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Biochimie 1531 > Les acides nucléiques > Flashcards

Les acides nucléiques Flashcards

1
Q

Quelle est la liaison entre le pentose du nucléotide et le phosphate?

A

Liaison phosphoester.

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Q

Quelle est la liaison entre le pentose du nucléotide et la base azotée (azote et carbone)?

A

Liaison glycosidique.

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3
Q

Quelles sont les cinq bases azotées?

A 
1- A : Adénine
2- T : Thymine
3- U : Uracil
4- C : Cytosine
5- G : Guanine
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4
Q

Lesquelles des bases azotées sont des purines et celles qui sont des pyrimidines?

A

Purines : Adénine et Guanine.

Pyrimidines : Uracil, Thymine et Cytosine.

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5
Q

Quelles sont les différences entre les purines et les pyrimidines (2) ?

A

1- Les purines ont deux cycles : un à 6 atomes et l’autre à 5.
2- Les purines sont formés d’une pyrimidines avec un groupement imidazole.

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6
Q

Quelle est la différence entre le ribose et le désoxyribose?

A

Le ribose a OH (groupe hydroxyle) sur son C2’, tandis que le désoxyribose a un H sur son C2’.

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7
Q

Vrai ou faux? Le phosphate dans les acides nucléiques provient de résidu de H3PO4.

A

Vrai

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8
Q

Quel est l’implication du phosphate auprès des acides nucléiques (2)?

A

1- Il apporte 2 charges négatives au pH de la cellule (HPO4^2-)
2- Il forme des esters avec fonctions OH (ex: glucide).

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9
Q

Dans le nucléoside, où se trouve exactement la liaison covalente B-N-glycosidique entre le sucre et la base azotée (purine et pyrimidine)?

A

Liaison covalente β-N glycosidique entre C-1’ de l’ose et N-1 de la pyrimidine ou N-9 de la purine.

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10
Q

À quelles positions se trouvent les groupements hydroxyles sur les ribonucléosides et sur les désoxyribonucléosides respectivement (estérifiable par PO4^2-)?

A

Les groupements hydroxyles sur les ribonucléosides : en 2’, 3’ et 5’ et sur les désoxyribonucléosides : en 3’ et 5’.

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11
Q

Vrai ou faux? Selon la nomenclature, une purine → «idine» et une pyrimidine → «osine».

A

Faux. C’est le contraire : une purine → «osine» et une pyrimidine → «idine».

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12
Q

Qu’est-ce qu’un nucléotide?

A

Un nucléotide est un nucléoside avec un ou plusieurs résidus phosphates (MAXIMUM 3).

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13
Q

En quelle position sont habituellement phosphorylé les nucléotides?

A

En position 5’ du pentose. (peut l’être aussi en 3’, mais c’est plus rare)

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14
Q

Comment nomme-t-on une adénine avec seulement un phosphate dans l’ADN?

A

désoxyadénosine 5’-monophosphate (dAMP).

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15
Q

Comment nomme-t-on une cytosine avec 3 phosphates dans l’ARN?

A

ribocytidine 5’-triphosphate (rCTP).

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16
Q

Comment nomme-t-on la liaison du deuxième et du troisième phosphate sur un nucléotide?

A

Liaison phosphoanhydre (riche en énergie).

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17
Q

Quelles sont les principales fonctions des nucléotides (2)?

A

1- Transfert d’un groupe phosphate (P), ou diphosphate (PP) à différents substrats.
2-Transfert d’un groupe adénilyl, guanidilyl,
cytidilyl, uridilyl ou thimidilyl.

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18
Q 
Complétez. L'ADN et l'ARN sont des polymères \_\_\_\_\_ de nucléotides reliés par des liens \_\_\_\_\_\_\_\_\_\_\_\_\_\_. 
A) Circulaires, 3'-5' glycosidiques
B)  Circulaires, 3'-5' phosphodiesters
C) Linéaires, 3'-5' glycosidiques
D) Linéaires, 3'-5' phosphodiesters
E) Linéaires, 3'-5' ponts hydrogènes
A

D)

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19
Q

Vrai ou faux? La longueur en polynucléotides est illimitée.

