TEMA 9 - Traducción I Flashcards

1
Q

¿Qué significa el mRNA procariota es policistrónico?

A

Un mRNA codifica para varias proteínas (muchos ORF).

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2
Q

¿Qué es la secuencia Shine-Dalgarno?

A

Ribosome binding site (RBS) en el mRNA procariota. 3-9 nt upstream del codón de iniciación. (secuencia de mRNA complementaria a rRNA 16S.

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3
Q

¿Que quiere decir que no haya efecto polar en la traducción en procariotas?

A
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4
Q

¿Hay RBS en el mRNA eucariota?

A

No. Hay unas secuencias conservardas alrededor del codon de iniciación que se llama secuencia Kozak.

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5
Q

¿Dónde en el mRNA eucariota se une el ribosoma?

A

El ribosoma se une al CAP e inicia la traducción en el primer codón iniciador que encuentra al desplazarse por el mRNA.

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6
Q

¿Es el mRNA policistrónico en eucariotas?

A

El mRNA eucariota es monocistrónico: un mRNA codifica solamente para una proteína.
Hay excepciones cuando codifican para proteínas muy pequeñas al principio del RNA, proteínas reguladoras de la traducción, sin función biológica.

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7
Q

A

A
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8
Q

B

A
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9
Q

C

A
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10
Q

D

A
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11
Q

E

A
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12
Q

¿Qué es especial sobre la secuencia de bases presente en el tRNA?

A

Tiene bases con modificaciones especiales.

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13
Q

Númera las bases del codón y anticodón.

A

Se llama primera base a la más cerca del extremo 5’.

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14
Q

¿Qué esta conservado en todos los tRNAs?

A
  • Los últimos nucleótidos en todos los tRNAs (extremo 3’) son CCA (a veces se añade a post- trascripcionalmente).
  • Bases conservadas: 7 en el brazo TYC , 4 en el brazo D y 1 en el brazo del anticodón).
  • Número de pares de bases en brazos TYC, D y aceptor.
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15
Q

¿Qué diferencias hay entre distintos tRNAs?

A

Algunas diferencias entre los tRNAs son:
* Anticodón
* Longitud del brazo variable: 3-5
bases en tRNAs de clase I, 13-21
bases en tRNAs de clase II.
* Discriminator base (anterior a CCA)

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16
Q

¿Cómo es la estructura terciaria del tRNA?

A
17
Q

¿Cómo nos vamos a encontrar un tRNA normalmente en la célula?

A

Unido a un AA (salvo en situaciones de escasez de AA).

18
Q

¿Qué son las aminoacil-tRNA sintetasas?

A
  • Las aminoacyl-tRNA sintetasas son una familia de enzimas que catalizan la reacción de union del aminoácido al tRNA.
  • Cada aminoacyl-tRNA sintetasa aminoacila todos los tRNAs que representan un aminoácido.
19
Q

¿Cómo reconoce una aminoacil-tRNA sintetasa a su tRNA?

A

El reconocimiento del tRNA por las tRNA sintetasas se basa en un grupo de nucleótidos del tRNA llamado identiy set, y que normalmente se concentran en el brazo aceptor y en las regiones del brazo del anticodón.

20
Q

¿Por qué es importante que las aminoacil-tRNA sintetasas unan cada tRNA con su AA correspondiente y no con otro?

A

Una vez se ha unido el AA, sólo se comprueba que el apareamiento codon-anticodon sea correcto. Por lo que el cargado del tRNA con su AA correspondiente forma parte de la fidelidad de la traducción.
La adición del aminoácido correcto al tRNA es un proceso crítico para la fidelidad de la traducción.

21
Q

¿Cómo es la reacción de unión del AA con el tRNA llevada a cabo por las aminoacil-tRNA sintetasas?

A

La unión del aminoácido al tRNA se lleva a cabo en dos pasos:
a. Adenilación del aminoácido: se forma un aminoácido adenilado con un enlace rico en energía que va a ser crítico en la traducción.
b. Carga del tRNA: el OH del extremo 3’ del brazo aceptor ataca al aminoácido adenilado, conectando el aminoácido al extremo 3’ y liberando AMP (se mantiene el enlace rico en energía).

22
Q

¿Cómo es la actividad proofreading de las aminoacyl-tRNA sintetasas?

A
23
Q

¿Qué avance consiguieron Severo Ochoa y Arthur Kornberg, de importancia para descifrar el código genético?

A

Estudiaron el mecanismo de la polinucleótido fosforilasa, que sirvió para poder sintetizar mRNA in vitro.

24
Q

¿Qué avance consiguió Marshall W. Niremberg, de importancia para descifrar el código genético?

A

Produjo cadenas de RNAs de solo una base, que daban lugar a una larga cadena de solo un tipo de AA. Así, se empezó a descifrar el código genético.
Para ello, consiguieron extractos celulares sin mRNA y añadieron su mRNA sintético. Descubrieron que subiendo la conc. de Mg2+ a 15mM se inica la traducción sin secuencias específicas.

25
Q

¿Qué avance consiguió Har Gobind Khorana, de importancia para descifrar el código genético?

A
26
Q

¿Qué avance consiguió Robert W. Holley, de importancia para descifrar el código genético?

A

Fue la primera persona que consiguió aislar el tRNA e identificar su estructura.

27
Q

¿Cuáles son 5 características del código genético?

A
28
Q

¿Qué es y por qué existe el fenómeno del balance/woobling?

A

La primera y segunda bases del codón (tercera y segunda del anticodon) siguen las reglas de apareamiento de Watson y Crick.
Sin embargo, en la tercera del codon (y primera del anticodon) hay un apareamiento más relajado (por ejemplo U en la 1ra posición del anticodon puede aparear con G o A=las dos purinas y G puede aparear con C o U = las dos pyrimidinas).
Esto se debe principalmente a dos factores:
1. La inosina se añade post-transcripcionalmente por desaminasas de adenosina especificas de tRNA (ADATs). (la Inosina puede aparear con A/C/U).
2. Fenómeno estructural. La primera base del anticodon está en una esquina, por lo que tiene mayor rango de movimiento para acomodarse a otras bases.

29
Q

¿Cuál es la composición del ribosoma eucariota y el ribosoma procariota?

A
30
Q

¿Cuál es la estructura del ribosoma?

A
31
Q

¿Cómo determino Ochoa la dirección de lectura del mRNA?

A
32
Q

¿Cómo se descubrió la dirección de síntesis de la cadena polipeptídica?

A

Mediante el uso de AA radioactivos, Howard Dintzis descubrió que la cadena polipéptidica se sintetiza desde el extremo N terminal al C terminal.
Empezaron la traducción de mRNAs con AA radioactivos y después la continuaron con AA no radiactivos.
Al terminar la traducción se dieron cuenta que la mayoría de la radioactividad estaba hacia el extremo N terminal.

33
Q
A