Techniques in molecular biology and biotechnology Flashcards

1
Q

Hu många kromosomer har arkéer och bakterier?

A

En cirkulär kromosom

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Hur många kromosomer har eukaryoter?

A

Flertalet kromosomer i kärnan, hur många beror på arten.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Vad har vissa bakterier extra av?

A

En extra minikromosom som kallas plasmid. De flesta plasmider kodar för antibiotikaresistans.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Hur replikerar plasmider sig? Hur kan de vandra?

A

Självständigt av bakteriekromosomen. De kan gå mellan bakterier. Detta är huvudorsaken till antibiotikaresitans.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Vad är plasmider?

A

Cirkulära minikromosomer härledda från bakterier

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Vad gör replication origin i plasmider?

A

Tillåter plasmidreplikation självständigt från bakteriekromosomen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Vad för typ av gen innehåller plasmider?

A

Antibiotikaresistans gen som ger bakterien en medfödd resistens.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Vad är plasmidvektorer?

A

De har blivit konstruerade att innehålla en promoter. Att placera en gen nedstöms vilket tillåter den genen att uttryckas i bakterien.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Vad är involverat i rekombinerat DNA teknologi?

A

Cutting och pasting av DNA till plasmidvektorer för framtida användning.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Vad är restriction enzymer?

A

Bakteriala enzym som klipper specifika DNA sekvenser med hög specialitet.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Vad är DNA ligas?

A

Sätter ihop DNA sekvenser efter replikation på lagging strand. Kan även användas vid DNA repair.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Vad används restriction enzym och DNA ligas till i bakterier?

A

Används i kloning för att cut and pastea ihop DNA segment.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Vad kan restriction enzymer användas till i bakterier?

A

Försvar mot en viral infektion

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Vad involverar kloning?

A

Limning av DNA segment till bakterieplasmider för att tillåta amplifikation, sekvensering eller rekombinerad proteinproduktion.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Hur sker kloning?

A

Ett DNA segment behandlas med ett restriktionsenzym. Segmentet mixas med en plasmid som har klippts med samma enzym. DNA fragmentet och plasmiden sätts ihop med DNA ligas för att producera en cirkulär plasmid som innehåller DNA segmentet.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Hur sker förstärkning av klonade plasmider?

A

Plasmiden kan förstärkas genom transformationsprocessen och rening från bakterialkulturen.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Vad är transformation och hur sker det?

A

Processen där bakterien tar upp plasmid DNA som innehåller en intressant gen. Plasmiden innehåller en gen för antibiotikaresistans. Bakterien värmechockas för att få porer i bakteriens cellvägg vilket tillåter plasmiden att gå in i cellen.

18
Q

Vad klassifieras en gen som som innehåller en modifierad plasmid?

A

GMO (genetically modified)

19
Q

Hur fungerar DNA amplifikation i bakterier?

A

En plasmid introduceras för bakterier replikeras när bakterien växer. När bakterien når log-fastillväxt kan de skördas och plasmid DNA renade.

20
Q

Vad är rekombinanta proteiner

A

Mänskliga proteiner som produceras i bakterieceller.

21
Q

Hur fungerar rekombinant proteinproduktion?

A

En mänsklig gen som finns i en plasmid introduceras i bakterien. Bakteriens transkriptions och translations maskineri gör RNA och protein från mänskliga gener.

22
Q

Hur går djurkloning till?

A

Man tar kärnan från en vuxens cell och fuserar det en anukleär eggcell. Embryot innehåller genetisk information av kärndonatorn och blir en exakt genetisk kopia.

23
Q

Hur fungerar transgeniska djur?

A

DNA encoding gen introducerat till embryoniska celler efter en in vitro fertilisering. Embryot implanteras i modern. Avkomman kommer uttrycka den introducerade genen i alla kroppsceller. Detta är känt som transgeniskt djur.

24
Q

Vad kan transgeniska djur användas som?

A

För att behandla eller bota mänskliga sjukdomar och för att förstå hur vissa gener influerar patologier.

25
Q

Fördelar med att använda GMO?

A

Mer mat, kan göra att växter kan stå emot bland annat kyla.
Minskade miljöpåverkningar.
Kan användas för att göra framsteg inom medicin.

26
Q

Nackdelar med GMO?

A

Etiska frågor
Risk för hyperhybrider
Okända sideffekter
Exploatering

27
Q

Hur fungerar PCR?

A
  1. Initiation
  2. Denaturation (95 grader)
  3. Primer annealing (55 grader)
  4. Extension (72 grader)
  5. Slutet av först cykeln
  6. Återgå till steg 2 och repetera 30-40 gånger
28
Q

Vilka tre huvudsteg består PCR av?

A

Deaturation för att separera DNA-strängarna.
Annealing så att primers kan binda.
Elongation för att polymeras ska fungera.

29
Q

Hur tillverkar man gel elektrofores?

A
  1. Load DNA sample
  2. Apply curent
  3. Analyze gel
30
Q

Hur fungerar gelet i elektrofores?

A

Gelet innehåller en fluorescent dye som binder till DNA. DNA band visualiseras under UV ljus.

31
Q

Vad är real-time PCR?

A

En PCR metod som använder fluorescent probes för att övervaka amplifikation i realtid.

32
Q

Vad är principerna för real time PCR?

A

Samma som för vanlig PCR men då DNA amplifieras ökar fluorescent intensiteten.

33
Q

Hur fungerar reverse transcriptase PCR?

A
  1. Purify DNA
  2. Reverse transcription of purified RNA to cDNA
  3. Amplify directly by qPCR
  4. Measure cDNA (mRNA) concentration
34
Q

Vad är omvänd transkription? Hur fungerar det?

A

En reaktion för att omvandla RNA till DNA (cDNA). Reaktionen använder ett extra steg med reverse transcriptase.

35
Q

Vad används omvänd transkription till?

A

Tekniken används för att analysera RNA och för att konvertera processerat mRNA till DNA för kloning till rekombinerade uttryckta vektorer.

36
Q

Vad innebär precision medicine (therapy)?

A

Involverar karakterisering av en patients genetiska profil för att förutse vilket medicin som är mer fördelaktig för deras behandling. Två patienter kan svara olika på samma medicin.

37
Q

Hur fungerar CRISPR/Cas9?

A

Utvecklades som ett bakteriellt immunsystem. Infekterade bakterier använder Cas 1/2 enzymer för att klippa en del av viral DNA. Cas enzymer modifierar DNA så att det kan bli pasted till CRISPR sites i bakteriens genom. DNA som infogas till CRISPR sites i bakteriens genom.

38
Q

Vad kan CRISPR/Cas 9 genredigering användas till?

A

CRISPR/Cas9 kan användas för att modifiera DNA genom att fungera som en molekylsax. Kan användas för att reparera felaktiga gener och behandla vissa sjukdomar.

39
Q

Hur fungerar DNA forensics?

A
  1. DNA används för att identifiera oidentifierade kroppar
  2. DNA forensics baseras på korta tandem upprepningar loci utspridda genom genomet
  3. STR: Sekvenser av baspar upprepningar. Högt varierade mellan individer
  4. STR nummer varieras vid samma site på varje kromosom (beroende på om det är maternalt eller paternalt)
40
Q

Vad är ett loci?

A

Specifika regioner på kromosomerna specifikt där en särskild gen eller genetisk markör finns.

41
Q

Hur fungerar genetiska test? Vad kan de visa?

A

Ger information om mutationer och associationer med mänskliga sjukdomar. 1 kopia av en gen från varje förälder. 1 kopia kan vara muterad och 1 normal.