Sem8 Flashcards

1
Q

Comment mesurer la quantité d’ADN ou d’amplicon à chaque cycle d’amplification?

A

Mesuré grâce à un marqueur fluorescent

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Q

Que permet d’obtenir la cinétique complète de la réaction de polymérisation ?

A

Un quantification absolue ou relative de la quantité initiale d’ADN

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3
Q

Comment est le graphe de la quantification de l’ADN par PCR en temps réel (qPCR)?

A

Fluorescence en fct du nbre de cycle

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4
Q

Quelle différente phase dans le graphe de la quantification par qPCR?

A
  1. Phase exponentielle
  2. Phase linéaire
  3. Phase plateau
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Q

Comment est la phase exponentielle?

A

La plus efficace de l’application
La quantité d’amplicon double

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6
Q

Pk la phase linéaire est moins efficace que la phase exponentielle?

A

Car réactif moins disponible car l’efficacité de la PCR diminue

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7
Q

Qu’est ce que la phase plateau?

A

La quantité de produit PCR et le signal fluorescent restent constants

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8
Q

Qu’est la valeur Ct?

A

Le nbre de cycle nécessaire pour que le signal atteigne le seuil

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9
Q

Moins il y a d’ADN à copier, plus la valeur Ct augmente?

A

Vrai

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10
Q

La valeur Ct est inversement proportionnelle au logarithme du nbre d’exemplaire de l’ADN cible avant le début de la PCR?

A

Vrai

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11
Q

Que permet la mesure de la valeur Ct grâce a la courbe d’étalonnage ?

A

De déterminer le nbre d’exemplaire d’ADN cible

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12
Q

A quoi sert les sondes TaqMan?

A

La sonde relie un fluorophore à un Quencher et lors de la polymérisation de l’ADN l’enzyme qui polymérise détruit la chaîne de nucleotides qui lui barre le chemin et libérer le fluophore de la sonde qui émet de la lumière
-> détecter ou quantifier l’ADN ou l’ARN cible avec précision.
Elle agit comme une sonde fluorescence qui émet un signal lorsque l’amplification de la séquence cible se produit

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13
Q

Qu’est ce qu’une sonde TaqMan?

A

Sonde marquée avec un colorant fluorescent mais portant également une molécule ayant la capacité de capturer l’émission fluorescente du colorant

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14
Q

Comment s’appelle l’émission fluorescente du colorant avec la sonde TaqMan

A

Le quencher

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15
Q

Que permet le kit QuantifilerTM Trio?

A
  • déterminer la quantité d’ADN masculin et total
  • dégradation d’ADN
  • présence d’inhibiteurs de PCR
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16
Q

Quelle sont les 4 cibles du kit Quantifiler TM Trio? Cbm de base chacun ?

A
  • cible longue d’ADN autosomique : 214 base
  • cible courte de l’ADN autosomique : 80 base
  • cible chromosomique Y: 75 base
  • contrôle interne de l’inhibition : 200 bases
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17
Q

Qu’ est ce que le contrôle interne d’inhibition (IPC)

A

C’est de l’ADN synthétique qui est quantifié simultanément avec l’échantillon, dans le même tube.

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18
Q

Qu’à de particulier le contrôle interne d’inhibition (IPC)?

A

Il a ses propres amorces et sonde TaqMan

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19
Q

Avant d’analyser les traces biologiques que fait il faire avec les traces ?

A
  1. Il faut les trouver
  2. Il faut avoir une idée sur leur nature
  3. Il faut réussir à les prélever
  4. Il faut avoir conscience des erreurs possible à chaque étape
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20
Q

Citer différent type de traces

A

Sang
Sperme
Salive
Os et dents
Cheveux, poils
Urine
Ongles
Liquide amniotique

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21
Q

Quels paramètres limitent le succès des analyses?

A
  • quantité d’ADN
  • degré de dégradation
  • présences de substances interférentes
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22
Q

Qu’est- ce qui constitue le sang?
Où se trouve l’ADN?

A

Globule blanc, globule rouge, plaquette
Dans les globules blancs

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23
Q

Pk les globules rouges n’ont pas d’ADN?

A

Les globules rouges ne contiennent pas de noyau cellulaire et donc pas d’ADN

24
Q

Même si surface nettoyée on peut encore trouvé de l’ADN où il y a eu du sang?
Pk?

