Transcription Flashcards
Professeur: Dr Dubrac
Réplication?
ADN en ADN
Transcription?
ADN en ARN
Traduction?
ARN en protéines
Que génère la transcription?
Un polymère de ribonucléotides
Par quoi est synthétisé le polymère de ribonucléotide?
ARN polymérase
Dans quel sens l’ARN polymérase synthétise-t-il le brin d’ARN?
5’ vers 3’
Que synthétise l’ARN polymérase?
Par rapport aux brins d’ADN
Copie complémentaire du brin matrice
Copie identique du brin codant (sauf U au lieu de T)
Dans quel sens est lu le brin matrice?
3’ vers 5’
L’ARN a la séquence du brin d’ADN codant mais avec des ___________ au lieu de désoxyribonucléotides, et de __ au lieu de T
ribonucléotides
U
Combien de brin pour l’ARN?
1
Que permet le simple brin d’ARN?
Interaction entre ses bases
Structure secondaire et tertiaire
Nomme la structure secondaire de l’ARN.
Tige boucle
Nomme la structure tertiaire de l’ARN.
Pseudoknot
Qu’est-ce que le pseudoknot?
Appariement de bases entre deux régions simple-brin qui sont normalement situées dans des boucles de l’ARN
Est-ce que la structure de l’ARN est linéaire?
NON
À quoi servent les structures secondaires de l’ARN?
Protection de celui-ci (et stabilisation)
Décrit en gros la région de la transcription chez les procaryotes.
- Déroulement de l’ADN au fur et à mesure de la synthèse d’ARN par l’ARN polymérase
- Reformation de la double hélice en arrière de l’ARN polymérase
- Courte région d’hélice hybride ADN/ARN formée transitoirement
Combien de nucléotides pour la courte région d’hélice hybride ADN/ARN formée transitoirement?
9
Nom de la courte région d’hélice hybride ADN/ARN formée transitoirement?
hétéroduplex
Nomme les différentes caractéristiques des ARN polymérases.
- Synthétise l’ARN en copiant d’un brin matrice d’ADN
- Transcrit de 5’ à 3’ (brin matrice de l’ADN doit être lu de 3’ à 5’)
- Ne nécessite pas d’amorce
- Crée des liens phosphodiesters entre les nucléotides en son site actif
Est-ce que l’ARN polymérase est aussi précise que l’ADN polymérase?
Non, la transcription n’A pas à être aussi précise que la réplication, mais c’est pas grave puisque les erreurs ont une durée de vie limitée correspondant à la durée de vie du transcrit
Comment l’ARN Polymérase « sait » où
commencer la transcription et où la terminer? Séquence d’ADN pour l’initiation de la transcription?
Promoteur: site d’initiation de la transcription
Comment l’ARN Polymérase « sait » où
commencer la transcription et où la terminer? Séquence d’ADN pour la terminaison de la transcription?
Terminateur: site de terminaison de la transcription
L’ARN polymérase est relâchée de l’ADN au niveau d’un signal de
terminaison: arrêt de la transcription
Que nécessite la polymérase pour initier et terminer la transcription?
Facteurs protéiques
Signaux dans l’ADN
Quel est le facteur protéique chez les procaryotes?
Sigma
Explique la transcription chez les procaryotes.
- Sigma se lie à ARN polymérase pour former le complexe d’initiation de la transcription
- Formation du complexe d’initiation (gigma-adn polymerase)
- Transcription
- Sigma est relaché après 10 nucléotides
- ARN polymérase est relâchée de l’ADN au niveau d’un signal stop
L’ARN polymérase est recrutée au niveau du ___________ et est relâchée de l’ADN au niveau d’un signal de _____.
promoteur
stop
Un facteur est une…
protéine!
Qu’est-ce qu’une séquence consensus?
Ordre des nucléotide ou aa le plus fréquent trouvés à chaque position en comparant plusieurs séquences similaires.
Quelles sont les caractéristiques des promoteurs et des terminateurs?
Séquences concensus/canoniques
Consensus = La lettre la plus fréquente à chaque position.
Canonique = La version parfaite ou typique d’une séquence.
Que représentent les séquences consensus? et donne le concensus à retenir pour ce cours.
Représente les résultats d’alignements de séquences multiples dans lesquels des séquences apparentées sont comparées les unes aux autres
Des pourcentages des motifs de séquences similaires
sont ainsi calculés pour chaque position
Séquence Consensus à Retenir :
Région -35 : TTGACAT
Région -10 : TATAAT
il y a entre 15 et 17 paires de bases entre ces deux séquences.
Région -35 : Située 35 bases avant le début de la transcription.
Région -10 : Située 10 bases avant le début de la transcription.
Ces séquences sont les plus communes dans les promoteurs bactériens.
