Protéine et ARN non codant Flashcards

Professeur: Dr Labbé

1
Q

Par quoi sont réalisé la plupart des fonctions dans la cellule?

A

Protéines

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Décrit pourquoi le repliment des protéine est si complexe.

A
  • Il est très sensible à l’environnement (pH, sel, T, ROS)
  • Il peut être affecté par des mutations
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Plus les protéines sont _________ et plus les erreurs de repliement sont fréquentes

Quel est le pourcentage de proteine mal repliees

A

complexes

50% et ce pourcentage augmente dans certaines maladies

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Donne un exemple de mutation qui affecte le repliement des protéines.

A

Anémie falciforme (GAG pour Glu devient GTG pour Val)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Comment sont appelés des modifications permanentes de l’ADN?

A

Mutations

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Avec l’âge, que se passe-t-il au niveau du repliement des protéines de la vision?

A

Il est affecté = cataractes

Devienne plus frequente avec l’age

20 millions aveugle a cause de sa

5% des cas de cécité et 60% en Avrique et Amerique du Sud

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Que sont les cristallines?

A

Protéines structurales solubles dans l’eau se trouvant dans la lentille et la cornée de l’oeil permettant la transparence

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Qu’est-ce que l’apha-cristalline?

A

Chaperone moléculaire qui empêche la précipitation des protéines dénaturées et d’augmenter la tolérance au stress cellulaire

Fonction importante pour transparence et prevention cataracte en maitenant proteine soluble

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Qu’est-ce qui cause les cataraques?

A

Avec l’age il y a Déclin des fonctions de l’alpha cristalline donc
Précipitation des protéines dans la lentille

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Quand débute le repliement d’une protéine?

A

Pendant sa synthèse

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Explique se que fait la protéine pendant sa synthèse.

A

1- Formation d’abord des éléments de structure secondaire de base (hélice a, feuillets b, boucles) qui se replient indépendamment
2- Formation des domaines
3- Puis ajustement de domaines et repliement final

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Qui aident les protéines nouvellement synthétisées à acquérir leur conformation finale?

A

Chaperones moléculaires, ce sont des protéines

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Que font les chaperones?

A

Elles préviennent l’agrégation en s’attachant à des parties prônes à s’agréger telles que les régions hydrophobes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Est-ce que la fixation entre la chaperone et le polypeptide consomme de l’énergie? quand les chaperonne se fixent à la protéine?

A

NON

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Est-ce que la séparation des chaperones et des protéines demande de l’énergie? quand il est temps que la cahperonne se détache de la protéine

A

OUI ATP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Si les protéines n’acquirent pas leur structure correcte, il se passe quoi? Quek est le pourcentage

A

Dégradées par l’UPS: ubiquitin-proteasome- system (50% des protéines y passent à cause de leur mauvaise conformation)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Explique la dégradation des protéines qui n’ont pas la bonne structure.

A
  1. Marqué pour dégradation par l’ajout d’une équiquette ubiquitine
  2. Dégradé par le protéasome
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Qu’est-ce que l’ubiquitine?

A

Une protéine de 76 aa ajouté sur un résidu Lysine (K) au protéines à être dégradées

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Le marquage via l’ubiquitine est fait par quoi? et donne les étapes

A

UPS système unbiquitine-protéasome

E1: ubiquitin-activating : ACTIVE l’ubiquitine

E2: ubiquitin-conjugating : TRANSFERT À E2 ,

E3: ubiquitin-ligase : E3 reconnait la protéines à être dégradée, lie la protéine à l’ubiquitine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Qu’est-ce que le protéasome? et donne les étapes de la dégradation par le protéasome

A
  • Est une machine à dégrader de protéines, qui fonctionne à l’ATP
  • Est un tube formé surtout de protéases
  • Les protéines à être dégradées sont reconnues à leur étiquette Ubiquitine.
  • Les Ub sont clivées avant de que la protéine ciblée n’entre le tube
  • la protéines ciblé est dépliée et entre dand le tube
  • Hydrolyse les protéines en petits peptides qui sont relâchés
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Est-ce que les Ub sont clivées avant que la protéine ciblée rentre dans le protéasome?