A

Vrai.

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20
Q

Où se trouvent les charges sur un nucléotide?

A

Il y a une charge négative par nucléotide et 2 charges négatives à l’extrémité 5’.

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21
Q

Vrai ou faux? Par convention, on note toujours les nucléotides de l’extrémité 3’ à 5’.

A

Faux. On note les nucléotides de 5’ à 3’.

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22
Q

Quels sont les pairages des purines et des pyrimidines ?

A

1- A-T et A-U

2- C-G

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23
Q

Combien ont de ponts H les pairage A-T et C-G respectivement?

A

A-T ont 2 ponts H

C-G ont 3 ponts H

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24
Q

Les brins de l’ADN sont parallèles ou antiparallèles?

A

Les brins de l’ADN sont antiparallèles.

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25
Q

À quoi fait-on référence quand on parle du squelette de la structure de l’ADN?

A

Au sucre-phosphate.

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26
Q

Quelles sont les deux règles de Chargaff?

A

1- Ration purines/pyrimidines = 1
2- A=T et G=C, donc A+G=T+C
Toutefois, (A+T)/(G+C) varie.

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27
Q

Quelle est la structure découvert par Watson et Crick formée par les deux brins de polynucléotides?

A

Une double hélice.

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28
Q

Quelle est la forme commune de la double hélice d’ADN?

A

ADN-B

29
Q

Quelles sont les caractéristiques de l’ADN-B (5)?

A

1- Escalier en spirale
2- Surcre-P-Sucre hydrophile (bord de l’hélice)
3- Centre de l’hélice hydrophobe (cycles aromatiques : bases azotées)
4- Hélice droite
5- Sillon mineur et majeur

30
Q

Quelle conformation d’ADN ne possède pas de sillon, une structure riche en GC et forme une hélice vers la gauche?

A

ADN-Z

31
Q

Quelle conformation d’ADN possède des sillons égaux, une structure plus compacte
due à la déshydratation et forme une hélice vers la droite?

A

ADN-A

32
Q

Quelles sont les forces stabilisant l’ADN-B (4)?

A

1- Effet hydrophobe (paires de bases)
2- Force de Van der Waals (empilement des bases)
3- Pont H (AT et GC)
4- Ponts salins (groupes phosphodiesters négatifs et cations M++)

33
Q

Que représente la température de détachement des brins (fusion)?

A

Température à laquelle 50% de l’ADN est en double brin et 50% en simple brin.

34
Q

Les nucléotides vont absorber la lumière à quelle longueur d’onde?

A

260nm.

35
Q

Vrai ou faux? La température de fusion dépend de la quantité en AT et en CG.

A

Vrai.

36
Q

Que peut-on dire sur la température de fusion d’un ADN plus riche en CG qu’un ADN plus riche en AT?

A

La température de fusion d’un ADN riche en CG est plus grande, car CG sot liés par 3 ponts H et AG par 2 ponts H.

37
Q

Est-ce qu’un ADN circulaire a une structure tertiaire?

A

Oui. Même un ADN circulaire subit un repliement et l’action de topoisomérases.

38
Q

La structure du nucléosome possède différents niveaux d’enroulement. Quel est le premier?

A

Enroulement de l’ADN autour d’histones : 5 protéines basiques octamériques riche en lysines et arginines.
H1, H2A, H2B, H3 et H4.

39
Q

Dans quel milieu on peut observer la chromatine décondensée, sous forme d’un «collier de perles»?

A

Dans un milieu de faible force ionique.

40
Q

Quel est le deuxième niveau d’enroulement de la structure du nucléosome?

A

Condensation de type solénoïde. 6 nucléosomes par tour et stabilisation effectuée par H1.

