Proteinnedbrytning och autofagi Flashcards
vad betyder proteom?
Alla proteinmolekyler i en cell. Olika mellan olika celltyper.
Vad influerar proteomet?
Produktion (genreglering, translation), Utsöndring, Proteinnedbrytning i cellen
Proteaser?
Enzym som bryter ned alla proteiner i tex matspjälkning.
Lysosomen?
Bryter ner proteiner utan reglering.
Ubikvitin (UB)
Protein på 76 a.a. Finns i alla celler. adresslap för nedbrytning.
Ubikvitinering?
Ubikvitin kopplas kovalent till lysinsidokedja på protein. Kan ses som post-translationel modifiering
Proteinkomplex ansvariga för ubikvitinering?
E1, E2, E3.
Ubikvitineringsprocessen?
E1 kopplar UB till Cystein på ett E1 protein. E1 Försvinner och E2 tar platsen. (E2-Cys-UB). E3 binder till E2 och ett protein med fri lysinsidokedja (målproteinet). E3 överför UB till Lysinet. Kopplar på flera UB
annat namn för E3?
Ubikvitinligas
Polyubikvitinerat protein?
Ett protein med en kedja av UB kopplat till en Lys. PolyUB är degraderingssignalen.
degron?
Den del av proteinet som känns ingen av E3.
vilket protein ger specificitet/bestämer vad som brytas ner?
E3/ubikvitinligas
Hur sker nedbrytningen?
Proteasomen (26S) Bryter ner PolyUB proteiner. ATPberoende
20S?
Centrala delen av proteasomen, core particle. Fyra ringar av proteinsubenheter (7 proteiner/subenheter per ring). 2 alpha 2 betaringar. Betaringar i mitten.
Vilka ringar aktiva proteasen i 20S?
B1, B2, B5.
Hur protein in i kammaren?
veckat protein kommer inte in, löses med 1. proteinkomplex ATP-beroende motor som veckar upp och drar in proteinet i kammaren.
2. Proteinkomplex som ger specificitet för polyUB proteiner. har griparmar som tar tag i polyUB och en komponent som klipper av polyUB (hydrolas). 1+2 kallas 19S eller regulatory particle. Kan sitta på en ellet två sidor om 20S.
sekvens av nedbrytning?
PolyUB binder till 19S som drar in i 20S. På väg in klipps polyUB bort. Hydrolys till korta peptider i 20S
Hur bryts ER-proteiner ner?
Veckning här misslyckas ofta. Inga proteiner bryts ner i ER. Istället ERAD (ER-associatet degradation). Transport till cytosol där de Ubikvitineras och degraderas med 26S.
Vad betyder autofagi?
Mekanismen för att bryta ner större saker i cellen. Betyder självätande.
vad är huvudkomponenten för autofagi?
Membraner
Hur autofagi?
Fagofor bildas. lipider tillförs och den växer runt komponent i cytoplasman. Sluts runt organellen och kallas då autofagosom (2 membraner). Smälter samman med lysosom och leder till autolysosom. Allt bryts ner tills bara lysosom kvar.
Två typer av autofagi?
Icke-selektiv. Pågår alltid på låg nivå. Städar lite. Uppregleras av svält.
Selektiv autofagi: väljer ut ubikvitinerad last som ska brytas ner. Autofagireceptorer binder mellan tex Ub och fagoforen.
