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Biochimie 1531 > Traduction > Flashcards

Traduction Flashcards

1
Q

Le code génétique se compose de codons. Qu’est-ce qu’un codon?

A

Mot de 3 lettres rapportant à des triades nucléotidiques d’ARNm ou d’ADN d’un gène.

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2
Q

Vrai ou faux? Les codons sont toujours traduits à la suite de l’un de l’autre
dans le sens 3’à 5’.

A

Faux. Les codons sont toujours traduits à la suite de l’un de l’autre
dans le sens 5’à 3’.

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3
Q

Qu’est-ce qu’un cadre de lecture?

A

Le point de départ potentiel d’une suite de codons (mots de 3 lettres).

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4
Q

Sur quoi repose la traduction fidèle du code génétique?

A

La traduction fidèle du code génétique repose
donc sur la fixation du cadre de lecture approprié à la traduction
d’une région donnée de la séquence nucléotidique.

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5
Q

Il existe 3 cadres de lecture pour un ARNm. Quel sont les 3 cadres pour l’ARNm suivant:
…AUGCAUGCAUGC…

A

Premier cadre de lecture : …AUG/CAU/GCA/UGC…
Deuxième cadre de lecture : …AU/GCA/UGC/AUG/C…
Troisième cadre de lecture : …A/UGC/AUG/CAU/GC…

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6
Q

Qu’est-ce qu’un cadre de lecture ouvert ?

A

La partie d’un cadre de lecture avec le potentiel
d’encoder une protéine. C’est une série de codons sans codon de
terminaison. C’est ce qu’on cherche.

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7
Q

Quel est la codon d’initiation?

A

AUG

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8
Q

Quelles sont les caractéristiques principales du code génétique? (3)

A

1- Tout codon ne
prescrit jamais qu’une seule espèce d’acide aminé.
2- Pour la plupart des acides aminés, il existe plusieurs codons. Les divers codons spécifiant un acide aminé donné sont des codons synonymes.
EXCEPTIONS: La méthionine (AUG) et
le tryptophane (UGG) sont les seuls acides aminés spécifiés par
un seul codon.
3-Les 3 autres codons (UAA, UGA et UAG) sont des codons de terminaison ou codons-stops.

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9
Q

Vrai ou faux? La dégénérescence
du code génétique atténue l’effet des mutations parce que le changement d’une seule base forme souvent un codon qui spécifie encore le même acide aminé.

A

Vrai.

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10
Q

Qu’est-ce qu’un décalage de lecture?

A

Une addition ou perte d’un ou deux nucléotides.

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11
Q

Quelles sont les quatre types de mutations génétiques à étudier?

A

1- Mutation silencieuse :
Ex : GGC (Gly) → GGA (Gly)

2- Mutation faux-sens
Ex: CGT (Arg) → CAU (His)

3- Mutation non-sens
Ex: TAT (Tyr) → UAA (Stop)

4- Mutation continuation
Ex: TAA (Stop) → UUA (Leu)

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12
Q

Le rôle des ARN de transfert est qu’ils servent d’interprètes à la lecture du code génétique, elles sont les médiatrices-clés entre la séquence nucléotidique de l’ARNm et la séquence d’acides aminés polypeptidique. Qu’est-ce que ça implique?

A

Ce rôle exige que la cellule dispose d’au moins 20 espèces différentes d’ARNt (un pour chaque acide aminé) et que chacun de ces ARNt puisse reconnaître au moins un codon de l’ARNm.

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13
Q

La structure des ARNt comporte combien de résidus nucléotidiques?

A

Entre 73-95 résidus nucléotidiques.

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14
Q

Chez l’ARNt, comment se forme la tige acceptrice (ou tige de l’acide aminé)?

A

Les bases de l’extrémité 5’ s’apparient à celle de la région bordant l’extrémité 3’ pour former la tige acceptrice.

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15
Q

Deux lobes dans l’ARNt sont nommés respectivement lobe tψc et le lobe D. Qu’est-ce qui les différencie?

A

Lobe tψc: porte une thymidine (T) suivie d’une pseudo-uridine (ψ) et d’une cytidine (C).

Lobe D: contient des résidus dihydrouridine.

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16
Q

Qu’est-ce que le lobe anticodon?

A

Boucle située à l’opposée de la tige acceptrice porte l’anticodon, séquence de
3 bases qui se fixe de façon complémentaire à un codon de l’ARNm. Boucle qui porte l’anticodon.

