Regulering og ekspression Flashcards
Hvad går Regulering af genekspressionen i eukaryot DNA ud på?
DNA-niveau-regulering går ud på at gøre DNA’et mere eller mindre tilgængeligt for transkription. Begge ting sker ved epigenetisk regulering.
Når DNA-sekvenser skal inaktiveres:
- Methylering af C eller A i DNA’et
- Methylering af histoner (permanent slukning)
- Deacetylering af histonhaler
Begge mekanismer vil kondensere DNA’et og få det til at blive transkriptorisk inaktivt heterokromatin
Når DNA-sekvenser skal aktiveres sker det ved remodellering:
- Acetylering af histonhale
- Aktivering af ATP-drevet kompleks
Begge mekanismer ‘unwinde’ DNA’et og få det til at blive transkriptorisk aktivt eukromatin
Hvad er histonhaler?
Histonhaler er små ”haler” af protein, som stikker ud fra nukleosomerne
Hvilken ladning har histonhaler?
De har en positiv ladning
Spørgsmål: Hvilken ladning har DNA, og hvordan interagerer det med histonhaler?
Svar: DNA har en negativ ladning, og tiltrækkes derfor af de positivt ladede histonhaler – hvilket gør, at DNA’et pakkes tæt sammen.
Hvad sker der, når histonhaler acetyleres?
Den positive ladning neutraliseres, DNA’et pakkes løsere → eukromatin (aktivt DNA).
Hvad sørger for Acetylering af histonhale?
histon-acetyl-transferase (HAT)
Hvad sørger for Deacetylering af histonhaler?
HDAC (histon-deacetylase)
Spørgsmål: Hvad sker der, når histonhaler deacetyleres af HDAC (histon-deacetylase)?
Svar: Den positive ladning gendannes, DNA’et pakkes tæt → heterokromatin (inaktivt DNA).
Hvad er med til at regulere DNA transkriptionen?
Der er specifikke TF tidligere – det er
aktivatorer og repressorer,
Hvad gør de?
de binder til ”enhancer”
eller ”silencer”-regioner opstrøms for promotoren.
Hvad gør positiv kontrol-inducer?
aktiverer aktivatorer til at binde til enhancer – øger transkriptionen.
Hvad gør negativ kontrol-inducer?
inhiberer repressors binding til silencer – øger transkriptionen
Hvad gør en Inhibitor?
inhiberer aktivatorer til at binde til enhancer – sænker transkriptionen.
Hvad gør co-represser?
aktiverer repressor til til at binde til silencer – sænker transkriptionen
Hvordan kan posttranskriptionelle modifikationer (RNA-
PTM’s) reguleres
- Stopcodon kan introduceres ved udskiftning af base © Emil Holm
- Alternativ splicing (som vi gennemgik tidligere)
- …og så skal I vide, at Polyadenyleringen og 5’ capping
også kan reguleres
Hvordan regulereres eksporten ud af cellekernen
Eksport af mRNA ud af cellekernen sker gennem nuclear-porerne.
denne proces kan også reguleres
Regulering af mRNA i cytosolen
Regulering af mRNA i cytosolen kaldes RNA-interferens
Hvordan kan cellen påvirke ”levetiden af mRNA’et”?
Det kan ske igennem:
-Inaktivering af mRNA’et
-Nedbrydning af mRNA’et.
Hvordan virker miRNA?
Nogle introns koder for mikro-RNA (miRNA) som kan inkoopereres i et kompleks, RISC.
miRNA’et i RISC-komplekset er komplementært til det cytosolære mRNA.
RISC-komplekset kan vandre rundt i cytosolen og forsøge at baseparre til frit mRNA. Det er her reguleringen
kommer i spil:
-100 % match = mRNA’et nedbrudt
- partiel match = mRNA’et blive inaktiveret
