Taxonomie des microorganismes

Question 1

Qu’est ce que la taxonomie?

Answer 1

Établir des groupes d’organismes qui présentent des caractères communs

Question 2

Comment appelle-t-on les groupes taxonomiques?

Answer 2

Des taxons ou taxa

Question 3

Comment fonctionne en général la hiérarchie des taxons?

Answer 3

Plus on va dans les rangs inférieurs, plus les traits sont restrictifs et moins il y a d’organismes qui les partagent.

Question 4

Donnez l’ordre des taxons chez les organismes bactériens (procaryotes)

Answer 4

• Domaine
• Phylum (embranchement)
• Classe
• Ordre
• Famille
• Genre
• Espèce

Question 5

Quel est le suffixe à ajouter dans le nom d’un ordre? Et d’une famille?

Answer 5

Ordre: -ales
Famille: -aceae

Question 6

Donnez l’ordre des taxons chez les eucaryotes

Answer 6

• Domaine
• Règne
• Embranchement
• Sous-embranchement
• Classe
• Ordre
• Famille
• Genre
• Espèce

Question 7

Quelles sont les trois étapes pour donner une taxonomie adéquate à un microorganisme?

Answer 7

1. Identification
2. Nomenclature
3. Classification systématique

Question 8

Qu’est-ce qu’une souche?

Answer 8

C’est un descendant d’une culture pure. Toutes les souches d’une même culture ne sont pas complètement identiques.

Question 9

Expliquez ce qu’est une espèce avec la notion de souche

Answer 9

Une espèce est un groupe de souches dont les caractéristiques sont presque identiques.

Question 10

Qu’est ce qu’une souche-type?

Answer 10

C’est une souche qui possède toutes les caractéristiques de l’espèce, souvent la référence.

Question 11

Quels sont les deux éléments de base nécessaire à l’identification (pour la taxonomie)

Answer 11

1. Il faut au préalable une culture pure de l’organisme d’intérêt
2. Il faut une souche -type en qualité de témoin comparatif.

Question 12

Vrai ou faux. L’ADN bicaténaire absorbe plus que l’ADN monocaténaire en spectroscopie UV.

Answer 12

Faux, c’est le contraire

Question 13

Définissez la température de fusion

Answer 13

C’est la température à laquelle 50% de l’ADN est sous forme monocaténaire

Question 14

Quel est l’impact de l’augmentation du pourcentage en G/C?

Answer 14

Augmentation de la température de fusion de l’organisme en question

Question 15

Quel est le pourcentage en G/C chez les plantes et les animaux? Et chez les microorganismes?

Answer 15

Plantes et animaux: 30-50%
Microorganismes: 25-80%

Question 16

Pourquoi dit-on que le pourcentage en G/C n’est pas exclusif d’une expece?

Answer 16

Parce que cette valeur est typique d’une espèce, mais cette espèces n’est pas nécessairement la seule a posséder ce même pourcentage en G/C

Question 17

Nommez deux façons d’identifier des interactions avec l’hôte.

Answer 17

1. La pathogénicité, qui est la capacité à provoquez une maladie chez différents hôtes
2. Symbiose

Question 18

Donnez un exemple de symbiose chez les poissons

Answer 18

Chez les poissons de fond, leur bioluminescence est causé par des microorganismes et non pas le poisson lui-même.

Question 19

Quelle est l’origine de la nomenclature?

Answer 19

Carl Von linné

Question 20

Nommez les quatre grandes caractéristiques de la nomenclature linnéenn

Answer 20

1.Binomiale
2. La première lettre du genre est en majuscule et c’est du latin/grec
3. Doit être descriptif (Ex.: Lactococcus, Pyrococcus, etc.)
4. Historique de la découverte

Question 21

Quels sont les deux paramètres pour déterminer la classification des microorganismes?

Answer 21

1. Selon les caractères communs
2. Selon les liens évolutifs

Question 22

Quels sont les deux types de classification? Expliquez.

Answer 22

1. Naturelle: nature biologique (atomique) des organismes
2. Phénétique: Caractères phénotypiques similaires

Question 23

Donnez les caractéristiques principales de la classification numérique

Answer 23

1. Comparaison de plusieurs organismes
2. Comparaison 2 par 2
3. Minimum de 50 caractères

Question 24

Qu’est ce que le %S?

Answer 24

C’est le pourcentage de similarité dans la classification numérique

Question 25

Donnez la formule du %S

Answer 25

%S = Nb de caractères similaires/Nb de caractères totaux*100%

Question 26

Expliquez ce que veut dire un %S de 24

Answer 26

Sur 100 caractères, il y en a 24 qui sont similaires entres les organismes A et B

Question 27

Quelle est la limite de la classification numérique?

Answer 27

La pondération des caractères

Question 28

Quelle est le problème avec la pondération des caractères dans la classification numérique?

Answer 28

C’est le fait que deux caractères ont le même poids, même si l’un peut avoir une fonction beaucoup plus importante que l’autre

Question 29

Qu’est ce que la pondération des caractères?

Answer 29

C’est le fait que dans la classification numériques, on attribue de manière uniforme le même poids à chacun de caractères, indépendamment de leur fonction par exemple.

Question 30

Qu’est ce que la phylogénétique?

Answer 30

C’est le fait de déduire des relations évolutives probables grâce aux ancêtres communs

Question 31

Pourquoi dit-on que les séquences conservés sont des chronomètres moléculaires?

Answer 31

Parce que si il y a une mutation et qu’elle n’a aucun effet, l’organisme survit et porte la mutation à long terme.
Si par contre la mutation a un effet néfaste sur l’organisme, ce dernier ne survit pas

Question 32

Vrai ou faux. Un mutation survient de manière contrôlée.

Answer 32

Faux, c’est au hasard