Semaine 2 Flashcards

1
Q

Quelle est la différence entre le milieu naturel et le milieu artificiel dans les phases?

A

Artificiel : la phase stationnaire avant la phase de mortalité
Naturel : la phase de mortalité avant la phase stationnaire

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2
Q

Nommer les 4 phases de la croissance.

A
  1. Phase de latence
  2. Phase exponentielle
  3. Phase stationnaire
  4. Phase de mortalité
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3
Q

Définir oligotrophe.

A

Peut se reproduire en milieu très pauvre.

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4
Q

Définir copiotrophe.

A

Se reproduit en milieu riche uniquement.

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5
Q

Définir la succession autogène (communauté microbienne 1).

A

La communauté modifie l’environnement en le rendant favorable pour la colonisation par d’autres MO.

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6
Q

Définir la succession allogène (communauté microbienne 1).

A

Ne modifie pas l’environnement, mais des facteurs extérieurs le modifie et favorise sa colonisation par d’autres MO.

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7
Q

Définir la niche écologique.

A

Environnement qui contient toutes les conditions permettant à un MO donné de se développer et de se multiplier.

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8
Q

Est-ce que la niche écologique peut être transitoire?

A

Oui (ex : probiotique, entrée d’une nouvelle bactérie dans la flore existante, période d’adaptation)

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9
Q

Définir le climax.

A

Stabilité relative au sein de la communauté.

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10
Q

Définir colonisation active.

A

Les MO se déplacent, car ils sont attirés par quelque chose (chimiotaxie).

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11
Q

Définir colonisation passive.

A

Les MO se déplacent par l’intermédiaire de l’eau, du vent, un vecteur, etc.

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12
Q

Qu’est-ce qui fait en sorte qu’un MO est pionnier?

A

Ça facilité à se disperser.

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13
Q

Les MO qui utilise une source d’énergie sont dits?

A

Phototrophes

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14
Q

Les MO qui utilise une source de carbone sont dits?

A

Autotrophes (Chimiototrophes, Hétérotrophes, Organotrophes)

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15
Q

Les MO qui utilise une source de donneur d’électrons sont dits?

A

Lithotrophes

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16
Q

Les MO qui utilise une source d’accepteur d’électrons sont dits?

A
  1. Respiration aérobie

2. Respiration anaérobie

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17
Q

Définir l’environnement microbien.

A

Ensemble des conditions extérieurs auxquelles les MO sont soumis.

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18
Q

Les environnements liquides sont plus homogènes ou hétérogènes?

A

Homogènes

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19
Q

Les environnements solides sont plus homogènes ou hétérogènes?

A

Hétérogènes

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20
Q

Nommer les niveaux d’organisation des MO. (5)

A
  1. Organisme (individu)
  2. Population microbienne
  3. Communauté microbienne
  4. Écosystème
  5. Biosphère
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21
Q

Définir le mot organisme.

A

MO unique avec ses propres caractéristiques, membre d’une espèce.

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22
Q

Définir la population microbienne.

A

Regroupement de plusieurs individus appartenant à la même espèce dans un espace physique donné.

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23
Q

Définir la communauté microbienne.

A

Deux populations ou plus d’espèces différentes vivant et interagissant dans un espace physique donné.

24
Q

Définir l’écosystème.

A

L’ensemble d’une/plusieurs communauté(s) et de son/leur environnement(s).

25
Q

Définir Biosphère.

A

Entité incluant tous les écosystèmes terrestres (composantes biotiques et abiotiques).

26
Q

Nommer les termes de la taxonomie. (7)

A
  1. Règne
  2. Embranchement
  3. Classe
  4. Famille
  5. Genre
  6. Espèce
  7. Sérovar/Écotype
27
Q

Les espèces d’un même genre possèdent des différences au niveau du génome. De quel terme taxonomique parle-t-on?

A

Sérovar/Écotype

28
Q

À partir de quoi les bactéries sont regroupées?

A

Le pourcentage d’homologie de leur ARN 16s.

29
Q

Comment nomme-t-on les regroupements formés à partir du % d’homologie de leur 16s?

A

OTU

30
Q

Définir la succession autotrophe.

A

Les premiers MO modifient l’environnement en produisant des composés organiques, ce qui influence les MO s’établissant par la suite.

31
Q

Définir la succession hétérotrophe.

A

Les premiers MO modifient l’environnement en consommant des composés, ce qui influence les MO s’établissant par la suite.

32
Q

Définir colonisation préemptive.

A

MO qui modifie l’environnement pour prévenir sa colonisation par d’autres MO.

33
Q

Lors d’une colonisation préemptive. Est-ce qu’il y a une communauté microbienne 2?

A

Non

34
Q

Définir la richesse.

A

Nombre d’espèces retrouvées sur le nombre total de MO (variété au niveau des espèces)

35
Q

Définir l’abondance.

A

Proportion des individus parmi les espèces présentes.

36
Q

L’abondance peut être calculée par quel indice?

A

Indice Pielou

37
Q

La richesse et l’abondance des MO dépend de? (2)

A
  1. Les conditions présents dans l’environnement

2. Les nutriments présents dans l’environnement

38
Q

Quel indice est utilisé pour déterminer la richesse et l’abondance des espèces à l’intérieur d’une communauté?

A

Indice alpha (Indice de Shannon)

39
Q

Plus l’indice de Shannon est élevé plus la diversité est élevée ou faible?

A

Élevée

40
Q

Quel indice permet l’évaluation de la différence entre deux communautés?

A

Indice bêta

41
Q

Plus l’indice bêta est élevé, plus les communautés comparées sont différentes ou semblables?

A

Différentes

42
Q

L’échantillonnage du sol dépend de deux éléments. Nommer.

A
  1. de l’expérience

2. des techniques que l’on souhaite utilisées

43
Q

Nommer les 4 emplacement possibles lors de l’échantillonnage du sol?

A
  1. Aléatoire
  2. Transect
  3. En deux étapes
  4. Grille systématique
44
Q

À quoi sert le milieu d’enrichissement?

A

Cultiver les échantillons dans des milieux dont les ressources et conditions imitent le plus possibles ceux de la niche du MO d’intérêt.

45
Q

À quoi sert le milieu sélectif?

A

Inhibe la croissance des MO non-désirés en ajoutant des conditions ou des substances.

46
Q

But du dénombrement sur pétri?

A

Évaluer le nombre de MO présent dans un échantillon.

47
Q

Nommer un avantage du dénombrement sur pétri?

A

Isolation de certains MO environnementaux spécifiques.

48
Q

Nommer un inconvénient du dénombrement sur pétri?

A

Pas une détection des MO qui sont viables mais non cultivables.

49
Q

But de la méthode du nombre le plus probable?

A

Évaluer statistiquement le nombre de MO présent dans un échantillon.

50
Q

Nommer un avantage de la méthode du nombre le plus probable?

A

Utile pour évaluer la présence d’une population fonctionnelle spécifique.

51
Q

Nommer un inconvénient de la méthode du nombre le plus probable?

A

Demande beaucoup de travail pour des résultats moins précis que le dénombrement sur pétri.

52
Q

Nommer les 3 défis avec l’échantillonnage du sol?

A
  1. Conservation des échantillons
  2. Contamination
  3. Zones difficiles
53
Q

Les cultures dépendantes permettent-elles une vision en profondeur d’un MO?

A

Oui

54
Q

Les cultures dépendantes permettent-elles une vision d’ensemble des MO dans l’environnement?

A

Non

55
Q

Quel est le but de la miniaturisation?

A

Examiner les interactions entre des MO d’intérêt et un environnement contrôlé.

56
Q

Qu’est-ce qu’un système gnotobiotique?

A

Modèle dans lequel on connait précisément la composition des populations microbiennes (stérilisation de l’environnement + inoculation avec MO).

57
Q

Nommer des méthodes de cultures dépendantes. (3)

A
  1. Dénombrement sur pétri
  2. Méthode du nombre le plus probable
  3. Miniaturisation