Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

Virologie > Semaine 1 > Flashcards

Semaine 1 Flashcards

1
Q

V ou F : il n’y a aucun groupe d’organismes qui n’est pas infecté par les virus.

A

Vrai, incluant les virus eux-mêmes. Virus infectent tous les êtres vivants.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

V ou F : nous avons des génomes viraux dans notre propre matériel génétique.

A

Vrai, souvent des génomes viraux pas actifs qui sont des artéfacts d’anciennes infections.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Combien y a-t-il de bactériophages dans l’océan?

A

10^30

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Combien pèse un bactériophage ?

A

1 fentogramme (10^-15), 1000x en dessous de picogramme.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

La biomasse totale des bactériophages est égale à la biomasse de…?

A

75 millions de baleines bleues.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

La longueur d’une ligne de 10^30 phages est = à?

A

100 millions d’années lumière : chiffre aussi intense en raison du mode de réplication des virusé

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Quelle caractéristique importante des virus leur confère un niveau de survie intense?

A

Leur grande capacité de mutation

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Une baleine excrète environ combien de calicivirus par jour?

A

10^13

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Est-ce que les virus sont très présents dans l’océan?

A

OUI, ils constituent 94% de la matière particulaire de l’océan

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Combien y-a-t’il d’infections virales par seconde dans l’océan?

A

environ 10^23

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

V ou F : lorsqu’une infection par un virus survient, le virus est seulement présent dans l’hôte le temps de l’infection.

A

Faux, une fois infecté, on l’est pour la vie.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Nous sommes infectés par environ ___ virus à chaque instant.

A

12

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Pourquoi existe-t-il des virus résistants à tous les traitements antiviraux actuels (et probablement ceux à venir)?

A

En raison du mode de survie des virus : ses derniers se reproduisent de façon +++ importante et mutent sans arrêt, ce qui crée forcément des variants résistants.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Pourquoi dit-on que le corps est un réservoir de virus?

A

Puisque les virus sont des constituants importants du microbiome. Le microbiome nous aide à développer l’immunité et favorise la digestion des aliments.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

V ou F : les humains ont plus de cellules bactériennes que de cellules humaines.

A

Vrai

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Que sont les rétrotransposons (LTR)

A

De l’ADN de virus ancien retrouvé dans le génome humain. Sections du génome ++ utiles (qui se seraient intégrées au génome chez nos ancêtres)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

V ou F : une grande majorité des virus ont un impact sur notre santé et notre bien-être.

A

Faux, peu ou pas d’impact. Notre système immunitaire est +++ efficace.
*Attention à l’immunosuppression

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Qu’est-ce qu’un virus?

A

Parasite infectieux intracellulaire obligatoire qui comprend du matériel génétique (ADN ou ARN) entouré par une couche protéique ou une enveloppe dérivée d’une membrane de la cellule hôte

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Caractéristiques distinctives des virus?

A
  1. Infectieux : peut se propager
  2. Intracellulaire obligatoire : nécessité d’une cellule hôte (pas de protéines métaboliques)
  3. Parasite : survit aux dépens de l’organisme vivant qui l’abrite
  4. Plus petits que les cellules
  5. Réplication via assemblage
  6. +++ mutations
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Pourquoi le fait de considérer le virus comme un organisme a deux phases permet de considérer les virus comme vivants?

A

Le virion ne vit pas (phase 1), mais est organisé. Lors de son interaction avec la viriocellule vivante (phase 2), le virion prend le contrôle et répond aux caractéristiques du vivanté

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

L’étude des cellules infectées par des virus a conduit à des découvertes fondamentales sur la cellule hôte. Exemples?

A
  • L’épissage de l’ARNm
  • Détails de la réplication de l’ADN
  • Rôle de la coiffe en 5’ de l’ARNm
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

V ou F : les virus sont ++ petits, même plus que les composants cellulaires.

