Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

TBME03 > Från gen till protein 2 > Flashcards

Från gen till protein 2 Flashcards

1
Q

Vad är RNA?

A

En kopia av DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Vad kallas processen där RNA skapas?

A

Transkription

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Vad innehåller RNA?

A

Informationen som blir receptet för tillverkningen av protein.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Vad kallas processen när proteiner skapas?

A

Translation

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Vad är det centrala dogmat?

A

Linjär transformering av information från DNA till protein

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Gör icke kodande gener RNA och proteiner?

A

De gör proteiner men inte RNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Vad gör rRNA gener och var finns de?

A

Gör katalytiskt RNA som behövs för att ribosomen ska fungera. rRNA gener finns i kärnan där nya ribosomer skapas.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Vad gör tRNA gener?

A

Kodar för tRNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Vad gör tRNA och vad är det?

A

Klöverbladsliknande RNA molekyl som bildas genom parning i molekylen. De sätts samman till en specifik aminosyra som avgörs av dess anti-kodon sekvens.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Vad gör miRNA gener?

A

Kodar för miRNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Vad är miRNA?

A

Små RNA strängar som korsas med specifika mRNA molekyler. miRNA formerar en del av RISC komplexet som riktar in sig på mRNA för degradering och minskar uttrycket av vissa gener.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Vad gör XIST gener?

A

Kodar för XIST RNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Vad är XIST RNA?

A

En stor RNA molekyl som är involverad i X kromosom inaktivering hos kvinnor.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Vad står DNA för?

A

Deoxyribonucleic acid

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Vad står RNA för?

A

Ribonucleic acid

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Vad används kolnumerering av ribosgruppen till?

A

Avgör riktningen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Vad kan RNA göra?

A

Fungerar som informationsförvaring, det är självreplikerande och katalyserar vissa reaktioner genom att fungera som ett ribozyme.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Varför finns inte uracil i DNA?

A

Informationen skulle snabbt bli rörig. Uracilavkänningsenzymer tar bort det från DNA när det uppstår.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Hur fungerar transkription?

A

En DNA sträng är den kodade strängen vilket bli proteinet. En sträng är mallsträngen (template strand), RNA polymeras använder detta för att skapa RNA. Sekvensen hos den kodande strängen ska vara identisk till RNA förutom att uracil ersätter tymin.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Vad innehåller eukaryota gener?

A

Många regulatoriska sekvenser samt proteinkodande regioner (ORF).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Vad inkluderar uppströmsregulatoriska sekvenser?

A

Distala och proximala förstärkare/tystare

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Vad är TATA boxen?

A

Kärnpromotern, en sekvens av DNA som binder RNA polymeras. Det är bindningsplatsen för transkriptionskomplexet.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Vad innehåller ORF?

A

Instruktionerna för ett protein, minus introder

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Vad inkluderar nedströmssekvenser?

A

En terminator som stoppar transkriptionen och kontrollerar element som kan influera genuttryck.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Prokaryoters gener?

A

Har relativt enkla gener där genen transkriberas helt till en mRNA molekyl.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Hur är prokaryota gener organiserade?

A

Många är orgaiserade som operoner vilket är gupper av relaterade gener som aktiveras eller undertrycks av närvarandet av specifika metaboliter.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

Eukaryota gener?

A

Mer komplexa, innehåller regioner kända som introner som inte kodar för protein.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

Vad transkriberas introner till?

A

RNA, men de tas bort i kärnan genom splicing för att skapa mRNA.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

Vad gör kondensering av kromatin?

A

Gömmer åtkomsten till gener, det behöver vara i en öppen formation för att tillåta tillträde till transkriptionsmaskineriet.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

Vad innebär nukleosom innehavande?

A

Histoner behöver ibland tas bort för att tillåta tillträde.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

Vad innebär histonmodifikation?

A

Histoner kan modifieras av kemiska grupper som ökar eller minskar deras interaktion med DNA:t.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

Vad innebär transkriptionsfaktortillgänglighet?

A

Vissa transkriptionsfaktorer uttrycks bara under vissa stimulin.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

Vad är regulatoriska element?

A

Förstärkarregioner ökar uttrycket av generna som de reglerar.

34
Q

Vad är transkriptionsfaktorer?

A

Proteiner som hjälper till att rekrytera RNA maskineriet till promotern av gener.

35
Q

Vad är genpromotern?