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17
Q

Appariement entre anticodon et codon se fait comme appariement des bases. Toutefois, on peut observer quelques fois des variant tolérants d’autres types d’appariements en position 5’ de l’anticodon. Nommez un exemple.

A

G-U.

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18
Q

Qu’est-ce que wobble?

A

La position 5’ de l’anticodon possède une flexibilité de conformation à cause de l’appariement à choix multiple.

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19
Q

Comment se nomme la position 5’ de l’anticodon dans un cas wobble?

A

Position de flottement.

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20
Q

Ainsi dans plusieurs
molécules d’ARNt, la
adenine en position 5’ de
l’anticodon a été désaminée pour donner une inosine. Quel impact cela apporte-t-il dans un cas où l’anticodon est IGC?

A

L’inosine peut partager des
liaisons hydrogènes aussi
bien avec l’adénine qu’avec la cytosine ou l’uridine. L’anticodon peut se lié alors à trois codons différents : GCA, GCC et GCU. Ces trois codons spécifie l’alanine.

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21
Q

Qu’est-ce que des ARNt isoaccepteurs?

A

Diverses molécules d’ARNt qui portent

toutes le même acide aminé. (Il faut souvent plusieurs molécules d’ARNt pour reconnaître tous les codons synonymes.)

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22
Q

Pendant la traduction
A) L’ADN est copié en ARNm complémentaire a l’ADN.
B) L’ADN est copié en ARNt.
C) L’ARNr est copié en séquence polypeptidique complémentaire à l’ARNr.
D) L’ARNt est copié à partir de l’ARNr.
E) Une séquence polypeptidique est fait selon la séquence nucléotidique de l’ARNm.

A

E)

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23
Q

Quel énoncé décrit le mieux un cadre de lecture ouvert
A) Une séquence qui contient un codon d’initiation et un codon de terminaison dans n’importe quel ordre.
B) Une séquence qui contient un codon d’initiation, plusieurs codons et après un codon de terminaison.
C) Une séquence qui contient plusieurs codons d’initiation.
D) Une séquence sans codon de terminaison.

A

D)

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24
Q

Comment se nomment les enzymes qui catalysent la réaction d’aminoacylation de l’ARNt?

A

Des aminoacyl-ARNt synthétases

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25
Q

Combien existe-t-il d’aminoacyl-ARNt synthétases distinctes?

A

Il existe 20 aminoacyl-ARNt synthétases distinctes.

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26
Q

Vrai ou faux? Une synthétase donnée peut reconnaître plusieurs ARNt isoaccepteurs.

A

Vrai.

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27
Q

Quelle est l’équation décrivant l’aminoacylation de l’ARNt?

A

aa+ ARNt+ATP→ Aminoacyl-ARNt + AMP + PPi

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28
Q

Il y a interactions entre 3 éléments lors de

l’aminoacylation de l’ARNt? Lesquels?

A

Lors de l’aminoacylation de l’ARNt, il y a des interactions entre :
1- L’anticodon
2- Face concave e la molécule ARNt
3- Site de l’aminoacylation

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29
Q

Associez les étapes de la synthèse protéique avec la bonne définition et dans le bon ordre.
1) Dès que la protéine est complétée, l’appareil de traduction se désagrège, au cours d’une étape de
terminaison distincte impliquant la dissociation des ribosomes d’avec l’ARNm.
2) Pendant l’allongement de la chaîne polypeptidique, les ribosomes et leurs composants associés progressent de 5’ en 3’ sur la matrice d’ARNm, en
synthétisant la protéine à partir de son extrémité aminée jusqu’à son extrémité carboxyle.
3) Consiste en l’assemblage du complexe de traduction autour du premier codon de l’ARNm.

A) L’initiation
B) La terminaison
C) L’allongement ou élongation.

A

A) et 3)
C) et 2)
B) et 1)

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30
Q

Qu’est-ce qui traduit les protéines?

A

Les ribosomes.

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31
Q

De longues molécules d’ARNm peuvent être traduites simultanément. Par quoi est effectuée cette traduction?

A

Polyribosome ou polysome.

32
Q

Quels sont les deux sites de fixation de l’ARNt au ribosome et que contient chacun de ces sites? (2)

A

1- Site P ou site peptidyle : contient une molécule d’aminoacyl-ARNt qui porte la chaîne polypeptidique naissante..
2- Site A ou site aminoacyle : contient l’autre molécule d’aminoacyl-ARNt.

