DNA Flashcards
Hvor findes DNA?
Hos eukaryote celler findes cirka 99 % af DNA’et i cellekernen, kaldet nukleært DNA. De resterende 1 % findes i mitokondrierne som mitokondrie-DNA (mtDNA).
Hvad er DNA’s funktion?
Hvad består DNA af?
Enheder der kaldes nukleotider, der består af en base, et sukker og en fosfatgruppe
Hvordan nummeres carbonatomerne?
Forskel på nukleosid og nukleotid?
Tegn en fosfodiesterbinding
Hvordan kan retningen på DNA-strengen afgøres?
Hvad er fosfat-backbone og hvorfor er den vigtig
”rygrad” af ribose og fosfat
Hvad er vigtigt at bemærke ved DNA’en struktur
Klassificer Adenin
Purin, to aromatiske ringe
Klassificer guanin
Purin, to aromatiske ringe
Klassificer cytosin
Pyramide, men én aromatisk ring: pYrimidinerne med Y er også baserne med Y
(cYtosin, thYmin)
Klassificer cytosin
Pyramide, men én aromatisk ring: pYrimidinerne med Y er også baserne med Y
(cYtosin, thYmin)
Hvordan holdes DNA-dobbelthelix’en sammen?
- Interaktioner mellem baser på
MODSATTE strene. Hydrogenbindinger mellem baserne ”limer” strengene sammen (baseparringsregel). Watson-Crick-Baseparring - Interaktioner mellem baser på SAMME streng. base-stacking holder ”nabo”-baserne på samme streng sammen (”base-stacking”)
Forklar om Watson-Crick-Baseparring
To baser på hver sin streng ”parrer” ved at danne hydrogenbindinger mellem hinanden. Adenin parrer altid med thymin med 2 hydrogenbindinger. Cytosin parrer altid med guanin med 3 hydrogenbindinger
Forklar om base-stacking
Baserne på samme DNA-streng danner Van der Waalske interaktioner med ”ovenliggende” og ”nedenstående” base.
DNA-pakning niveau 1
DNA-dobbelthelixen vikles rundt om kerne-histoner ca. 1,7 gange. Kernehistonerne er 4 typer histon-proteiner.De nye strukturer kaldes ”nucleosomer” og ligner perler på snor.
DNA-pakning niveau 2
- Niveau: 30 nm kromatin-fiber (interfase ”kromosom”)
Histon H1 hjælper med at pakke nucleosomerne i 30 nm kromatin-fibre. Strukturerne kaldes ”solenoider”
DNA-pakning niveau 3
- Niveau: 300 nm kromatin-slynge
Solenoiderne pakkes i en hårnåle-struktur af
nucleære matrix proteiner (ikke histon- proteiner). Strukturen kaldes en kromatinslynge.
DNA-pakning niveau 4
- Niveau: 700 nm kromsom-arm (kun ved metafase kromosom)
Kondensiner folder kromatinfibrene og kondenserer DNA’et i en sådan grad, at det er synligt i et mikroskop
S/F - Sukker-phosphat backbone’en er postivtladet
Falsk –> Er negativt ladet, hvilket bevirker at DNA bliver negativt ladet
S/F - RNA er som regel dobbletstrenget
S/F - RNA er som regel dobbletstrenget
Falsk –> Enkelt strenget
S/F - RNA er det genitiske materiale for eukaryote celler
Falsk –> DNA er det genitiske materiale for eukaryote celler
S/F - I eukaryote celler er tRNA aldrig posttranskriptionelt modificeret
Falsk –> I eukaryote celler er tRNA OFTE posttranskriptionelt modificeret $
S/F - Histonmolekylerne H1, H2A, H2B og H3 udgør et nukleosom (+DNA)
FALSK –> H1 er ikke med til at udgøre et nukleosom!
S/F - En purin kan godt danne basepar med en anden purin i DNA
FALSK –> Puriner vil danne basepar med pyrimidiner og omvendt
S/F - De to DNA-strenge sidder sammen med en amidbinding
FALSK –> hydrogenbindinger
S/F - De to DNA-strenge er anti-parallelle
Sandt –> 5’ på den ene streng er 3’ på den anden
Når to alleller kaldes for homozygote betyder det:
At det er de 100 % ens ABCD=ABCD
Når to alleller kaldes for heterozygote betyder det:
Der er små forskelle mellem dem ABcD=ABCD
Nummerere carbon-atomerne på dexoyribose:
I hvilken cellecyklus-fase kan kromatinet findes i den kondenserede form (kromosomer)?
S-fasen
I DNA har man sukkerenheden deoxyribose og i RNA har man
Ribose
Hvorfor er der altid den samme afstand mellem de to DNA-strenge?
Fordi puriner og pyrimidiner altid danner basepar!
Hvordan sidder sukker-phosphat backbone’en sammen?
Sidder sammen med en phosphordiester binding
(binder nukleotiderne sammen)
Hvor mange hydrogen bindinger laver baseparringen G+C?
3
Hvor mange hydrogen bindinger laver baseparringen A+T?
2
Hvor mange histonmolekyler er der i et nukleosom?
8
Hvor mange gange er DNA’et viklet rundt om histonmolekylerne?
1,7 gange (2 gange jf. holdtimen)
Hvor mange aromatiske ringe består pyrimidiner af:
1
Hvor mange aromatiske ringe består puriner af?
2
Hvilket molekyle er med til at styre yderligere pakning af kromatinet?
H1
Hvilken base kan findes i RNA, der er forskellig fra dem i DNA?
Uracil (U) i stedet for Thymin (T)
Hvilke histonmolekyler består et nukleosom af:
- H2A
- H2B
- H3
- H4
Hvilke baser hører under pyrimidiner?
Cytosin (C)
Thymin (T)
Hvilke baser hører under puriner?
Adenin (A)
Guanin (G)
$
Hvad udgøres RNA’s backbone af?
Sukker og fosfat
Hvad skal forstås ved Watson-Crick basepar?
Adenin + Thymin
Guanin + Cytosin
Bundet sammen af hydrogenbindinger
Hvad siger man at kromatin ligner?
Perler på en snor
Hvad kaldes den struktur, der dannes når “perler på en snor”-strukturen vikles rundt om flere histoner?
Solenoider
zlet
Angiv de tre dominerende versioner af RNA:
mRNA
rRNA
tRNA
Angiv tRNA’s funktion:
Oversætter genitisk information (DNA) til proteiner
Bærer aminosyrer til ribosomet hvor de inkorporeres i den voksende polypeptidkæde
Definere alleller:
2 versioner af samme gen
Definere et nukleosid:
En enkel bestanddel af DNA der består af en base og en sukkerenhed
Definere et nukleosom:
DNA der er viklet ca. 2 gange rundt histonmolekyler
Definere et nukleotid:
En enkel bestanddel af DNA der består af en base, en sukkerenhed og en fosfatgruppe