Tentor Flashcards
Ni ska rena fram ett protein från celler. Ge ett exempel på hur kan man gå
tillväga för att lysera cellerna och beskriv en av de reningsmetoder som kan
användas för att rena proteiner (hur går reningsproceduren till och vad är det
för princip bakom?).
Cellerna kan lyseras på ett flertal olika sätt, med celler som brister väldigt
lätt (exempelvis röda blodkroppar) kan man inkubera dem i en hypoton lösning
(låg salt) där cellerna tar in vatten till de slutligen sprängs. Andra metoder är
sonikering och olika mekaniska metoder (freezer mill, French press etc). När det
gäller rening kan man fälla ut proteiner av intresse (till exempel
ammoniumsulfatfällning) eller rena de med olika kolonner där de bland annat
separeras med hjälp av laddning, hydrofobicitet, storlek, ligandbindning
(affinitetsrening). I hemoglobinlabben separerades de med avseende på storlek i
en gelfiltreringskolonn där små molekyler tar lång tid på sig att gå igenom
kolonnen medan stora molekyler går snabbt igenom eftersom de till mindre grad
går in i partiklarna som materialet består av och därför passerar vid sidan om
(volymen de måste passera blir mindre). Endast en lyseringsmetod och en
reningsmetod krävs för godkänt.
Var i en proteinstruktur finner man vanligen polära sidokedjor?
a) Dolt i proteinets struktur
b) I α-helixstrukturer
c) I β-sheet strukturer
d) På ytan av proteinet
d
Många läkemedel verkar genom att specifikt hämma enzymers katalytiska
förmåga. Ange tre principiellt olika sätt som enzymhämmare fungerar på, samt
förklara hur de verkar på enzymnivå.
Irreversibel hämning: Hämmaren binder kovalent till enzymet (eller förändrar
enzymets kovalenta struktur) vilket leder till att enzymets katalytiska aktivitet
går ner eller försvinner. Enzymet kan inte återfå sin aktivitet.
Kompetitiv hämning: Hämmaren konkurrerar med det naturliga substratet om
bindning till active site. Vid höga koncentrationer av hämmare blockeras
bindning, och därmed omsättning, av substratet. Enzymet återfår sin aktivitet
om koncentration av hämmare minskar eller substrat ökar.
Non-kompetitiv/okompetitiv hämning: Icke-kovalent bindning av hämmare till
enzymet (oftast till en yta skild från active site) ger en alloster effekt hos
enzymet som påverkar strukturen hos active site så att aktiviteten går ner.
Enzymet återfår sin normala aktivitet när hämmaren försvinner. I den
okompetitiva hämningen kan hämmaren endast binda till enzymet om substrat
redan är bundet
I vilka vävnader syntetiseras glykogen huvudsakligen? Hur går det till?
Vilket enzym är viktigast vad gäller syntesens reglering?
Lever och muskler. Glukos-6-fosfat ger UDP-glukos med hjälp av UTP. UDP-
glukosen kopplas samman till kedjor (med alfa-1,4-glykosidbindningar) m h a
glykogensyntetas (det centrala enzymet för processens reglering). Branching
enzyme skapar alfa-1,6-glykosidbindningar vilket gör att glykogen blir en grenad
struktur.
Vad är sant om de reaktioner som katalyseras av glykolysens kinaser?
a) Alla resulterar i konsumtion av ATP
b) Alla resulterar i bildning av ATP
c) Pyruvatkinasreaktionen används även i glukoneogenesen
d) Fosfofruktokinas 1 stimuleras av produkten av fosfofruktokinas 2
d
Vad är sant om ketonkroppar?
a) Bildas uteslutande från fettsyror
b) Kan brytas ner såväl i som utanför mitokondrien
c) Resulterar vid fullständig nedbrytning i bildning av 4 koldioxid
d) Två ketonkroppar ger lika mycket energi som en glukos
c
Vilka enzymer utav dessa behövs för mismatch repair?
o DNA polymerase o TFIIH o PCNA o helikas o topoisomeras 1 o DNA ligas o endonukleas o exonukleas o clamploader o primas o MutS
DNA polymerase, PCNA, DNA ligas, exonukleas, clamploader, MutS
Nämn sex olika sätt för en eukaryot transkriptionsrepressor att repressa
transkriptionen
Repressorn kan
- kompetitivt binda till DNA så att en aktivator hindras binda till en
överlappande eller närliggande DNA-sekvens.
- binda till och därmed inaktivera en transkriptionsaktiverande yta hos en
transkriptionsaktivator.
- binda till en generell transkriptionsfaktor, co-activator eller mediatorn så att en
transkriptionsaktivator hindras att binda där.
- rekrytera repressande kromatinremodellerande proteinkomplex.
- rekrytera histondeacetylas som tar bort en aktiverande histonacetylering.
- rekrytera histonmetyltransferas som gör en repressande histonmetylering.
Vilket svarsalternativ är rätt beträffande glycerofosfolipider:
a) Fosfatidylinositol är en glycerofosfolipid
b) Fosfatidylkolin har en netto negativ laddning vid fysiologiskt pH
c) Fosfatidylkolin och sfingomyelin finns främst i det inre lagret av
plasmamemranets lipiddubbelskikt
d) Glycerofosfolipiderna bildas i RER
e) Lipoproteiner bildas genom avknoppning av plasmamembran från leverceller
a
D. Vilket svarsalternativ är rätt beträffande fettsyror:
a) Hos människa kan n-3 fettsyror bildas från n-6 fettsyror
b) Lösligheten i vatten är högre för en fettsyra vid pH 2.5 än vid pH 10.5
c) Fleromättade fettsyror kan frisättas från glycerofosfolipider av fosfolipas A2
d) Dubbelbindningarna i fysiologiskt förekommande fleromättade fettsyror är
vanligen konjugerade
e) Arakidonsyra kan ge upphov till TXA2, PGI2, PGH2 och LTC2
c
Place the following steps in the correct order in the mammalian Ras signalling
pathway.
1. Activation of Ras
2. Activation of a tyrosine kinase transmembrane receptor
3. Activation of MAP kinase
2, 1, 3.
Nervcellens vilopotential: Ange vilka faktorer som är viktigast för en
vanlig nervcells vilomembranpotential och förklara vilken roll var och en av
dessa faktorer spelar!
Vilopotentialen, som ofta är ca -70 mV, avgörs av
koncentrationsgradienten för de olika jonslag som membranet är permeabelt
för vid vila, samt av den relativa permeabiliteten för dessa jonslag. K+-joner
har störst betydelse eftersom membranets permeabilitet för K+ är relativt
stor. De driver membranpotentialen i riktning mot K+-jonernas
jämviktspotential som är mycket negativ (ca -100 mV), p g a hög intracellulär
och låg extracellulär K+-koncentration. Membranet har dock även en viss Na+-
jonpermeabilitet, vilken driver potentialen något i riktning mot Na+-jonernas
jämviktspotential, vilken p g a fördelning av dessa joner över membranet,
med låg intracellulär och hög extracellulär koncentration, är positiv (ca +70
mV). I ett längre tidsperspektiv är Na+-K+-pumpen av betydelse för att
upprätthålla koncentrationsgradienterna för Na+ och K+, och därmed också
för att upprätthålla vilopotentialen.
Beskriv den molekylära händelsekedjan från det att en cell blir
mitogenstimulerad till det att den uttrycker S-fas gener. Vilka faktorer aktiveras
på vägen och vad är deras funktion?
Aktivering av Myc. 2. Myc aktiverar uttryck av G1 cyklin. 3. G1
cyklin/CDK fosforylerar Rb. 4. Rb lossnar från E2F, E2F är fritt att aktivera
uttryck av S-fas gener.
Desmosomes link_______________ of adjacent cells in epithelial layers.
d) intermediate filaments
Omlagring av extracellulärt matrix (ECM) är en komplex biologisk process
som är viktig för många livsprocesser t ex processer som involverar
inflammation. Vissa sjukdomstillstånd kan också bero på felaktigheter när det
gäller omlagring av ECM. Beskriv 4 olika fysiologiska eller patologiska processer
som involverar ECM-omlagring. Beskrivning av processer från båda grupperna
ska vara med för full poäng. När det gäller patologiska processer skall du
beskriva vad som blivit fel när det gäller omlagring av ECM. När det gäller de
olika processerna skall du kortfattat beskriva vilka ECM-omlagrande proteaser
som är involverade och på vilket sätt dessa är involverade eller vad som blivit fel.
Exempel på fysiologiska processer är ovulation (ägglossning) och
angiogenes (bildning av blodkärl). I båda dessa fallen är både PA- och MMP-
systemen involverade och de genererar den proteolytiska aktiviteten som krävs
för att bryta ned ECM. Exempel på patologiska processer är reumatisk artrit
(RA), utebliven eller försämrad sårläkning samt metastasbildning. När det gäller
RA som är en autoimmun sjukdom aktiveras de ECM-omlagrande proteaserna på
ett felaktigt sätt vilket bl a gör att brosk i lederna bryts ned. När det gäller
metastasbildning används de ECM-omlagrande proteaserna av tumörcellerna på
ett felaktigt sätt vilket leder till att dessa kan bryta ned vävnad och sprida sig i
kroppen. När det gäller utebliven sårläkning har läkningsprocessen stannat upp
eller går för sakta vilket kan bero på att nivån av plasminogen i såret är för låg. I
många fall kan läkningsprocessen aktiveras och/eller påskyndas genom att
proteinet plasminogen tillsätts varvid läkningsprocessen aktiveras.
