Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

Molekulinė biologija > Transkripcija eukariotuose > Flashcards

Transkripcija eukariotuose Flashcards

1
Q

Branduolio polimerazės

A
  • RNR pol I: sintetina rRNR (18S rRNR, 5.8S rRNR, 28S rRNR) geno pirmtaką branduolėlyje (išskyrus 5S rRNR) ~ 75% visos RNR;
  • RNR pol II: sintetina visas (su labai retom išimtimis) iRNR nukleoplazmoje (~5-10% visos RNR); transkribuoja miRNR, kai kurias snRNR;
  • RNR pol III: sintetina tRNR, 5S rRNR, snRNR ir kitas mažas RNR nukleoplazmoje (~15% visos RNR);
  • RNR pol IV ir V: augalų ląstelių branduolyje sintetina transkriptus, dalyvauja nuo RNR priklausomame genų tildyme (RNA-directed DNA methylation, RdDM)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Ne branduolio RNAP

A
  • mitochondrijų RNR polimerazė: sintetina mitochondrijų genų koduojamus transkriptus;
  • chloroplastų RNR polimerazė: sintetina chloroplastų genų koduojamus transkriptus
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Eukariotų RNAP slopiklis

A

alfa amanitinas - slopina RNR pol II ir RNR pol III

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Promotorių atpažinimas

A

Eukariotų RNR polimerazės tiesiogiai neatpažįsta genų promotorių. Šia atpažinimo funkciją atlieka transkripcijos veiksniai

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

IGS

A

Tarpgeniniai tarpai skiriantys RNR pol I promotoriaus vienetus

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Promotorius prieš rRNR transkripcijos vienetą

A

Jį sudaro šerdinis rRNR promotorius (-45 +20), daug GC. Priekyje esantis kontrolės elementas UCE arba UPE

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Eukariotų RNAP sintezės vieta

A
  • RNR pol I sintetina rRNR branduolėlyje;
  • RNR pol II sintetina iRNR, transliuoja miRNR, kai kurias snRNR;
  • RNR pol III sintetina tRNR, 5S, rRNR, snRNR nukleoplazmoje
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

RNAP I promotoriaus iniciacijos transkripcijos veiksniai

A
  • veiksnys sąveikaujantis su promotoriaus UCE elementu (žmoguje - UBF, mielėse - UAF);
  • veiksnio sąveikaujančio su šerdiniu promotoriumi (žmoguje - SL1, mielėse - CF, abiejuose TBP(TATA binding protein) + TAF (transcrioption activation factors)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

RNAP III promotoriai

A

I - 5S rRNR;
II - tRNR;
III - U6 snRNR
I ir II tipo promotorių sekos yra genų viduje

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

RNAP III I ir II tipo promotorių elementai

A

I tipo: A, IE, C
II tipo: A ir B
III tipo promotorius neturi tipiškų elementų

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

TFIIIC

A

Veiksnys, kuris įeina į transkripcijos iniciacijos kompleksų sudėtį;
Jungiasi prie A, B ir C elementų;
Pagrindinė TFIIIC funkcija - prijungti TFIIIB

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

TFIIIB sudėtis

A
  • TBP (jungiasi prie TATA dėžutės);
  • BDP;
  • BRF1
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Genų raiška eukariotinėse ląst.

A

Dažniausiai valdoma transkripcijos iniciacijos etape

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

BH ir TL eukariotuose

A

Kaip ir prokariotuose RNR pol II aktyviajame centre yra du judrūs elementai: BH spiralė ir TL kilpa

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

RNR pol II

A

Transkripcijos veiksniai:
- tiesiogiai sąveikauja su trumpomis savitosiomis DNR sritimis promotoriuose ir stiprikliuose;
- didina transkripcijos iniciacijos dažnį;
Koveiksniai:
- tiesiogiai prie DNR nesijungia;
- per tikruosius transkripcijos veiksnius pritraukiami į transkripcijos vietą ir dalyvauja transkripcijos valdyme;
- tam tikri koveiksniai keičia chromatino struktūrą

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Transkripcijos veiksniai

A

Pagrindiniai transkripcijos veiksniai (GTF):
- jų reikia bazinei transkripcijai;
- sąveikauja su promotoriaus sritimis netoli +1;
- nustato +1;
- tiesiogiai sąveikauja su RNR pol II;
- atlieka kitas funkcijas

17
Q

Šerdinis promotorius

A

Yra mažiausias DNR sekos fragmentas (~60 bp), kurio užtenka inicijuoti konkretaus geno transkripciją

18
Q

Iniciacijos būdai eukariotuose

A

Galimi transkripcijos iniciacijos būdai nuo eukariotų genų promotorių:
- sutelkta transkripcija;
- išskaidyta transkripcija;
- mišri transkripcija

19
Q

Šerdinių promotorių atpažinimas

A

Šerdinių promotorių elementus dažniausiai atpažįsta pagrindinis transkripcijos veiksnys TFIID; išimtis - BRE elementas, kurį atpažįsta TFIIB

20
Q

Artimieji promotorių elementai

A

sritys prieš šerdinį promotorių:
- CAAT “dėžutė”;
- GC “dėžutė” (CpG salelė), GGGCGG seka, paprastai yra prieš namų ūkio genus - 60% žmogaus genų turi nemetelintus;
- oktameras išsidėstęs prieš GC “dėžutę” (Okt1 ir Okt2)

21
Q

Transkripcijos aktyvikliai

A
  • pvz.: prie GC baltymo jungiasi SP1 baltymas;
  • jis prisitraukia TFIID veiksnį, per vieną iš jo baltymų;
  • prie CAAT dėžutės jungiasi transkripcijos aktyviklis CTF
22
Q

RNAP II tolimieji reguliaciniai elementai

A

RNR pol II transkripcijos valdyme dalyvauja tolimieji reguliacijos elementai:
- stiprikliai;
- slopikliai;
- izoliatoriai;
- srities kontrolės rajonai;
- užpildo prisijungimo sritys MAR;

23
Q

Stipriklių atpažinimas

A

Stipriklių modulinės struktūros reguliacinės sritis (~10 sričių viename) atpažįsta transkripcijos veiksniai:
- pvz.: kompleksas, kuris susimontuoja kaip atsakas į interferoną ties stiprikliu - enhantsosoma

24
Q

Klasikinis stipriklio veikimo modelis

A

Stipriklis sudaro DNR kilpas ir tokiu būdu sutelkia transkripcijos komponentus ties tiksliniu promotoriumi, lokaliai padidindamas tokių komponentų koncentraciją

25
Q

Stiprikliai/slopikliai - skirtumai

A

Stiprikliai leidžia aktyvuoti RNR polimerazę leisdami ją fosforilinti, o slopikliai slopina fosforilinimą

26
Q

Izoliatoriai

A

Žymi ribą tarp heterochromatino ir euchromatino (neleidžia plisti heterochromatinui į transkripciškai aktyvias sritis)

27
Q

LCR

A

Srities kontrolės elementai organizuoja funkcinį chromatino domeną ir dažniausiai aktyvina už jo esančių genų transkripciją (b-globinai, žmogaus augimo hormonai)

28
Q

MAR yra DNR seka

A

Prie kurios jungiasi fibriliniai baltymai, kurie palaiko išvyniotą chromatiną

29
Q

PIC

A

Preiniciacijos kompleksas, jį sudaro RNR pol II ir pagrindiniai transkripcijos veiksniai

30
Q

Sąveika su baziniu transkripcijos aparatu

A

Sąveikauja transkripcijos veiksniai (aktyvikliai, koaktyvikliai, slopikliai) ir keičia transkripcijos preiniciacijos komplekso susimontavimo veiksmingumą ir transkripcijos iniciacijos dažnį;
Svarbus koaktyviklis, stabilizuojantis PIC kompleksą ties promotoriumi, yra mediatoriaus kompleksas

31
Q

TFIID

A

Sudaro TBP baltymas ir transkripcijos veiksniai - TAF’ai: TBP - universalus visuose eukariotuose, sąveikauja su TATA sritimi. Jis sulenkia DNR, dėl ko lengviau prisijungia kiti veiksniai

32
Q

TFIIB

A

C-galinis domenas sąveikauja su TBP ir su DNR, N-galinis domenas sąveikauja su RNR pol II

33
Q

TFIIF

A

tiksliai įjungia RNR pol II į PIC kompleksą, išdėsto +1 atžvilgiu

34
Q

TFIIE

A

Reikia įtraukti į PIC kompleksą TFIIH veiksnio kinazės modulį CAK

35
Q

TFIIH

A
  • 10 subvienetų;
  • šerdinis kompleksas (6 subv.);
  • kinazės kompleksas - fosforilina DNR (CAK 3 subv.);
  • jungiamasis baltymas;
    dvi helikazės: XPB ir XPD;
  • nuo ciklinų priklausoma baltymų kinazė cdk7-ciklinas H;
  • TFIIH reikia atviro transkripcijos komplekso susidarymui ir promotoriaus atlaisvinimui (fosforilina pol II CTD domeną)
36
Q

CTD

A

RNR pol II C-galinis domenas, turintis daug Ser a.r., kurios yra grįžtamo fosforilinimo taikiniai.
Dvi CTD formos:
- hiperfosforilinta, RNAPIIO;
- hipofosforilinta, RNAPIIA (mažai liekanų fosforilinta)

Molekulinė biologija (6 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions