Struct mol. exam 1 Flashcards
Définition du vivant (4)
- Au moins une fois dans sa vie il se développe et grandit jusqu’à pouvoir se reproduire
- Il consomme, stock de l’énergie et rejette des déchets
- Il peut bouger ou au moins provoquer la circulation des fluides internes
- S’il perçoit les caractéristiques de son environnement et réagit en conséquence
Nombre d’éléments essentiels aux organismes vivants
30 des 94 éléments chimiques et naturels
Éléments qui composent le plus le vivant
H, C, N, O
Définitions Oligo-éléments avec ex
Éléments représentant une fraction infime du corps, mais sont essentiels à la vie ex: fer
Nomme dans l’ordre les groupes fonctionnels (photo #1)
Methyl, Ethyl et Phenyl
Nomme dans l’ordre les groupes fonctionnels (photo #2)
Méthane, Chaine hydrocarbonée d’un acide gras
Nomme dans l’ordre les groupes fonctionnels (photo #3)
Alcool, Aldéhyde, Cétone, Acide carboxylique
Nomme dans l’ordre les groupes fonctionnels (photo #4)
Groupement amine
Nomme dans l’ordre les groupes fonctionnels (photo #5)
Groupement amide
Nomme dans l’ordre les groupes fonctionnels (photo #6)
Thiol, Disulfide, Thioester
Def. isomère
Molécules ayant la même formule brute mais des structures ou configurations différentes
Def. chiralité
Atome de carbone entouré de 4 autres atomes différentes donc deux molécules pareil dans le miroire mais on peux pas les coller
Sous-unité sucre : macromolécule, élément strucural, fonction
Polysaccharides, éléments structuraux extracell. site de liaison pour protéines, réserve d’énergie
Sous-unité lipides : macromolécule, élément strucural, fonction
Ne forme pas de macromolécules, composants structurels des memebranes, réserve d’énergie, pigments et signaux intracell.
Sous-unité acides-aminées : macromolécule, élément strucural, fonction
Protéines, éléments structurels du corps, récepteurs de signaux ou transporteurs qui transportent des substances spécifiques dans ou hors de cellules
Sous-unité nucléotides : macromolécule, élément strucural, fonction
Acides nucléiques, stock et transmette l’énergie, stock et transmette l’info génétique
Hypothèses apparition de la vie (5)
Les conditions pour créer des molécules organiques aurait pu se faire dans des étangs chauds, dans des volcans, dans l’atmosphère primitive, dans l’océan (fumée thermale), dans l’espace (météorite)
Pourquoi H2O est polaire
Car il y a une grande différence d’électronégativité entre les H+ et le O-
Liaison hydrogène
les liaison hydrogène ont sont exclusive à l’atome d’hydrogène et elles sont faibles elle se font le plus souvent avec l’oxygène ou l’azote
Liaison covalente non polaire (apolaire)
Différence d’électronégativité (ΔE-) plus petite que 0,4
Liaison covalente polaire
Différence d’électronégativité (ΔE-) entre 0,4 et 1,6
Liaison ionique
Différence d’électronégativité (ΔE-) supérieur à 1,6
Cohésion de l’eau et glace
Causé par les liaisons hydrogènes entre l’hydrogène et l’oxygène d’une autre molécule d’eau, max de 4 liaisons hydrogènes, cela donne une structure instable et dynamique (toujours 4 liaisons dans la glace)
Dissolution composé ionique dans l’eau
Les molécules d’eau vont s’agréger autours des ions + et - ce qui va les neutraliser et les séparer
Dissolution composé polaire dans l’eau
L’eau est elle aussi polaire, elle va donc faire des interaction électrostatique avec le composé, il y aura donc des liaisons hydrogène entre le composé polaire et l’eau
Interaction de Van der Waals : Dipôle-dipôle
Interaction électrostatique de faible intensité entre 2 atomes proches entre des molécules polaires mais non réellement chargé
Interaction de Van der Waals : Dispersion de London
Interaction de faible intensité entre deux molécules non polaires ayant une fluctuation dans la répartition de leur électron = dipôle transitoire
Classe les liaisons par force du plus fort au moins fort
- Liaison covalente
- Interaction ionique
- Liaison hydrogène
- Interaction de Van der Waals : Dipôle-dipôle
- Interaction de Van der Waals : Dispersion de London
Molécule hydrophobe et ex
Molécule non polaire sont hydrophobe comme les hydrocarbure
Molécule amphiphile
Région polaire interagit avec l’eau (tête hydrophile) et région apolaire évite l’eau (queue hydrophobe)
Équilibre acide base dans l’eau pure
H20 + H2O = H3O+ + OH-
Cette réaction est a l’équilibre donc l’eau est à la fois acide et base
Équation d’Henderson-Hasselbalch
pH = pK + log [A-]/[HA]
Gamme de pH efficace d’une solution tampon
pKa-1 < pH < pKa+1
Série D vs série L des glucose
Sur le dernier carbone chiral :
Si OH sur la droit : Isomère D
Si OH sur la gauche : Isomère L
Carbone chiral d’un glucose
Carbone qui est lié à 4 groupement DIFFÉRENTS
2 groupes fonctionnels de base des glucides
O (lié au C par une double liaison)
Aldéhyde : R - C - H
O (lié au C par une double liaison)
Cétone : R - C - R’
Dessine un D-glucose
Rep dans photo
comment calculer le nb de stéréoisomère
2 exposant le nb de carbone chiraux
Énantiomère
image miroire sur tout les carbone chiraux de 2 glucoses
Épimère
Asymétrie sur un seul carbone chiral de 2 glucoses
Diastéroisomère
Plus qu’un carbone chiral différent entre 2 glucides
Deux isomère du D-Glucopyranose
Groupement OH opposé au au CH2OH : forme alpha
Groupement OH du même côté que le CH2OH : forme beta
Quelques dérivés de monosaccharides
Sucre aminé, Sucre phosphorylé, Sucre avec groupement carboxylique, Sucre ADN/ARN
pourquoi deux monosaccharides peuvent former plusieurs type de disacchardies
- la liaison entre deux monosaccharide se fait à partir du carbone anomérique et un autre groupe
- Plusieurs groupement OH d’un monosaccharide peuvent participer à une condensation pour une liaison donc il peut être lié de plein de manière
- Chaque accroche différente forme un polysacchardie différent
Sucre réducteur ou non
- Un sucre réducteur peut céder des électrons à un oxydant
- Un polysacc. est réducteur si le carbone anomérique du 2e glucide est libre
- Il n’est donc pas réducteur quand les 2 carbone anomérique sont engagé dans la liaison
Structure et rôle physiologique lactose
Lactose = Beta-D-Galactose + D-Glucose
Lien glycosidique : Beta 1 -> 4
Rôle : Sucre dans le lait -> élément majeure pour les nouveaux nés chez les mammifères
Structure et rôle physiologique maltose
Maltose = alpha-D-Glucose + D-Glucose
Lien glycosidique : Alpha 1 -> 4
Rôle : Provient de l’hydrolyse de l’amidon, utilisé pour brasser de la bière et on en retrouve dans les céréales
Structure et rôle physiologique Saccharose
Sucrose = alpha-D-Glucose + beta-D-Fructose
Lien glycosidique: alpha-1 -> beta-2
Rôle : produit par la photosynthèse, sucre le plus abondant sur Terre
Différence homo et hétéropolysaccharides
Homopolysaccharides : même monosacc. répété
Hétéropolysaccharide : différents monosaccharides
Structure et rôle physiologique Amidon
Forme linéaire et forme ramifié
Amidon = chaine de glucose liés alpha-1 -> 4
Rôle : Polysacc. de réserve le plus imp. chez les plantes
Forme linéaire : Amylose
Forme ramifiée : Amylopectine ramification de forme alpha-1 -> 6
Structure et rôle physiologique Glycogène et ramification
Glycogène : chaine de glucose liés alpha-1 -> 4
Rôle : Polysaccharide de réserve le plus imp. chez les animaux, plus ramifié que l’amidon
Ramification de forme alpha-1 -> 6
Structure et rôle physiologique Cellulose et arrangement
Cellulose : Chaine de glucose linéaire lié beta-1 -> 4
Arrangement en faisceaux avec des laisons hydrogène
Rôle : Polysacc. de structure présent chez les végétaux, représent 50% de toute la m.o. sur Terre, indigestible pour les vertébrés
Structure et rôle physiologique Chitine
Chitine : Chaine de glucose linéaire lié beta-1 -> 4
Rôle : Polysacc. de structure qui compose l’exosquelette des insectes et crustacés et les parois cellulaire des champignons, ressemble à la cellulose, indigestible pour les vertébérés
Structure et fonction oligosaccharide N-liés
Attaché à une Asparagine par un azote
Enzymes qui font la glycolisation hautement spécifique
Le sucre sert de reconnaissance de la protéine
Structure et fonction oligosaccharide O-liés
Attaché à une Sérine ou une Thréonine par un oxygène
