Transcription

Question 1

Inhibiteur ProK

Answer 1

Actinomycine
Acridine
Rifampicine

Question 2

Inhibiteur EuK

Answer 2

Actinomycine
Acridine
Alpha-amantine

Question 3

Brin sens

Answer 3

5’—>3’
Brin codant= brin non transcrit = brin non-matrice

Question 4

Brin anti-sens

Answer 4

5’—>3’
Brin non codant= brin transcrit = brin matrice

Question 5

Caractéristique du site 5’ des Introns

Answer 5

Site donneur d’épissage ( SDE )
+1 et +2 = GU dans tout les introns
+3 = A ou G dans 95% des introns

Doit avoir un environnement favorable d’une douzaine de nt pour être reconnu

Question 6

Caractéristique du site 3’ des Introns

Answer 6

Site accepteur d’épissage ( SAE )
-1 et -2 = AG dans tout les introns
-3 = C dans 80% des introns

Doit avoir un environnement favorable: séquence de 15 pb riche en pyrimidines en amont du AG

Question 7

Boîte ou A de branchement

Answer 7

Positionné a une cinquantaine de nt ( 30 a 50 nt) de l’extrémité 3’ = SAE

Question 8

ARN pol I

Localisation nucléaire :
Transcrit :
Activité cellulaire :

Answer 8

Localisation nucléaire : nucléole

Transcrit : ARNr 5.8S / 18S / 28S —> 45S

Activité cellulaire : 60-70%

Question 9

ARN pol II

Localisation nucléaire :
Transcrit :
Activité cellulaire :

Answer 9

Localisation nucléaire : nucléoplasme

Transcrit : ARNm / ARNsn / ARNsno / ARNlnc / miARN

Activité cellulaire : 10-30%

Question 10

ARN pol III

Localisation nucléaire :
Transcrit :
Activité cellulaire :

Answer 10

Localisation nucléaire : nucléoplasme

Transcrit : ARNt / ARNr 5S / ARNsn

Activité cellulaire : 10%

Question 11

Actinomycine D

Mécanisme :
Utilisation :

Answer 11

Intercalants de l’ADN qui induisent une distorsion/déformation de l’ADN (voir répa).
Bloque le mouvement de l’ARN pol.

Actinomycine D = molécule anti-cancéreuse , de moins en moins utilisée en thérapeutique aujourd’hui

Question 12

Acridine

Mécanisme :
Utilisation :

Answer 12

Intercalants de l’ADN qui induisent une distorsion/déformation de l’ADN (voir répa).
Bloque le mouvement de l’ARN pol.

Acridine pas utilisée en thérapeutique mais dans les labos de diagnostic moléculaire (détection de n’importe quel AN).

Question 13

Rifampicine

Mécanisme :
Utilisation :

Answer 13

Se lie à la su ß de l’ARN pol (elle l’inhibe ainsi).
Explication : blocage de la liaison au ribonu-cléotide. (Logique car B se lie à celui-ci).

Antibiotique encore largement utilisé en clinique, notamment contre la tuberculose. On l’utilise aussi contre des infections ostéo-articulaires assez invasives (pas en pre intention).

Question 14

Alpha-amantinine

Mécanisme :
Utilisation :

Answer 14

Bloque la transcription par action sur une ARNpol (surtout la pol II).

Cause des décès chaque année (entre 1 et 2 en région Rhône-Alpes tous les hivers (osef). Très utile en recherche pour étudier la vitesse de polymérisation.

Question 15

Caractéristique de ces séquences promotrice

Answer 15

Séquence consensus = conservées
Double brin

2 endroits :
- région -10 ( riche en A et T ) = boite de Pribnow
- région -35 ( moins riche en A et T )

( séquence hexamérique )

Question 16

Déficit du site +1

Answer 16

1er désoxyribonucléotide transcrit

10nt entre boite de Pribnow et le site +1

Question 17

Caractéristique correction pyrophospholytique

Answer 17

Uniquement chez les Procaryotes

Capacité e l’enzyme à éliminer le dernier nucléotide ajouté par l’enzyme dans le transcrit primaire

