Semaine 10 : Réovirales et rotavirus

Question 1

L’étude des réovirus a abouti à..?

Answer 1

La découverte de la structure de la coiffe en 5’ de l’ARNm

Question 2

Classification dans l’ordre des Reovirales?

Answer 2

• 2 familles
• 15 genres

Question 3

V ou F : certains réovirus sont pathogènes.

Answer 3

Vrai

• Rotavirus provoquent une gastro-entérite, cause majeure de maladie infantile
• Obivirus = agents pathgogènes qui s’attaquent aux moutons et aux vaches

Question 4

Les réovirus sont utilisés dans le traitement de …?

Answer 4

Du cancer

• Certains virus ont naturellement une préférence pour les cellules cancéreuses et ont des mécanismes spécifiques pour s’y répliquer (tue la ¢ cancéreuse)
• Ex : certains réovirus ciblent les cellules ayant un système Ras actif

Question 5

Les deux sous-familles des Réovirales?

Answer 5

1. Spinareovirinae : virions avec grandes spicules et tourelles, structure = 2 couches (noyau + capside)
2. Sedoreovirinae : virions lisses et sphériques, structure = 3 couches (couche intérieure fragile, couche qui renforce et capside)

Question 6

Structure des orthoreovirus?

Answer 6

• Particules sphériques, non enveloppées, 85 nm diamètre
• Formé de 2 coquilles protéiques concentriques qui protègent le génome d’ARNdb
• La particule noyau entoure le génome (condensé)
• Capside = 200 complexes hétérohexamériques (µ1 𝜎3) = réseau qui recouvre les “core particules”
• Capside = perforée sur les axes par des structures de tourelles formées par les SU λ2, protéines 𝜎1 forment des trimères filamenteux

Question 7

Il existe plusieurs morphotypes différents des orthoreovirus présents dans les cellules infectées, lesquels?

Answer 7

• des virions à structure complète (avec et sans génomes)

-des particules sous virion infectieuses (ISVP)

-des particules de noyau («core particles»)

Question 8

En quoi résulte le démontage du virion après l’attachement et l’entrée?

Answer 8

En l’apparition d’une particule ISVP (pas de protéine 𝜎3, mais conserve 𝜎1 et une version modifiée de µ1)

Question 9

Les 3 particules de la capside externe?

Answer 9

µ1, 𝜎1 et 𝜎3

Question 10

V ou F : la “core particule” présente tjrs toutes les particules de la capside.

Answer 10

Faux juste λ1 𝜎2, et mais les protéines λ2 des tourelles sont tjrs présentes.

• Contient aussi la polymérase (λ3) et un cofacteur (µ2). Chaque λ3 est ancrée à la surface interne du «core particle» par une protéine λ1.

Question 11

Rôle des tourelles sur la “core particule”?

Answer 11

Forment des pores (cylindres creux) qui permettent l’accès à l’intérieur de la particule, permettent aux substrats de pénétrer à l’intérieur et aux ARNm viraux de sortir.

À la base des tourelles : complexes permettant le “5’-capping” de l’ARNm

Question 12

Structure du génome des orthoréovirus?

Answer 12

• 10 segments d’ARNsb (1100-3900 nt) convertis en 12 protéines
• Les brins + et - de l’ARNdb génomique sont complémentaires et co-linéaires
• Génome de 23 000 pb
• Les ARNm viraux ne sont pas polyadénylés mais ils ont une coiffe en 5’

Question 13

Génome des orthoréovirus est segmenté, caractéristiques de ces segments?

Answer 13

• Présents en qutés. équimolaires
• Regroupés en 3 catégories de tailles : L, M et S en fonction de leur migration dans un gel d’agarose → 3L, 3M et 4S
• Chaque virus a un modèle différent de migration sur gel, chaque segment code pour au moins un produit protéique

Question 14

Protéines de structure principales?

Answer 14

λ1, λ2, 𝜎1, 𝜎2 et 𝜎3

Question 15

10 segments codent pour 12 protéines. Quels sont les deux codons qui codent pour 2 protéines?

Answer 15

M3 et S1, la localisation des codons d’initiation diffère

Question 16

Chez les orthoréovirus, toutes les protéines sont traduites à partir de…?

Answer 16

À partir du brin + du duplex d’ARN

Question 17

Les UTR 5’ et 3’ sont impliqués dans…?

Answer 17

Dans l’encapsidation de l’ARN viral

Question 18

V ou F : les réovirus sont capables de réassortiment

Answer 18

Vrai, la co-infection de la même cellule avec différentes souches de réovirus produit des descendances virales contenant diverses combinaisons

L’origine parentale de chaque segment de gène peut être déterminée par électrophorèse sur gel d’agarose

Question 19

Réplication des orthoréovirus?

Answer 19

• Le virion se lie à un
  récepteur cellulaire
• Une variante, un ISVP se lie à un récepteur cellulaire
• Les deux formes du virus entrent dans la cellule par endocytose médiée par un récepteur
• Dans la vésicule, le virion subit un clivage protéolytique acide nécessaire pour devenir un ISVP
• L’ISVP traverse la membrane vacuolaire. Il est désormais sous la forme d’un «core particle»
• Une fois dans le cytoplasme, la synthèse des 10 ARNm viraux avec les coiffes en 5’ commence dans le «core particle» → ARNm sont traduits et associés avec des protéines virales
• Complexes se forment en particules sous virales dans lesquelles les réassortiments peuvent se produire
• Chacun des 10 ARNm sert de gabarit pour la synthèse d’ARN de brin
• Les ARNm viraux produits dans les «core particles» sont utilisés pour la synthèse de protéines virales, essentielles dans l’assemblage des nouveaux virions

Dans l’étape finale, les complexes préformés de protéines de la capside externe sont ajoutés aux particules sous virales contenant des segments de l’ARNdb. Les virions matures sont ensuite libérés de la cellule par lyse

Question 20

Où se produisent la réplication et l’assemblage des virions?

Answer 20

Dans des structures cytoplasmiques appelées usines virales (VF)

Question 21

Quand apparaissent les usines virales?

Answer 21

2-4h après l’infection, puis ↑ en taille

Question 22

Structure des usines virales? But?

Answer 22

• Contiennent des microtubules et des particules virales matures et intermédiaires
• But : séquestrer et concentrer l’ARN viral et les protéines structurales pour augmenter la réplication et l’assemblage + fournir protection contre les défenses cellulaires

Question 23

Gastro-entérite : cause et symptômes?

Answer 23

• Survie +++ sur les surfaces, facilite transmission
• Voie féco-orale = mode de transmission le + important, mais transmission par l’air ?

Question 24

Épidémiologie de la gastro-entérite?

Answer 24

• Environ 95 % des enfants dans le monde l’attrape avant 5 ans, parfois mortelle
• L’asie du sud est la plus touchée
• Sérotype G1P est le plus fréquent à l’échelle mondiale
• Vaccins dispos (vivants atténués), ↓ de 80 % les risque d’hospitalisation