Proteinnedbrytning och autofagi

Question 1

vad betyder proteom?

Answer 1

Alla proteinmolekyler i en cell. Olika mellan olika celltyper.

Question 2

Vad influerar proteomet?

Answer 2

Produktion (genreglering, translation), Utsöndring, Proteinnedbrytning i cellen

Question 3

Proteaser?

Answer 3

Enzym som bryter ned alla proteiner i tex matspjälkning.

Question 4

Lysosomen?

Answer 4

Bryter ner proteiner utan reglering.

Question 5

Ubikvitin (UB)

Answer 5

Protein på 76 a.a. Finns i alla celler. adresslap för nedbrytning.

Question 6

Ubikvitinering?

Answer 6

Ubikvitin kopplas kovalent till lysinsidokedja på protein. Kan ses som post-translationel modifiering

Question 7

Proteinkomplex ansvariga för ubikvitinering?

Answer 7

E1, E2, E3.

Question 8

Ubikvitineringsprocessen?

Answer 8

E1 kopplar UB till Cystein på ett E1 protein. E1 Försvinner och E2 tar platsen. (E2-Cys-UB). E3 binder till E2 och ett protein med fri lysinsidokedja (målproteinet). E3 överför UB till Lysinet. Kopplar på flera UB

Question 9

annat namn för E3?

Answer 9

Ubikvitinligas

Question 10

Polyubikvitinerat protein?

Answer 10

Ett protein med en kedja av UB kopplat till en Lys. PolyUB är degraderingssignalen.

Question 11

degron?

Answer 11

Den del av proteinet som känns ingen av E3.

Question 12

vilket protein ger specificitet/bestämer vad som brytas ner?

Answer 12

E3/ubikvitinligas

Question 13

Hur sker nedbrytningen?

Answer 13

Proteasomen (26S) Bryter ner PolyUB proteiner. ATPberoende

Question 14

20S?

Answer 14

Centrala delen av proteasomen, core particle. Fyra ringar av proteinsubenheter (7 proteiner/subenheter per ring). 2 alpha 2 betaringar. Betaringar i mitten.

Question 15

Vilka ringar aktiva proteasen i 20S?

Answer 15

B1, B2, B5.

Question 16

Hur protein in i kammaren?

Answer 16

veckat protein kommer inte in, löses med 1. proteinkomplex ATP-beroende motor som veckar upp och drar in proteinet i kammaren.
2. Proteinkomplex som ger specificitet för polyUB proteiner. har griparmar som tar tag i polyUB och en komponent som klipper av polyUB (hydrolas). 1+2 kallas 19S eller regulatory particle. Kan sitta på en ellet två sidor om 20S.

Question 17

sekvens av nedbrytning?

Answer 17

PolyUB binder till 19S som drar in i 20S. På väg in klipps polyUB bort. Hydrolys till korta peptider i 20S

Question 18

Hur bryts ER-proteiner ner?

Answer 18

Veckning här misslyckas ofta. Inga proteiner bryts ner i ER. Istället ERAD (ER-associatet degradation). Transport till cytosol där de Ubikvitineras och degraderas med 26S.

Question 19

Vad betyder autofagi?

Answer 19

Mekanismen för att bryta ner större saker i cellen. Betyder självätande.

Question 20

vad är huvudkomponenten för autofagi?

Answer 20

Membraner

Question 21

Hur autofagi?

Answer 21

Fagofor bildas. lipider tillförs och den växer runt komponent i cytoplasman. Sluts runt organellen och kallas då autofagosom (2 membraner). Smälter samman med lysosom och leder till autolysosom. Allt bryts ner tills bara lysosom kvar.

Question 22

Två typer av autofagi?

Answer 22

Icke-selektiv. Pågår alltid på låg nivå. Städar lite. Uppregleras av svält.
Selektiv autofagi: väljer ut ubikvitinerad last som ska brytas ner. Autofagireceptorer binder mellan tex Ub och fagoforen.