Semaine 5 - Gènes liés, gènes indépendants et recombinaison Flashcards
Quand est-ce que des gènes peuvent faire la recombinaison?
Si les 2 gènes sont sur le même chromosome et à une bonne distance (pas trop proche et pas trop loin les uns des autres).
Si ils sont trop éloignés ou sur 2 chromosomes différents, il n’y a pas de recombinaison possible.
Quelle est la convention d’écriture pour des gènes indépendants?
Allèles de chaque paire au-dessus et au-dessous de lignes horizontales distinctes
Que veut dire “linkage”?
Linkage / groupe de liaison: Association de 2 ou plusieurs gènes sur un même chromosome. Les gènes sont tellement proches sur un même chromosome qu’ils font rarement de recombinaison, ils voyagent presque toujours ensemble et donc ont tendance à être hérités ensemble.
Quels sont les deux types d’assortiments?
Indépendants et non-indépendants (liés) (ne jamais dire dépendants)
Indépendant: Comme les lois de Mendel (pour AaBb: 4 possibilités de gamètes différents en proportions égales)
Non-indépendants: Selon le degré de linkage, affecte les proportions des gamètes
Quelle est la convention d’écriture pour des gènes non-indépendants?
Allèles de chaque paire au-dessus et au-dessous d’une ligne horizontale commune.
À quoi est proportionnel le degré de linkage?
Inversement proportionnel à la distance entre les deux gènes.
Comment peut-on mesurer le degré de linkage entre différents gènes?
À l’aide du pourcentage de recombinaison (%R) entre les locis.
Plus le pourcentage de recombinaison est élevé, plus le degré de linkage est faible.
Que signifient un linkage incomplet et complet?
Linkage incomplet: 4 gamètes possibles en proportions différentes (gamètes des parents les plus fréquents, recombinaisons à plus faible fréquence)
Linkage complet: 2 gamètes possibles (identiques aux chromosomes parentaux)
Quelles sont les 2 possibilités de liaisons des gènes? Quelles sont les conséquences?
Cis: Les 2 allèles dominants sont sur le même chromosome
→ Les gamètes seront homozygotes (50% homozygote récessif, 50% homozygote dominant)
Trans: Les allèles dominants sont sur 2 chromosomes différents.
→ Les gamètes seront hétérozygotes
Quels sont les types de combinaisons obtenus dans les phénotypes lors d’un linkage incomplet?
- Combinaison parental (majoritaire)
- Combinaison recombinante (minoritaire)
Qu’est-ce que le crossing-over / recombinaison homologue?
Échange réciproque de matériel génétique entre 2 chromosomes / chromatides non-soeurs.
Quelles sont les étapes (3) de la recombinaison homologue?
Cassure, invasion d’un chromatide non-soeur, réparation
Quelles sont les deux types de coupes de l’hétéroduplexe formé lors de la recombinaison homologue?
Verticale et horizontale
Donnent différents phénotypes
Quelles sont les conditions optimales (où sont disposés les gènes les uns par rapport aux autres) pour un taux de recombinaison élevé?
Plus 2 gènes sont éloignés (petit degré de linkage) (jusqu’à une certaine distance), plus leur taux de recombinaison est élevé (sans jamais dépasser 50%).
Comment fait-on pour calculer le pourcentage / fréquence de recombinaison (%R) (quelle est la formule)?
%R = # de recombinants / # total x 100
Quelle est l’unité de mesure de la fréquence / pourcentage de recombinaison? Qu’est-ce que cela représente?
%R mesuré en centiMorgan (cM) = Distance entre 2 gènes sur un chromosome.
1cM = Distance pour laquelle un produit de méiose sur 100 est un recombinant.
Ex: 17%R = 17cM entre les 2 gènes
Quel est l’avantage d’un test trilocal vs bilocal?
Les résultats d’un test bilocal nous donnent 2 résultats (2 distances) donc 2 possiblités de les positionner sur un chromosome. On doit donc faire des tests trilocaux
Quelles sont les 4 possibilités de crossing-over pour un test trilocal?
- Pas de crossing over
- Recombinaison entre les 2 premiers allèles
- Recombinaison entre les deux derniers allèles
- Double recombinaison, d’abord entre les deux premiers puis entre les 2 derniers.
Comment calcule-t-on le taux de recombinaison entre a et c pour les tests trilocaux (a b c)?
- Calculer le taux de recombinaison de la région 1 (*)
- Calculer le taux de recombinaison de la région 2 (*)
- Additionner les 2 taux de recombinaisons
*: Ne pas oublier d’ajouter les doubles recombinaisons dans le taux de recombinants)
Quel résultat de recombinaison est le moins nombreux?
Recombinaisons doubles.
Plus nombreux = Combinaisons parentales
Qu’est-ce que l’interférence chromosomique?
Un chiasma dans une région donnée peut nuire à la formation d’un autre chiasma dans une région chromosomique voisine. En pratique, on n’a donc pas toujours le taux de recombinaison théorique.
Comment peut-on calculer la proportion attendue de recombinaisons doubles lorsqu’on a seulement les résultats des recombinaisons des régions 1 et 2?
Multiplier les résultats des recombinaisons des régions 1 et 2
Qu’est-ce que le coefficient de coïncidence et que permet-il de calculer? Comment se calcule-t-il?
Permet de mesurer l’importance de l’interférence chromosomique dans une région donnée.
Calcul: Proportion obtenue des doubles crossovers / Proportion prévue des doubles crossovers
Si résultat = 0: Interférence complète
Si résultat = 1: Aucune interférence
À quoi ont servi les tests bilocaux et trilocaux, entre autre?
À développer la cartographie des chromosomes.
Quand doit-on additionner vs multiplier les taux de recombinaisons?
Additionner pour avoir le taux de recombinaison entre a et c
Multiplier pour avoir les résultats théoriques de recombinaison double
