Taxonomie des microorganismes Flashcards
Qu’est ce que la taxonomie?
Établir des groupes d’organismes qui présentent des caractères communs
Comment appelle-t-on les groupes taxonomiques?
Des taxons ou taxa
Comment fonctionne en général la hiérarchie des taxons?
Plus on va dans les rangs inférieurs, plus les traits sont restrictifs et moins il y a d’organismes qui les partagent.
Donnez l’ordre des taxons chez les organismes bactériens (procaryotes)
- Domaine
- Phylum (embranchement)
- Classe
- Ordre
- Famille
- Genre
- Espèce
Quel est le suffixe à ajouter dans le nom d’un ordre? Et d’une famille?
Ordre: -ales
Famille: -aceae
Donnez l’ordre des taxons chez les eucaryotes
- Domaine
- Règne
- Embranchement
- Sous-embranchement
- Classe
- Ordre
- Famille
- Genre
- Espèce
Quelles sont les trois étapes pour donner une taxonomie adéquate à un microorganisme?
- Identification
- Nomenclature
- Classification systématique
Qu’est-ce qu’une souche?
C’est un descendant d’une culture pure. Toutes les souches d’une même culture ne sont pas complètement identiques.
Expliquez ce qu’est une espèce avec la notion de souche
Une espèce est un groupe de souches dont les caractéristiques sont presque identiques.
Qu’est ce qu’une souche-type?
C’est une souche qui possède toutes les caractéristiques de l’espèce, souvent la référence.
Quels sont les deux éléments de base nécessaire à l’identification (pour la taxonomie)
- Il faut au préalable une culture pure de l’organisme d’intérêt
- Il faut une souche -type en qualité de témoin comparatif.
Vrai ou faux. L’ADN bicaténaire absorbe plus que l’ADN monocaténaire en spectroscopie UV.
Faux, c’est le contraire
Définissez la température de fusion
C’est la température à laquelle 50% de l’ADN est sous forme monocaténaire
Quel est l’impact de l’augmentation du pourcentage en G/C?
Augmentation de la température de fusion de l’organisme en question
Quel est le pourcentage en G/C chez les plantes et les animaux? Et chez les microorganismes?
Plantes et animaux: 30-50%
Microorganismes: 25-80%
Pourquoi dit-on que le pourcentage en G/C n’est pas exclusif d’une expece?
Parce que cette valeur est typique d’une espèce, mais cette espèces n’est pas nécessairement la seule a posséder ce même pourcentage en G/C
Nommez deux façons d’identifier des interactions avec l’hôte.
- La pathogénicité, qui est la capacité à provoquez une maladie chez différents hôtes
- Symbiose
Donnez un exemple de symbiose chez les poissons
Chez les poissons de fond, leur bioluminescence est causé par des microorganismes et non pas le poisson lui-même.
Quelle est l’origine de la nomenclature?
Carl Von linné
Nommez les quatre grandes caractéristiques de la nomenclature linnéenn
1.Binomiale
2. La première lettre du genre est en majuscule et c’est du latin/grec
3. Doit être descriptif (Ex.: Lactococcus, Pyrococcus, etc.)
4. Historique de la découverte
Quels sont les deux paramètres pour déterminer la classification des microorganismes?
- Selon les caractères communs
- Selon les liens évolutifs
Quels sont les deux types de classification? Expliquez.
- Naturelle: nature biologique (atomique) des organismes
- Phénétique: Caractères phénotypiques similaires
Donnez les caractéristiques principales de la classification numérique
- Comparaison de plusieurs organismes
- Comparaison 2 par 2
- Minimum de 50 caractères
Qu’est ce que le %S?
C’est le pourcentage de similarité dans la classification numérique
Donnez la formule du %S
%S = Nb de caractères similaires/Nb de caractères totaux*100%
Expliquez ce que veut dire un %S de 24
Sur 100 caractères, il y en a 24 qui sont similaires entres les organismes A et B
Quelle est la limite de la classification numérique?
La pondération des caractères
Quelle est le problème avec la pondération des caractères dans la classification numérique?
C’est le fait que deux caractères ont le même poids, même si l’un peut avoir une fonction beaucoup plus importante que l’autre
Qu’est ce que la pondération des caractères?
C’est le fait que dans la classification numériques, on attribue de manière uniforme le même poids à chacun de caractères, indépendamment de leur fonction par exemple.
Qu’est ce que la phylogénétique?
C’est le fait de déduire des relations évolutives probables grâce aux ancêtres communs
Pourquoi dit-on que les séquences conservés sont des chronomètres moléculaires?
Parce que si il y a une mutation et qu’elle n’a aucun effet, l’organisme survit et porte la mutation à long terme.
Si par contre la mutation a un effet néfaste sur l’organisme, ce dernier ne survit pas
Vrai ou faux. Un mutation survient de manière contrôlée.
Faux, c’est au hasard
