trafic membranaire intracell Flashcards
voies principales de trafic membranaire intracell
- voie endosomale/dégradation (internalisation)
- voie de sécrétion/biosynthèse
la membrane plasmique est à la fois compartiement … et …
donneur pour endocytose
cible pour sécrétion (exocytose)
ou se produit le trafic membranaire
très dynamique, dans le cyto extrêmement dense
transport intracell se fait via….?
formation et fusion de vésicules
à quoi servent les vésicules
intermédiaires de transport de molécules de chargements (cargo) entre les diff compartiment
comment est contrôlé la spécificité de transport
cells utilisent des étiquettes
exocytose
sécrétion= fusion avec membrane plasmique
endocytose
internalisation (formation de vésicule à partir de la membrane plasmique)
caractéristiques commune entre membrane plasmique et endomembrane
asymétrie
que devient le feuillet à la lumière des vésicules
feuillet externe de la membrane plasmique et vice versa
mécanisme d’internalisation par membrane plasmique
- phagocytose (particules larges)
- macropinocytose (liquide non-spécifique)
- endocytose ( dépendante de la clathrine, de la cacéoline, indep) = non spé, petite taille
phagocytose
le pseudopode est ….?
pseudopode dépendant de l’actine
qu’est ce que le PS (phosphatidylsérine)
signal reconnu par macrophages, induit phago des corps apoptiques
pendant l’apoptose, la PS devient…?
exposée au feuillet ext de la membrane plasmique
macropinocytose
similaire à la phagpcytose mais pas de particule solide
ingestion de fluides avec nutriments (aa)
dépendant de l’actibe
que se passe t-il autour d’une région de membrane activée lors de la macropinocytose
polymérisation de l’actine par phospholipide PIP3
étapes endocytose médiée par récepteurs (dépendant de clathrine)
- recrutement de cathrine et déformation de la membrane
- acission par dynamine (hydrolyse de GTP)
- vésicule mantelée de clathrine
- perte de manteau (hydrolyse ATP)
forme de clathrine dans cytosol
triskèle
comment est formée la vésicule avec clathrine
polymérisation en forme de polyédrale de la clathrine
rôle de la dynamine pour formation de vésicule mantelée
forme oligomères en hélices autour du cou de la vésicule en formation
endocytose médié par cavéoline forme des vésicules…
plus petites qu’avec clathrine
les endosomes
vésicules entourées d’une simple membrane provenant de la membrane plasmique suite à l’endocytose
que se passe t-il lors de la maturation des endosomes
deviennent de plus en plus acide
maturation des endosomes
endosome précoce
endosome de recyclage (tri et recyclage)
transport médié par MT
endosome tardif/CMV (dégradation)
endolysosome
lysosome
transport de choléstérol via lipoprot de basse densité LDL
- endocytose
- perte du manteau
- fusion avec un endosome (+ acidification)
- tri
- transfert au lysosome et dégradation
recyclage: vésicule de transport se détachent
retour des récept de LDL vers membrane plasmique
site de dégradation du système endomembranaire
lysosomes acides et riches en hydrolases
hydrolases acides
enzymes actives seulement à bas pH, donc innactif avant d’arriver dans lysosome
exosomes
vésicules extracells qui proviennent du système endosomale
quand sont libérés les exosomes
quand les MVP se fusionnent avec la membrane plasmique
ou bourgeonne les exosomes
à l’int de l’endosome tardif
sources du matériel que reçoivent les lysosomes
endocytose
phagpcytose
autographie
autogragie
mécanisme qui entoure en membrane des régions de cytoplasme, des aggrégats protéiques, certains organites tels que mitochondries et peroxisomes, permettant leur dégradation via la fusion avec des lysosomes
membrane des autophagosome
membrane double
comment sont formés les autophagosomes
via l’intermédiaire de phagophore qui s’assemblent via le recrutement de pro spécifiques et fusion des vésicules en provenance du RE
étapes de l’autogragie
nucléation
extension
maturation
fusion
Digestion
de quelle façon l’autogragie se produit et dans quel but
constitutive pour maintenir l’homéostasie de la cell
quand est stimulé l’autogragie
en cas de déprivation de nutriments pour promouvoir la survie
peroxysomes
présents dans toutes cells eucaryotes
ressemblent au lysosomes (pas dans le système endo-lysomal)
sphérique, simple membrane
d= 200-1000nm
important pour métabolisme et détoxification
les peroxysomes sont important pour le métabolisme car…?
oxidation d’acides gras
peroxysomes emportant pour detoxification car
prod et dégradation du H2O2 et métabolisme des espèces réactives d’oxygène ROS
rôle des peroxysomes
plus de 50 enzymes
catalase plus abondante ROS
synthèse des acides biliaires (foie)
synthèse des lipides (en plus de RE)
biogenèse des peroxysomes
RE> bourgeonnement
croissance
import protéique (étiquette spécifique)
peroxysome mature
fission/division (dynamine)
croissance
prot transmembranaires de fusion des membranes
SNARE
SNARE de la vésicule
v-SNARE
SNARe de la membrane cible
t-SNARE (target)
de quoi dépend le desassemblage des complexes v-/t- SNARE
hydrolyse d’ATP
nécessaire pour recycler les composants
que doit d’abord faire une vésicule pour se fusionner à une mmebrane
s’attacher et s’appareiller avec membrane cible
GEF
guanine nucleotide exchange factor
GAP
GTPase activating protein
inactive state Rab
Rab + GDP
active state RAB (vesicule trafficking)
Rab + GTP
from inactive to active state Rab
GEF
from active to inactive state Rab
GAP
feuillet ext
PC phosphadidylcholine
SM sphingomyeline
GS: glycosphingolipides
feuilllet int
PI phosphadidylinositol
PE ohosphadidylethanolamine
PS phosphadidylserine
variantes de PI phosphorylés
phosphoinositides
anneau inositol peut être phospho/dephospho sur quelle position et par quoi?
