Genoma eucariotico Flashcards
Da 7.1 a 13
Cromosomi eucariotici, numero minimo, struttura
7.1
Sistema di packaging dei cromosomi
7.1
Istoni e nucleosomi. Cosa sono, come e di quanto riescono a compattare il dna
7.1
Forma più compattata del dna eucariotico, quale è? quando si trova così il dna?
7.1
Eucromatina ed eterocromatina differenze. Quando il dna si trova in una e nell’altra forma?
8
Eterocromatina costitutiva ed eterocromatina facoltativa. Differenze ed esempi
8.1
Struttura dell’eucromatina
8
Struttura dell’eterocromatina
8
Chromosome staining, localizzazione di ciascun cromosoma rispetto al nucleo
8
LAD e TAD. Cosa sono? Funzioni
8
Tecnica 3C. Obiettivi, fasi tecnica
8.1
Tecnica 4C. Obiettivi e fasi
8.1
Studio dei domini TAD
8.1
Tecnica 5c e Hi-C
8.1
Cluster map, a che serve come si crea
9
Definizione di insulators, dimensioni, effetto posizionale degli insulators
9
Effetto posizionale significato
9
Locus control regions. Cosa sono e funzione
9
Modifiche istoniche, a che servono, quando avvengono. Quali sono le più frequenti?
9.1
Cross-talk tra modifiche istoniche
9.1
Complessi di rimodellamento della cromatina atp dipendenti. Quali possono essere i meccanismi?
9.1
C-value paradox
10
Paradosso del numero dei geni
10
Numero degli stati teorici del trascrittoma, calcolo approssimativo e perchè non si calcola così
10
Contenuto in GC negli eucarioti in funzione della %GC in frammenti genetici
10
Curve isocore. Quali sono quelle umane? Come sono correlate alla presenza di geni?
10
Dove troviamo isocore L1 e L2?
10
Dove troviamo isocore H1 H2 e H3?
10
Cosa sono le isole CpG? Lunghezza, localizzazione. Perchè abbiamo meno cpg del dato atteso
10.1
Detection computazionale delle isole CpG. Che parametri devono essere rispettati?
10.1
Descrizione di un gene eucariotico
11
Struttura intronica per lo splicing
11.1
Come avviene lo splicing con gli elementi dell’introne? Che struttura si forma e destino di questa struttura
11.1
Introni di fase 0, di fase 1 e di fase 2
11.1
Trascrizione, maturazione rna e traduzione, generale
12
Come avviene lo splicing alternativo? Con quali meccanismi?
12
Cosa è lo spliceosoma? Tipologie e funzioni
12.1
Effetti dello splicing alternativo su caspasi 9
12.1
Cosa è il trans-splicing
13
Modello di definizione dell’introne e dell’esone, cosa sono e a cosa rispondono
12.1
