Traduction et repliement des protéines Flashcards

1
Q

C’est quoi un codon et pour quoi code-t-il?

A

3 bases

1 acide aminé

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2
Q

Le premier codon AUG sur un cadre de lecture code pour quoi

A

l’initiation

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3
Q

AUG code pour quel acide aminé

A

Méthionine

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4
Q

Quels 3 codons signalent un STOP

A

UAA
UAG
UGA

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5
Q

C’est quoi un cadre de lecture

A

La région codante d’un ARNm
Se situe entre le codon initiatieur (AUG) et le codon STOP
Se situe entre la 5’ UTR et la 3’ UTR

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6
Q

Fonction de la coiffe

A
  • Reconnaissance par le ribosome
  • Efficacité de la traduction
  • Stabilité de l’ARNm
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7
Q

Fonction de la queue PolyA

A
  • Efficacité de la traduction
  • Stabilité de l’ARNm
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8
Q

Fonction de la 5’ UTR

A
  • Efficacité de la traduction
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9
Q

Fonction de la 3’ UTR

A
  • Efficacité de la traduction
  • Stabilité de l’ARNm
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10
Q

Qu’est ce qui détermine le cadre de lecture ouvert

A

le premier codon AUG

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11
Q

combien de cadres de lectures possibles pour une molécule d’ARNm

A

3

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12
Q

Possibles mutations liés à la synthèse protéique

A

Silencieuse (Diff codon, même aa)
Faux-sens (Diff aa)
Non- sens (Code pour un stop)
Continuation
Insertion
Déletion

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13
Q

Rôle de l’ARNt

A

Associe les acides aminés aux codons

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14
Q

C’est quoi un anticodon

A

la partie de l’ARNt qui va se poser sur le codon

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15
Q

Redondance du code génétique implique quoi

A

que certains acides aminés ont plusieurs ARNt

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16
Q

Fonction de l’enzyme aminoacyl-ARNt-synthétase

A

reconnait et couple un aa à son ARNt spécifique
Processus appelé “Chargement”

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17
Q

Composantes du ribosome

A

Grande sous-unité:
- 3 ARN
bcp de prot

Petite sous-unité:
- 1 ARN
bcp de prot

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18
Q

Structure du ribosome

A

1 site de liaison à l’ARNm

3 sites de liaison aux ARNt
- Site A (site accepteur)
- Site P
- Site E (exit)

19
Q

Phases majeures de la traduction

A
  • Initiation
  • Élongation
  • Terminaison
20
Q

Étapes de l’élongation

A

1) Un ARNt chargé se lie au site A du ribosome

2) L’aa attaché à l’ARNt au site P se détache de son ARNt et forme une lie par liaison peptique avec l’aa de l’ARNt au site A

3) Un déplacement de la grande sous-unité par rapport à la petite déplace les 2 ARNt ds A et P vers les site P et E respectivement

4) Petite sous-unité se déplace d’exactement 3 nucléotides sur la molécule d’ARNm pour se remettre en face de la grande sous-unité
Site A est libre pour accueillir le prochain ARNt chargé

Retour à l’étape 1, l’ARNt ds le site E est éjecté

21
Q

Processus de la terminaison

A

Qd le ribosome arrive à un codon stop, aucun ARNt correspond à ce codon

Un facteur de libération (Release factor) se lie au site du ribosome ou ya le codon stop et met fin à la traduction

Polypeptide formé se détache et ribosome se dissocie en ses 2 sous-unités

22
Q

un polysome c’est quoi, fonction

A

une série de ribosomes qui traduisent le même ARNm

Fonction: + grande efficacité de traduction

23
Q

Exemples de maladies causées par le mauvais repliement de prot

A
  • Anémie falciforme (génétique)
  • les Cataractes (avec l’âge)
  • Tremblante du mouton
  • Fibrose kystique
  • Maladie de la vache folle
  • Maladie de Huntington
  • Alzheimer
24
Q

Cristallines

A

prot structurales solubles ds l’eau qui se trouvent la lentille et la cornée qui permettent la transparence

25
Alpha-Cristallines
chaperone moléculaire qui empêche la précipitation des prot dénaturées et d'augmenter la tolérance de l'oeil au stress
26
Cause des cataractes
avec l'âge y'a un déclin des fonctions de l'alpha-cristalline ce qui va causer des cataractes par précipitation des protéines dans la lentille
27
Étapes de repliement des prot
Repliement des protéines débute pendant leur synthèse 1) Formation des structures secondaires (hélices alpha, feuillets bêta) 2) Formation des domaines 3) Ajustement des domaines et repliement final
28
chaperones moléculaires
Prots qui aident les nouvelles prot à acquérir leur conformation correctes
29
Mode d'action d'un chaperone moléculaire
Prévient l'agrégation en s'attachant à des parties prônes à s'agréger comme les régions hydrophobes
30
IMPORTANT: consommation d'énergie par les chaperones moléculaires
Fixation des chaperones sur la prot en synthèse: NE consomme PAS d'énergie Délogement des chaperones de la prot: CONSOMME de l'énergie
31
Qu'est ce qui se passe avec les prot mal repliées?
Sont marquées pour dégradation par l'ajout d'une étiquette Ubiquitine Ce marquage est fait par le Système Ubiquitine-Protéasome (UPS)
32
Étapes de marquage par l'Ubiquitine
1) Activation de l'ubiquitine E1 (ubiquitin-activating enzyme) se lie à une ubiquitine 2) E1 transfert l'ubiquitine à E2 (ubiquitin-conjugating enzyme) 3) E2 se lie à E3 (ubiquitin-ligaze enzyme). E3 reconnait la prot à être dégradée. L'ubiquitine se lie à la prot 4) La prot (qui est mtn marquée par l'ubiquitine) est libérée et sera reconnue par un protéasome pour être dégradée
33
Protéasome
machine à dégrader des prot qui fonctionne à l'ATP Tube formé surtout de protéases
34
Dégradation par le protéasome
Prot à dégrader sont reconnues grâce à leur étiquette ubiquitine. (Ub seront clivés avant que la prot rentre ds le tube) Protéasome hydrolyse ensuite prot en petits peptides qui sont relâchés et recyclés
35
Huntington's disease
maladie génétique neurodégénerative Son gène code pour prot appellée Huntingtine qui a pour fonction de réguler fonctions cellulaires comme trafic vésiculaire et sécrétion de facteurs neutrophiques Chez les patients atteints, Huntingtine agrège et forme des fibres amyloïdes et la perte de fonction de cette prot entraine la mort de neurones par apoptose
36
Cause du Huntington's disease au niv moléculaire
Expansion des triplets CAG qui codent pour l'acide aminé Glutamine Ceci va causer une séquence poly-glutamine (Poly-Q) ce qui va provoquer agrégation de la Huntingtine
37
Maladie d'Alzheimer
Diminution de l'efficacité de repliement et de dégradation de prot avec l'âge La non dégradation d'une prot (qu'on ne connait pas trop mais qui est associée à la membrane d'un neurone) Formation d'agrégats de prot sous forme de plaques amyloïdes détruisant les neurones environnant Résultat: perte de fonction des neurones après leur mort
38
définition d'un Prion
Protéine qui peut se trouver dans deux ou plus de conformations, dont une est autoréplicative
39
Exemple de maladie causée par un prion
maladie de Creutzfeldt-Jakob
40
Trois grandes catégories de la maladie de Creutzfeldt-Jakob
- Sporadique (spontané) - Génétique (héréditaire) - Transmis (contagieux)
41
Maladie de Creutzfeldt-Jakob sporadique
Apparait sans avertissement ou explication Touche les personnes âgées Prion commence à se former ds une ou plusieurs cellules du cerveau puis se propage au reste du cerveau
42
Maladie de Creutzfeldt-Jakob génétique
dus à une mutation génétique
43
Maladie de Creutzfeldt-Jakob transmise
par accident pendant procédure médicale impliquant tissus humains ingestion de viande de vache folle
44
Maladies de prions comment ca marche
1 prot va changer de conformation (hyper rare) et quand d'autres prot vont rentrer en contact avec elle, elles aussi vont changer de conformation et vont s'empiler Résultat: Apoptose de neurones