33
Q

La première étape de la traduction de l’ARN est l’initiation. Cette étape constitue l’assemblage d’un complexe d’initiation au départ du cadre de lecture. Que comprend le complexe d’initiation? (3)

A

1- ARNm servant de matrice à la traduction.
2- ARNt initiateur particulier.
3- Plusieurs protéines auxiliaires nommées facteurs d’initiation.

34
Q

Quel est le rôle de l’initiation de la mécanisme de la traduction?

A

Imposer que le bon codon d’initiation et le bon cadre de lecture soient choisis avant que la traduction ne démarre.

35
Q

Quelle est la particularité d’un ARNt initiateur ?

A

Il ne reconnait que le codon AUD d’initiation.

36
Q

Comment se nomme l’ARNt initiateur chez les eubactéries?

A

ARNtf^Met.

37
Q

Quelles sont les 4 étapes de l’initiation de la traduction ?

A

1- Dissociation
2- Assemblage du complexe 30S ARNmf^Met- ARNt^Met -IF-2-GTP et interaction avec SD. (Complexe 30S)
3- La sous-unité 50S s’associe (Complexe 70S).
4- Ribosome est prêt à se fixer à un deuxième aa-ARNt.

38
Q

Le complexe d’initiation ne se forme pas spontanément, mais dépend de l’intervention de plusieurs facteurs
d’initiation. On en connaît 3 chez les Procaryotes. Nommez-les et dites leur fonction respective.

A

1- IF-1 : s’attache à l’élément 30S et provoque la dissociation entre la grande et la petite sous-unité.
2- IF-2 : une protéine de liaison au GTP. Lie le f-MetARNt^Met initiateur et aide sa fixation a la petite sous-unité.
3- IF-3 : fixe l’ARNm sur le ribosome. La fixation de IF-3 à la sous-unité 30S a pour conséquence d’empêcher l’association des deux sous-unités du ribosome. IF-3 empêche l’association prématurée des sous-unité 30S et 50S en ribosome 70S.

39
Q

Qu’est-ce que la séquence Shine-Dalgarno?

A

Une région riche en purines (placée juste en amont du codon initiateur de l’ARNm) et qui est donc complémentaire d’un segment riche en pyrimidine du bout 3’ de la molécule d’ARNr 16S.

40
Q

Vrai ou faux? Les complexes d’initiation ne

s’assemblent qu’au niveau des codons internes de méthionine.

A

Faux. Les complexes d’initiation ne s’assemblent qu’au niveau des codons INITIATEURS , jamais au niveau des codons internes de méthionine.

41
Q

Quelle est la différence entre l’initiation de la traduction chez les Eucaryotes VS chez les Procaryotes ?

A

Contrairement à ceux des Procaryotes, les ARNm des Eucaryotes sont dépourvus de séquence de Shine-Delgarno.

42
Q

Qu’est-ce que la séquence de Kozak consensus?

A

Pu-Py-Py-A-U-G-Pu (ACCAUGG)

43
Q

Comment s’effectue l’initiation de la traduction chez les eucaryotes?

A

La sous-unité ribosomique 40S se fixe à l’extrémité 5’ du message et parcourt l’ARNm de 5’ en 3’ jusqu’à ce qu’elle rencontre un codon initiateur (Balayage).

44
Q 
Les ribosomes sont fait en:
A) ADN et protéines
B) Protéines et ARN
C) ARN, ADN et protéines
D) ARN et lipides
A

B)

45
Q

Le ribosome procaryote 70S est fait des sous-unités :
A) 50S et 20S
B) 40S et 30S
C) 50s et 30S

A

C)

46
Q

L’ARNt initiateur chez les bactéries:
A) Chargé avec Met et
B) Chargé avec fMet
C) Chargé avec Met et modifié après en fMet

A

C)

47
Q

Dans l’allongement de la chaîne (élongation) de la traduction, chaque acide aminé passe par un microcycle. Quelles sont les 3 étapes de ce microcycle?

A

1- La mise en place correcte de l’aminoacyl-ARNt au site A du ribosome.
2- La formation de la liaison peptidique.
3- La translocation, c’est-à-dire l’étape qui fait avancer le ribosome d’un codon sur l’ARNm.

48
Q

Vrai ou faux? L’appareil de traduction fonctionne très rapidement. Ainsi, beaucoup d’acides aminés sont produits en peu de temps.

A

Faux. L’appareil de traduction fonctionne assez lentement, synthèse de 18 acides
aminés par seconde (bactéries).

49
Q

Comment nomme-t-on la chaîne polypeptidique naissante?

A

Le peptidyl-ARNt.

50
Q

Chez les bactéries, l’allongement est catalysée par un facteur d’élongation. comment se nomme-t-il?

A

EF-Tu.

51
Q

Vrai ou faux? EF-Tu est un monomère protéique muni d’un site de fixation pour le GTP.

A

Vrai.

52
Q

Vri ou faux? Dans l’étape de la formation de la liaison peptidique dans l’allongement de la chaîne, il n’est pas possible de former
une liaison peptidique avant l’hydrolyse du GTP par EF-Tu.

A

Vrai.

53
Q

La translocation est le troisième étape du microcycle d’allongement de la chaîne. Que se passe-t-il à cette étape?

A

1- Une fois la liaison peptidique formée,
EF-G catalyse la translocation : le
ribosome glisse en direction 5’-3’, 3
nucléotides (un codon).
2- Ce glissement fait passer le peptidyl-
ARNt du site A au site P.

Processus nécessitant l’hydrolyse de GTP.

54
Q

Qu’est-ce que le site E ?

A

L’ARNt déchargé passe du site P au site E pour être ensuite libéré.

55
Q 
Au début du microcycle, le site A est vacant et le site P est occupé par l'ARNt initiateur chargé de : 
A) Protéines
B) Méthyl
C) Methionine
D) GTP
A

C)

56
Q

Qu’est-ce qui assure l’irréversibilité des réactions de l’élongation?

A

L’hydrolyse du GTP pendant l’élongation..

57
Q

Chez E.coli, 3 facteurs de terminaison (relargage) prennent part à la terminaison de la synthèse protéique. Lesquels?

A

RF-1, Rf-2 et Rf-3.

58
Q

Après formation
de la dernière liaison peptidique d’une chaîne, le peptidyl-ARNt porteur de la nouvelle chaîne passe, comme auparavant, du site A au site P. Lors de cette translocation, qu’est-ce qui arrive vis-à-vis le site A ?

A

L’un des trois codons de terminaisons (UGA, UAG, UAA).

59
Q

Le complexe ternaire EF-Tu-GTP aa-ARNt comprend qu’un complexe EF-Tu-GTP reconnaît des structures tertiaires spécifiques d’ARNt. Ce complexe se fixe fermement à toutes les molécules d’aminoacyl-ARNt à l’exception d’une molécule. Laquelle?

A

Le complexe EF-Tu-GTP se fixe fermement à toutes les molécules d’aminoacyl-ARNt pour former le complexe ternaire EF-Tu-GTP aa-ARNt sauf fMét-ARNti^Mét, ayant une structure très différente des autres aminoacyl-ARNt.

60
Q

Durant la terminaison de la traduction, les codons de terminaison sont reconnus par des facteurs de relargage. Associez le bon facteur de relargage aux bons codons de terminaison.

1) UAA
2) UAG
3) UGA
4) Aucune de ces réponses

A) RF-1
B) RF-2
C) RF-3

A

A) reconnaît 1) et 2)
B) reconnaît 1) et 3)
C) et 4)

61
Q

Si le facteur de relargage RF-3 ne reconnaît par des codons, quel est son rôle dans la terminaison de la traduction?

A

Le facteur RF-3 lié à un GTP et rend plus efficace l’action des facteurs RF-1 et RF-2.

62
Q

Vrai ou faux? La terminaison
s’accompagne d’une
hydrolyse d’ATP et du départ des facteurs de relargage du ribosome.
À ce stade, les sous-unités du ribosome se détachent de l’ARNm
et se séparent.

A

Faux. La terminaison
s’accompagne d’une
hydrolyse de GTP (et non d’ATP) et du départ des facteurs de relargage du ribosome.

63
Q

Combien il y a d’ATP qui sont consommé pour chaque liaison peptidique?

A

4 ATP consommés pour chaque liaison peptidiques :
2 ATP pour amonoacylation de l’ARNt
1 ATP pour la formation de la liaison peptidique.
1 ATP pour la catalysation de la translocation par la facteur EF-G.

64
Q

Quel elle la fonction du GTP dans l’initiation de la traduction?
A) Liaison de l’ARNm au ribosome.
B) Liaison de l’ARNt initiateur par IF2.
C) Donne l’énergie pour dissocier le complexe ternaire après la formation de la liaison codon-anticodon.