A

Oui car 5’000 à 10’000 par globule blancs par ul de sang

25
Peut on analyser l’ADN d’une poche de sang?
Éliminé globule blancs donc non
26
Que peut on retrouver lors de délits sexuel? A quelle quantité?
- spermatozoïdes (100 000 cellule / ul) - cellule épithéliales (les cellules des parois des glandes et canaux) - leucocytes (globule blancs) -> 100 cellules/ul
27
Quelle est la méthode d’extraction spécifique pour l’ADN de spermatozoïdes ? Quelles sont les étapes?
Différentielle - extraction normale (seule les spmzde reste intacte) - ajout de solvant particulier pour casser les ponts disulfure
28
Que contient la salive?
Cellule décrochées des parois des glandes salivaire ou des parois buccales (100 cellules/ ul)
29
Ou peut on retrouver de la salive?
- mégots de cigarette - verres - chewing-gum - timbre
30
A quoi peuvent servir les os et les dents?
Servent à l’identification de cadavres et de cutines de conflits
31
Pk les dents sont très peu dégradé?
A l’intérieur de la tête et bien vascularisé
32
Pour les os quelles ADN analyse?
Le nucléaire fonctionne bien même s’il cadavre vieux et ou brûle mais si le tissus est mal conservé l’ADN mitochondrial peut donner de bon résultats
33
Quels cheveux et poil donne les meilleurs résultats ?
Ceux arraché; l’ADNmt de la tige donne des résultats dans 75% des cas
34
Comment peut on retrouver de l’ADN dans de l’urine?
Contient quelques cellules décrochées des parois des organes traversés par l’urine cad la vessie et les canaux urinaire
35
Pk le fait que les ongles soient une bonne sources d’ADN est embêtant pour bcp d’enquête (sauf identification de cadavre)
- si la victime a griffé l’agresseur, l’ADN majoritaire sera quand même celui de la victime
36
Comment se fait il que le liquide amniotique permet le diagnostic pré-natal ?
Il est constitué d’eau mais également de cellules fœtales et d’urine foetale
37
Pk ne fait on pas de test de paternité grave au liquide amniotique ?
Méthode (amniocentèse) trop invasive
38
La PCR a permis d’envisager d’exploiter toutes les traces laissées par le contact de la peau sur des objets?
Vrai
39
Que chercher sur un oreiller par ex?
Des pellicules
40
Les préparations sur lame de microscopie servent à quoi?
- utiliser avant d’annoncer maladie grave à un patient pour s’assurer de ne pas mélanger d’échantillon - svt seul échantillon disponible d’une personne décédée ou disparue
41
Quels sont les « 3 ennemi » de l’ADN? Et le petit dernier
- l’humidité - la chaleur - la lumière - substances chimique
42
Que faut l’humidité sur l’ADN?
Rupture de liaisons Activation des nucléaires Croissance de micro-organisme
43
Que fait la chaleur sur l’ADN?
Élément déterminant la vitesse de toute réaction chimique
44
Pk la lumière attaque l’ADN?
Surtout à cause des rayons UV car provoquent des mutations
45
Quelle méthode pour prélever des traces?
- mini tapes - écouvillons - papier FTA
46
Que peut prélever les mini tapes?
Prélever l’ADN des cellules de la peau dans pratiquement tous les articles (cagoule, vêtement, arme)
47
Comment prélève t’on la peau grâce au mini tapes?
- le tape/ scotch est pressée à plusieurs reprises contre l’article pour transférer l’ADN - le tape contenant l’ADN est ensuite transféré dans un tube d’extraction prêt à être analysé
48
Dans quoi sont rangés les écouvillons?
Boîte en carton offrant de bonnes conditions de séchages, de protection et de mise sous scellé des prélèvements
49
Quel technique avec écouvillon?
Double Swab 1 écouvillon humide et 1 écouvillon sec
50
Dans quoi sont utilisés des écouvillons
Prélèvement buccal (frottement d’un écouvillon sur la paroi buccale)
51
Qu’est ce qu’un papier FTA?
C’est la Papier spécial sur lequel est simplement appliqué le prélèvement buccal obtenu par frottement d’un coussinet de mousse sur la paroi buccal
52
Qu’est la capacité des papier FTA? Que neutralise t’il?
A la capacité de casser les cellules et de libérer l’ADN fixé dans les mailles du papier. Il neutralise les bactéries et virus pathogène
53
Qu’est ce que les contaminations de l’ADN?
ADN qui arrive après les faits
54
Citer des exemple de contaminations d’ADN
- police - paire de gants inchangée et mélange de trace - personnel de laboratoire
55
Donner quelque mesure préventive pour la contamination
- locaux et matériel séparé - gant et masque - jamais se tenir au dessus des échantillons ouvert - filtre de protection - contrôle positif - contrôle négatif - répéter l’analyse
56
Une fausse incrimination est possible?
Presque pas
57
Une fausse exclusion est possible?
Oui