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Biochimie > Synchrone chap 11 > Flashcards

Synchrone chap 11 Flashcards

1
Q

Quelle enzyme (et son type) converti le lactose en glucose, galactose et allolactose?

A

La bêta-galactosidase est une enzyme inductive (seulement présente en grande quantité en présence de lactose)

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Q

Qu’est-ce qu’un répresseur?

A

Une molécule, souvent une protéine, régulant négativement la transcription d’un ou de plusieurs gènes en se liant à une séquence spécifique sur l’ADN, appelée opérateur.

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Q

Explique ce qui se passe lorsque le lactose est disponible comme source de carbone.

A

Une partie du lactose se transforme en allolactose. Lorsque l’allolactose se fixe au répresseur lac I, cela induit une transformation qui entraîne la dissociation du répresseur de son site de liaison sur l’opérateur.

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Q

Qu’empêche la fixation du répresseur lac?

A

Elle empêche l’ARN polymérase de démarrer la transcription. Cependant, l’ARN polymérase peut tout de même s’attacher au promoteur.

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5
Q

La liaison de quelle protéine à l’ADN permet d’accélérer l’initiation de la transcription par le complexe de l’ARN polymérase?

A

CRP (cyclic AMP receptor protein)

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6
Q

Quelle molécule inhibe la formation de AMPc, ce qui inactive la CRP?

A

Le glucose

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7
Q

Comment peut-on contrôler la transcription?

A

-Avec les activateurs: permet d’accélérer la transcription à partir de promoteur peu puissant (ex: protéine CRP)

-Avec des répresseurs: freinage de la transcription (empêchement de l’ARN polymérase d’atteindre le promoteur ou inhiber les réactions d’initiation ou empêcher l’enzyme de quitter le promoteur)

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8
Q

Vrai ou faux.
Les gènes lac sont exprimés en tout temps.

A

Vrai.

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9
Q

Comment peut-on expliquer la diversité de types et états cellulaires chez les organismes multicellulaires?

A

Facteurs de transcription

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10
Q

Que sont les facteurs de transcription?

A

Des protéines qui décide si un gène est exprimé ou pas

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11
Q

Quelles sont deux caractéristiques des facteurs de transcription (FT)?

A

-Possèdent 1 ou plusieurs domaines de fixation à l’ADN qui se fixent à une séquence régulatrice de l’ADN

-Possèdent un domaine qui module la transcription

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12
Q

Comment classifie-t-on les facteurs de transcription?

A

-En facteurs constitutifs
-En facteurs régulateurs (régulés par le développement ou par des signaux spécifiques

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13
Q

Que représente LacI?

A

C’est le membre fondateur de protéines qui lie l’ADN et régulent la transcription. Il lie la séquence de l’opérateur dans l’opéron lac.

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14
Q

Vrai ou faux.
Chaque FT lie de façon spécifique une séquence consensus qui constitue son élément de réponse.

A

Vrai.

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15
Q

Après avoir liée sa séquence consensus, que peut faire le FT?

A

Recruter des complexes de remodelage de la chromatine, médiateur, les facteurs généraux et l’ARN polymérase.

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16
Q

Vrai ou faux.
Les facteurs généraux sont les régulateurs principaux de l’expression des gènes.

A

Faux.
Ce sont les facteurs de transcription qui sont les régulateurs principaux de l’expression des gènes.

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17
Q

Vrai ou faux.
Les facteurs de transcription peuvent réprimer les gènes.

A

Vrai.

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18
Q

Combien de gènes sont régulés par chaque facteur de transcription?

A

Des milliers

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19
Q

Si un FT peut réguler l’expression de milliers de gènes, qu’est-ce que ces gènes ont en commun?

A

Ils ont tous l’élément de réponse correspondant pour ce FT précisément.

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20
Q

Comment sont régulés chaque type cellulaire?

A

Par un ou une combinaison spécifique de FT.

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21
Q

Quelle famille de FT contrôle le développement, mais plus spécifiquement, l’organisation de l’embryon et l’identité des plusieurs organes?

A

Les homéodomaines

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22
Q

Vrai ou faux.
Les gènes Hox contrôlent le développement des segments du corps le long de l’axe antéro-postérieur.

A

Vrai.

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23
Q

Vrai ou faux.
Pour la plupart des gènes, un seul FT est requis pour son expression.

A

Faux.
La plupart des gènes nécessitent plus d’un FT pour leur expression.

24
Q

Que sont les amplificateurs (enhancer)?

A

Séquences d’ADN qui augmentent la transcription et peuvent agir à distance du promoteur, soit en amont ou en aval.

25
Q

Nomme quelques propriétés des amplificateurs.

A

-Plusieurs centaines de pb
-Plusieurs éléments de répons
-Lient plusieurs FT
-La liaison est coopérative

26
Q

Qu’est-ce qu’un coactivateur?

A

Cela inclut les complexes de remodelage de la chromatine. Un coactivateur aide à enlever l’effet répresseur des histones en les modifiant

27
Q

Qu’est-ce qu’un corépresseur?

A

Oppose l’action de coactivateur et modifie la chromatine.

28
Q

Qu’implique l’activation de la transcription?

A
  1. La liaison du FT
  2. Le recrutement de coactivateurs et le remodelage de la chromatine
  3. Le recrutement du médiateur
  4. Le recrutement de la pol II et des facteurs généraux
29
Q

Qu’est-ce que la maturation?

A

Décrit l’ensemble des modifications qui transforment les transcrits primaire d’ARN en molécules matures.

30
Q

Quels sont les types de remaniements possible lors de la maturation de l’ARN?

A
  1. La soustraction de nucléotides aux transcrits primaires d’ARN
  2. L’addition de séquences nucléotidiques non codées par le gène correspondant
  3. La modification covalente de certaines bases.
31
Q

Vrai ou faux.
Chez les procaryotes, le transcrit primaire d’ARNm est traduit tel quel. En fait sa traduction démarre avant même que la transcription ne s’achève.

A

Vrai.
Il n’y a pas de maturation chez les procaryotes.

32
Q

Chez les eucaryotes, où se déroule:
A. transcription
B. traduction

A

A. noyau
B. cytoplasme

33
Q

Comment sortent les ARNm du noyau après leur maturation?

A

Par les pores nucléaires

34
Q

Quand débute la maturation chez les eucaryotes?

A

Avant la fin de la transcription, dès que le transcrit commence à émerger de l’ARN polymérase

35
Q

Lors de la maturation chez les eucaryotes, comment est modifié l’extrémité 5’?

A

On élimine d’abord le groupe phosphate terminal sous l’action d’une phosphohydrolase. Le groupe 5’-diphosphate formé réagit avec une GTP pour donner une liaison 5’-5’-triphosphate.

36
Q

Qu’est-ce qui résulte de la modification de l’extrémité 5’ et quelle enzyme le permet?

A

La coiffe et cette réaction est catalysée pas l’enzyme guanylyltransférase.

37
Q

Lorsque la coiffe est présente, comment transforme-t-elle le précurseur d’ARNm.

A

Elle le transforme en substrat pour d’autres enzymes nucléaires de maturation, comme celles qui effectuent l’excision-épissage.

38
Q

Dans l’ARNM définitif, à quoi sert la coiffe?

A

À ancrer les ribosomes en vue de la synthèse protéique.

39
Q

Lors de la modification de l’extrémité 3’ des précurseurs d’ARNm, à quel moment l’ARN naissant est scindé?

A

Lorsque l’ARN polymérase II a transcrit la séquence consensus du signal de polyadénylation (AAUAAA).

40
Q

À quoi sert la nouvelle extrémité 3’ créer après avoir coupé une partie de l’ARN naissant?

A

Sert d’amorce à l’addition récurrente d’une série d’adénosine, au cours d’une réaction catalysée par la poly(A) polymérase. On obtient donc la queue poly-A.

41
Q

Vrai ou faux.
La poly(A) polymérase agit avec une matrice.

A

Faux.
Elle agit sans matrice.

42
Q

À quel moment se termine la transcription?

A

Lorsque Rat1 (éxonucléase) fait une collision avec l’ARN pol II

43
Q

Vrai ou faux.
Les queues poly-A d’ARNm précurseurs et d’ARN mature s’associent fermement à la protéine PABP et cela permet de stabiliser l’ARNm.

A

Vrai

44
Q

Vrai ou faux.
Tous les eucaryotes possèdent une queue poly-A.

A

Faux.
Certains n’en possèdent pas.

45
Q

Que sont les introns?

A

Des séquences non codantes et intercalaires qui sont excisées du transcrit primaire d’ARN. Les introns sont donc absents de la molécule d’ARN mature.

46
Q

Que sont les exons?

A

Séquences présentent à la fois dans le transcrit primaire d’ARN et dans la molécule d’ARN mature.

47
Q

Comment se nomme le processus qui élimine les introns et met ensemble les exons?

A

Épissage

48
Q

Décrit les 2 étapes de l’épissage? *voir image si c’est pas clair

A
  1. Une attaque nucléophile du 2’-OH du ribose de l’adénosine de la boîte de branchement sur le phosphate de la jonction exon-intron en 5’ créer la libération de l’extrémité 3’ de l’exon en amont.
  2. Le 3’-OH libéré au niveau de l’exon en amont attaque le phosphate de la jontion exon-intron en aval. Les exons sont rassemblés et les introns en forme de lasso sont dégradés.
49
Q

Qui est responsable de reconnaître les signaux d’épissage et a-t-on besoin d’ATP?

A

C’est le spliceosome qui nécessite de l’ATP.
Spliceosome: 5 molécules d’ARN (U1, U2, U4, U5, U6)

50
Q

Qu’est-ce que l’épissage alternatif?

A

Les exons sont soient conservés dans l’ARNm ou ciblés en vue de leur élimination créant ainsi de milliers de combinaisons possible pour avoir des protéines différentes.
*70% des gènes du génome humain fonctionnerait pas épissage alternatif.

51
Q

Qui permet la synthèse de l’ARN ribosomique?

A

L’ARN polymérase I

52
Q

Qui permet la synthèse de l’ARNt et l’ARNr 5S?

A

L’ARN polymérase III

53
Q

Qu’est-ce qu’un ribozyme?

A

ARN capable de catalyser une réaction spécifique.

54
Q

Les ARN interférents (siRNA, miRNA, piRNA) servent à l’expression des gènes de quoi?

A

Des facteurs de transcription

55
Q

Vrai ou faux.
siRNA, miRNA, piRNA sont des ARN très longs.

A

Faux.
Ils sont très courts.

56
Q

Qu’est-ce que CRISPR?

A

Des séquence d’ADN répétitives dans le génome de bactéries E.coli
Serait capable de modifier des gènes humains.

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