A

C)

65
Q

Le rôle de EF-Tu c’est :
A) Réplication de l’ADN
B) La translocation du ribosomes pendant l’élongation
C) Amener les aminoacyl-ARNt aux ribosomes pendant l’élongation
D) Terminaison de la traduction

A

C)

66
Q

Récapitulation. Quelle sont les facteurs d’initiation chez les procaryotes et qu’elle sont les rôles respectifs? (3)

A

1- IF-1 :
2- IF-2 :
3- IF-3 :

67
Q

Récapitulation. Quelle sont les facteurs d’élongation chez les procaryotes et qu’elle sont les rôles respectifs? (3)

A

1- EF-Tu :
2- EF-Ts :
3- EF-G

68
Q

Récapitulation. Quelle sont les facteurs de terminaison chez les procaryotes et qu’elle sont les rôles respectifs? (3)

A

1- RF-1 :
2- RF-2 :
3- RF-3 :

69
Q

Récapitulation. Quelle sont les facteurs d’initiation chez les procaryotes et qu’elle sont les rôles respectifs? (3)

A

1- IF-1 : s’attache à l’élément 30S et provoque la dissociation
entre la grande et la petite sous-unité.

2- IF-2 :Protéine de liaison au GTP. Lie le f-MetARNt^Met initiateur et aide sa fixation à la petite sous-unité.

3- IF-3 : fixe l’ARNm sur le ribosome. La fixation de IF-3 à la sous-unité 30S a : empêcher l’association des deux sous-unités du ribosome. IF-3 empêche
l’association prématurée des sous-unités 30S et 50S en ribosome 70S.

70
Q

Récapitulation. Quelle sont les facteurs de terminaison chez les procaryotes et qu’elle sont les rôles respectifs? (3)

A

1- RF-1 :

2- RF-2 :

3- RF-3 :

71
Q

Associez les antibiotiques suivants à le mode d’action respectif.
1)
2) Empêche la liaison codon - anticodon.
3)
4)
5)

A) Chloramphenicol
B) Erythromycine
C) Tetracycline
D) Streptomycine
E)
A

A) et
B) et
C) et 2)
D) et

72
Q

Récapitulation. Quelle sont les facteurs d’initiation chez les procaryotes et qu’elle sont les rôles respectifs? (3)

A

1- IF-1 : s’attache à l’élément 30S et provoque la dissociation
entre la grande et la petite sous-unité. Assite la liaison de IF-3.

2- IF-2 :Protéine de liaison au GTP. Lie le f-MetARNt^Met initiateur et aide sa fixation à la petite sous-unité.

3- IF-3 : fixe l’ARNm sur le ribosome. La fixation de IF-3 à la sous-unité 30S a : empêcher l’association des deux sous-unités du ribosome. IF-3 empêche
l’association prématurée des sous-unités 30S et 50S en ribosome 70S.

73
Q

Récapitulation. Quelle sont les facteurs d’élongation chez les procaryotes et qu’elle sont les rôles respectifs? (3)

A

1- EF-Tu : Catalyse le placement de l’aminocayl-ARNt correct au site A du complexe de la traduction en liant à un GTP.

2- EF-Ts : Aide EF-Tu à échanger GDP pour GTP.

3- EF-G : Catalyse la translocation en liant un GTP au ribosome.

74
Q

Récapitulation. Quelle sont les facteurs de terminaison chez les procaryotes et qu’elle sont les rôles respectifs? (3)

A

1- RF-1 : Reconnaît les codons de terminaison UAA et UAG.

2- RF-2 : Reconnaît les codons de terminaison UAA et UGA.

3- RF-3 : Se li à un GTP pour rendre plus efficace l’action de RF-1 et RF-2.

75
Q

Les antibiotiques peuvent jouer un rôle dans la compréhension de la traduction. Quel est le mécanisme d’action de la puromycine?

A

L’action de la puromycine : Elle a pour effet d’inhiber la biosynthèse des protéines en mimant l’extrémité 3’ d’un aminoacyl-ARNt, ce qui provoque l’arrêt anticipé de la traduction de l’ARN messager par le ribosome par le détachement des chaînes peptidiques incomplètes.

76
Q

Associez les antibiotiques suivants à le mode d’action respectif.

1) Se lie au complexe 50S-ARNr et prévient le mouvement de l’ARNm.
2) Empêche la liaison codon - anticodon.
3) Change la conformation de 30S-ARNr et cause la mauvaise lecture de l’ARNm.
4) Se lie au complexe 50S-ARNr et inhibe la formation de liaison peptidique.

A) Chloramphenicol
B) Erythromycine
C) Tetracycline
D) Streptomycine

A

A) et 4)
B) et 1)
C) et 2)
D) et 3)

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