A

Faux, ils sont plus grands que les composants cellulaires (lipides, protéines) mais plus petits que les bactéries, organites, cellules, etc..

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

V ou F : des virus de la même taille que certaines cellules existent.

A

Vrai :
Rhinovirus, Mimivirus, HIV

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Décrit les pandoravirus, découverts en 2013.

A
  • Particules de 1µm (observation au microscope optique)
  • Génome de 2 Mb (plus grand que certaines bactéries)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Qu’est-ce que le pithovirus?

A

Le plus grand virion jamais vu, retrouvé dans le périglace.

  • Diamètre = 1,5 micromètre
  • Mange des amibes
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Comment se répliquent les virus?

A

Par assemblage de composants pré-formés en plusieurs particules.

  • Font des morceaux, qui s’assemblent en produit final
  • Pas de fission binaire
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

Quand sont survenus les virus?

A

Probablement en même temps que la vie cellulaire : ils ont infectés les dinosaures (virus de l’herpès)
*** Références antiques aux maladies virales

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

Traitement dans le passé des infections virales?

A

Se fait depuis le 11e siècle, sans la connaissance des virus.

Ex : la variolation-inoculation des individus en bonne santé avec un matériau d’une pustule de variole (Ladu Montagu)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

Vaccination?

A

Par Edward Jenner en 1790 en Angleterre

30
Q

Le concept des m-o dans le temps?

A

1632-1723 : Leewenhoek → les microbes existent

1822-1895 : Pasteur → vaccination, fermentation, pasteurisation

1843-1910 : Koch → Les microbes causent des maladies (3 postulats)

31
Q

Quel virus a permis la découverte virale?

A

Le virus de la mosaÏque du tabac (1890), qui était observé comme infectieux et contagieux

32
Q

Explique la découverte virale par les agents filtrables (personnes impliquées, dates…)

A

1892 : Ivanosvsky → il existe quelque chose de vivant, mais ce n’est pas une bactérie. Met en évidence les propriétés du virus de la mosaïque du tabac. Filtres de porcelaines

1898 : Beijerinck → Découvre que les virus sont comme un liquide visqueux, un poison, une toxine

33
Q

Suite à la découverte virale par les agents filtrables, quelles sont les autres découvertes virales au fil des années?

A

1898 : Loeffler et Frosch → découvre que les virus sont +++ petits (virus fièvre aphteuse avec filtre de 0,2 microns)

1926 : Thomas Rivers → agents très petits qui se reproduisent uniquement dans l’hôte, pas cultivables en milieux de culture

34
Q

Découverte virale : 1901 et 1903?

A
  • 1901 : premier virus humain (virus de la fièvre jaune)
  • 1903 : virus de la rage
35
Q

Découverte virale : 1906 et 1908?

A
  • 1906 : virus variolique
  • 1908 : poliovirus (virus leucémie du poulet)
36
Q

Découverte virale : 1911 et 1915?

A
  • 1911 : Virus du sarcome de Rous (cancer)
  • 1915 : bactériophages et virus de la grippe
37
Q

Quand est-ce que les premières images de virus ont été produites? Conséquence?

A

En 1930, avec l’invention du microscope électronique → il a été établi que les virus sont des particules

38
Q

Comment classifie-t-on les virus?

A
  • Nature et séquence d’acide nucléique
  • Symétrie de l’enveloppe de protéine (capside)
  • Présence/absence d’une enveloppe (membrane lipidique)
  • Dimensions du virion et de la capside
39
Q

Dans le système hiérarchique classique, où commence la classification des virus?

A

À l’ordre (virales); hyper difficile de classer au dessus de ça

40
Q

Pourquoi s’intéresse-t-on à l’étude des virus?

A
  • Virus sont plus nombreux que la vie cellulaire (10 pour 1)
  • Virus influencent les cycles biogéochimiques
  • Virus peuvent être bénéfiques
  • Virus inconnus peuvent devenir de nouveaux agents pathogènes
41
Q

Vrai ou F : les virus comprennent la plus grande biodiversité de la Terre.

