replikation og repair Flashcards
Hvad er formål med replikation?
producere to identiske kopier af en celles genom.
Hvor starter replikation-processen?
replikations-origin
Hvilket enzym bruges til dna-replikation?
DNA-polymerase
Hvilket enzym bruges til at adskille strengene?
Helicase
Hvad dannes der når helicase deler de to strenge?
en replikationsgaffel
Hvilken retning fra replikations-origin sker replikatoin fra?
bidirektionel, dvs. den foregår i begge retninger ud fra replikationsorigin.
Hvor mange replikationsorigin i dna?
flere
Hvilken retning syntesers nyt dna?
5’-3’ retningen
Hvad har dna-polymerasen brug for for at kunne synitsere?
En fri OH-gruppe at syntisere udefra:
hvordan får cellen skabt en fri OH-gruppe i 3’-enden, som polymerasen kan syntetisere fra?
Den låner en RNA-polymerase
Hvad kaldes RNA-polymerase
primase
hvad gør en primase
laver et lille stykke
komplementært RNA
Hvad kaldes et lille stykke
komplementært RNA
primer
Hvad hjælper primasen med at syntetisere
primeren.
DNA-polymerase (alpha)
Så hvad sker der efter replikationsgaflen er dannet?
Dannelse af en fri OH-gruppe i 3’-enden vha. primase
og primer
Hvad starter syntiseringen af en komplementær DNA-streng?
DNA-polymerase (epsilon)
Hvad er diskontinuerlig syntetisering?
DNA-strenge er antiparallelle. På den anden streng bliver der altså ikke åbnet op i den retning, som DNA-polymerasen gerne
vil arbejde i. DNA-polymerase (delta) syntetiserer ”bagud” ved at løbende lave mindre brudstykker, der til sidst kan limes sammen.
Hvad kaldes de mindre brudstykker?
Okazaki-fragmenter
Hvad kaldes den ‘nemme’ og besværlige streng?
Leading og lagging strand
Hvad fjernes primeren af?
RNAse-H
Hvad udfyldes hullerne af?
hullerne udflydes af DNA-polymerase (delta)
Hvordan limes de mindre brudstykker sammen?
Af DNA-ligase
Hvad gør DNA-ligasen
katalyserer dannelsen af en fosfodiesterbinding mellem ozakifragmenterne
Hvad gør DNA-polymerase (alpha)
Hjælper primasen med at lave primeren
DNA-polymerase (delta)
Står for resten af DNA- syntesen på lagging strand
DNA-polymerase (epsilon)
Står for hele DNA- syntesen på leading strand
Single Strand Binding Proteins (SSBP) ?
er små proteiner, der binder til DNA-strengene efter
helicasen har åbnet den. Det sørger for, at DNA’et
ikke samler sig igen eller bliver nedbrudt.
Topoisomerasen?
indes lidt nedstrøms for
replikationsgaflen. Topoisomerasen vil klippe backbone op og frigøre det stress, DNA-dobbelthelix’en udsættes for
Det er DNA-polymerase delta og epsilon replikerer størstedelen af DNA’et. Processen er ikke fejlfri, og der opstår derfor fejl. Hvordan håndtere cellen disse fejl?
DNA-polymerase δ og ε har exonuclease-aktivitet og udfører proofreading.
Proofreading?
DNA-polymeraser har 3’ til 5’
proofreading-aktivitet, hvilket betyder, at de kan ”læse bagud” og tjekke, om de nucleotider, der lige er blevet påsat den voksende streng, er korrekte.
Exonuclease-aktivitet
Hvis nucleotiderne ikke er påsat
korrekt kan polymerasen skære de seneste baser fra og sætte nye nucleotider på igen korrekt.
Forskel på Exonuclease-aktivitet og Endonuclease-aktivitet
Exonuclease-aktivitet betyder, at nucleotider fjernes fra enden af en DNA-streng.
Endonuclease-aktivitet betyder, at nucleotider fjernes midt i en DNA-streng.
Men hvad så, når polymerasens proofreading ikke opdager mismatch?
Så laver cellen mismatch repair: fjerner den forkerte base på den nysyntetiserede streng, og erstatter det med den rigtige
base
Hvad er DNA-skade?
DNA-skade er basen direkte beskadiget, og ikke bare sat på det forkerte sted
Hvordan er den almindelige repair mekaniske?
- Cellen opdager skade i DNA’et
- Endo- og exonuclease fjerner DNA rundt om skaden ved hydrolyse af fosfodiesterbindingerne
- Repair DNA-polymerase og DNA-ligase udfylder
og limer hullerne sammen
Telomerasen. Hvad og formål?
Et enzym, der forlænger enderne af
kromosomer (telomerer) ved at tilføje gentagne DNA-sekvenser. Forhindrer, at kromosomer bliver kortere ved hver celledelig
I hvilke celler er Telomerasen aktiv og inaktiv?
inaktivt i de fleste somatiske celler
aktiv i kønsceller