La séquence exacte n’est pas toujours la même, mais plus elle est proche de TTGACAT, plus l’ARN polymérase s’y fixera efficacement.
Que nécessite la polymérase pour initier et terminer la transcription?
Facteurs protéiques
Signaux dans l’ADN
À quel niveau est recruté l’ARN polymérase?
Promoteur
Qui est le facteur nécessaire à l’initiation de la transcription qui permet la sélection du promoteur du gène à transcrire chez les procaryotes?
Sigma
Est-ce qu’il existe plusieurs facteurs sigma?
Oui
À quoi se lie le facteur sigma avant de se lier au promoteur?
Pour former quoi?
Polymérase
Complexe d’initiation
Quels sont les courts motifs reconnus par les facteurs sigma bactériens sur le promoteur procaryote ?
Les boîtes -10 et -35, situées respectivement à 10 et 35 bases avant le site d’initiation de la transcription.
La position de -10 et -35 dicte quoi?
Le brin à utiliser et le sens de la transcription
Pourquoi ces motifs sont-ils appelés boîtes -10 et -35 ?
Ils sont appelés ainsi à cause de leur position par rapport au site d’initiation de la transcription (+1).
Qu’est-ce que la séquence consensus promoteur?
Séquence idéal obtenue obtenue pas analyse statistique des fréquences des bases à chaque position
Qu’est-ce qui permet d’avoir un promoteur fort?
Plus la séquence d’un promoteur est similaire à la séquence consensus
(idéale) plus grande sera l’affinité du facteur sigma et plus grande sera l’efficacité d’initiation la transcription = Promoteur plus fort
Quelle est la séquence du promoteur typique à -10 chez les procaryotes ?
séquence TATAAT (-10)
Où se situe la séquence TATAAT par rapport au site d’initiation de la transcription ?
Elle est située environ 10 paires de bases en amont du site d’initiation de la transcription.
Quel est le rôle de la séquence TATAAT chez les procaryotes ?
Elle sert de point de repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription.
l’ARN polymérase et sigma est recruté au niveau du promoteur; Comment se fait la reconnaissance moléculaire entre la polymérase/sigma et le promoteur?
Liaisons chimiques faibles!
Nomme les liaisons chimiques faibles non convalent.
1- Forces de Van der Waals
2- Ponts hydrogène
3- Liens ioniques
4- Interactions hydrophobes
Décrit les facteurs sigma des procaryotes.
Les procaryotes possèdent typiquement plusieurs facteurs sigmas, chacun ayant sa propre spécificité de séquence
Est-ce que tout les sigma interagissent avec l’ARN polymérase?
Oui
De quoi sont responsable les sigma?
reconnaissance de la séquence
promotrice sur l’ADN
Explique avec pleins de détails la transcription de l’ADN chez les procaryotes.
1.Le facteur sigma s’associe à l’ARN polymérase avant la transcription. Ce complexe ira se fixer sur le promoteur.
2. Le contact de l’ARN polymérase avec le promoteur entraîne l’ouverture locale de la double hélice d’ADN -> bulle de transcription
3. Initiation de la synthèse d’ARN à 50 ribonucléotides/seconde
4. Relâchement du facteur sigma après la synthèse d’une chaîne de ± 10 ribonucléotides
5. Élongation
6. Rencontre du signal de terminaison
7. L’ARN polymérase se détache, libérant l’ARN
8. L’ARN polymérase peut ensuite aller retrouver un facteur sigma pour enclencher une nouvelle transcription
Qu’est-ce qu’un signal de terminaison?
Il s’agit de la forme que prend l’ARN grâce aux appariements locaux (intramoléculaires).
Lorsque l’ARN se met sous cette forme, cela indique à l’ARN polymérase qu’elle doit être relâchée
Quel est le type de structure formée par le signal de terminaison dans l’ARNm ?
Tige boucle ou hairpinloop
Localisation du signal de terminaison de la transcription encodée par l’ADN? (procaryote)
A l’extrémité 3’ de l’ARN néosynthétisée se trouve le signal de
terminaison de la transcription
encodée par l’ADN
La séquence d’ARN transcrite du
signal de terminaison permet la
formation d’une tige-boucle, Que crée la séquence d’ARN tige boucle?
Contrainte au niveau du complexe de l’ARN polymérase ce qui favorise le détachement de l’ARN polymérase
Décrit la séquence tige boucle.
Riche en G-C suivi d’une série de U
cause la terminaison de la transcription chez les procaryotes
Particularités de la transcription des cellules eucaryotes?
utilisent 3 ARN polymérases
produisent Plusieurs types d’ARN
Nomme les types d’ARN produit par les cellules eucaryotes.
ARNm
ARNr
ARNt
Petits ARN
ARN polymérase de ARNm?
2
ARN polymérase de ARNr?
1
ARN polymérase de ARNt?
3