Semaine 2 Flashcards

1
Q

Les anticorps participent à quelles tâches du système immunitaire?

A
  • Reconnaissance (Discrimination Soi non-Soi)
  • Communication
  • Attaque (élimination, confinement)
  • Mémoire
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2
Q

Qu’est-ce qui était connu en 1890 par rapport à l’immunologie? (3)

A
  • Phénomène de l‘immunité acquise
    (beaucoup de maladies nous attaquent
    seulement une fois)
  • Immunité par vaccination (Jenner 1790)
  • Le sérum sanguin a une activité bactéricide
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3
Q

Qui ont les scientifiques qui ont découvert les anticorps? (2)

A

Emil Behring
Shibasaburo Kitasato

(dans le laboratoire de Robert Koch)

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4
Q

Décrire l’expérience faite par Behring et Kitasato.

A
  • 1 ml tetanus toxin = lapin mort
  • 1 ml tetanus toxin atténué = lapin vivant
  • 20 ml tetanus toxin + sérum sanguin du lapin précédant = vivant
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5
Q

Quelles sont les conclusions de l’expérience de Behring et Kitasato? (3)

A
  • Le sérum sanguin change après une
    immunisation
  • L‘immunité peut être transférée avec le sérum = réponse humorale =
    (activité acellulaire) = antitoxines = anticorps
  • Les antitoxines (=anticorps) neutralisent les
    toxines (utilisation des « toxines-antitoxines » pour la vaccination)
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6
Q

Pour quelle maladie Behring a-t-il utilisé la “thérapie du sérum”?

A

Diphtérie: immunisation de chevaux et d’ânes

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7
Q

Qu’est-ce qu’un hapten?

A

Petite molécule qui n’est pas immunogénique en soi, mais qui le devient quand elle est couplée à un “porteur” (protéine).

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8
Q

Qui a fait l’expérience de spécificité des anticorps?

A

Landsteiner (1921)

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9
Q

Quelle est la structure des IgG?

A

Hétéro-tétramère composé de 2 chaînes lourdes et deux chaînes légères = ~150 kDa

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10
Q

Où se trouvent les régions variables et constantes des anticorps?

A

Variable: portion N-terminale

Constante: portion c-terminale

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11
Q

Qu’est-ce qu’on obtient d’une digestion de l’anticorps par la papain?

A

2 Fab (Fragment antibody binding)

1 Fc (fragment crystalizable)

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12
Q

Qu’est-ce qu’on obtient d’une digestion de l’anticorps par la pepsin?

A

1 F(ab’)2 (les deux fragments Fab encore liés ensembles)

1 portion Fc fragmentée

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13
Q

Quels sont les différents isotypes d’anticorps?

A

IgM

IgG

IgD (un peu à oublier)

IgA (sécrétés)

IgE (allergies, parasites)

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14
Q

Comment diffèrent les différents isotypes?

A

Ils diffèrent dans les parties constantes des chaînes lourdes

(Reconnus par différents récepteurs Fc)

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15
Q

Caractéristiques des chaînes légères.

A
  • Structure en sandwich
  • 2 feuillets beta
  • Ponts disulfures
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16
Q

Où se trouve les régions de la reconnaissance des antigènes?

A

Les régions hyper-variables

HV hypervariable region ou CDR (1-3) complementary determining regions

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17
Q

Comment appelle-t-on la région variable qui n’interagit normalement pas avec les antigènes?

A

FR: framework region (=chassis)

Certaines régions des FR peuvent interagir avec les antigènes

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18
Q

Un seul bras de l’antigène possède combien de boucles de CDR?

A

6

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19
Q

Qu’est-ce qu’un épitope?

A

« déterminant antigénique » ce qui est vu par l’ac. (ou la cellule T)

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20
Q

Quels sont les différents types d’épitopes?

A
  • Épitope discontinu ou conformationnel (protéines natives)

- Épitope linéaire (peptides, protéines dénaturées)

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21
Q

Quelles sont les interactions non-covalentes entre molécules? (4)

A
  • Forces électrostatiques
  • Ponts Hydrogènes
  • Forces Van der Waals
  • Forces Hydrophobes
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22
Q

Caractéristique du récepteur de la cellule T (lymphocyte T).

A

(TCR)

  • Ressemble à un Fab membranaire
  • 2 domaines Ig + région transmembranaire
  • alpha, beta (gamma, delta) - hétérodimères
  • Courte queue cytoplasmique à l’intérieur de la cellule T
  • 2x CDR 1-3
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23
Q

Quel est le principe de reconnaissance des antigènes des cellules T?

A

Le même que chez les anticorps

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24
Q

Quelle est la différence entre la génération de diversité des cellules B et T?

A

Aucune.

C’est le même mécanisme chez
les cellules B et T!

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25
Q

Quelles sont les différentes hypothèses sur la variabilité des gènes Ig?

A
  • Un gène avec un haut taux de mutations somatiques dans la région V
  • Beaucoup de différents gènes (10.000 - 100.000)
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26
Q

Décrivez l’expérience de Tonegawa (1975).

A
  1. Extraction d‘ADN génomique
  2. digestion avec enzyme de réstriction (BamH I)
  3. Southern blot avec sondes pour partie variable ou constante d‘un gène Ig
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27
Q

Quelles sont les conclusions de l’expérience de Tonegawa?

A
  1. Il y a beaucoup d‘éléments V, mais un seul élément C
  2. Les éléments V et C sont recombinés seulement dans les cellules B

Alors, il y a un changement chromosomique de l’ADN germinal lors de la différenciation des cellules B !

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28
Q

Y-a-t-il des éléments D dans les chaînes légères?

A

Non

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29
Q

Comment s’appelle le mécanisme responsable de la grande variabilité des anticorps?

A

Recombinaison V(D)J

V = Variable

D = Diversité

J = Jonction

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30
Q

Comment s’appellent les différents fragments résultants de la coupure de la recombinaison V(D)J?

A
  • Coding joint

- Signal joint (poubelle)

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31
Q

Quel est le risque du réarrangement V(D)J?

A

La mauvaise recombinaison peut mener au cancer

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32
Q

Quels sont les 2 types de régions variables sur la chaîne légère?

A

Vκ (kappa)

Vλ (lambda)

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33
Q

Quelles sont les composantes impliquées dans la recombinaison des chaînes légères?

A

V (variable)

J (jonction)

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34
Q

Dans la chaîne légère, combien a-t-il de segments Vk? Jk?

A

Vk : 80

Jk : 4

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35
Q

Comment se fait la vérification du cadre de lecture dans la formation des segments variables des anticorps?

A

En regardant au niveau des protéines

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36
Q

Vrai ou faux : si la recombinaison des segments Vk et Jk ne donne pas de protéines fonctionnelles, la cellule tombe en apoptose et meurt.

A

Faux : elle a d’autres chances de se recombiner et de faire des cadres de lectures fonctionnels.

37
Q

Quel élément de l’ADN permet le réarrangement des segments V(D)J au bon moment et dans le bon locus?

A

Le promoteur

38
Q

Vrai ou faux : chaque élément variable porte son propre promoteur

A

Vrai

39
Q

Sous quelles formes passe l’ADN pour se rendre jusqu’à une protéine?

A
  • ADN
  • Transcrit primaire
  • ARNm (épissé, queue poly-A…)
  • Protéines
40
Q

Dans la chaîne lourde, combien a-t-il d’éléments VH? D? JH?

A

VH : 120
D : 12
JH : 4

41
Q

Vrai ou faux : l’élément D est seulement présent sur la chaîne lourde.

A

Vrai

42
Q

Nommer les réarrangements de la chaîne lourde en ordre.

A
  1. D-J

2. V-D-J

43
Q

Que stipule la règle 12/23?

A

Les régions 12 doivent nécessairement être reliées avec les régions 23. 12 et 23 représentent le nombre de nucléotides entre les heptamères et les nonamères sur les RSS.

44
Q

Que sont les RSS?

A

Recombinaison signal sequence, séquences qui possèdent les régions 12 et 23 entre les nonamères et les heptamères.

45
Q

Dans la règle 12/23, que représentent au niveau de la structure moléculaire les chiffres 12 et 23?

A

Le nombre de tour de l’hélice d’ADN (1 ou 2)

46
Q

Pour la chaîne λ, quel élément est associé avec le 12? Le 23? (Règle 12/23)

A

V : 23

J : 12

47
Q

Pour la chaîne κ, quel élément est associé avec le 12? Le 23? (Règle 12/23)

A

V : 12

J : 23

48
Q

Pour la chaîne H, quel élément est associé avec le 12? Le 23? (Règle 12/23)

A

V et J : 23

D : 12

49
Q

Qu’est-ce qui fait en sorte que dans la chaîne lourde, des segments J et V ne se lient pas ensemble?

A

Règle 12/23

50
Q

Quelle est l’utilité du complexe RAG?

A

Reconnait l’emplacement où il faut cliver (segments 12/23) et va faire cette coupure

51
Q

Combien de sous-unités comporte le complexe RAG?

A

2 (RAG 1/2)

52
Q

Quel est le nom complet du complexe RAG?

A

Recombination Activation Gene

53
Q

Où se lie le complexe RAG?

A

RSS

54
Q

À quoi sert la protéine HMG?

A

Se lie à l’ADN pour le courber et faciliter le travail du complexe RAG pour respecter la règle 12/23.

55
Q

Quelle protéine s’associe avec le complexe RAG?

A

HMG

56
Q

Quel est le nom complet du complexe HMG?

A

High Mobility Group protein

57
Q

Qu’arrive-t-il lorsqu’il y a un défaut génétique dans le RAG?

