TEMA 7 - Transcripción en eucariotas III (regulación) Flashcards
¿Qué son los silenciadores?
Elementos del DNA donde se unen represores, promoviendo la formación de heterocromatina y silenciando la transcripción.
¿Qué son los insulators?
Complejos de DNA+proteínas que funcionan como barreras, restringiendo la extensión de la heterocromatina y bloqueando la actuación de los enhancers.
¿Qué son los enhancers?
Elementos del DNA donde se unen activadores que incrementan la expresión de un gen.
¿Cuáles son las similitudes/diferencias entre un enhancer y un promotor?
¿Qué es un mediador?
La proteína que conecta la proteína activadora en el enhancer con la maquinaria de transcripción.
¿Qué es un regulatory loop?
Loops de DNA que se forman en el genoma que acercan el enhancer al promotor.
¿Qué quiere decir esta imagen?
¿Qué ocurre con el enhancer B?
Está inactivo, ya que tiene nucleosomas, y los enhancers activos están caracterizados por una falta de nucleosomas.
¿Actúan los mismos enhancers igual en todos los tejidos?
No. Se pueden formar distintos regulatory loops (mediados por la cohesina y otras proteínas) dónde distintos enhancers son acercados al promotor.
Algunas modificaciones en histonas también pueden silenciar enhancers.
¿Qué son los eRNAs?
Enhancer RNAs. Son una clase de ncRNA (non-coding RNA) que son transcritos por la RNA pol II desde enhancers activos y están implicados en el plegamiento del DNA. Se ha descrito que los eRNAs interaccionan con el complejo mediador.
¿Sobre qué etapas de la transcripción tienen efecto los enhancers?
Inicio de la transcripción y elongación
¿Cuál es la estructura del complejo mediador en mamíferos?
Esta formado por 26 subunidades.
¿Se pueden unir varios vactores de transcripción al mismo mediador al mismo tiempo?
Sí, ya que los diferentes factores de transcripción se pueden unir a cada una de las subunidades.
¿Qué quiere decir que el mediador es un complejo flexible?
Las subunidades del mediador pueden variar, cambiando su capacidad de interaccionar con otras proteínas.
Por ejemplo, la interacción con la RNA pol II puede provocar cambios estructurales en el mediador que afecten a la elongación.
La unión de CDK8 al mediador puede inhibir la unión de la RNA pol II al mediador y favorecer la unión a factores de elongación.
¿Qué es un superenhancer?
Agrupamientos de enhancers (decenas de kilobases). Suelen tener mayor densidad de factores de transcripción y mayor habilidad para activar la transcripción.
¿Como actúan los silenciadores?
Los silenciadores (S) reclutan factores de transcripción (TF) específicos que reclutan remodeladores de cromatina (CR) y modificadores de histonas (HM), las cuales crean sitios de unión para proteínas represoras (R).
¿Qué son los elementos Barriere?
Un tipo de insulators que recluta factores de transcripción, que a su vez reclutan complejos que modifican los nucleosomas, evitando la propagación de zonas de heterocromatina a zonas de eucromatina.
¿Qué son los enhancer blocking elements?
Un tipo de insulator que interfiere en la interacción entre un enhancer y un promotor cuando está colocado entre los dos.
¿Qué es el metiloma?
El set de nucleótidos metilados en el genoma en un momento dado. Es específico de tejido y célula, pero no es fijo y cambia según cambian las condiciones.
¿Cuando ocurre la metilación del DNA en mamíferos?
Tras la replicación y durante la diferenciación celular.
¿Cómo es la metilación en mamíferos?
Se añade un grupo metilo a la citosina en el carbono 5, dando lugar a 5 - metilcitosina (5mc).
¿Qué enzimas catalizan la metilación del DNA?
La metilación del DNA está catalizada por la familia de enzimas DNA metiltransferasas (DNMTs).
Metilasas de novo (DNMT3a y DNMT3b) añaden grupos metilo a DNAs no metilados.
Metilasas de mantenimiento (DNMT1), que actúan sobre el DNA hemimetilado y permiten mantener el estado de metilación después de la replicación.
¿Qué enzimas llevan a cabo la demetilación?
Las enzimas TET.
¿Qué citosinas suelen estar metiladas en el DNA?
Las adyacentes a guanina (dinucleótido CpG).