41
Q

Les fibres d’ADN forment des boucles de longueur variable où une quantité de paires de bases sont ancrées à une charpente de :
A) Nucléosomes
B) Protéines non-histones
C) Protéines histones

A

B)

42
Q

Quel est le facteur d’enroulement des boucles et mini-bandes d’ADN?

A

Facteur d’enroulement de 200X.

43
Q

Qu’est-ce qu’un chromosome?

A

Un empilement de minibandes stabilisées par des complexes de protéines et d’ARN.

44
Q

Combien de paires de chromosomes retrouve-t-on chez l’humain?

A

23 paires de chromosomes.

45
Q

Si une molécule d’ADN contient 48% de GC, quel est le pourcentage de chacun des nucléotides dans cette molécule d’ADN?

A

52 % = contenu en AT (100-48)
Donc, A 26% et T 26%.
C 24% et G 24%.

46
Q

Quels sont les énoncés vrais?
A) L’ADN est retrouvée dans la nature sous forme d’hélice double brin parallèles où les bases azotées partagent des ponts hydrogènes.
B) Dans l’ADN double brin, les bases azotées et les liens phosphodiesters (groupements phosphates) se retrouvent aux rebords extérieurs de l’hélice, alors
que les sucres se retrouvent à l’intérieur.
C) Les ponts salins, les ponts hydrogènes, les interactions de Van der Waals et l’effet hydrophobe sont impliqués dans la structure double brin de l’ADN.
D) Les ponts hydrogènes jouent un rôle de première importance dans l’établissement de la structure double brin de l’ADN.
E) Dans la structure double brin de l’ADN, la géométrie de ponts hydrogènes entre les bases azotées et la position des bases azotées est telle qu’on voit apparaître un sillon majeur et un sillon mineur dans la
double hélice.
F) Les bases azotées de l’ADN, mais pas de l’ARN, sont planaires et absorbent la lumière dans les longueurs d’onde qui correspondent à l’ultraviolet (UV).

A

C), D) et E).

47
Q 
Pour de l'ADN double brins, donnez la séquence complémentaire à la séquence suivante : 5'GGTCAGTAT-3' 
A) 5’-ATACTGACC-3’
B) 5’-CCAGTCATA-3’ 
C) 5’-CCAGUCAUA-3’
D) 5’-AUACUGACC-3'
E) aucune de ces réponses n'est correcte
A

A)

48
Q

Parmi les éléments suivants, 5 se retrouvent dans les acides nucléiques :

  1. Phosphore.
  2. Azote.
  3. Oxygène.
  4. Hydrogène.
  5. Carbone.
  6. Soufre.
A

1, 2, 3, 4 et 5.

49
Q

Autre le fait que l’ADN est le porteur de l’information génétique, quelles sont ces deux fonctions?

A

1- Rôle dans la stabilité de l’information.

2- Rôle dans la transmission.

50
Q

Quels sont les avantages de la structure de l’ADN en forme de double hélice et complémentarité des bases (3)?

A

1- La réplication est fidèle
2- Mécanismes de réparation efficaces (préviennent les mutations)
3- Transfert de l’information à l’ARN

51
Q

La réplication de l’ADN est :
A) Dispersive
B) Conservative
C) Semi-conservative

A

C)

52
Q

En quoi consiste la réplication semi-conservative de l’ADN selon Watson et Crick?

A

La réplication aboutit ainsi à 2 molécules-filles d’ADN
bicaténaire, chacune formée d’un brin parental et d’un brin nouvellement
synthétisé.

53
Q

Comment la réplication semi-conservative a été confirmée par Meselson-Stahl?

A

Par une expérience avec de l’azote lourd et de l’azote léger.

54
Q

Lequel de ses énoncés concernant la synthèse de l’ADN est faux?
A) La synthèse de l’ADN est catalysée par des ADN polymérases.
B) Requiert des ribonucléosides 5’-triphosphates.
C) Nécessite une amorce afin de débuter (ARN).
D) Procède toujours en direction 5’→3’.

A

B) La synthèse de l’ADN requiert des désoxynucléosides 5’-triphosphates (dNTPs, où N= A, T, C ou G) et non des ribonucléosides 5’-triphosphates.

55
Q

Quelle est la première étape de la synthèse de l’ADN ?

A

Reconnaissances origines de réplication (régions riches en AT).

56
Q

Dans la synthèse de l’ADN, Afin de dupliquer le duplex d’ADN, l’ADN double brin doit être séparé en deux brins‐matrices. Par quelle enzyme cette étape est effectuée?

A

Par des hélicases.

57
Q

Vrai ou faux? Les procaryotes ont plusieurs origines de réplication tandis que les eucaryotes n’en possèdent qu’un.

A

Faux. C’est le contraire : Les eucaryotes ont plusieurs origines (plusieurs centaines) de réplication tandis que les procaryotes n’en possèdent qu’un.

58
Q

Associez le nom de l’origine de réplication et l’organisme à qui il appartient.

1) OriC
2) ORC

A) Eucaryotes
B) Procaryotes

A

A) et 2)

B) et 1)

59
Q

De combien de sous-unités est formés ORC?

A

C’est un complexe protéique composé de 6 sous-unités

60
Q

Quelle est la différence entre les origines de réplication des eucaryotes VS des procaryotes?

A

Procaryote : génome moins grand, réplication plus vite, plus d’erreur.
Eucaryotes c’est le contraire.

61
Q

Quelle est la deuxième étape de la synthèse de l’ADN ?

A

Le duplexe d’ADN est dénaturé, puis déroulé par une hélicase aux origines de réplications (régions riches en AT).

62
Q

Quelle est la troisième étape de la synthèse de l’ADN ?

A

Relâchement du sur-enroulement de l’ADN par les topoisomérases.

63
Q

Lesquels des énoncés est faux concernant la réplication à double sens de l’ADN?
A) Le réplicateur ou réplisome est la machinerie capable de procéder aux réaction de polymérisation.
B) La réplication de ce chromosome démarre
en un site unique, appelé origine de réplication.
C) Il y a un réplicateur pour les deux fourches de réplication.
D) Quand les fourches de réplication se rencontrent au site de terminaison, les 2 chromosomes se séparent.

A

C) Chacune des deux fourches de réplication possède un réplicateur.

64
Q

Vrai ou faux? Tant chez les eucaryotes que chez les procaryotes, la réplication se fait dans les 2 sens. La différence est que les procaryotes se réplique à partie d’une seule origine et que la réplication des ADN chromosomiques des eucaryotes s’amorce en de nombreux sites.

A

Vrai.

65
Q

Quelle est la quatrième étape de la synthèse de l’ADN?

A

Synthèse d’une amorce d’ARN par la primase qui la synthétise à l’origine de réplication.

66
Q

Quelle est la cinquième étape de la synthèse de l’ADN?

A

Catalyse de la polymérisation de l’ADN par ADN pol alpha qui ajoute quelques nucléotides avant d’être remplacée par ADN pol omega afin de poursuivre la polymérisation.

67
Q

Quelles sont les trois enzymes de réplication chez les procaryotes dans la synthèse de l’ADN et quelle est leur fonction respective?

A

1- ADN pol I : répare l’ADN et prend part à la synthèse de l’un des brins au cours de la réplication.
2- ADN pol II : collabore à la réparation de l’ADN.
3- ADN pol III : composant-clef du réplicateur et enzyme principale de la réplication de l’ADN. Assure l’élongation de la chaîne au cours de sa réplication.

68
Q

Quelles sont les quatre enzymes de réplication chez les eucaryotes dans la synthèse de l’ADN et quelle est leur fonction respective?

A

1- ADN pol alpha

Biochimie 1531 (8 decks)

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