A

En region av DNA som koordinera transkription från en gen, som en på/av knapp för gener.

36
Q

Vad består transkriptionskomplexet av?

A

Transkriptionsfaktorer och RNA polymeras 2 (enzymet som tillverkar RNA).

37
Q

Vad är/gör “förbättrande regioner” (enhancer regions)?

A

Förser med specifisering. Aktivatorer och maediatorer hjälper till att speeda upp och stabilisera transkriptionsfaktorförsamlingen, t.ex. p53 där E2F binder förstärkare i generna de reglerar.

38
Q

Vad händer när transkriptionskomplexet blivit byggt?

A

Det hålls i ett inaktivt tillstånd. Fosforylation av RNA polymeras 2 orsakar disassociation av komplexet och RNA polymeras 2 börjar röra sig in till genen.

39
Q

Vad gör RNA polymeras 2?

A

Läser DNA sekvenser från template strand och bygger en korrespondernade RNA kopia. Ribonukleotider är byggstenar, uracil istället för tymin.

40
Q

När stannar RNA polymeras 2?

A

Fortsätter till en termineringssekvens i slutet av genen nås. Polymeras 2 dissocierar och RNA processeras.

41
Q

Vad tystar genuttryck och vad tillåter detta?

A

Bindning av vissa transkriptionsfaktorer vilket tillåter negativ reglering av vissa gener.

42
Q

Vad består retrovirus av?

A

Har ett RNA genom och innehåller ett enzym som kallas reverse transkriptas.

43
Q

Vad händer vid en infektion?

A

Virusets RNA genom kopieras till DNA av reverse transcriptase (genom användning av fria nukleotider) i cytosolen. Detta bryter det centrala dogmat (DNA-RNA-Protein).

44
Q

Vad händer med DNA kopian av virusets genom?

A

Tas in i cellkärnan och sys in i cellens genom. Virus DNA genomet kan sedan producera RNA och reverse transkriptas att producera nya virala partiklar.

45
Q

Hur sker RNA processing?

A
  1. 5´ änden har en cap med en atypisk guanin (innehåller metylgrupp). Capping enzymkomplex binder till polymeras 2 och RNA molekyler begränsas efter transkriptionen startar. 5´ capping ökar stabiliteten och är nödvändig för kärntransport.
  2. Post polymeras transkription repeterad adenin rester adderas till 3´ svansen. PolyAsvansen ökar stabiliteten av RNA molekylen.
  3. Splicing av introner: Splicosom maskineriet tar bort introner från RNA molekylen och sätter ihop exonerna.
  4. RNA bindande proteiner känner igen processerar mRNA och underlättar dess export till cytosolen.
46
Q

Vad är introner?

A

Introner är mellanliggande sekvenser i gener som inte kodar för protein.

47
Q

Vad är exoner?

A

De uttryckta sekvenserna

48
Q

Vad måste göras för att få ett fungerande protein?

A

För att tillverka ett fungerande protein måste intronerna tas bort. Hela genen, inklusive intronerna, transkriberas och det blir pre-mRNA.

49
Q

Vad är en splicosom och vad gör den?

A

Ett protein-RNA komplex som binder knutpunkterna mellan introner och exoner och tar bort intronerna vilket ger mRNA. Processen kallas splicing.

50
Q

Vad ger alternativ splicing av exoner?

A

Produktionen av funktionella olika proteiner.

51
Q

Varför är det bra med introner och exoner?

A

Det ger mångfald

52
Q

Hur fungerar proteintranslation?

A

RNA strängen som tillverkats modifieras och lämnar kärnan. Den binder till RNA och läser koden till ett protein.

53
Q

Vad är en ribosom?

A

Ett multiproteinkomplex som innehåller rRNA. Består av en stor och en liten subenhet.

54
Q

Vad är tRNA?

A

En RNA struktur som innehåller ett anti-kodon som är komplementärt till kodonet i mRNA:t. Varje tRNA har en specifik aminosyra kopplat korrekt för sin anti-kodon sekvens.

55
Q

Hur fungerar miRNA regelering av genuttryck?

A
  1. Pre-miRNA transkriberas från miRNA gener. RNA:t self anneals och det formeras en hårnålsstruktur.
  2. Pre-miRNA binder till enzymet Dicer och klyvs till små fragment.
  3. Ett RNA fragment rekryteras till RNA inducerade tystande komplexet (RISC).
  4. RISC + miRNA binder till ett komplementärt mRNA.
  5. mRNA klyvs av RISC komplexet.
  6. Klyvt mRNA degraderas i cellen.
56
Q

Vad gör miRNA och hur?