A

Oui

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Le protéasome hydrolyse les protéines en quoi?

A

Petits peptides

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Nomme les maladies du repliement des protéines.

A

Conformational Disorders
Protein Folding Diseases
Protein Misfolding diseases
Trafficking Diseases
ER Storage Diseases

Voici une version en français de ta carte :

•	Troubles conformationnels
•	Maladies du repliement des protéines
•	Maladies du mauvais repliement des protéines
•	Maladies de trafic intracellulaire
•	Maladies de stockage dans le réticulum endoplasmique
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Décrit la fibrose kystique.

A
  • Maladie autosomale récessive
  • Mutation la plus fréquente (80%)
  • DF508, délétion de 3 nucléotides qui codent pour la phénylalanine 508 du canal chlore CFTR
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Décrit la maladie de Huntington.

A
  • Maladie génétique neurodégénérative,
  • Transmission est autosomique dominante
  • Code pour une grosse protéine appelée Huntingtine
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

À quoi sert la protéine Huntingtine?

A

diverse fonction cellulaire
* Trafic véciculaire
* Sécrétion de facteurs neurotrophiques comme le BDNF

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

Que se passe-t-il avec la Huntigntine des patients atteint de la maladie?

A

La Huntigntine agrège formant des fibres amyloïdes. La perte de fonction de cette protéine et son agrégation causent la mort de neurones par apoptose

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

Qu’est-ce qui cause la maladie de Huntington?

A
  • Expansion du triplet CAG qui code pour Glu (glutamine)
  • cause Séquence Poly-glutamine dites POLY-Q dans la protéine
  • Agrégation de la Huntingtine
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

Qu’est-ce qui détermine si on est atteint ou pas de la maladie de H?

A
  • nb de triplets de CAG répété (36 à 121 =afecté) (27 à 41=prématuré) et
  • âge du début des symptômes
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

Que causent les protéines mal repliées qui ne sont pas éliminées?

A

Des maladies graves, comme l’alzheimer

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

Décrit la cause et la conséquence de l’Alzheimer.

A
  • Diminution de l’efficacité du repliement et la dégradation de protéines avec l’âge
  • protéine dont la fonction normale est inconnue et qui est normalement associée à la membrane d’un neurone ne se dégrade pas correctement
  • Formation d’agrégats de protéines sous forme de plaques amyloïdes détruisant les neurones environnants
  • Il en résulte une perte de la fonction des neurones et leur mort
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

Qu’est-ce qu’un prion?

A

Protéine qui peut se trouver dans deux ou plus conformations, dont une est autoréplicative

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

Nomme les maladies du prion chez les animaux.

A
  • Scrapie : Tremblante (chez les moutons et les chèvres)
  • Transmissible mink encephalopathy : Encéphalopathie des visons transmissible
  • Bovine spongiform encephalopathy (BSE) : Encéphalopathie spongiforme bovine (ESB)
  • Chronic wasting disease (CWD) : Maladie débilitante chronique (chez les cerfs et les wapitis)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
34
Q

Nomme les maladies du prion chez les humains.

A
  • Kuru : Kuru
  • Creutzfeldt-Jakob disease (CJD) : Maladie de Creutzfeldt-Jakob (MCJ)
  • Variant CJD (vCJD) : Variante de la maladie de Creutzfeldt-Jakob (vMCJ)
  • Fatal familial insomnia (FFI) : Insomnie fatale familiale (IFF)
  • Gerstmann-Sträussler-Scheinker syndrome (GSS) : Syndrome de Gerstmann-Sträussler-Scheinker (GSS)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
35
Q

Nomme les trois grandes catégories de maladies de CJD.

A
  1. Sporadique (90%)
  2. Maladies génétiques à prions (10%)
  3. Transmis (contagieux)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
36
Q

Explique le CJD sporadique.

A
  • 90 % des cas
  • Touchent les personnes âgées, sans avertissement ni explication.
  • Le prion commence à se former dans une ou plusieurs cellules du cerveau, puis se propage au reste du cerveau
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
37
Q

Explique le CJD génétique à prions.

A
  • 10%
  • Dus à une mutation génétique qui peut augmenter vos risques de développer la maladie
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
38
Q

Décrit la CJD transmise.

A
  • rare
  • La maladie peut être transmise accidentellement au cours d’une procédure médicale impliquant des tissus humains («iatrogène») ou par ingestion de la viande de vache folle («variante» BSE)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
39
Q

Explique la réplication des prions.

A

Ils peuvent induire d’autres malrepliments de d’autres protéines adjacentes

les agrégat amyloide s’Accumulent

mener à la mort des neurones par aptose.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
40
Q

Qu’est- ce qu’un codon et que les triplets codifient?

A

Une séquence d’aa qui va créer une protéine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
41
Q

Qu’est-ce qu’un cadre de lecture et comment on l’identifie?

A

ORF (région qui est codante)
AUG à STOP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
42
Q

Possibles conséquences de mutations dans synthèse protéique?

A
  • Silencieuse (rien)
  • Faux sens (mauvais aa)
  • Non sens (STOP)
  • Continuation (plus de STOP)
  • Insertion/délétion (+-1 frameshift)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
43
Q

ARNt, codon anticodon?

A

ARNt: ARN chargé d’un aa qui contient un anticodon
Codon: triplet sur ARNm
Anticodon: triplet complémentaires sur ARNt

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
44
Q

Ribosome et sa structure?

A

4 ARN
80 protéines
2 sous-unités

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
45
Q

Les étapes de la traduction, initiation, élongation, arrêt?

A

Bien décrit dans les autres flash cards

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
46
Q

Les chaperones moléculaires et le repliement des protéines?

A

Les chaperones moléculaires préviennent l’agrégation en s’attachant à des parties prônes à s’agréger telles que les régions hydrophobes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
47
Q

Dégradation des protéines mal repliées par le UPS?

A

Ajout d’ubiquitine
Dégradation

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
48
Q

Les maladies causées par un mauvais repliement?

A

Conformational Disorders
Protein Folding Diseases
Protein Misfolding diseases
Trafficking Diseases
ER Storage Diseases

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
49
Q

L’exemple des prions?

A

Les prions ont un mauvais repliement ce qui cause la mort des cellules (agglomération dans la cellule)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
50
Q

Qu’est-ce qu’un ARN non codant?

A

Molécule d’ARN fonctionnelle qui est transcrite mais pas traduite en protéine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
51
Q

mRNA

A

= ARN messager code pour une protéine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
52
Q

ncRNA=

A

= non-coding RNA
ARN non-codant
Ne code pas pour une protéine

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
53
Q

Par qui est porté la fonction d’un ARN non traduit?

A

Par l’ARN lui-même

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
54
Q

Nomme les deux types de séquences d’ADN chez l’humain.

A

SÉQUENCES « UTILES » CORRESPONDANT AUX GÈNES
* gènes ~ 10-20% du génome/ exons ~ 1,5-2% du génome
SÉQUENCES INTERGÉNIQUES (« INUTILES » / « JUNK » )
* (~80 - 90% du génome)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
55
Q

Qu’est une large portion des séquences junk?

A

Séquences répétées

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
56
Q

Qu’on mis en évidence des analyses génomiques à grande échelle?

A

Existence d’une multitude d’ARN non codants

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
57
Q

Au moins ___% du génome humain peut être transcrit

A

70

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
58
Q

D’environ 180 000 ARNs transcrits, environ _____ encodent des protéines.

A

30 000

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
59
Q

Environ _______ ARN sont de long non-coding RNAs (lncRNAs)

A

150 000

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
60
Q

Le génome humain peut coder de ______ miRNA (micro ARNs)

A

400 à 600

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
61
Q

Quelle était l’hypothèse de base pour les ncRNAs?

