Transcription et traduction Flashcards
La régulation de l’expression des gènes s’effectue à quel niveau?
Par la transcription de l’ADN et l’ARN et la traduction des ARN en protéines.
C’est quoi les principales différences entre l’ADN et l’ARN?
ADN: Désoxyriboses, thymine et principalement double-brin.
ARN: Riboses, uracile et principalement simple-brin.
L’ARN simple-brin est capable de quoi?
De se replier pour former pleins de structures secondaires comme les tiges-boucles et des structures tertiaires qui sont importantes pour leur fonction.
Certains ARNs ont même une activité catalytique qui s’appelle quoi?
Les ribozymes.
Connaître et expliquer les trois types d’ARNs.
ARN messagers: Véhiculent l’information contenue dans l’ADN vers le cytoplasme pour la traduction.
ARN de transferts: Amène acide aminé au ribrosome.
ARN ribosomiques: Nécessaires à la traduction quand entre dans la composition des ribosomes et coordonnent le positionnement de l’ARNm et l’ARNt.
C’est quoi les 3 types d’ARN polymérase et leurs cibles transcriptionnelles?
ARN polymérase I: Gros ARNs ribosomiaux comme 28S, 18S et 5.8S.
ARN polymérase II: ARNm.
ARN polymérase III: ARNt et petits ARNs comme 5s.
C’est quoi les principales caractéristiques de la polymérisation de la chaîne d’ARN par les polymérases?
Toujours dans le sens 5’ vers 3’. 5’ phosphate du nucléotide entrant réagit avec le 3’ OH de la chaîne d’ARN en élongation. Pas besoin d’amorces pour la synthèse. Synthétise la chaîne d’ARN complémentaire au brin matrice (non-codant).
C’est quoi les trois grandes étapes de la transcription?
Initiation:
1. Liaison au promoteur
2. Fusion de l’ADN (séparation des brins) et formation d’une bulle de transcription
3. Ajout des 2 premiers nucléotides du transcrit
Élongation:
4. Polymérisation de l’ARN à partir du brin matrice
Terminaison:
5. Rencontre de la séquence de terminaison dans l’ADN et relâchement de l’ARN
Les ARN polymérase ont besoin de quoi pour trouver leurs promoteurs?
Ont besoin de facteurs de transcription.
Qu’est ce que les eucaryotes ont de plus que les procaryotes dans la transcription?
En plus du promoteur, ils ont aussi des éléments de contrôle distaux qui sont liés par des facteurs de transcription et qui aident à stabiliser le complexe de transcription au niveau du promoteur.
Que permet les facteurs généraux de transcription?
Permettent le recrutement et le bon positionnement de l’ARN polymérase II au niveau du promoteur grâce à la reconnaissance d’éléments conservés dans l’ADN (boîte TATA). Ces facteurs permettent également d’ouvrir l’ADN grâce à des activités hélicases.
C’est quoi la structure générale des facteurs de transcription non-généraux (activateurs)?
Le domaine de liaison de l’ADN qui reconnaît des séquences spécifiques dans l’ADN est lié aux sites de liaisons dans l’ADN. Au milieu, il y a le domaine de dimérisation. Finalement, il y a la région d’activation de la transcription.
Schéma dans mon cahier.
Que permettent les domaines d’activation de la transcription de recruter?
L’ARNpol II, des facteurs généraux de transcription, des enzymes de remodelage de la chromatine et des enzymes de modification des histones.
Des enzymes de remodelage de la chromatine et des enzymes de modification des histones sont appelées quoi aussi?
Les coactivateurs.
Que possède l’ARNpol II?
Une queue C-terminale qui est une platforme d’interaction protéine-protéine.
La phosphorylation de la queue C-terminale de l’ARNpol II permet quoi?
Permet de transitionner entre l’initiation et l’élongation des ARNs.
Nommer les principales étapes de maturation des ARNs.
Ajout de la coiffe (protège contre dégradation), clivage site AATAAA, ajout de la queue poly A (protège extrémité/stabilise ARN), épissage.
L’épissage des ARNs permet quoi?
De mettre les exons ensemble et enlever les intons.
L’épissage est effectué par quoi?
Par un complexe ribonucléoprotéique: le spliceosome.
L’épissage alternatif permet quoi?
Permet de générer plusieurs protéines différentes à partir d’un même gène. Cela permet de produire plusieurs isoformes d’une protéine particulière.
Quelle est la fonction la plus importante de l’épissage?
L’épissage alternatif.
C’est quoi la structure des ribosomes eucaryotes?
Une ribonucléoprotéine composée de protéines et d’ARNr formée de deux sous-unités de 40S et 60S.
Nommer les trois cavités importantes sur le ribosome.
Site A: Aminoacyl
Site P: Peptide
Site E: Exit
C’est quoi la structure des ARNt matures?
Comporte une portion CCA-OH en 3’ sur laquelle on ajoute un acide aminé. Les ARNt ont aussi une boucle anticodon pouvant s’apparier aux codons complémentaires sur les ARNm.
C’est quoi les trois grandes étapes de la traduction?
L’initiation, l’élongation et la terminaison.
Expliquer l’étape de l’initiation de la traduction.
Le complexe 43S qui comprend la SU 40S du ribosome, l’ARNt initiateur et le facteur eIF2 s’associe avec le complexe ARNm lié par d’autres facteurs d’initiation de la traduction. Ensuite, on trouve l’AUG initial. Puis, on hydrolyse le GTP par eIF2 qui permet de recruter la SU 60S et la traduction peut débuter.
Expliquer les étapes de l’élongation lors de la traduction de la chaîne peptidique.
Le nouvel aminoacyl ARNt complexé à un facteur d’élongation lié à du GTP arrive dans le site A. L’arrivée du bon aminoacyl ARNt forme une bonne interaction avec l’ARNm qui le stabilise au site A. De manière spontanée, la fonction amine de l’acide aminé au site A attaque le carboxyl de l’acide aminé au site P, cette réaction est catalysée par la peptidyl transférase. Une fois le lien peptidique formé, le ribosome pivote grâce à l’activité GTPase de eIF2 et glisse de trois nucléotides sur l’ARNm. L’ARNt sans aminoacyl se retrouve dans le site E et quitte le ribosome, le peptide-ARNt se retrouve au site P et un nouvel ARNt aminoacyl complexé au facteur d’élongation et GTP peut entrer dans le site A.
Comment se fait la terminaison de la traduction?
Les codons stop dans l’ARN sont reconnus par des facteurs de relâchement qui favorisent l’hydrolyse du lien ester dans la chaîne peptidique et l’ARNt. Ensuite, il y a relâchement de l’ARNm, de la protéine et dissociation du ribosome.
