Transcription Flashcards
Professeur: Dr Dubrac
Réplication?
ADN en ADN
Transcription?
ADN en ARN
Traduction?
ARN en protéines
Que génère la transcription?
Un polymère de ribonucléotides
Par quoi est synthétisé le polymère de ribonucléotide?
ARN polymérase
Dans quel sens l’ARN polymérase synthétise-t-il le brin d’ARN?
5’ vers 3’
Que synthétise l’ARN polymérase?
Copie complémentaire du brin matrice
Copie identique du brin codant
Dans quel sens est lu le brin matrice?
3’ vers 5’
L’ARN a la séquence du brin d’ADN codant mais avec des ___________ au lieu de désoxyribonucléotides, et de __ au lieu de T
ribonucléotides
U
Combien de brin pour l’ARN?
1
Que permet le simple brin d’ARN?
Interaction entre ses bases
Structure secondaire et tertiaire
Nomme la structure secondaire de l’ARN.
Tige boucle
Nomme la structure tertiaire de l’ARN.
Pseudoknot
Qu’est-ce que le pseudoknot?
Appariement de bases entre deux régions simple-brin de boucles
Est-ce que la structure de l’ARN est linéaire?
NON
À quoi servent les structures secondaires de l’ARN?
Protection de celui-ci (et stabilisation)
Décrit en gros la région de la transcription chez les procaryotes.
- Déroulement de l’ADN au fur et à mesure de la synthèse d’ARN par l’ARN polymérase
- Reformation de la double hélice en arrière de l’ARN polymérase
- Courte région d’hélice hybride ADN/ARN formée transitoirement
Combien de nucléotides pour la courte région d’hélice hybride ADN/ARN formée transitoirement?
9
Nom de la courte région d’hélice hybride ADN/ARN formée transitoirement?
hétéroduplex
Nomme les différentes caractéristiques des ARN polymérases.
- Synthétise l’ARN en copiant d’un brin matrice d’ADN
- Transcrit de 5’ à 3’ (brin matrice de l’ADN doit être lu de 3’ à 5’)
- Ne nécessite pas d’amorce
- Crée des liens phosphodiesters entre les nucléotides en son site actif
Est-ce que l’ARN polymérase est aussi précise que l’ADN polymérase?
Non, mais c’est pas grave puisque les erreurs ont une durée de vie limitée correspondant à la durée de vie du transcrit
Séquence d’ADN pour l’initiation de la transcription?
Promoteur
Séquence d’ADN pour la terminaison de la transcription?
Terminateur
Que nécessite la polymérase pour initier et terminer la transcription?
Facteurs protéiques
Signaux dans l’ADN
Quel est le facteur protéique chez les procaryotes?
Sigma
Explique la transcription chez les procaryotes.
- Sigma se lie à ARN polymérase
- Formation du complexe d’initiation
- L’ARN polymérase est recrutée au niveau
du promoteur avec le facteur sigma - Transcription
- Sigma se retire après 10 nucléotides
- ARN polymérase est relâchée au niveau d’un signal stop
L’ARN polymérase est recrutée au niveau du ___________ et est relâchée de l’ADN au niveau d’un signal de _____.
promoteur
stop
Un facteur est une…
protéine!
Quelles sont les caractéristiques des promoteurs et des terminateurs?
Séquences concensus/canoniques
Qu’est-ce qu’une séquence consensus?
Ordre calculé des nucléotidiques (acides nucléiques) ou acides aminés (protéines), trouvés à chaque position dans un alignement de séquences
Que représentent les séquences consensus?
Représente les résultats d’alignements de séquences multiples dans lesquels des séquences apparentées sont comparées les unes aux autres
Que nécessite la polymérase pour initier et terminer la transcription?
Facteurs protéiques
Signaux dans l’ADN
À quel niveau est recruté l’ARN polymérase?
Promoteur
Qui est le facteur nécessaire e à l’initiation de la transcription qui permet la sélection du promoteur du gène à transcrire chez les procaryotes?
Sigma
Est-ce qu’il existe plusieurs facteurs sigma?
Oui
À quoi se lie le facteur sigma avant de se lier au promoteur?
Pour former quoi?
Polymérase
Complexe d’initiation
Nomme les deux promoteurs procaryotes.
Boites -10 (TATA) et -35
La position de -10 et -35 dicte quoi?
Le brin à utiliser et le sens de la transcription
Qu’est-ce que la séquence consensus promoteur?
Séquence idéal obtenue obtenue pas analyse statistique des fréquences des bases à chaque position
Qu’est-ce qui permet d’avoir un promoteur fort?
Plus la séquence d’un promoteur est similaire à la séquence consensus
(idéale) plus grande sera l’affinité du facteur sigma et plus grande sera l’efficacité d’initiation la transcription = Promoteur plus fort
Qui est le point de repère pour l’assemblage du complexe d’initiation de la transcription?
séquence TATAAT (-10)
Comment se fait la reconnaissance moléculaire entre la polymérase/sigma et le promoteur?
Liaisons chimiques faibles!
Nomme les liaisons chimiques faibles.
1- Forces de Van der Waals
2- Ponts hydrogène
3- Liens ioniques
4- Interactions hydrophobes
Décrit les facteurs sigma des procaryotes.
Les procaryotes possèdent typiquement plusieurs facteurs sigmas, chacun ayant sa propre spécificité de séquence
Est-ce que tout les sigma interagissent avec l’ARN polymérase?
Oui
De quoi sont responsable les sigma?
reconnaissance de la séquence
promotrice sur l’ADN
Explique avec pleins de détails la transcription de l’ADN chez les procaryotes.
1.Le facteur sigma s’associe à l’ARN polymérase avant la transcription. Ce complexe ira se fixer sur le promoteur.
2. Le contact de l’ARN polymérase avec le promoteur entraîne l’ouverture locale de la double hélice d’ADN -> bulle de transcription
3. Initiation de la synthèse d’ARN à 50 ribonucléotides/seconde
4. Relâchement du facteur sigma après la synthèse d’une chaîne de ± 10 ribonucléotides
5. Élongation
6. Rencontre du signal de terminaison
7. L’ARN polymérase se détache, libérant l’ARN
8. L’ARN polymérase peut ensuite aller retrouver un facteur sigma pour enclencher une nouvelle transcription
Qu’est-ce qu’un signal de terminaison?
Il s’agit de la forme que prend l’ARN grâce aux appariements locaux (intramoléculaires).
Lorsque l’ARN se met sous cette forme, cela indique à l’ARN polymérase qu’elle doit être relâchée
Quel est le nom de la forme “stop” que prend l’ARN?
Tige boucle
Localisation du signal de terminaison de la transcription encodée par l’ADN? (procaryote)
A l’extrémité 3’ de l’ARN néo-synthétisée
Que crée la séquence d’ARN tige boucle?
Contrainte au niveau du complexe de l’ARN polymérase ce qui favorise son détachement
Décrit la séquence tige boucle.
Riche en G-C suivi d’une série de U
Particularités de la transcription des cellules eucaryotes?
Trois ARN polymérases
Plusieurs types d’ARN
Nomme les types d’ARN produit par les cellules eucaryotes.
ARNm
ARNr
ARNt
Petits ARN
ARN polymérase de ARNm?
2
ARN polymérase de ARNr?
1
ARN polymérase de ARNt?
3
ARN polymérase de petits ARN?
3
Fonction des ARNm?
Codent pour des protéines