Baltymų biosintezė

Question 1

Baltymų biosintezė

Answer 1

• iniciacijos;
• elongacijos;
• terminacijos;

Baltymus sintetina ribonukleoproteininis kompleksas:
- ribosoma
- iRNR;
- Aminoacil-tRNR

Question 2

Ribosoma sudėtis

Answer 2

• didysis subvienetas;
• mažasis subvienetas;
  Ribosomų erdvinę struktūrą lemia rRNR

Question 3

Ribosomos aktyvios vietos

Answer 3

• A (aminoacilinė) vieta: joje ateinanti pakrauta tRNR prisijungia ribosomą ir skaito iRNR esantį kodoną (Aminoacitil-tRNR);
• P (peptidinė) vieta: joje yra tRNR su augančia polipeptido grandine (Peptidil-tRNR);
• E (išėjimo) vieta: joje tRNR palieka ribosomą. Polipeptido išėjimo tunelis yra daugelio antibiotikų prisijungimo vieta - jie blokuoja polipetido judėjimą

Energija gaunama idrolizuojant GTP

Question 4

Prokariotų transliacijos iniciacijos būtina

Answer 4

• iRNR;
• 30S ir 50S subvienetai (mažasis ir didysis ribosomos subvienetai);
• iniciatorinė tRNR (komplementari iRNR AUG-start kodonas);
• baltymai - iniciacijos veiksniai (IF-1, IF-2, IF-3);
• GTP

Question 5

Transliacijos iniciacija prokariotuose

Answer 5

• 30S subvieneto 16S rRNR su IF-1 ir IF-3 prisijungia prie A ir G nt turinčios iRNR srities
• IF-2 prisijungia prie įkrautos iniciatorinės formilmetionil-tRNR (fMet-tRNR);
• Ribosoma ir fMet-tRNR susideda ant mRNR

Question 6

Iniciacijos veiksniai (baltymų sintezė)

Answer 6

• IF-1 jungiasi A srityje;
• IF-1 kartu su IF-2 užtikrina iniciatorinės tRNR prisijungimą P srityje;
• IF-2 sudaro kompleksą su iniciatorine tRNR;
• IF-2 nuo ribosomos priklausoma GTPazė;
• IF-3 jungiasi E srityje ir veikia kaip tikslumo veiksnys;
• IF-3 lemia deacetilintų tRNR disociaciją

Question 7

Elongacijos ciklos etapai

Answer 7

• Aminoacil-tRNR išdėstymas ribosomos A srityje;
• peptidinio ryšio susidarymas;
• pailgėjusios peptidil-tRNR perkėlimas iš A srities į P sritį, šis procesas vadinamas perstūmimu;
• bakterijų aminoacil-tRNR jungimui ribosomos A srityje reikia veiksnio EF-Tu - monomerinė GTPazė

Question 8

Iškodavimo funkcija mažajame subvienete

Answer 8

Komplementari sąveika tarp pirmų dviejų kodono ir antikodono heterociklinių bazių sukelia konformacinius pokyčius 30S subvienete;
G530, A1492 ir A1493 nt konformacija priklauso nuo mažojo griovio;
A1492 ir A1493 sudaro vandenilinius ryšius su pirmąja ir antrąja kodono ir antikodono nt poromis (tik Votsono-Kriko poros);
G530 toleruojama nevienarržeikšmė sąveika

Question 9

Peptidinio ryšio susidarymas

Answer 9

• iš dalies dvigubas - dėl amidų rezonanso;
• dėl iš dalies dvigubo ryšio negali apsisukti aplink ašį, todėl egzistuoja konformacijos plokščioje erdvėje: cis ir trans;
• Aminorūgštis: centrinis anglies atomas Calfa, formuoja kovalentinius ryšius su NH3+ (amino grupe), COO- (karboksilo grupe), H (vandenilio atomu) ir R (šonine grupe)