Transkription Flashcards
Formål med transkription?
Formålet med transkriptionen er altså at få lavet noget RNA ud fra vores DNA.
Når et mRNA-molekyle laves ud fra en DNA streng
SKAL det bygges i hvilken retning?
Det læses fra 3-5, men syntiseres fra 5-3
Hvad er den kodende streng?
Den kodende streng er den DNA-streng, hvis sekvens bruges til at beskrive genet.
Hvordan adskiller mRNA-sekvensen sig fra den kodende streng?
mRNA har samme basesekvens som den kodende streng, men med uracil (U) i stedet for thymin (T).
Hvor mange basepar består det menneskelige genom af, og hvordan er de fordelt?
Det menneskelige genom består af 3 milliarder basepar fordelt på 23 kromosompar.
exons?
De protein-kodende sekvenser(5% af gener)
introns?
kke-koende sekvenser kaldes
introns.
Hvilket enzym katalyserer dannelsen af pre-mRNA?
RNA-polymerase katalyserer dannelsen af pre-mRNA.
Hvordan aflæser RNA-polymerase DNA’et under transkriptionen?
RNA-polymerase aflæser template-strengen fra 3-5 og syntetiserer en komplementær pre-mRNA-streng i 5’ til 3’ retningen.
Hvad kaldes sekvensen af basepar, der findes opstrøms for et gen?
Genets promotor-region
Hvad er de tre hovedfunktioner af promotoren i transkriptionen?
Bestemme hvor transkriptionen starter.
Bestemme retningen af transkriptionen.
Regulere mængden af transkription.
Hvad er en core-promotor?
En region i promotoren, hvor transkriptionsfaktorer (TF’er) kan binde og danne en platform for RNA-polymerase.
Hvad er basale transkriptionsfaktorer?
Proteiner, der binder til core-promotoren og er nødvendige for at transkriptionen kan finde sted.
Hvad er TATA-boksen, og hvorfor er den vigtig?
En sekvens på 5-8 basepar rig på T’er og A’er, hvor TATA-binding-protein (TBP) binder og bøjer DNA-helixen. Dette skaber en platform for RNA-polymerase-komplekset.
Hvilken funktion har de basale transkriptionsfaktorer, der binder til TATA-boksen?
Helicase-aktivitet (splitter DNA-strenge).
Proof-reading.
Stabilisering af transkriptionskomplekset.
Assistering i rekruttering af RNA-polymerase.
Hvad sker der, når RNA-polymerasen binder til promotoren?
De basale transkriptionsfaktorer udviser helicase-aktivitet, hvilket adskiller de to DNA-strenge og gør dem klar til transkription.
Hvad syntetiserer RNA-polymerasen efter binding til promotoren?
RNA-polymerasen syntetiserer en pre-mRNA-streng de novo, som er komplementær til template-strengen.
Hvordan interagerer DNA og pre-mRNA under transkriptionen?
DNA og pre-mRNA danner kun kortvarigt en DNA-RNA-hybrid, før RNA’et frigives.
Hvilken region hjælper transkriptionen med at stoppe?
Terminatoren (eller termineringssignalet), som findes nedstrøms for den kodende region, hjælper transkriptionen med at stoppe.
Hvad sker der, når RNA-polymerasen når termineringssignalet?
Transkriptionen stopper, og pre-mRNA frigøres fra DNA-strengen.
Hvor mange typer RNA-polymeraser findes der, og hvad syntetiserer de?
Der findes tre RNA-polymeraser:
RNA-polymerase I → rRNA
RNA-polymerase II → mRNA, miRNA
RNA-polymerase III → tRNA
Hvad er pre-mRNA?
pre-mRNA er en umoden form for mRNA, som endnu ikke er klar til at blive eksporteret ud af cellekernen. Det skal gennemgå flere modifikationer, før det bliver til modent mRNA og kan deltage i translationen.
Hvad er RNA-splicing?
RNA-splicing er en proces, hvor ikke-protein-kodende introns fjernes fra pre-mRNA, så kun de protein-kodende exons bevares.
Hvilket kompleks katalyserer RNA-splicing?
Spliceosomet
Hvilken basesekvens adskiller exons og introns?
Basesekvensen “AGGU” markerer grænsen mellem exons og introns og genkendes af spliceosomet.
Hvad sker der med pre-mRNA-strengen under RNA-splicing for at sikre korrekt sammensætning?
pre-mRNA danner en løkke, så de frie ender, der opstår, når spliceosomet klipper introns ud, hurtigt kan sættes sammen igen uden at blive nedbrudt.
Hvad er alternativ splicing?
Alternativ splicing er en proces, hvor forskellige kombinationer af exons sammensættes, hvilket gør det muligt at producere flere forskellige proteiner fra ét enkelt gen.
Hvad er de tre posttranskriptionelle modifikationer (PTM’s), der sker?
RNA-splicing – Fjernelse af introns og sammensætning af exons.
5’-cap – methyleret guanosin sættes på 5’ enden af mRNA’et, For at beskytte mRNA’et fra at blive nedbrudt
Poly(A)-hale – En række af adenosin-nukleotider i 3’-enden, For at beskytte mRNA’et fra at blive nedbrudt
Beskriv selve transkriptionen:
RNA-polymerasen rekrutteres til promotorregionen af basale transkriptionsfaktorer, som er proteiner, der kan binde til specifikke DNA-sekvenser i promotoren – såkaldte bokse. Promotoren ligger opstrøms for genet. Efter binding af RNA-polymerasen skilles DNA-strengene ad, og syntesen af pre-mRNA sker de novo.
pre-mRNA-strengen syntetiseres i 5’ til 3’ retningen, og DNA-templaten (ikke-kodende streng) læses i 3’ til 5’ retningen. Transkriptionen stopper, når RNA-polymerasen har passeret et Poly(A)-signal og efterfølgende rammer et termineringssignal.
Beskriv Posttranskriptionelle modifikationer:
Det syntetiserede pre-mRNA indeholder både exons og introns. Introns fjernes vha. splicing. Før pre-mRNA’et kan eksporteres ud af cellekernen til ribosomerne i cytosolen, får det en 5’ cap og en poly(A)-hale i 3’ enden.
Modifikationerne vil bl.a. beskytte mRNA’et og hjælpe det med at finde vej til ribosomerne.
slet
selt