A

Bruit de fond transcriptionnel généré par liaison aléatoire de l’ARN Polymérase à des séquences d’ADN ressemblantes à des promoteurs

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
62
Q

Que font les ncRNAs en général? nomme les

A

Ils régulent l’expression des gènes au niveau transcriptionnel et post transcriptionnel (épissage)

s miRNA, siRNA lncRNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
63
Q

Que peuvent réguler les ncRNAs?

A
  • Formation d’hétérochromatine
  • Modification d’histones
  • Ciblage de la méthylation
  • Silencing des gènes
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
64
Q

Les ARNnc sont impliqués dans quoi de négatif?

A

Pathologies comme le cancer

65
Q

Nome les deux types d’ARNnc à l’étude.

A

RNA interference
Large non-coding RNA

66
Q

Nomme deux sortes de RNAI.

A

miRNA
siRNA

67
Q

Que régulent les miRNA, siRNA et IncRNA?

A

L’expression des gènes au niveau transcriptionnel, post-transcriptionnel et l’épissage du pré-ARNm

68
Q

Explique la classification des ARNnc.

A

Définition arbitraire
IncRNA: + de 200 nucléotides
sncRNA: - de 200 nucléotides

69
Q

Que comprend le groupe des sncRNA?

A

miRNA
siRNA

70
Q

Qu’est-ce que l’épigénétique?

A

Changements dans l’expression de gènes ou phénotypes sans changements de la séquence d’ADN

71
Q

Quel est le rôle important de l’épigénétique?

A

l’établissement et maintien de types cellulaires

72
Q

À la base, quel est le rôle des RNAi?

A

Défense des cellules contre les séquences nucléotidiques parasites - virus et transposons

73
Q

Explique le processus biologique qu’est le iRNA.

A

Des molécules d’ARN inhibent l’expression ou la traduction des gènes en neutralisant les molécules d’ARNm ciblées

74
Q

Que peuvent faire des iRNA synthétiques introduits dans les cellules?

A

Peuvent inhiber de manière sélective et robuste l’expression de gènes d’intérêt spécifiques

Le RNAi a des applications en recherche et dans des approches
thérapeutiques

75
Q

Qu’est-ce qu’un miRNA?

A

Est une petite molécule de ncRNA d’environ 22 nucléotides

76
Q

Localisation des miRNA?

A
  • Se trouvent chez les plantes, les animaux et certains virus
  • Sont abondants dans de nombreux types de cellules de mammifères
  • Semblent cibler environ 60% des gènes humains
77
Q

Fonction des miRNA?

A

Fonctionne dans la régulation post-transcriptionnelle de l’expression génique

78
Q

Qu’est-ce qui explique que l’on peut étudier les miRNA chez la souris pour comprendre leur fonction chez l’humain?

A

La plupart de ces miRNA sont conservés entre les espèces et ont des fonctions importantes

On peut donc les étudier chez la souris
pour comprendre leurs fonctions chez l’humain

79
Q

Que font la plupart des miRNA?

A

inhibent l’expression génique en ciblant des
ARNm

80
Q

Via quoi fonctionnent les miRNA?

A

Les miRNA fonctionnent via l’appariement de bases avec des séquences complémentaires au sein de molécules d’ARNm cibles

81
Q

Les molécules d’ARNm ciblés par les miRNA sont inactivées par un
ou plusieurs des processus suivants: Nomme les processus des miRNA pour silencer les ARNm ciblés.

A
  • Clivage du brin d’ARNm en deux morceaux,
  • Déstabilisation de l’ARNm par clivage de sa queue poly(A)
  • Réduction de l’efficacité de traduction de l’ARNm en protéines
82
Q

Jusqu’à __% des gènes des miRNAs peuvent se trouver dans les introns, ou même, dans les exons d’autres gènes

A

40

83
Q

Par quoi sont généralement transcrit les miRNA?

A

ARN polymérase II

84
Q

Que se passe-t-il avec le transcrit de miRNA?