A

Vrai

42
Q

Pourquoi il y a une simplicité et un ordre sous-jacent aux virus?

A
  • Les génomes viraux sont des parasites moléculaires obligatoires
  • Tous les virus doivent faire de l’ARNm qui est traduit par les ribosomes d’hôtes : ce sont tous les parasites de la machinerie de la synthèse de protéines de l’hôte
43
Q

Qui a découvert les bactériophages?

A

Félix d’hérelle, en trouvant un microbe invisible soit un virus parasite des bactéries “mangeurs de bactéries”

44
Q

Qu’ont fait le groupe de phages en 1940? Dirigé par?

A
  • Dirigé par Max Delbruck
  • Ont utilisés les phages comme systèmes modèles expérimentaux pour comprendre le gène : naissance du domaine de la biologie moléculaire
45
Q

Comment la façon la biologie des phages a contribué à la biologie moléculaire?

A

L’étude des phages comme systèmes modèles expérimentaux a permis de mieux comprendre les gènes

  • Zender et Lederberg : découverte de la transduction avec le phage T4 en 1952
  • Découverte du séquençage Sanger avec le phage OX174 en 1977
  • Découverte du CRISPR-Cas9 en 2012
46
Q

La biologie moléculaire est fondée sur l’étude des bactériophage : qu’a permis de découvrir la recherche sur les phages?

A
  • Les acides nucléiques encodent l’information génétique (pas des protéines)
  • Mécanismes de régulation des gènes
  • Comment les protéines se replient (flod)
  • Recombinaison génétique
  • Évolution des organismes par le transfert horizontal de gènes
47
Q

Comment sont actuellement classés les phages?

A
  • Par la composition d’acide nucléique (ADN ou ARN)
  • Morphologie (type de capside, queue..)
  • Propriétés structurales (membrane lipidique?)
48
Q

Les phages sont actuellement classés selon la morphologie même s’ils sont presque génétiquement identiques. Pourquoi cela n’est pas la meilleure façon?

A
  • Pas possible de déterminer de tous les phages
  • Les prophages sont largement méconnus dans le système taxonomique actuel (car intégrés dans le génome)
49
Q

Pourquoi est-ce difficile de classifier les bactériophages?

A
  • ++ transferts de gènes chez les phages, donc génome est composé de pleins de morceaux qui viennent de pleins de phages
  • Les phages avec des acides nucléiques différents ne peuvent pas partager d’ancêtres communs
  • Les phages n’ont pas de gènes universellement conservés
50
Q

Quelle est la nouvelle taxonomie pour les virus?

A
  • Classe des Caudoviricetes remplace l’ordre Caudovirales
  • Abolition des familles Myoviridae, Podoviridae et Siphoviridae
  • L’appartenance à une espèce nécessite plus de critères que 95% d’identité génomique
  • Le regroupement en famille nécessite une ascendance monophylétique (dérivé d’une seule espèce) de plusieurs gènes orthologues → Prouver que des gènes homologues de plusieurs familles ont des ancêtres communs
51
Q

Un virion peut produire plus de ___ descendants infectieux en 1h

A

100

52
Q

Il se produit combien d’infection productives par seconde pour maintenir la population de phages à 10^31?

A

10^24

53
Q

Cycle de réplication des phages : que doit faire un virion lors de sa réplication?

A
  1. Le virion doit protéger son génome des dangers de l’environnement (ex : UV) : échapper aux défenses de la ¢ hôte
  2. Détecter son récepteur spécifique et s’y lier de façon irréversible (test)
  3. Doit délivrer son génome dans la ¢ hôte et réorienter la machinerie cellulaire de l’hôte vers la production de virions descendants
54
Q

Qu’est-ce qu’une virocellule?

A

Union de la ¢ et du phage

55
Q

Réplication des phages : le génome du phage se réplique plusieurs fois jusqu’à atteindre…?

