replikation og repair

Question 1

Hvad er formål med replikation?

Answer 1

producere to identiske kopier af en celles genom.

Question 2

Hvor starter replikation-processen?

Answer 2

replikations-origin

Question 3

Hvilket enzym bruges til dna-replikation?

Answer 3

DNA-polymerase

Question 4

Hvilket enzym bruges til at adskille strengene?

Answer 4

Helicase

Question 5

Hvad dannes der når helicase deler de to strenge?

Answer 5

en replikationsgaffel

Question 6

Hvilken retning fra replikations-origin sker replikatoin fra?

Answer 6

bidirektionel, dvs. den foregår i begge retninger ud fra replikationsorigin.

Question 7

Hvor mange replikationsorigin i dna?

Answer 7

flere

Question 8

Hvilken retning syntesers nyt dna?

Answer 8

5’-3’ retningen

Question 9

Hvad har dna-polymerasen brug for for at kunne synitsere?

Answer 9

En fri OH-gruppe at syntisere udefra:

Question 10

hvordan får cellen skabt en fri OH-gruppe i 3’-enden, som polymerasen kan syntetisere fra?

Answer 10

Den låner en RNA-polymerase

Question 11

Hvad kaldes RNA-polymerase

Answer 11

primase

Question 12

hvad gør en primase

Answer 12

laver et lille stykke
komplementært RNA

Question 13

Hvad kaldes et lille stykke
komplementært RNA

Answer 13

primer

Question 14

Hvad hjælper primasen med at syntetisere
primeren.

Answer 14

DNA-polymerase (alpha)

Question 15

Så hvad sker der efter replikationsgaflen er dannet?

Answer 15

Dannelse af en fri OH-gruppe i 3’-enden vha. primase
og primer

Question 16

Hvad starter syntiseringen af en komplementær DNA-streng?

Answer 16

DNA-polymerase (epsilon)

Question 17

Hvad er diskontinuerlig syntetisering?

Answer 17

DNA-strenge er antiparallelle. På den anden streng bliver der altså ikke åbnet op i den retning, som DNA-polymerasen gerne
vil arbejde i. DNA-polymerase (delta) syntetiserer ”bagud” ved at løbende lave mindre brudstykker, der til sidst kan limes sammen.

Question 18

Hvad kaldes de mindre brudstykker?

Answer 18

Okazaki-fragmenter

Question 19

Hvad kaldes den ‘nemme’ og besværlige streng?

Answer 19

Leading og lagging strand

Question 20

Hvad fjernes primeren af?

Answer 20

RNAse-H

Question 21

Hvad udfyldes hullerne af?

Answer 21

hullerne udflydes af DNA-polymerase (delta)

Question 22

Hvordan limes de mindre brudstykker sammen?

Answer 22

Af DNA-ligase

Question 23

Hvad gør DNA-ligasen

Answer 23

katalyserer dannelsen af en fosfodiesterbinding mellem ozakifragmenterne

Question 24

Hvad gør DNA-polymerase (alpha)

Answer 24

Hjælper primasen med at lave primeren

Question 25

DNA-polymerase (delta)

Answer 25

Står for resten af DNA- syntesen på lagging strand

Question 26

DNA-polymerase (epsilon)

Answer 26

Står for hele DNA- syntesen på leading strand

Question 27

Single Strand Binding Proteins (SSBP) ?

Answer 27

er små proteiner, der binder til DNA-strengene efter helicasen har åbnet den. Det sørger for, at DNA’et ikke samler sig igen eller bliver nedbrudt.

Question 28

Topoisomerasen?

Answer 28

indes lidt nedstrøms for replikationsgaflen. Topoisomerasen vil klippe backbone op og frigøre det stress, DNA-dobbelthelix’en udsættes for

Question 29

Det er DNA-polymerase delta og epsilon replikerer størstedelen af DNA’et. Processen er ikke fejlfri, og der opstår derfor fejl. Hvordan håndtere cellen disse fejl?

Answer 29

DNA-polymerase δ og ε har exonuclease-aktivitet og udfører proofreading.

Question 30

Proofreading?

Answer 30

DNA-polymeraser har 3’ til 5’ proofreading-aktivitet, hvilket betyder, at de kan ”læse bagud” og tjekke, om de nucleotider, der lige er blevet påsat den voksende streng, er korrekte.

Question 31

Exonuclease-aktivitet

Answer 31

Hvis nucleotiderne ikke er påsat korrekt kan polymerasen skære de seneste baser fra og sætte nye nucleotider på igen korrekt.

Question 32

Forskel på Exonuclease-aktivitet og Endonuclease-aktivitet

Answer 32

Exonuclease-aktivitet betyder, at nucleotider fjernes fra enden af en DNA-streng. Endonuclease-aktivitet betyder, at nucleotider fjernes midt i en DNA-streng.

Question 33

Men hvad så, når polymerasens proofreading ikke opdager mismatch?

Answer 33

Så laver cellen mismatch repair: fjerner den forkerte base på den nysyntetiserede streng, og erstatter det med den rigtige base

Question 34

Hvad er DNA-skade?

Answer 34

DNA-skade er basen direkte beskadiget, og ikke bare sat på det forkerte sted

Question 35

Hvordan er den almindelige repair mekaniske?

Answer 35

1. Cellen opdager skade i DNA’et 2. Endo- og exonuclease fjerner DNA rundt om skaden ved hydrolyse af fosfodiesterbindingerne 3. Repair DNA-polymerase og DNA-ligase udfylder og limer hullerne sammen

Question 36

Telomerasen. Hvad og formål?

Answer 36

Et enzym, der forlænger enderne af kromosomer (telomerer) ved at tilføje gentagne DNA-sekvenser. Forhindrer, at kromosomer bliver kortere ved hver celledelig

Question 37

I hvilke celler er Telomerasen aktiv og inaktiv?

Answer 37

inaktivt i de fleste somatiske celler aktiv i kønsceller

Question 38

Answer 38

Question 39

Answer 39

Question 40

Answer 40