Traduction Flashcards

1
Q

Quelle partie que la traduction décode d’un ARNm?

A

Cadre de lecture ouvert (ORF)

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Q

Combien de codons ne codent pas pour des acides aminés?

A

3 codons stop

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3
Q

Quel est le codon d’initiation?

A

AUG

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4
Q

Quelles sont les différences entre Procaryotes et Eucaryotes?

A

Eucaryote : Coiffe en 5’ et queue polyA en 3’, monocistronique
Procaryote : Pas de coiffe en 5’ , pas de queuePolyA en 3’ , souvent polycistroniques, recrutement du ribosome par site de liaison des ribosomes, besoin d’adaptateur

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5
Q

Qu’est-ce que les ARNt?

A

Adaptateurs entre codon et acides aminés , se sont des petits ARNs de 75-95 nt, partagent une structure secondaire en forme de feuille de trèfle, capable de reconnaitre à la fois un acide aminé et un codon

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6
Q

Qu’est-ce que fait l’aminoacyl-ARNt synthétase?

A

Responsable de réaction
Chargement des acides aminés sur ARNt -> défi spécificité
Aminoacyl-ARNt synthétase tyrosine sur la tige acceptatrice et sur la boucle anticodon.

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7
Q

Qu’est-ce qu’un ribosome?

A
  • 2-20 acides aminés/seconde
  • Protéines + ARN
  • 2 sous-unités pour les procaryotes : 50S et 30S
  • Énergivore de faire des ribosomes
  • Transport dans le nucléole par entrée dans un canal
  • Centre peptidyl-transférase : 60S
  • Centre de décodage : 40S
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8
Q

Qu’est-ce qu’un polysome?

A
  • Plus ou =1 ribosomes/ARNm
    -ARN - stable que protéine
  • Réaction peptidyl-transférase
    -Trois sites de fixation d’ARNt au ribosome :
    —> Utilisé par l’ARNt libéré
    —> Utilisé le peptidyl-ARNt
    —> Utilisé par ARNt Aminoacylé

Trois sites de fixation : Site P, Site A et Site E

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9
Q

Quelle est l’étape la plus contrôlé de la synthèse protéique?

A

Initiation des eucaryotes

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10
Q

Quelles sont les grandes étapes de l’initiation?

A

1- Formation du complexe de pré-initiation 43S
2- Préparation de l’ARNm par complexe eIF4
3- Formation du complexe de pré-initiation 48S
4- Scanning de l’ARNm pour trouver le codon d’initiation
5- Recrutement de la grande sous-unité ribosomique

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11
Q

Qu’est-ce qui arrive lors de l’étape #1 de l’initiation?

A

— 40S + eIF1, eIFA, eIF3 et eIF5 :
Bloque l’arrimage du 60S
Bloque l’entrée d’un ARNt aminoacylé au site A

—Formation du complexe tertiaire :
Association entre eIF2-GTP et l’ARNt initiateur en 3’
Seul eIF2-GTP peut reconnaitre l’ARNt méthionine

—Positionnement de ARNt met au site P :
Interaction entre eIF2 et eIF5 facilite le positionnement de l’ARNt met au site P de la sous-unité 40S
Formation du complexe de pré-initiation 43S

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12
Q

Qu’est-ce qui se passe à l’étape #2 de l’initiation?

A

Recrutement de eIF4 à la coiffe 5’
Interaction entre eIF4E et eIF4G permet le recrutement de eIF4G et eIF4A en 5’ de l’ARNm
Ce complexe permet l’association de eIF4B et eIF4A, ce qui stimule l’activité hélicase de eIF4A
L’hélicase défaut les structures secondaires dans la région 5’ de l’ARNm qui empêcherait l’association du complexe de pré-initiation 43S

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13
Q

Qu’est-ce qui se passe lors de l’étape #3 de l’initiation?

A

Interaction entre eIF4 lié à l’ARNm et le eIFs lié au 43S entraine le recrutement de la petite sous-unité à la coiffe de l’ARNm
Formation du complexe 48S

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14
Q

Qu’est-ce qui se passe lors de l’étape #4 dans l’initiation?

A

-Déplacement du complexe de pré-initiation dans le direction 5’-> 3’ de l’ARNm : ATP + eIF4A/B (hélicase)
— Reconnaissance du codon d’initiation par appariement des bases entre l’anticodon de l’ARNt initiateur et le codon d’initiation
— Changement de conformation d’eIF5, stimulant l’hydrolyse du GTP associé à eIF2
—Dissociation entre eIF2-GDP et ARNt met
—Libération des facteurs eIF1, eIF3 et eIF5 du 40S

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15
Q

Qu’est-ce qui se passe lors de l’étape #5 durant l’initiation?

A

—Hydrolyse du GTP par eIF2 entraine la dissociation des facteurs eIF1, eIF3, eIF5 du 48S
— Cette dissociation permet le recrutement du complexe eIF5B-GTP, qui permet l’association de la grande avec la petite sous-unité ribosomique
—L’association de la sous-unité 60S stimule l’activité GTPase d’eIF5B : hydrolyse du GTP et libération des facteurs eIF5B et eIF1A
— Initiation complète … ribosome avec ARNti met au site P est prêt à recevoir un ARNt chargé complémentaire au codon #2 de l’ARNm

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16
Q

Vrai ou faux

Les procaryotes ont également une coiffe en 5’

A

Faux

17
Q

Quelles sont les protéines auxiliaires de l’élongation chez les eucaryotes?

A

Facteur d’élongation eEF-1 et eEF2

18
Q

Quelles sont les étapes de l’élongation?

A

Étape #1 : Entrée d’un aminoacyl-ARNt au site A en concordance avec liaison codon-anticodon
Étape #2 : Liaison peptidique entre aminoacyl-ARNt au site A et la chaine peptidique attachée au peptidyl-ARNt du site P. La réaction peptidyl transférase entraine le transfert de la chaune polypeptidique en croissance du site P vers l’ARNt situé au site A.
Étape #3 : Translocation du peptidyl-ARNt situé du site A au site P au ribosome. Translocation de l’ARNt déchargé du site P au site E du ribosome. Translocation de l’ARNm de 3 nt en direction 5’ -> 3’. Ribosome prêt pour un nouveau cycle de reconnaissance codon-anticodon pour la formation d’une nouvelle liaison peptidique.

19
Q

Quelles sont les étapes de la translocation du ribosome durant l’élongation?

A

Étape #1 : Translocstion de la grande sous-unité ribosomique

Étape #2 : eEF2 stimule la translocation de la petite sous-unité

20
Q

Quels sont les 3 codons stops?

A

UAA, UAG, UGA

21
Q

Quelles sont les étapes de la terminaison?

A
  • La libération de la chaine polypeptidique entraine un changement de conformation au ribosome et de RF1
  • Ce changement permet la liaison du facteur RF3-GDP au ribosome
  • La liaison de RF3-GDP au ribosome permet l’échange du GDP pour le GTP
  • RF3-GTP a une forte affinité pour le ribosome et permet le déplacement de RF1 et de l’hydrolyse du GTP
  • En absence de RF1, RF3-GDP a peu d’affinité pour le ribosome
22
Q

Vrai ou faux

La queue Poly A en 3’ inhibe l’initiation de la traduction en 5’

A

Faux

La queue Poly A en 3’ stimule l’initiation de la traduction en 5’

23
Q

Les microARN se lient généralement aux UTR 3’ ou UTR 5’?

A

UTR 3’