A

Severe combined immunodefiency (SCID) : absence de cellules B et T

58
Q

Grâce à quels processus est régulé le réarrangement V(D)J dans les cellules B? (2)

A
  • Transcription des loci (via les promoteurs et enhancers)

- Expression du complexe RAG

59
Q

Après le clivage de l’ADN par le complexe RAG, quelles sont les 2 parties qu’on retrouve?

A
  • Coding joint

- Signal joint (circulaire, va au poubelles)

60
Q

Vrai ou faux : le signal joint est directement impliqué dans la formation du segment variable de l’anticorps

A

Faux

61
Q

Quelles sont les 2 façons de créer de la diversité additionnelle?

A

Ajout de palindromes et de nucléotides aléatoires

62
Q

Par quel moyen est-il possible de former des palindromes lors de la recombinaison de l’ADN des anticorps?

A

C’est grâce aux hairpins

63
Q

Quelles enzymes sont impliquées dans la formation de la diversité additionnelle à l’aide de palindromes? (2)

A

Artemis : DNA-PK et RAG1/2

64
Q

Quel est le rôle du complexe RAG dans la formation de palindromes?

A

Fait une coupure franche qui va générer des hairpins

65
Q

Quel est le rôle du complexe Artemis dans la formation de palindromes?

A

Ouverture des hairpins

66
Q

Qu’arrive-t-il dans la cas de défauts génétiques dans le complexe Artemis:DNA-PK

A

SCID : pas de système immunitaire adaptatif

67
Q

Quelle enzyme est impliquée dans l’ajout de nucléotides aléatoires pour la diversification des segments variables des anticorps?

A

TdT

68
Q

Vrai ou faux : l’enzyme TdT est exprimée dans les cellules B immatures uniquement.

A

Faux : cellules T immatures aussi

69
Q

Quel est le nom complet de l’enzyme TdT?

A

Terminal Deoxynucleotidyl Transferase

70
Q

Où sont ajoutés les N-nucléotides ajoutés par la TdT?

A

Extrémité 3’ du brin d’ADN

71
Q

Quelle enzyme va permettre de compléter le brin après l’ajout des N-nucléotides par la TdT?

A

Exonucléase

72
Q

La région V(D)J correspond à quelle région du domaine variable sur l’anticorps?

A

CDR3

73
Q

Quels sont les 2 types de chaînes légères?

A

Kappa et lambda

74
Q

Quel CDR se retrouve au milieu de l’interaction anticorps-antigène?

A

CDR3

75
Q

Quelles sont les 2 façons que les Ig peuvent être exprimés?

A
  • Soluble (anticorps)

- Membranaires (BCR)

76
Q

Quel est le rôle du BCR?

A

Indiquer à la cellule B qu’il a reconnu quelque chose pour éventuellement produire plus d’anticorps

77
Q

Comment sont générées les formes membranaires et sécrétées des anticorps?

A

Par épissage alternatif

78
Q

Quels sont les nucléotides qui bordent les exons en 5’ et 3’ et qui sont hyper-conservés? Pourquoi sont-ils aussi importants?

A

5’ : AG
3’ : GU

Ils délimitent les introns et les exons

79
Q

Dans la forme BCR, qu’est-ce qui se trouve à l’emplacement où est le codon stop dans le cas de la forme sécrétée de l’anticorps?

A

Un site d’épissage alternatif cryptique qui se trouve en amont du codon stop

80
Q

Quelles sont les 2 grandes composantes des BCR?

A
  • IG membranaire

- Module se transmission de signal (Igα et Igβ)

81
Q

Que produit une mutation dans le Igα ou Igβ des BCR?

A

Ammaglobulinémie (pas d’anticorps)

82
Q

Pourquoi est-ce qu’un module de transmission de signal est nécessaire pour le fonctionnement des BCR?

A

Parce que la queue cytoplasmique de la chaîne lourde ne peut pas transmettre des signaux dans la cellule à cause de sa courte taille.

83
Q

Quelle section du module de transmission du signal des BCR se retrouve à l’intérieur des cellules?

A

ITAM

84
Q

Quel est le nom complet de l’ITAM?

A

Immunoreceptor tyrosine-based activation motif

85
Q

Quel acide aminé d’importance fait partie de l’ITAM?

A

La tyrosine

86
Q

Quelle propriété de la tyrosine fait en sorte qu’elle est utilisée dans l’ITAM et permet l’envoie de signaux?

A

Elle peut se faire phosphoryler par des tyrosines kinases.

87
Q

Quelles sont les composantes des TCR? (3)

A
  • αβ hétérodimère
  • Module de transmission de signal CD3
  • ITAM
88
Q

Que permet la recombinaison V(D)J?

A

Génération de diversité

89
Q

Comment se fait, vraiment très globalement, la recombinaison des sections variables des Ig?

A

Cassure de chromosome physiologique