Réplication et réparation de l'ADN Flashcards
La molécule d’ADN est répliqué de quelle façon?
De façon semi-conservative.
Schématiser le résultat du mode de réplication semi-conservatif.
Réponse dans mon cahier.
Comment l’ADN est répliqué à partir d’origines de réplication?
Via la formation de bulles de réplication bidirectionnelles.
Qu’est-ce que provoque le déroulement de la double-hélice de l’ADN et durant quels moments?
Provoque un surenroulement de l’ADN devant la fourche de réplication ou la bulle de transcription pendant la réplication ou la transcription.
Que font les topoisomérases de type 1 et 2?
Peuvent couper un ou deux brins d’ADN afin de diminuer le surenroulement.
Que se passe si on ne diminue pas le surenroulement par les topoisomérases?
Sans ces enzymes, la fourche réplicative ne pourrait plus avancer car il deviendrait trop difficile de dérouler l’ADN.
La double-hélice d’ADN a une orientation 1 des deux brins et qu’elle est formée par l’appariement des 2 via des ponts hydrogènes entre les A-T qui forment 3 et C-G qui forment 4. Chacun des brins est formé par des liens 5 entre le 6 d’un désoxyribose d’un nucléotide et le 7 du désoxyribose du nucléotide suivant.
- antiparallèle
- bases azotées
- 2 ponts
- 3 ponts
- phosphodiesters
- 3’
- 5’
La synthèse de l’ADN est effectuée par quoi? Que démarre la synthèse d’ADN?
Effectuée par des ADN polymérases qui ont toutes une activité 5’-3’ polymérase. Les ADN polymérases en général nécessitent une amorce pour démarrer la synthèse d’ADN ainsi qu’un brin codant afin de déterminer quel nucléoside triphosphate sera ajouté à la chaîne en élongation.
Savoir concrètement ce que font les ADN polymérases.
Les ADN polymérases catalysent la réaction entre le 3’ OH de la chaîne en élongation et le premier groupement phosphate du nucléotide approprié pour former un nouveau lien phosphodiester qui allonge la chaîne d’ADN d’un nucléotide à la fois et forme une nouvelle paire de bases.
Pouvoir représenter l’architecture d’une fourche de réplication.
Réponse dans mon cahier.
Pourquoi un des brins d’ADN est synthétisé de façon continue et l’autre brin doit être synthétisé de façon discontinue?
Le brin continue est synthétisé dans la direction de l’ouverture de la double hélice d’ADN et par conséquent se déroule de façon continue. Le brin discontinu est synthétisé dans la direction opposé à l’ouverture de la double hélice d’ADN et par conséquent se déroule de façon discontinu.
C’est quoi les fragments d’Okazaki?
Des petits ARN synthétisés par une enzyme appelée primase servent comme amorces par l’ADN polymérase puis retirés quand l’ADN polymérase complète la synthèse d’ADN. Une ADN ligase connecte ensuite les brin d’ADN sur le brin discontinu.
Nommer deux autres protéines accessoires essentielles à la réplication.
L’ADN hélicase et les protéines de liaison à l’ADN simple-brin (SSB).
Les ADN polymérases sont équipés de quoi pour réparer des erreurs pendant la réplication?
D’une activité exonucléase 3’-5’ qui leur permet de retirer les nucléotides mésappariées.
En plus de cette activité anti-mésappariement, il y a quoi d’autre?
Il existe de nombreux mécanismes de réparation de l’ADN capable de détecter les lésions dans l’ADN et de les réparer.
C’est quoi les différentes sources intrinsèques et extrinsèques de dommages à l’ADN?
Facteurs intrinsèques: Erreurs de réplication, le métabolisme comme des produits métabolisés, des radicaux libres dérivés de l’oxygène et la chaleur.
Facteurs extrinsèques: Rayons UV, rayons ionisants (gamma, X) et produits chimiques.
Nommer les types de lésions dans l’ADN.
Mauvais appariements de bases, bases modifiées chimiquement, dimères de pyridimines ou cassures du lien phosphodiester.
C’est quoi les différents systèmes de réparation de l’ADN et le type de dommage qu’ils sont capables de réparer?
Réparation par excision de nucléotides (NER): Dimères de pyridimines, bases modifiées qui déforment l’hélice.
Réparation par excision de base (BER): Mésappariement avec U ou avec T-G, bases modifiées.
Réparation des mauvais appariements (MMR): Mésappariement après réplication.
Recombinaison homologue (HR): Bris double-brin, fourches de réplication bloquées.
Jonction non-homologue (NHEJ): Bris double-brin.
C’est quoi les différentes étapes de la réparation par excision des nucléotides? (NER)
- Reconnaissance du dommage par blocage de l’ADN polymérase sur le brin matrice dans les gènes transcrits ou par détection de la torsion dans l’hélice induite par la lésion ayant lieu dans les autres endroits du génome. Dans la voie liée à la transcription, la détection est fait pas l’ADN polymérase et dans la voie globale, la détection est fait par des protéines XPs.
- Hélicase déroule l’ADN autour du dommage.
- Clivage du brin endommagé par des endonucléases.
- Hélicase enlève le brin endommagé.
- ADN polymérase resynthétise l’information manquante en utilisant le brin intact comme matrice.
- ADN ligase recolle le brin.
C’est quoi les différentes étapes de la réparation par excision des bases? (BER)
- Reconnaissance de la base modifiée par une glycosylase spécifique
- Clivage de la base
- Endonucléase qui coupe le lien phosphodiester
- L’activité phoshodiestérase de l’ADN polymérase enlève le désoxyribosephosphate restant et polymérise le nucléotide manquant à partir du brin matrice intact
- Une ADN ligase complète la réparation
C’est quoi les différentes étapes de la réparation de mésapariement? (MMR)
- Reconnaissance de la lésion et du brin mère et fille par les hétérodimères MSH2-MSH6 (paires de bases) ou MSH2-MSH3 (boucles d’ADN)
- Recrutement de l’endonucléase MLH1-PMS2 qui fait des brins simples-brins dans l’ADN à proximité de la lésion
- Exonucléase 1 vient faire un trou
- ADN polymérase répare le trou
- ADN ligase complète la réparation
Différencier la voie de réparation par appariements des bouts (NHEJ) de la recombinaison homologue (HR).
NHEJ: Recolle les deux extrémités de brins double-brins en faisant parfois des erreurs.
HR: Répare les brins double-brins en recopiant l’information manquante à partir d’un brin-homologue. Cette façon évite l’incorporation d’erreurs lors de la réparation.
