Transkripcijos valdymas Flashcards
Operonas
Genų sankaupa (reguliacinis vienetas), kurį sudaro:
- struktūriniai genai;
- promotorius;
- operatorius;
- terminatorius;
- Represoriai ir aktyvikliai
Bakterijų lac opertonas
Sudaro trijų struktūrinių genų sankaupą:
- lacZ - koduoja fermentą beta galaktozidazę;
- lacY - koduoja laktozės permiazę;
- lacA - koduoja tiogalaktozido tranacetilazę;
Laktozės operono transkripcijos valdymas
- Valdo baltymas reguliatorius, kurį koduoja lacI genas;
- lacI genas turi savo promotorinę ir terminacinę seką;
- lac operono transkripcijos valdymo pobūdis - neigiamas. Reikia laktozės, kad būtų atjungtas baltymas reguliatorius, kuris slopina transkripciją;
- alolaktozė yra lac operono induktorius
Represoriaus valdymas
Alosteriniu būdu, nes prie jo gali jungtis induktorius ir nuslopinti, ar pakeisti jo funkciją
IPTG (izopropiltiogalaktozinas)
nemokamas induktorius (patekęs į ląstelę nėra suskaidomas), indukuoja lac operoną
Katabolinis slopinimas
Reiškinys, kai genų trasnkripcija valdoma ne jų koduojamais baltymais
CRP
transkripcijos aktyvatoriaus cAMP koncentracija priklauso nuo gliukozės koncentracijos. Kuo didesnė gliukozės koncentracija, tuo cAMP - mažesnė
Gliukozė ir laktozė - konkurencija
Kai yra gliukozė ir laktozė, tada praktiškai neskaido laktozės, kai gliukozės nėra, tada daug laktozės skaidymo baltymų
Triptofanas (trpR)
triptofano receptorius. šis operonas gali koduoti penkis genus, turi trp operono korepresorių, kol baltymas nesusijungęs. Kuo daugiau triptofano, tuo mažiau transkripto
Ateniuacija
Transkripcijos terminacija, kai susidaro segtukas. Gali susidaryti transkripcijos pradžios vietoje, būdinga triptofanui
Triptofano operono represorius
Represorius prie lac operono yra prisijungęs kol nėra laktozės, prisijungus - jis disocijuoja. Triptofano operono represorius jungiasi prie operatoriaus tik tuomet, kai prie kofaktroriaus (tarpinis baltymas) prisijungia triptofanas. Tad kuo daugiau laktozės, tuo daugiau lac transkripcijos. Kuo daugiau triptofano, tuo mažiau transkripto
Transkripcijos autoreguliavimas
Kai geno transkripciją valdo jo paties produktas
Griežtasis atsakas
Kai trūksta medžiagų ir yra slopinami gyvybiškai svarbūs procesai:
- rRNR ir tRNR sintezė sumažėja;
- šio atsako metu sintetinami netipiški nt - alarmonai, kurie prisijungdami prie baltymų keičia jų aktyvumą
Veiksniai dalyvaujantys transkripcijoje ir jos valdyme
- Pagrindiniai transkripcijos veiksniai;
- Transkripcijos aktyvikliai ir represoriai
Eukariotų transkripcijos aktyvikliai
Yra modulinės struktūros baltymai, turintys kelis domenus:
- DNR prisijungiantis;
- trans aktyvinantis;
- atsakingas už dimerizaciją
Atsako elementai
- temperatūrinio šoko atsako elementas HSE;
- gliukokortikoidių elementas GRE;
- serumo atsako elementas SRE
Aktyviklių domenų skirstymas
Sąveikaujančių su DNR struktūra motyvai skirstomi į:
- cinko pirštelius;
- steroidinius receptorius;
- spiralės-posūkio-spiralės motyvus;
- spiralės-kilpos-spiralės motyvus;
- leucino užtrauktuko motyvus
Cinko pirštelių motyvai
Nustatyti TFIIA transkripcijos veiksnyje:
- turi dvi cisteino ir dvi histidino a.r. liekanas, kurios koordinuoja Zn joną
Steroidų struktūra
Panaši į Zn pirštų, tik neturi his a.r.
Spiralės-kilpos-spiralės
Amfipatinės - vienoje hidrofobinės, kitoje - hidrofilinės a.r. I
Leucino užtrauktukas
Leucino užtrauktuko motyve kas a.r. yra leucino a.r., struktūra primena y raidę
siRNR, miRNR, piRNR
siRNR ir miRNR - iš dvigrandžių transkriptų;
piRNR - viengrandžių
RNR interferencija
genų raiškos nutildymas. siRNR veikia susijungęs su baltymu ir prisijungia prie komplimentarios iRNR. Tada kai prisijungia, baltymas ją perkerpa - sudegraduoja
mikroRNR brendimo etapai
- branduolys ir citoplazma;
- stiebo-kilpos stuktūrą atpžįsta ir skelia Dorsha nukleazė (veikia su kofaktoriumi);
- nuskeltos Pre-miRNR 3’ gale lieka išsikišę 2 nt, kurias atpažįsta eksportinas 5;
- pernešimui reikia GTP surišantis Ran baltymas;
- citozolyje skelia Dicer endonukleazė;
- subrendusi miRNR jungiasi prie AGO baltymo, susidaro RISC kompleksas
