Composition Des ARN Flashcards
ARNm
Pourcentage :
Nb de sorte :
Composition :
(2% des ARN totaux)
Seul ARN à être traduit en protéine.
1 000 sorte / cellule
Coiffe / 5’UTR / codant / 3’UTR / queue poly a
ARNt
16% de ARN totaux
Transport des acides aminés dans le cytoplasme vers les ribosomes, permettent
l’incorporation des acides aminés dans les protéines.
70-90 ribonucléotides
Structure en forme de trèfle
Nombreux nucléotide atypique
Petit ARN
1%
ARNsn (ARN small nuclear) : impliqués dans l’épissage des préARNm.
Liés a des prot U1 à U7
ARNsno (ARN small nucleolar) : impliqués dans les modifications chimiques et la
maturation des ARNr.
Ils sont uniquement EUCARYOTES + + + et situés dans le NOYAU !
3 ARN polymérases chez les eucaryotes
Pol 1
Pol 2
Pol 3
ARN Pol 1
Localisation :
Transcrit :
Activité cellulaire :
Localisation : nucléole
Transcrit : ARNr 5.8S 18S 28S via le 45S
Activité cellulaire : 60-70%
ARN Pol 2
Localisation :
Transcrit :
Activité cellulaire :
Localisation : nucleoplasme
Transcrit : ARNm/ ARNSsn / ARNlnc / miARN
Activité cellulaire :10-30%
ARN Pol 3
Localisation :
Transcrit :
Activité cellulaire :
Localisation : nucleoplasme
Transcrit : ARNt / ARNr 5S / ARNsn
Activité cellulaire : 10%
Rôle des SU α
Liaison aux séquence promotrice, assemblage de l’enzyme, maintien du Brin non transcrit à l’écart
Rôle des SU β et β´
Bêta : liaison au Ringo, nucléotides
Bêta’ : liaison à la matrice d’ADN
Rôle SU σ
Reconnaissance du promoteur et initiation de la transcription
( Se détache au bout de 10 nucléotides )
ARNsn
Moins de 1%
Petite taille < 200 nt
Épissage des pré-ARNm
Excision d’intron par deux réaction de trans-estérification ( consomme bcp d’énergie )
Dans le noyau
Associé a des snRNP ( 7snRNP pour 1 ARNsn )
Avec un spliceosome
Spliceosome
Composé de complexe de snRNP = protéine + ARNsn
Riche en U donc U1 ,U2 ,U3,…
U1 = reconnaît le SDE
U2 = reconnaît le A de branchement
ARNr
82%
Pas d’épissage / pas d’ajout de cap / pas de queue polyA
Résultat d’une étape de clivage ( pas d’épissage )
Transcription: dans le nucléole d’un précurseur très grand par ARN Pol I
Maturation: ARN 45S = non mature
-modification chimique par des snoRNP
-snoRNP = protéine + snoARN = guide les modifications chimique + les endonucléase ( hydrolyse au NV des espaceurs intra génique )
Obtention: des ARNr 18S , 28S et 5,8S
Formé dans le noyau puis assemblé dans le cytosol
MicroARN
Taille : 20nt
Transcrit dans le noyau par l’ARN pol II et maturation dans le noyau et le cytoplasme
Rôle : régulation de l’expression des gènes
-s’hybride ( liaisons hydrogène ) avec ARNm au NV de 3’ UTR
- dégradation de l’ARNm OU Blocage de la traduction de cet ARNm
1) Pri-miARN
2) DROSHA —> pré-miARN
3) dans le cytoplasme DICER
4) RISC le rend simple brin
5) miARN se fixe sur son ARNm cible
Base mineure
Hypoxanthine (désamination hydrolytique de l’Adénine) → 6-oxopurine
Pseudo-uracile (surtout présent dans les ARNt au sein du bras TVC).
4-thiouracile (peu important)
5-méthylcytosine (ADN, méthylation spontanée de la Cytosine) : base importante pour la transcription. S’apparie avec la guanine (mésappariement) = hot spot de mutation.
(Attention ici, l’appariement de la cytosine methylée avec la guanine n’est pas un mésappariement en soi, mais la Cm peut devenir une thymine par désamination et c’est là qu’on a une mutation.)
7-méthylguanine (ARNm) : CAP en 5’.
5,6-dihydrouracile (ARNt au sein du bras DHU).
Désamination
Adénine
Guanine
Cytosine
Thymine
Adénine —-> hypoxanthine
Guanine —-> Xanthine
Cytosine —-> Uracile
Thymine —-> pas possible
Appariement
Hypoxanthine
Xanthine
Uracile
hypoxanthine —-> cytosine
Xanthine —> Thymine
Uracile —-> Adénine
Règle de Chargaff
Rapport A/T = G/C = 1
A+T / G+C = 1.46
A+G / T+C = 1
Caractéristiques ADN B
Région interne Hydrophobe
Empilée et partiellement superposées
Plan parallèle
Décalée de 0.34 nm / rotation = 36° / pas d’hélice = 3.4nm / diamètre = 2nm
10pb/tour d’hélice
Résidu phosphate orientés vers l’extérieur
Grand sillon = ARN régulateur et protéines / Petit sillon = fixation histone et protéines
Prot basique lysine ou Arginine
Inhibiteur de la gyrase bactérienne
Rôle :
Exemple :
Rôle : inhibition pour le traitement des infections urinaire
Exemple : acide nalidixique
Inhibiteur de la topoisomérase humaine
Rôle :
Exemple :
Rôle : cellule tumorale
Exemple :
Topoisomérase I = Irinotécan ( cancer digestif , colorectaux )
Topoisomérase II = Doxorubicine ( Lymphomes , tumeurs du sein , sarcome , myélomes )
ADN Z
Zig Zag / Hélice gauchère
Plateaux de base peu inclinés
Méthylation en C5 des îlots CG
Alternance régulière des base purique et pyrimidiques
Multiple cytosine au sein des promoteurs
Caractéristique des modifications des Histones
Séquence N-term des histones sont libre
Modifications post traductionelle:
- acéthylation = décompaction
- méthylation = compactions
Fibre de 10 nm du nucléosome
150 Pb ( autour des histones ) + 50 Pb (ADN linker)
2 H3 + 2 H4 + 2 H2A-H2B
H1 non comprise dans le nucléosome car lésions entre
Fibre de 30 nm du nucléosome
Structure solénoïde
6 nucléosomes = 1 hélice
Caractéristique de l’ADN mitochondrial
Pourcentage :
Nb de copie / mitochondries :
Taille :
< 1% de l’ADN cellulaire
10 copies / mitochondrie
Tailles : 16 569 pb
Fonctionnement autonome
légèrement différent de celui du génome nucléaire
Codon STOP
Nucléaire :
Nucléaire : UAA / UGA / UAG
Taille des Ribosomes Eucaryote
Petite et grande sous unité
Eucaryote : 80S = 60S(Grande) + 20S(petite)
Grande —-> ARNr = 5S + 5,8S + 28S
Petite ——-> ARNr = 18S
siARN
Double brin
Origine exogène : viral ou introduit artificiellement
Cible spécifique
miARN
Environ 2 600 types chez l’homme
Simple brin / origine Endogène / 18 a 24 nt / transcrit de 90 a 200 nt
Orientation anti-sens ( 40% ) dans les introns
Control près de 50% des gènes
Se lie à la région 3’ UTR —> répression de la traduction / dégradation
1 seul miARN peut cibler jusqu’à 100 ARNm ou plus
Maturation des miARN
Pri-miARN —> complexe DROSHA —->
pré-miARN ——> enzyme DICER —->
duplex de miARN —-> miARN simple Brin
Complexe RISC
Lnc ARN
Environ 30 000
Taille : >200 nt - 10 000
S’exprime plus faiblement
5 classes :
- sens et anti sens ( dans la portion 3’ et chevauche au moins un exos codant )
- intronique
- divergent ( proximités du promoteur )
- intergénique ( éloigné d’environ 5 000 nucléotides d’un gène codant )
Action Locale en Cis / action distale en trans
Exemple : XIST inactive le chromosome X ( 19kb )
Ploycomb2 maintien l’inactivation du chromosome X
Produits de la dégradation des cytosine
Beta-Alanine
NH3
CO2
Produits de la dégradation des thymine
Acide beta-amino-Isobutyrique