A

Le transcrit est d’abord
coiffé,
polyadénylé,
et épissé

85
Q

De quoi font partie les miRNA?

A

D’un transcrit précurseur contentant un ou plusieurs miRNA appelé pri-miRNA

86
Q

Combien de pré-miRNA peut contenir un seul pri-miRNA?

A

1-6

87
Q

Quelle est la structure de chaque pré-miRNA?

A

Structure en tige-boucle (épingle à cheveux) composées d’environ 70- 80 nucléotides

88
Q

Est-ce que l’ARN poly III peut transcrire des miRNA?

A

Oui, mais juste ceux avec des séquences Alu en amont des ARNt

Alu do it etre devant arnt

89
Q

Explique la maturation dans le noyau des miRNAs.

A
  1. Chaque structure à ARN double brin (dsRNA) des épingles à cheveux dans un pri-miRNA est reconnue par une protéine nucléaire appelée DGCR8 chez les vertébrés, ou “Pasha” chez les invertébrés
  2. DGCR8 (Pasha) et l’enzyme Drosha forment le complexe « microprocesseur »
  3. L’activité enzymatique de Drosha découpe les pré-miRNA à partir du pri-miRNA
  4. CROPPING: Drosha libère les pre-miRNA (épingles à cheveux) des pri-miRNA à la base en épingle à cheveux
  5. Le produit résultant, le pré-miRNA a deux nucléotides non-appariés à son extrémité 3’
90
Q

Explique l’export du noyau des miRNAs.

A

Les pré-miRNA sont exportées par Exportin-5, qui reconnaît les 2 nucléotides laissés à l’extrémité 3’ par Drosha

91
Q

De quoi dépend le transport par l’exportine 5 vers le cytoplasme?

A

De l’énergie du GTP lié à la protéine Ran (Ran-GTP)

92
Q

Explique la maturation dans le cytoplasme des miRNAs.

A
  1. DICING: Dans le cytoplasme, l’épingle cheveux pré-miRNA est processé par Dicer
  2. Dicer est une endoribonucléase qui coupe la boucle reliant les bras de l’épingle à cheveux et donnant un duplex miARN/miARN* imparfait d’environ 22 nucléotides de long
93
Q

miRNA est nommé le…

A

brin guide

94
Q

miRNA* est nommé…

A

brin passager

95
Q

Quel brin est choisi par l’Ago?

A

ABien que l’un ou l’autre des brins du duplex puisse potentiellement agir en tant que miRNA fonctionnel

Argonaute (Ago) choisi un seul brin
seulement, le Brin Guide (miRNA)

96
Q

Que forment le brin guide avec Ago et d’Autres protéines?

A

RISC

est aussi appelé complexe miRNA
ribonucléoprotéine (miRNP)

97
Q

À quoi sert le RISC?

A

Interaction entre le miRNA et sa cible d’ARNm

98
Q

À quoi servent les Ago?

A

jouent un rôle central dans la fonction RISC

Lient le miRNA mature, ce dernier le guide RSIC pour une interaction avec un ARNm cible

99
Q

Explique l’appariment étendu (parfait).

A
  • SLICING: si l’appariement entre miRNA et le mRNA est étendu (presque parfait), le mRNA cible est clivé puis dégradé
    Certains argonautes, par exemple Ago2 humaine clivent directement les mRNAs cibles
100
Q

Explique l’appariment imparfait.

A
  • Séquestration dans des P-bodies
  • Si l’appariement de bases n’est pas extensif (partiel) Argonaute ne “sclice“ pas, la traduction est inhibée, le mRNA déstabilisé
  • Les mRNAs sont séquestrés dans des structures cytosoliques dites P-bodies où a lieu la dégradation des mRNAs
101
Q

Que sont les P-bodies?

A

Les P-bodies sont des structures dynamiques contenant l’enzyme Dcp1 (Decaping enzyme) ainsi que des enzymes de dégradation des mRNAs

102
Q

Explique 3 autres mécanismes d’action des miRNAs.