A

miRNA reglerar genuttryck genom att destablisera mRNA efter att det har transkriberats från gener. Sekvensen i miRNA är spegelsekvensen av mRNA. De kan reglera genuttryck genom att degradera specifikt mRNA eller blockera ribosomassociation.

57
Q

Hur fungerar acetylering?

A

Maskeras positiva laddningar på histoner vilket reducerar interaktionen med DNA (negativt laddad).

58
Q

Hur fungerar metylering?

A

Skapar dockingsplatser för repressorproteiner att binda till. Associerade med packning och gentystning.

59
Q

Hur fungerar fosforylering?

A

Associeras med DNA skada och mitos. Används för att markera skadat DNA för reparationsplatser. Histon 3 fosforylering triggar kromosompackning i M-fasen.

60
Q

Hur fungerar ubiquitinering?

A

Kan markera histoner för degradering.

61
Q

Vad sker ofta vid ladade aminosyror (lysin och arginin) i histonsvansarna?

A

Vanliga platser för modifiering

62
Q

Vad gör acetylering av kärnhistoner?

A

Reducerar positiva laddningar på histonproteinet. Reduktionen i laddning reducerar elektronstatiska interaktioner mellan negativt laddat DNA och positivt laddade histoner.

63
Q

Vad leder metylering av histoner till?

A

Skapar dockningsplatser för repressorproteiner för att binda och göra DNA kompakt.

64
Q

Vad är processen av histon acetylering och deacetylering?

A

Reversibel

65
Q

Vad avgör om kromatinet är öppet eller stängt?

A

På motsatta åtgärder av acetylaser/deacetylaser och metylaser/demetylaser.

66
Q

Metylering av cytosin?

A

Cytosinrester kan modifieras direkt av metylering.

67
Q

Vad associeras metylering av cytosin i promoters med?

A

Gensplicing

68
Q

När sker permanent metylering av vissa genpromotorer?

A

Under stamcellsdifferentiering och imprinting

69
Q

Vad underhåller pluripotenta stamceller?

A

Metylering av gener som kontrollerar differentiering.

70
Q

Vad gör demetylering med stamceller?

A

Demetylering tvingar stamceller att specialisera sig.

71
Q

Vad är genomic imprinting?

A

En mekanism där en gen tystas beroende på vilken förälder den ärvdes från.

72
Q

Vad är promoters och förstärkande regioner hos en imprintad gen? Vad leder detta till?

A

Den är starkt metylerad. Metylering rekryterar repressorproteiner som blockerar promoterplatsen och orsakar kompaktering av genregionen. Transkriptionskomplexet kan då inte nå genen.

73
Q

Vad korrelerar förändringar i genomic imprinting till?

A

sjukdom och trauma

74
Q

Vad innebär X kromosom inaktivering? När sker det?

A

Kvinnor har två X kromosomer, en från varje förälder men bara en uttrycks. Under embryogenesen inaktiveras en X kromosom slumpmässigt. Processen kontrolleras av XIC som innehåller XIST genen.

75
Q

Hur fungerar X kromosom inaktivering?

A

Båda X kromosomerna uttrycker XIST genen. Under utvecklingen uttrycker en gen mer XIST RNA än den andra. XIST RNA rekryterar metyltransferaser som tystar kromosomen.

76
Q

Vad gör insulinlik tillväxtfaktor genen (IGF2)?

A

Kodar för en tillväxtfaktor som stimulerar tillväxt och metabolism. Ökning av uttryck av genen gör en person till en “better survivor” vid lågnutrienta förhållanden.

77
Q

Vad leder epigenetiska förändringar i cancer till?

A

Det kan alternera hur proto-oncogener eller tumör suppresor gener uttrycks.

78
Q

Vad leder genome-wide demetylering till?

A

Aktivering av tystade gener (cancer-testis genes) och transposabla element ökar genomisk instabilitet.

79
Q

Vad kan reducerad acetylering leda till?

A

Kan tysta nyckel tumör suppressors

80
Q

Vad är överuttryckt i cancer?

A

Deacetylaser (HDACs)

81
Q

Vad gör att man blir laktosintolerant?

A

Man uttrycker inte laktas och kan då inte bryta ner laktos.

TBME03 (16 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions