifisch an der DNA entlang bis es eine passende Bindungsstelle findet, verändert seine Konformation und interagiert mit den Nukleotiden.
Dann kann der Rest der Polymerase an ihn binden
mit Schlüsselprotein TFIIH:
Öffnet unter ATP Verbrauch die dsDNA & Phosphoryliert CTD (C terminal domain) von Pol II
Was machen Enhancer und wie?
Enhancer initiieren aus der Ferne; sind die binding site für Aktivierungsproteine
können sehr weit weg in der Sequenz sein, aber durch die Flexibilität der DNA können sie in Nachbarschaft der DNA geraten,
erst die Interaktion schickt die Polymerase los bzw hemmt sie
-funktionieren meist mit Koregulatoren
Elongation
Wenn sich die RNA Polymerase entlang der DNA bewegt, entspiralisiert sie die Windungen der Doppelhelix und exponiert etwa 10 20 Basen auf einmal, die sich mit RNA Nukleotiden paaren können
-> Entstehung von mRNA
Topoisomerasen entspannen die Torsionsspannungen
Transkriptionstermination in Prokaryoten
Termination ohne Terminationsfaktor; Sekundärstruktur beendet Transkription:
Hairpin Loop bildet sich selbst, da RNA gern mit sich selbst faltet, loop “piekst” Pol und diese fällt runter von der DNA, quasi in der RNA kodiertes Ende
Termination mit Terminationsfaktor Rho
Termination in Eukaryoten
-Spez. Faktoren binden naszierende RNA
Signalsequenzen ( Poly A site)
-RNA wird hier geschnitten
-PolyA Schwanz wird an das 3‘ Ende der fertigen RNA
gehängt
-Eine 5‘ 3‘ Exonuklease degradiert die RNA bis die Polymerase erreicht ist, die dann vom template dissoziiert
Verknüpfung von Transkription und RNA Reifung in
Eukaryoten über die CTD der RNA Pol II
Der CTD belädt die RNA mit RNA Prozessierunsfaktoren und die DNA mit Chromatinmodulatoren
(hier kann noch mehr dazu)