3, 4 et 5
kinases
phosphatase
comment les cells distinguent les compartiments
diff phosphoinositides sont enrichies sur diff membranes
phosphoinositides des macropinosome
PI (3,4,5)P3
lieu de passage des prot nouvellement synthétisée
RER
destination des nouv prot synthétiée au RER
membrane plasmique, export par sécrétion/ou à autres organites comme lysosomes
Réticulum endoplasmique
réseau de citernes/ sac membranaires autour du noyau
REL ou RER (ribosomes)
qu’est ce que fait le RE
fabrique membrane des cells
en quoi est en continuité le RE
enveloppe nucléaire
REL
sans ribosome
réseau de tubules
en continuité avec le RER
roles du REL
synthèse lipidique:
phospholipides, cholésterol, hormones stéroides, parties lipidiques des lipoprot
reservoir de Ca2+ (réticulum sarcoplasmiques dans les muscles)
RER
avec ribosome
réseau de citernes
en continuité avec le REL
role du RER
synthèse protéique
repliement des prot ( pont de disulfure)
controle de qualité
glycosylation
ribosomes
composés de ARN ribosomales et prot
20-30nm
2 sous unités : Grandes (50S) et petit (30S)
essention pour trad des ARNm en prot
comment produire des prot destinées à être sécrétées hors de la cell/insérer dans la memrbane plasmique
séquence signal, signal peptide (étiquette, 23 aa) N-terminal qui dirige le ribosome au RE
ribosomes libres VS RE
libres: prot cystoliques (nucléaires/mito)
RE: prot destinées à être sécrétées ou transmembranaire ou qui fonctionne dans le système endomembranaire
translocation co-traductionnelle au RER
séquence signal amène les ribosomes qui chevauchent l”ARNm en voie de traduction à la surface ext de RE et la prot se forme s’allonge dans la citerne du réticulum à travers un complexe proteique, la translocon. séquence signal est ensuite clibé par peptidase
comment sont insérés les prot transmembranaires dans la bicouche lipidique
via translocon
ou commence la glycoslyation des prot
dans la lumière du RE
classes de glycoprot
N-glycosylation (oses, glucose, liés à un nitrogène de l’asparagine Asn) RE
O-glycosylation (oses, galactose, lié à un oxygène de la sérine/Thr) appareil de golgi
ou commence la N-glycoslyation des prot
lumière du RE avec ajout de glycane préformé.
N des asparagines deviennent glycosylées avec une chaine initiale de 14 sucres dans lla lumière du RER
précurseur de glycane
2x GlcNAc
9x mannoses
3x glucose
contrôle de qualité dans la lumière du RE
chaperon calnexin retient les glycoprot incorrectement repliées. Seules les prot correctement repliées sont permuses de quitter vers appareil de Golgi
si il y a trop de prot mal repliées que se passe t-il
cell augm la transcritpion des gènes chaperons tel que calnexine pour augm la qnt de RE
auto-controle de la taille de RE
recept: IRE1
regulateur de transcription: XBP1
que se passe t-il pour les prot anormalement repliées
retro-transloquées et éliminés via degradation associé au RE (ERAD)
entrée sortie de l’appareil de golgi
entrée: côté RER
sortie: côté membrane plasmique
morpho appareil de golgi
série de citernes/sacs aplaties
citernes cis, medianes, trans
Compartiment intermédiaire RE-golgien (ERGIC)
cluster tubulo-vesiculaire
réseau cis-golgien
RE
enveloppe nucléaire
COPII
transport antérograde
COPI
transport de récupération (retrograde)
retention au RE via quoi
transport retrograde COPI
role de l’appareil de Golgi
finition (maturation) des prot produites dans le RER par glycosylation (ajout d’oses pour activ et stabilisation des prot)
etiquettage des prot pour marquer destination finale
tirage, concentration et emballage des prot dans vesicules ou granules de secretions
vesicules/granules vont être acheminés à leur destination (ex memb plasmique) par transport le long des MT grâce à moteurs (dyenine, kinésine)
sécrétion constitutive
fait pas toutes les cells
des prot solubles sécrétées en permanence
aussi pour l’homeostasie (maintient) de la membrane plasmique (Na+/K+ ATPase)
sécrétion régulée
uniquement dans les cells sécrétoires suite à un signal extracell (cell beta qui sécrète insuline suite au glucose)
cells spécialisés comme adipocytes qui augm le nb de transporteurs GLUT4 à leur membrane plasmique en reponse à insuline
TGN fait le tri pour séparer les composantes des diff types de cells sécrétoires
type de sécrétion bouton synaptique
régulée
étapes de la sécrétion du bouton synaptique
- livraison du contenu des vésicules synaptique à la membrane plasmique
- endocytose de composantes des vésicules synaptique pour former nouv vesicules synaptiques
- endocytose de composantes des vesicules synaptiques
- bourgeonnement de vesicules depuis les endosomes
- chargement de NT dans les vesicules synaptique
- secretion de NT par exocytose en rep à un potentiel d’action
transport endosomale dans les cells polarisés
transcytose
endocytose de la membrane plasmique apicale, suivi de transport et fustion avec la membrane plasmique basolatéral.