semaine 4- transcription Flashcards
ressemblance entre transcription et réplication?
2 mécanismes nécessite des enzymes qui synthétisent un nouveau brin d’acide nucléique complémentaire à un brin matrice d’ADN
direction 5’ 3’
différence entre transcription et réplication?
- transcription: brin d’ARN car nécessite ribonucléotides
- ARN pol ne nécessite pas d’amorce
- ARN nouvellement synthétisé reste pas apparié au brin matrice d’ADN (elle se déplace)
- transcription moins précise que réplication
Pourquoi est-ce logique pour la cellule que la transcription soit moins fidèle?
ADN = support du matériel génétique
réplication= doit assurer transmission fidèle
erreur dans le génome: conséquence transmissent aux autre génération
Nombre d’ARN pol chez les bactéries? eucaryotes?
bactéries: une seule ARN pol
eucaryotes: 3 ARN pol : pol 1 pol2 pol 3
De quoi est responsable pol 2?
enzyme responsable de la transcription des gènes, essentiellement tous ceux qui sont codant
De quoi est responsable pol 1?
transcrit gènes codant pour le grand précurseur des ARNr
De quoi est responsable pol 3?
transcrit les gènes codant les ARNt
certains ARN nucléaires et ARNr 5s
Que contient l’enzyme (ARN pol) minimale bactérienne?
2 sous unités alpha
sous unité beta, beta’ et omega
(α2ββ’ω)
peut initier transcription n’importe ou sur l’ADN (vrai in vitro mais pas in vivo)
À quoi sont homoloques les sous-unités B et B’ des procaryotes?
aux sous unités RPB1 et RPB2 de pol 2
À quoi est similaire la structure du coeur de l’ARN polymérase bactérienne?
similaire à celle de pol2 de la levure
- même forme globale et organisation
plus les parties internes que les parties périphériques
Quel ion contient le site actif?
1 Mg2+ permanent
2ième introduit avec chaque nouveau nucléotide et libéré avec pyrophosphate
Quelles sont les 3 phases effectuées par l’ARN pol?
initiation
élongation
terminaison
Qu’est ce qu’un promoteur?
séquence d’ADN qui fixe ARN polymérase et les facteurs d’initiation requis
Quelles sont les 3 étapes de l’initiation de la transcription?
1- formation complexe fermé (ADN double-brin)
2- formation complexe ouvert (ADN simple-brin) -irréversible
3- polymérase démarre transcription: détache du promoteur, synthétise court fragment
Que fait l’ARN pol dans l’élongation?
- déroule l’ADN devant elle
- réassocie les brins en arrière du complexe
- dissocie chaine d’ARN en croissance de la matrice au fur et à mesure de sa progression
- corrige erreurs potentielles
Quelle est la première étape de la l’initiation?
former un complexe fermé par liaison initiale de la polymérase au promoteur
- brins d’ADN toujours appariés
Quelle est la deuxième étape de la l’initiation?
complexe fermé subit une transition vers le complexe ouvert
- brins d’ADN se séparent sur une distance de 14pb autour du site d’initiation pour former BULLE DE TRANSCRIPTION
Quelle est la troisième étape de la l’initiation?
polymérase démarre transcription et se détache du promoteur
- 2 premiers ribon. amenés dans le site actif, alignés sur la matrice liés l’un à l’autre
- ribonucléotides suivants incorporés à la chaine naissante d’ARN
incorporation de la première dizaine inefficace
lorsqu’il y en a 10 = enzyme libérée du promoteur
À quel niveau les polymérase initient la transcription?
au niveau des promoteurs
Comment et en quoi est convertit l’Enzyme minimale?
addition d’un facteur d’initiation : sigma
convertie enzyme minimale en holoenzyme de l’ARN polymérase qui initient la transcription au niveau des promoteurs
Quel est le facteur σ prédominant chez E.coli?
σ70
Les promoteurs reconnus par σ70 partagent quoi?
2 séquences conservées de 6 nucléotides séparés par un segment non-spécifique de 17-19 nucléotides, pas identique pour tous les gènes
Quels sont les éléments préférés des gènes conservés pour le promoteur σ70?
éléments -10 et -35
Qu’est ce que des promoteurs forts?
ceux dont la séquence se rapproche le plus du consensus.