A

25-100 reproductions

56
Q

Que se passe-t-il lors de la réorientation de la machinerie cellulaire de l’hôte par le phage?

A
  • L’énergie produite par le métabolisme de l’hôte est dérivée par le phage (même si la transcription des gènes de l’hôte peut être arrêtée et l’ADN d’hôte détruit)
  • Les génomes des nouveaux phages créés s’échangent mutuellement des segments génomiques et échangent aussi avec le chromosome de l’hôte par recombinaison.
57
Q

Décrit la phase finale du cycle de réplication des phages.

A
  • Les protéines structurales sont synthétisées et assemblées en procapsides, puis un génome est emballé dans chacun d’entre elles.
  • Les virions maturent s’accumulent dans le cytoplasme jusqu’à ce que l’infection soit interrompue par la lyse de la ¢ hôte.
  • Les virions partent à la recherche de nouveaux hôtes.
58
Q

Décrit le mode de vie tempéré des phages.

A
  • Partenariat temporaire avec la cellule hôte
  • Le phage reporte la production de virions en échange d’une habitation provisoire dans la cellule
  • Le génome du phage est répliqué au cours de la réplication du génome de l’hôte
  • Le prophage réprime la transcription des gènes qui déclenchent la voie lytique
59
Q

Comment se nomme les phages qui ne commencent pas le cycle lytique immédiatement après l’infection?

A

Les phages tempérés

60
Q

Comment les phages tempérés intègrent leur génome dans le chromosome de l’hôte?

A

Via une intégrase qui permet l’insertion à un endroit spécifique par la recombinaison génétique spécifique au site.

61
Q

Qu’est-ce qu’un prophage?

A

Génome de phage inséré dans le chromosome de l’hôte

62
Q

Comment nomme-t-on une bactérie contenant un prophage?

A

Une bactérie lysogène

63
Q

Qu’est-ce que la lysogénie?

A

La relation entre un prophage et sa cellule hôte

64
Q

Pendant la lysogénie, quel est l’avantage pour la bactérie?

A

Le prophage peut la protéger de l’infection des phages voisins (immunité de surinfection) : le phage “prête” quelques gènes pour la défense

65
Q

Quand est-ce qu’un prophage s’excise du chromosome de la bactérie?

A

Quand les conditions changent (deviennent favorables); le prophage peut s’exciser (induction) et entrer dans la voie lytique.
*** Si le phage ne s’excise pas, il meurt avec la bactérie

66
Q

Combien de gènes sont nécessaires pour la réplication des phages?

A
  • La taille des génomes de phage vont de 4000 pb à 500 000 pb
  • Phage QB = 4 gènes, phage bacillus G = 700 gènes
67
Q

Vrai ou faux : comme les plasmides, certains phages tempérés n’intègrent pas le chromosome bactérien.

A

Vrai, mais ils persistent dans la cellule et se répliquent lorsque la cellule se réplique.

68
Q

Qu’est-ce que la pseudolysogénie?

A

Le génome viral ne se réplique pas à partir de l’hôte, mais demeure simplement dans la cellule.

69
Q

Comment se fait le choix entre la lysogénie et la voie lytique?

A

Le choix optimal est celui qui favorise le plus de descendances au fil du temps.

70
Q

Quels facteurs influencent le choix entre la lysogénie et la voie lytique?

A
  • Concentration des hôtes potentiels
  • Concentration de phages concurrents
  • % des bactéries résistantes
  • Durée de vie du virion
  • État métabolique de l’hôte
  • Rendement de lyse prédit
71
Q

Explique comment fonctionne la communication entre les phages.

A

Le génome du phage code pour une protéine qui lui permet de communiquer avec des virus qui ont infectés d’autres cellules. Si la concentration de cette protéine est élevée dans une cellule, le virus suivra le cycle lysogène

Virologie (8 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions