Tecnologías de secuenciación Flashcards
¿Qué es la secuenciación de ADN?
Es el proceso de determinar la secuencia de bases de nucleotidos en una fragmento de ADN.
¿Qué es DDNTP´s?
1.- especie de nucleotidos mutantes
2.- Dideoxinucleotidos
¿En qué dirección crece la nueva cadena de DDNTP´s?
De 5´a 3´
¿Como funciona la electroforesis capilar?
¿Qué es un electroferograma?
Resultado de la electroforesis capilar
¿Qué es un CDNA?
¿Qué es un transcriptoma?
Complejo o conjunto de genes que se están expresando en el proceso de transcripción.
¿En qué consiste la secuenciación Sanger?
_______ A medida que los fragmentos migran por el gel, los marcadores fluorescentes o radioactivos presentes en los ddNTPs se detectan, lo que permite identificar qué nucleótido (A, T, C, o G).
_______ De manera aleatoria, en lugar de un nucleótido normal, se incorpora un ddNTP (nucleótido terminado en dideoxi), lo que interrumpe la síntesis de la cadena, ya que estos ddNTPs no tienen un grupo 3’-OH necesario para agregar más nucleótidos.
______ Los fragmentos de ADN generados, de distintas longitudes, se separan por electroforesis en gel.
______ polimerasa comienza a sintetizar una nueva hebra de ADN complementaria a la hebra molde, añadiendo nucleótidos normales (dNTPs).
_______ El proceso de elongación se detiene en distintos puntos de la secuencia debido a la incorporación de los ddNTPs, generando cadenas de ADN de diferentes longitudes.
5.- A medida que los fragmentos migran por el gel, los marcadores fluorescentes o radioactivos presentes en los ddNTPs se detectan, lo que permite identificar qué nucleótido (A, T, C, o G).
2.- De manera aleatoria, en lugar de un nucleótido normal, se incorpora un ddNTP (nucleótido terminado en dideoxi), lo que interrumpe la síntesis de la cadena, ya que estos ddNTPs no tienen un grupo 3’-OH necesario para agregar más nucleótidos.
4.- Los fragmentos de ADN generados, de distintas longitudes, se separan por electroforesis en gel.
1.- La ADN polimerasa comienza a sintetizar una nueva hebra de ADN complementaria a la hebra molde, añadiendo nucleótidos normales (dNTPs).
3.- El proceso de elongación se detiene en distintos puntos de la secuencia debido a la incorporación de los ddNTPs, generando cadenas de ADN de diferentes longitudes.
¿Que ventajas tiene Sanger?
1.- es más precisa
2.- secuencia segmentos largos
3.- puede secuencias continuas
¿Que desventajas tiene Sanger?
1.- costosa
2.- ineficiente para la secuenciación de genomas completos y metagenomas
Cuáles son las divisiones de molécula única o de tercera generación?
1.- nanoporos
2.- hibridación
¿Qué tipo de secuenciación es ilumina?
Secuenciación por síntesis
¿Qué porcentaje representa la parte codificante del genoma?
2 %