A
  1. Les miRNA partiellement complémentaires peuvent inhiber l’initiation de la traduction de l’ARNm cible en se liant au début du ARNm
  2. Des miRNA partiellement complémentaires
    peuvent également accélérer la déadénylation entraînant la dégradation précoce des ARNm
  3. Les miRNA provoquent parfois aussi la modification d’histones et la méthylation de l’ADN des sites promoteurs, ce qui affecte l’expression des gènes cibles
103
Q

Explique en bref l’inhibition de la traduction.

A

Les miRNA partiellement complémentaires inhibent la traduction de l’ARNm cible

104
Q

Explique en bref l’accélération de la dé-adénylation.

A
  • Des miRNA partiellement complémentaires peuvent accélérer la dé-adénylation.
  • L’accélération de la dé-adénylation entraine la dégradation précoce des ARNm
105
Q

Explique en bref la modification d’histones et méthylation de l’ADN.

A

Les miRNAs provoquent parfois aussi la modification d’histones et la méthylation de l’ADN des sites promoteurs, ce qui affecte
l’expression des gènes cibles

106
Q

La majorité des miRNA sont ____________.

A

intracellulaires

107
Q

Nomme les miARN extracellulaire.

A

miRNA circulants

108
Q

Que sont les IncRNA?

A

Des transcrits de plus de 200 nucléotides qui ne codent pas pour des protéines

109
Q

Décrit l’expression des IncRNA.

A
  • Sont exprimés plus faiblement que les gènes codants pour des protéines
  • Leur expression est remarquablement spécifique dans certains tissus
110
Q

Ou sont plus renrichi les Inc RNA ?

A

Noyau

111
Q

Décrit la conservation des IncRNA.

A

Montrent une plus faible conservation de séquence, bien que certains d’entre eux soient fortement conservés

112
Q

Les lncRNAs sont transcrits et matures comme les mRNA codants pour des protéinés mais pas ________.

A

traduits

113
Q

Par quoi sont définis les gènes de IncRNA?

A

Par leur position relative aux gènes codants qui sont situés à leur proximité

114
Q

lncRNA intergéniques (lincRNA)

A

lncRNA localisés dans une région entre gènes codant

115
Q

lncRNA antisens

A

lncRNA transcrits dans la direction opposée d’un gène codant et dont la séquence chevauche en partie ou totalement le gène codant lui étant associé

116
Q

lncRNA introniques

A

lncRNA contenus dans un intron d’un gène codant

117
Q

lncRNA divergents

A

IncRNA transcrits de façon divergente au promoteur d’un gène codant

118
Q

Les lncRNA peuvent contrôler l’expression des gènes…

A

1) voisins (en cis, action locale)
2) indépendamment de la localisation de leurs gènes cibles (en trans, action distale)

119
Q

Que peut être le contrôle des IncRNA sur les gènes?

A

Ce contrôle peut avoir un impact positif ou négatif (+/-) sur l’expression des gènes cibles (répression ou activation)

120
Q

Nomme les cinq rôles des long ARN non codants.

A

A. dirigent des modificateurs de la chromatine vers des gènes cibles spécifiques
B. déplacent des régulateurs de l’expression (activateurs ou répresseurs) des séquences régulatrices de l’expression
C. entrent en compétition avec des miRNA et
protègent des ARN messagers de la dégradation par ces miRNA (fonction éponge)
D. modulent des évènements d’épissage et interfèrent avec la traduction
E. promeuvent l’association des facteurs à des
séquences amplificatrices et promotrices pour initier la transcription

121
Q

Est-ce que tous les ARN non codant ont des fonctions dans la régulation de l’expression des gènes?

A

Oui (mais on est pas certain)

122
Q

Quelles sont les ARN polymérases impliquées dans la biosynthèse des ARN non codants?

A

ARN polymérase 2

123
Q

Quelles sont les différences entre miRNA et lncRNA?

A

miRNA: mieux connus, plus petits,agissent sur les ARNm directements

124
Q

Quelles sont les protéines et les étapes impliquées dans la biogénèse des ncRNAs?