Question 18

Caractéristique correction Hydrolytique

Answer 18

Procaryote et Eucaryote

Correction un petit peu plus large de la polymérase qui recule de quelques nucléotides , coupe la fin de l’extrémité 3’ du transcrit en cours de synthèse , pour recommencer sans erreur .
Elle enlève toute une région d’ARN pour ensuite reprendre la polymérisation

Question 19

TATA box

Answer 19

5’ TATAAA 3’

Séquence d’initiation la plus importante
Équivalent Eucaryote de la boite de Pribnow
Permet le recrutement de l’ARNpol

Localisée en -30 à -26 avant le site +1

Double brin et hexamérique

Très conservée au cours de l’évolition

Question 20

Séquence AAUAAA

Answer 20

Reconnue par des facteurs protéique ( ribonucléase)

Signal de terminaison et de polyadénylation sur l’ARNm

Clive l’ARNm 10 à 15 nucléotides en aval

Séquence conservée et transcrite

Question 21

Phosphatase

Answer 21

Élimine un phosphate en 5’ de l’ARNm

( car le 1er ribonucléotide est resté sous le forme triphosphate )

Question 22

Guanyltransférase

Answer 22

Transfert d’une guanosine mono phosphate

( relié par une liaison 5’-5’ triphosphate )

Question 23

Méthyltransférase

Answer 23

Pour méthyler la guanosine —> 7-méthylguanosine

Question 24

Caractéristiques polyA

Answer 24

Extrémité 3’ OH libre

200-250 A rajouté par la Polyadénylate polymérase

Spécifique des ARNm Eucaryote

Modification post-transcriptionelle

( Protège )

Question 25

Que possède presque tout les introns

Answer 25

Un site 5’ ou site donneur d’épissage ( SDE ). = GU —> U1

Un site 3’ ou site accepteur d’épissage ( SAE ) = AG —> U5

Un A de branchement a 30-50 nt de l’extremité 3’ de l’intron —> U2

Question 26

Spliceosome

Answer 26

SnARN + Prot

Question 27

Beta- globine

Answer 27

Constitution de l’hémoglobine

Contient 3 exons et 2 introns

Ensemble du gène = 2 000 nucleotides

Question 28

Facteur VIII de coagulation

Answer 28

Facteur pour la formation d’un caillot de sang

Gène = 200 000 Pb

Introns = plusieurs millier de pb

Question 29

Caractéristique du site donneur

Answer 29

en 5’ de l’intron

+1 et +2 : GU en 5’ dans 100% des introns

+3 : A ou G dans 95% des cas

Question 30

Caractéristique boite de branchement

Answer 30

Contient le A de branchement

20 à 50 nt en amont du site accepteur

Question 31

Caractéristique site accepteur en 3’ de l’intron

Answer 31

-1 : AG en 3’ dans tout les introns

-3 : C dans 80% des cas

15pb : Régions riche en pyrimidine

Question 32

Def EJC

Answer 32

Exon Junction Complex

Complexe protéique important pour l’export de l’ARNm hors du noyau

Se fixe à la jonction exon-exon après épissage = permettent la vérification que l’épissage a été réalisé

Question 33

Caractéristiques Transcription Procaryote

Answer 33

Pas de polyadénylation

Pas de Cap

Pas d’épissage

1 gène = 1 protéine

Question 34

Caractéristiques Transcription EuK

Answer 34

Maturation
- coiffe
- Queue polyA
- épissage

1 gène peut donner plusieurs ARN

Épissage alternatif : 1 pré-ARNm

Question 35

Nombre de gènes

Nombre de protéines

Answer 35

Environ 22 000 gènes

100 000 à 1 000 000 protéines

Question 36

Application clinique humaine Pré-ARNm de l’hormone de croissance

Answer 36

Nanisme par déficit isolé en hormone de croissance de type II

Question 37

Application clinique humaine Pré-ARNm d’un gene important dans le développement des reins et des gonades

Answer 37

Syndrome de Frasier

Question 38

Application clinique humaine Pré-ARNm codant pour une protéine du cytosquelette

Answer 38

Démence

Question 39

Application clinique humaine mutation dans un gène de la machinerie d’épissage

Answer 39

Atrophie musculaire spinale

Question 40

Application clinique humaine Mutant p73 : épissage aberrant

Answer 40

Carcinome pavimentaire