plusieurs oligosacc. O-liés autours de la protéine, moins spécifique
Structure et rôle protéoglycanes
- Toujours O-liés, la polysaccharide occupe la majeure partie de la molécule, la protéine sert seulement d’échafaudage
- Rôle : structure, protection ex: tissu conjonctif, mucus
Structure et rôles petidoglycanes
Polysaccharides linéaires liés entre eux par un pontage peptidique (réseau)
Rôle : structure des paroi BACTÉRIENNE SEULEMENT
Glycoprotéine avec un petit oligosaccharde
- Protéine occupe la majeure partie de la molécule
- L’oligosaccharide sert de reconnaissance et de communication cellulaire
Structure générale et fonction des acides gras
Structutre : Acide carboxylique avec une chaine aliphatique (entre 4 et 36 carbones), amphiphile
Rôle : Nutriment énergétique
2 types d’acides gras
Saturés : saturé en hydrogène ce qui ne permet pas au carbone de faire une double liaison
Insaturé : Une (mono-insaturé) ou plusieurs (poly-insaturé) double liaison
décrire la nomenclature simplifiée des acides gras
C n : x (delta-exp ou omega-exp)
n = nb d’atome de carbone
x = nb de double liaison
exp = position de la double liaison par rapport au premier carbone
Delta : premier = plus proche de l’acide carboxylique)
Omega : premier = fin de la chaine aliphatique)
Décrire la nomenclature standard acide gras saturés
Acide + nb de carbone + anoïque
nb de carbone : 12 =dodéc-, 13 = tridéc-, …
2 types d’acides gars polyinsaturés
Non conjugué : Double liaison séparé par un groupe méthylène
Conjugué : alternance de simple et de double liaison
(presque toujours non-conjugé)
Forme cis/trans
Cis : double liaison a une forme coudé,
Trans : double liaison de forme linéaire
Presque tout les acides gras insaturés ont une configuration cis
utiliser nomenclature pour C18 : 1 (delta9)
et pour C18 : 3 (delta9,12,15)
Acide cis-9-octadécanoïque
Acide cis-, cis-, cis-9, 12, 15 - octadécatrienoïque
Acides gras essentiels
Acide gars que l’humain ne peut pas synthétiser
Doit être apporté par l’alimentation
Ex : omega 3, omega 6
Propriété des acides gras (hydrophobicité, tem. de fusion)
- Plus le nb de carbone augmente, plus la molécule est hydrophobe
- Plus le nb de carbone augmente, plus la température de fusion augmente
- Plus il y a d’insaturation, plus la temp. de fusion diminue (linéaire = plus d’intéraction de Van der Waals qui solidifie la structure)
Propriété acides gras exemples (temp. de fusion)
- Les matière grasse contenant une grande proportion d’acide gras saturé sont solide à température ambiante (beurre)
- Les matière grasse poly-insaturé sont liquides à tem. ambiante (huile olive)
Structure, propriété et Rôle triglycérides
- Les acides gras sont stocker sous forme de trigycérides
- Composé de 3 acide gras lié par un ester à un glycérol
- Propriété : fonction carboxylique neutralisé donc complètement hydrophobe
- Fonctions : stockage, réserve énergétique
2 types de triglycérides
Triglycéride simple : avec 3 acides gras identiques
Triglycéride mixte : avec des acides gras différents
Rôle métabolique des Triglycérides
- Stockés sous forme de gouttelettes lipidique dans les adipocytes
- Servent de réserve d’énergie et d’isolant thermique
Structure, Propriété et rôle des phospholipides
- Glycérol + phosphate + groupement polaire + 2 acides gras
- Amphiphiles
- Forme la bicouche membranaire des bactéries et des eucaryotes
Différents lipides membranaires (4)
- Glycéroglycolipides : glycérol + mono/oligosaccharide + 2 acides gras
- Sphingolipides : Sphingosine + groupement polaire + 1 acide gras
- Sphingophospholipides : Sphingosine + phosphate + gpt polaire + 1 acide gras
- Sphingoglycolipides : Sphingosine + mono/oligosaccharide + 1 acide gras
Strucutre et rôle cires
- Esters d’acides gras et d’alcools à longue chaine carboné
- Réserve énergétique
- Imperméabilisant
Strucutre et rôle cholestérols
- hydroxyle + noyau stéroïde + alkyl
- Principal stérol d’origine animale dans les membranes
- Précurseurs de nombreuses substances : stéroïdes, hormones sexuelles, vitamine D
