Membraner och proteiner Flashcards
Vilka är det två huvudgrupperna av membraner?
Lipider och proteiner.
Hur stor del av membranet står av protein?
Olika mellan olika membran men ofta mer än 50% av massan är protein. Mest i inre mitokondriemembranet och också mycket i PM.
Vilka funktioner har membranproteiner?
- Transport
- Kommunikation
- Stabiliserande protein
- Forma/börja membraner
- Reaktionslokalisering
- Proteiner som förankrar celler (adhesionsprotein)
Vad karaktäriserar transportproteiner?
Specifika för en/några molekyler. Vissa kan öppnas/stängas av signal
Var karaktäriserar integrala membranproteiner?
sitter till en viss del inuti den hydrofoba delen av membranet. om det går helt igenom membranet kallas det för ett transmembranprotein.
Hur kan peptidbindningen som är polär vara i den hydrofoba kärnan av membranet?
görs genom sekundärstruktur. Finns ingen random coil eller loopar hos den delen av proteinet i hydrofoba kränan.
Vad kallas ett protein som korsar membranet en gång? / flera?
Single pass m.p eller multi-pass m.p (M.p=membranproteiner).
vad har transmembranproteiner ofta för domäner?
alphahelixar med 20 hydrofoba aminosyror.
Varför är det 20 aminosyror på en transmembranproteins alphahelix?
För att det blir ca 3nm, dvs nog för att passera membranet.
Vad karaktäriserar lipidförankrade membranproteiner?
Kovalent bundna. Bindningen kan bildas och brytas (dymanisk förankring). Detta kan göras med enzym.
Vad menas med acylering?
Modifiering med fettsyra.
Va är de olika typerna av lipidförankrade membranproteiner?
Acylerade
Prenylerade
vad är den vanligaste fettsyran vid acyleing av lipidförankrade membran?
Myristinsyra (C14) är vanligast. Palmitinsyra också vanligt.
Vad menas med prenylerade lipidförankrade membranproteiner?
Binder till molekyler som bygger på isoprenenheter (C5), tex Geranyl (inte vanligt), Farnesyl (C15), GeranylGeranyl
Vad gör acylering och prenylering av lipidförandrade membranprotein?
kopplar av och på dem till membranet. Görs med hjälp av enzymer. Kombineras ofta för att få en starkare membranförankring
Vad karaktäriserar GPI-förankrade membranproteiner?
Stabil och statisk förankring till cellytan. Finns framförallt i CNS och immunsystemet. Står för glykosyl fosfatidylinositol
Vad är glykosyl respektive fosfatidylinositol?
Glykosyl är ett socker fosfatidylinositol är en glycerofosfolipid
Vad karaktäriserar perifera membranproteiner?
Sitter på membranet icke-kovalent. Har bindning till lipids huvudgrupp eller en protein-proteininteraktion. Finns en tredje variant som är en bindning via amfipatisk helix. Alla dessa typer av bindningar är reversibla.
Vad är en amfipatisk helix?
Har omväxlande hydrofoba/hydrofila aminosyror så att den får en hydrofob/hydrofil sida. Den binder till membranet genom att den lägger sig på membranet och den hydrofoba sidan borrar in sig. Kallas “shallow insertion”.
