Traduction et repliement des protéines Flashcards
C’est quoi un codon et pour quoi code-t-il?
3 bases
1 acide aminé
Le premier codon AUG sur un cadre de lecture code pour quoi
l’initiation
AUG code pour quel acide aminé
Méthionine
Quels 3 codons signalent un STOP
UAA
UAG
UGA
C’est quoi un cadre de lecture
La région codante d’un ARNm
Se situe entre le codon initiatieur (AUG) et le codon STOP
Se situe entre la 5’ UTR et la 3’ UTR
Fonction de la coiffe
- Reconnaissance par le ribosome
- Efficacité de la traduction
- Stabilité de l’ARNm
Fonction de la queue PolyA
- Efficacité de la traduction
- Stabilité de l’ARNm
Fonction de la 5’ UTR
- Efficacité de la traduction
Fonction de la 3’ UTR
- Efficacité de la traduction
- Stabilité de l’ARNm
Qu’est ce qui détermine le cadre de lecture ouvert
le premier codon AUG
combien de cadres de lectures possibles pour une molécule d’ARNm
3
Possibles mutations liés à la synthèse protéique
Silencieuse (Diff codon, même aa)
Faux-sens (Diff aa)
Non- sens (Code pour un stop)
Continuation
Insertion
Déletion
Rôle de l’ARNt
Associe les acides aminés aux codons
C’est quoi un anticodon
la partie de l’ARNt qui va se poser sur le codon
Redondance du code génétique implique quoi
que certains acides aminés ont plusieurs ARNt
Fonction de l’enzyme aminoacyl-ARNt-synthétase
reconnait et couple un aa à son ARNt spécifique
Processus appelé “Chargement”
Composantes du ribosome
Grande sous-unité:
- 3 ARN
bcp de prot
Petite sous-unité:
- 1 ARN
bcp de prot
Structure du ribosome
1 site de liaison à l’ARNm
3 sites de liaison aux ARNt
- Site A (site accepteur)
- Site P
- Site E (exit)
Phases majeures de la traduction
- Initiation
- Élongation
- Terminaison
Étapes de l’élongation
1) Un ARNt chargé se lie au site A du ribosome
2) L’aa attaché à l’ARNt au site P se détache de son ARNt et forme une lie par liaison peptique avec l’aa de l’ARNt au site A
3) Un déplacement de la grande sous-unité par rapport à la petite déplace les 2 ARNt ds A et P vers les site P et E respectivement
4) Petite sous-unité se déplace d’exactement 3 nucléotides sur la molécule d’ARNm pour se remettre en face de la grande sous-unité
Site A est libre pour accueillir le prochain ARNt chargé
Retour à l’étape 1, l’ARNt ds le site E est éjecté
Processus de la terminaison
Qd le ribosome arrive à un codon stop, aucun ARNt correspond à ce codon
Un facteur de libération (Release factor) se lie au site du ribosome ou ya le codon stop et met fin à la traduction
Polypeptide formé se détache et ribosome se dissocie en ses 2 sous-unités
un polysome c’est quoi, fonction
une série de ribosomes qui traduisent le même ARNm
Fonction: + grande efficacité de traduction
Exemples de maladies causées par le mauvais repliement de prot
- Anémie falciforme (génétique)
- les Cataractes (avec l’âge)
- Tremblante du mouton
- Fibrose kystique
- Maladie de la vache folle
- Maladie de Huntington
- Alzheimer
Cristallines
prot structurales solubles ds l’eau qui se trouvent la lentille et la cornée qui permettent la transparence
Alpha-Cristallines
chaperone moléculaire qui empêche la précipitation des prot dénaturées et d’augmenter la tolérance de l’oeil au stress
Cause des cataractes
avec l’âge y’a un déclin des fonctions de l’alpha-cristalline ce qui va causer des cataractes par précipitation des protéines dans la lentille
Étapes de repliement des prot
Repliement des protéines débute pendant leur synthèse
1) Formation des structures secondaires (hélices alpha, feuillets bêta)
2) Formation des domaines
3) Ajustement des domaines et repliement final
chaperones moléculaires
Prots qui aident les nouvelles prot à acquérir leur conformation correctes
Mode d’action d’un chaperone moléculaire
Prévient l’agrégation en s’attachant à des parties prônes à s’agréger comme les régions hydrophobes
IMPORTANT:
consommation d’énergie par les chaperones moléculaires
Fixation des chaperones sur la prot en synthèse: NE consomme PAS d’énergie
Délogement des chaperones de la prot:
CONSOMME de l’énergie
Qu’est ce qui se passe avec les prot mal repliées?
Sont marquées pour dégradation par l’ajout d’une étiquette Ubiquitine
Ce marquage est fait par le Système Ubiquitine-Protéasome (UPS)
Étapes de marquage par l’Ubiquitine
1) Activation de l’ubiquitine
E1 (ubiquitin-activating enzyme) se lie à une ubiquitine
2) E1 transfert l’ubiquitine à E2 (ubiquitin-conjugating enzyme)
3) E2 se lie à E3 (ubiquitin-ligaze enzyme). E3 reconnait la prot à être dégradée. L’ubiquitine se lie à la prot
4) La prot (qui est mtn marquée par l’ubiquitine) est libérée et sera reconnue par un protéasome pour être dégradée
Protéasome
machine à dégrader des prot qui fonctionne à l’ATP
Tube formé surtout de protéases
Dégradation par le protéasome
Prot à dégrader sont reconnues grâce à leur étiquette ubiquitine. (Ub seront clivés avant que la prot rentre ds le tube)
Protéasome hydrolyse ensuite prot en petits peptides qui sont relâchés et recyclés
Huntington’s disease
maladie génétique neurodégénerative
Son gène code pour prot appellée Huntingtine qui a pour fonction de réguler fonctions cellulaires comme trafic vésiculaire et sécrétion de facteurs neutrophiques
Chez les patients atteints, Huntingtine agrège et forme des fibres amyloïdes et la perte de fonction de cette prot entraine la mort de neurones par apoptose
Cause du Huntington’s disease au niv moléculaire
Expansion des triplets CAG qui codent pour l’acide aminé Glutamine
Ceci va causer une séquence poly-glutamine (Poly-Q) ce qui va provoquer agrégation de la Huntingtine
Maladie d’Alzheimer
Diminution de l’efficacité de repliement et de dégradation de prot avec l’âge
La non dégradation d’une prot (qu’on ne connait pas trop mais qui est associée à la membrane d’un neurone)
Formation d’agrégats de prot sous forme de plaques amyloïdes détruisant les neurones environnant
Résultat: perte de fonction des neurones après leur mort
définition d’un Prion
Protéine qui peut se trouver dans deux ou plus de conformations, dont une est autoréplicative
Exemple de maladie causée par un prion
maladie de Creutzfeldt-Jakob
Trois grandes catégories de la maladie de Creutzfeldt-Jakob
- Sporadique (spontané)
- Génétique (héréditaire)
- Transmis (contagieux)
Maladie de Creutzfeldt-Jakob sporadique
Apparait sans avertissement ou explication
Touche les personnes âgées
Prion commence à se former ds une ou plusieurs cellules du cerveau puis se propage au reste du cerveau
Maladie de Creutzfeldt-Jakob génétique
dus à une mutation génétique
Maladie de Creutzfeldt-Jakob transmise
par accident pendant procédure médicale impliquant tissus humains
ingestion de viande de vache folle
Maladies de prions comment ca marche
1 prot va changer de conformation (hyper rare) et quand d’autres prot vont rentrer en contact avec elle, elles aussi vont changer de conformation et vont s’empiler
Résultat: Apoptose de neurones