A

Bien expliqué dans les autres flash cards

125
Q

Où sont situés les gènes des ncRNA?

A

Partout dans le génome

126
Q

Quelles sont les fonctions cellulaires des ncRNA?

A

Modifient l’épigénétique

127
Q

Quelles sont les utilités des ncRNA en médecine?

A

Permettent de modifier des processus de transcription dans les gènes

128
Q

Combien d’ARN produits codent pour des protéines?

A

1-2%

129
Q

Que font les ARN non codants?

A

Régule l’expression génique

130
Q

Comment appelle-t-on le mécanisme que modifie l’ARN non codants?

A

Épigénétique

131
Q

Est-ce que les ARN non codants modifient les bases de l’ADN?

A

Non

132
Q

À quoi ont servi les iRNA en premier?

A

À se défendre contre les virus

133
Q

Décrit la structure d’un miRNA.

A

Tige boucle avec bolge

134
Q

Comment se lie un miARN à son ARNm?

A

Via un appariment complémentaire de bases

135
Q

Comme quoi sont traité les miARN qui viennent d’être traduit?

A

Comme un ARNm

136
Q

Localisation finale des miARN?

A

Cytoplasme

137
Q

Explique le transport à l’extérieur du noyau des miARN.

A

Sort via le port nucléaire grâce aux exportines qui s’activent via Ran-GTP

138
Q

Est-ce que le brin passager va s’apparier?

A

Non

139
Q

À quoi sert Ago?

A

Sert à réguler les gènes avec miRNA (cibler ARNm pour le cliver ou inhiber la traduction)

140
Q

Qui permet au miRNA d’interragir avec ARNm cible?

A

RISC

141
Q

Vrai ou faux? Il existe plusieurs classes d’Ago.

A

Vrai

142
Q

Quelle fonction des miRNA est modulable?

A

Inhibition de la traduction

143
Q

Vrai ou faux? Les miRNA sont manipulable.

A

Vrai

144
Q

Quelle étude des ARN non codants est la plus complexe?

A

IncRNA

145
Q

Localisation des IncRNA?

A

Partout dans le génome

146
Q

Pourquoi est-ce que l’étude des IncRNA est si difficile?

A
  • Obligation de l’étudier chez l’homme
  • Il faut trouver une règle commune
147
Q

Le repliement des protéines se fait en même temps que quoi?

A

Que sa synthèse

148
Q

Qu’est-ce qui se passe avec le vieillisement?

A

Plus de mutation des protéines

149
Q

Pourquoi l’anémie falciforme est prévalente en Afrique?

A

Il y aurait peut-être une protection à la malaria avec cette maladie

150
Q

Que fait un repliement incorrect d’une protéine?

A

Changement de sa fonction

151
Q

Que forme l’alpha cristalline dans la cornée?

A

Oligodendromères

152
Q

Est-ce qu’un seul monomère d’alpha cristalline est actif seule?

A

Non

153
Q

Que permet les chaperonne?

A

Donne le temps à la protéine de bien se replier

154
Q

Que fait HSP?

A

Empêche les protéines de perdre leurs fonctions et de se précipiter

155
Q

Explique la destruction d’une protéine par le protéasome.

A
  1. Activation de l’ubiquitine via E1
  2. Transfert à E2 (conjugating)
  3. E3 reconnait la protéine à être dégradée
  4. E3 rajoute une ubiquitine sur la protéine
  5. Si 4 ubiquitines sont rajoutées, la protéine est dégradé par le protéasome
156
Q

Que se passe-t-il au niveau du canal chlore dans la fibrose kystique?

A

Mal replié donc accumulation dans le RE et pas assez à la membrane plasmique

157
Q

Que se passe-t-il dans un neurone atteint de la maladie de Huntington?

A

Formation d’agrégats de protéines ce qui tue la cellules (ici le neurone)

158
Q

Est-ce que les fibres amyloides sont néfastes?

A

OUI