Transcription et traduction

Question 1

La régulation de l’expression des gènes s’effectue à quel niveau?

Answer 1

Par la transcription de l’ADN et l’ARN et la traduction des ARN en protéines.

Question 2

C’est quoi les principales différences entre l’ADN et l’ARN?

Answer 2

ADN: Désoxyriboses, thymine et principalement double-brin.
ARN: Riboses, uracile et principalement simple-brin.

Question 3

L’ARN simple-brin est capable de quoi?

Answer 3

De se replier pour former pleins de structures secondaires comme les tiges-boucles et des structures tertiaires qui sont importantes pour leur fonction.

Question 4

Certains ARNs ont même une activité catalytique qui s’appelle quoi?

Answer 4

Les ribozymes.

Question 5

Connaître et expliquer les trois types d’ARNs.

Answer 5

ARN messagers: Véhiculent l’information contenue dans l’ADN vers le cytoplasme pour la traduction.
ARN de transferts: Amène acide aminé au ribrosome.
ARN ribosomiques: Nécessaires à la traduction quand entre dans la composition des ribosomes et coordonnent le positionnement de l’ARNm et l’ARNt.

Question 6

C’est quoi les 3 types d’ARN polymérase et leurs cibles transcriptionnelles?

Answer 6

ARN polymérase I: Gros ARNs ribosomiaux comme 28S, 18S et 5.8S.
ARN polymérase II: ARNm.
ARN polymérase III: ARNt et petits ARNs comme 5s.

Question 7

C’est quoi les principales caractéristiques de la polymérisation de la chaîne d’ARN par les polymérases?

Answer 7

Toujours dans le sens 5’ vers 3’. 5’ phosphate du nucléotide entrant réagit avec le 3’ OH de la chaîne d’ARN en élongation. Pas besoin d’amorces pour la synthèse. Synthétise la chaîne d’ARN complémentaire au brin matrice (non-codant).

Question 8

C’est quoi les trois grandes étapes de la transcription?

Answer 8

Initiation:
1. Liaison au promoteur
2. Fusion de l’ADN (séparation des brins) et formation d’une bulle de transcription
3. Ajout des 2 premiers nucléotides du transcrit
Élongation:
4. Polymérisation de l’ARN à partir du brin matrice
Terminaison:
5. Rencontre de la séquence de terminaison dans l’ADN et relâchement de l’ARN

Question 9

Les ARN polymérase ont besoin de quoi pour trouver leurs promoteurs?

Answer 9

Ont besoin de facteurs de transcription.

Question 10

Qu’est ce que les eucaryotes ont de plus que les procaryotes dans la transcription?

Answer 10

En plus du promoteur, ils ont aussi des éléments de contrôle distaux qui sont liés par des facteurs de transcription et qui aident à stabiliser le complexe de transcription au niveau du promoteur.

Question 11

Que permet les facteurs généraux de transcription?

Answer 11

Permettent le recrutement et le bon positionnement de l’ARN polymérase II au niveau du promoteur grâce à la reconnaissance d’éléments conservés dans l’ADN (boîte TATA). Ces facteurs permettent également d’ouvrir l’ADN grâce à des activités hélicases.

Question 12

C’est quoi la structure générale des facteurs de transcription non-généraux (activateurs)?

Answer 12

Le domaine de liaison de l’ADN qui reconnaît des séquences spécifiques dans l’ADN est lié aux sites de liaisons dans l’ADN. Au milieu, il y a le domaine de dimérisation. Finalement, il y a la région d’activation de la transcription.
Schéma dans mon cahier.

Question 13

Que permettent les domaines d’activation de la transcription de recruter?

Answer 13

L’ARNpol II, des facteurs généraux de transcription, des enzymes de remodelage de la chromatine et des enzymes de modification des histones.

Question 14

Des enzymes de remodelage de la chromatine et des enzymes de modification des histones sont appelées quoi aussi?

Answer 14

Les coactivateurs.

Question 15

Que possède l’ARNpol II?

Answer 15

Une queue C-terminale qui est une platforme d’interaction protéine-protéine.

Question 16

La phosphorylation de la queue C-terminale de l’ARNpol II permet quoi?

Answer 16

Permet de transitionner entre l’initiation et l’élongation des ARNs.

Question 17

Nommer les principales étapes de maturation des ARNs.

Answer 17

Ajout de la coiffe (protège contre dégradation), clivage site AATAAA, ajout de la queue poly A (protège extrémité/stabilise ARN), épissage.

Question 18

L’épissage des ARNs permet quoi?

Answer 18

De mettre les exons ensemble et enlever les intons.

Question 19

L’épissage est effectué par quoi?

Answer 19

Par un complexe ribonucléoprotéique: le spliceosome.

Question 20

L’épissage alternatif permet quoi?

Answer 20

Permet de générer plusieurs protéines différentes à partir d’un même gène. Cela permet de produire plusieurs isoformes d’une protéine particulière.

Question 21

Quelle est la fonction la plus importante de l’épissage?

Answer 21

L’épissage alternatif.

Question 22

C’est quoi la structure des ribosomes eucaryotes?

Answer 22

Une ribonucléoprotéine composée de protéines et d’ARNr formée de deux sous-unités de 40S et 60S.

Question 23

Nommer les trois cavités importantes sur le ribosome.

Answer 23

Site A: Aminoacyl
Site P: Peptide
Site E: Exit

Question 24

C’est quoi la structure des ARNt matures?

Answer 24

Comporte une portion CCA-OH en 3’ sur laquelle on ajoute un acide aminé. Les ARNt ont aussi une boucle anticodon pouvant s’apparier aux codons complémentaires sur les ARNm.

Question 25

C’est quoi les trois grandes étapes de la traduction?

Answer 25

L’initiation, l’élongation et la terminaison.

Question 26

Expliquer l’étape de l’initiation de la traduction.

Answer 26

Le complexe 43S qui comprend la SU 40S du ribosome, l’ARNt initiateur et le facteur eIF2 s’associe avec le complexe ARNm lié par d’autres facteurs d’initiation de la traduction. Ensuite, on trouve l’AUG initial. Puis, on hydrolyse le GTP par eIF2 qui permet de recruter la SU 60S et la traduction peut débuter.

Question 27

Expliquer les étapes de l’élongation lors de la traduction de la chaîne peptidique.

Answer 27

Le nouvel aminoacyl ARNt complexé à un facteur d’élongation lié à du GTP arrive dans le site A. L’arrivée du bon aminoacyl ARNt forme une bonne interaction avec l’ARNm qui le stabilise au site A. De manière spontanée, la fonction amine de l’acide aminé au site A attaque le carboxyl de l’acide aminé au site P, cette réaction est catalysée par la peptidyl transférase. Une fois le lien peptidique formé, le ribosome pivote grâce à l’activité GTPase de eIF2 et glisse de trois nucléotides sur l’ARNm. L’ARNt sans aminoacyl se retrouve dans le site E et quitte le ribosome, le peptide-ARNt se retrouve au site P et un nouvel ARNt aminoacyl complexé au facteur d’élongation et GTP peut entrer dans le site A.

Question 28

Comment se fait la terminaison de la traduction?

Answer 28

Les codons stop dans l’ARN sont reconnus par des facteurs de relâchement qui favorisent l’hydrolyse du lien ester dans la chaîne peptidique et l’ARNt. Ensuite, il y a relâchement de l’ARNm, de la protéine et dissociation du ribosome.