Tecniche di sequenziamento Flashcards
Da 29.1 a 34
Sequenziamento sanger. Generazione
Lunghezza reads
Limiti e vantaggi
29.1
Sequenziamento sanger. Come avviene se classico o automatizzato
29.1
Output sequenziamento sanger, descrizione
29.1
Formato file ottenuto da sequenziamento e descrizione
29.1
Cosa è il phred score. Come si calcola e minimo phred score accettabile per un sequenziamento
29.1
Roche 454. Generazione. Descrizione tecnologia e preparazione del campione
30
Rilevazione base con Sanger
29.1
Rilevazione base con Roche 454
30
Tecnologia illumina, preparazione del campione
30.1
Tecnologia illumina. Formazione cluster sulla flow-cell
30.1
Descrizione della flow cell illumina
30.1
Fase di sequenziamento Illumina. Come avviene
31
Seq. paired ends and sigle reads illumina, cosa ottengo con le due tecniche.
Metodo per paired ends
31
Rilevazione nt con illumina, diversi tipi di tecnologie
31
Svantaggi di illumina, a cosa sono dovuti?
31.1
Tecnologia solid. Preparazione della library e tecnica
32
Tecnologia solid rilevazione
32
Tecnologia ion torrent, preparazione library e tecnica
32.1
Rilevazione nt con ion torrent
32.1
Tecnologia helicos. Preparazione campione e tecnica
33
Rilevazione con helicos
33
Tecnica pacbio. Preparazione campioni e tecnologia
33.1
Rilevazione PacBio
33.1
Flow cell per PacBio
33.1
Preparazione campione nanopore
34
Tecnologia nanopore come funziona
34
Rilevazione nanopore e output
34
Struttura nanoporo per sequenziamento nanopore
34
Come posso sequenziare direttamente RNA cellulare con che tecnica e con che accorgimenti
34
Reads Sanger
29.1
Reads Illumina
30.1
Reads roche 454
30
Reads ion torrent
32.1
Reads nanopore
34
Reads solid
32
Reads pacbio
33.1
Store raw data in nanopore
34
Ultimi miglioramenti per nanopore
34
Detection di basi modificate con nanopore, diverse tecnologie emergenti. Su quali principi si basano i diversi algoritmi
34
Nanopolish, cosa è e come funziona
34
Come hanno identificato la presenza di ribonucleotidi nel DNA? Perchè c’erano?
34 dietro
