Sem8 Flashcards
Comment mesurer la quantité d’ADN ou d’amplicon à chaque cycle d’amplification?
Mesuré grâce à un marqueur fluorescent
Que permet d’obtenir la cinétique complète de la réaction de polymérisation ?
Un quantification absolue ou relative de la quantité initiale d’ADN
Comment est le graphe de la quantification de l’ADN par PCR en temps réel (qPCR)?
Fluorescence en fct du nbre de cycle
Quelle différente phase dans le graphe de la quantification par qPCR?
- Phase exponentielle
- Phase linéaire
- Phase plateau
Comment est la phase exponentielle?
La plus efficace de l’application
La quantité d’amolicon double
Pk la phase linéaire est moins efficace que la phase exponentielle?
Car réactif moins disponible car l’efficacité de la PCR diminue
Qu’est ce que la phase plateau?
La quantité de produit PCR et le signal fluorescent restent constants
Qu’est la valeur Ct?
Le nbre de cycle nécessaire pour que le signal atteigne le seuil
Moins il y a d’ADN à copier, plus la valeur Ct augmente?
Vrai
La valeur Ct est inversement proportionnelle au logarithme du nbre d’exemplaire de l’ADN cible avant le début de la PCR?
Vrai
Que permet la mesure de la valeur Ct grâce a la courbe d’étalonnage ?
De déterminer le nbre d’exemplaire d’ADN cible
A quoi sert les sondes TaqMan?
La sonde relie un fluorophore à un Quencher et lors de la polymérisation de l’ADN l’enzyme qui polymérise détruit la chaîne de nucleotides qui lui barre le chemin et libérer le fluophore de la sonde qui émet de la lumière
Qu’est ce qu’une sonde TaqMan?
Sonde marquée avec un colorant fluorescent mais portant également une molécule ayant la capacité de capturer l’émission fluorescente du colorant
Comment s’appelle l’émission fluorescente du colorant avec la sonde TaqMan
Le quencher
Que permet le kit QuantifilerTM Trio?
- déterminer la quantité d’ADN masculin et total
- dégradation d’ADN
- présence d’inhibiteurs de PCR
Quelle sont les 4 cibles du kit Quantifiler TM Trio? Cbm de base chacun ?
- cible longue d’ADN autosomique : 214 base
- cible courte de l’ADN autosomique : 80 base
- cible chromosomique Y: 75 base
- contrôle interne de l’inhibition : 200 bases
Qu’ est ce que le contrôle interne d’inhibition (IPC)
C’est de l’ADN synthétique qui est quantifié simultanément avec l’échantillon, dans le même tube.
Qu’à de particulier le contrôle interne d’inhibition (IPC)?
Il a ses propres amorces et sonde TaqMan
Avant d’analyser les traces biologiques que fait il faire avec les traces ?
- Il faut les trouver
- Il faut avoir une idée sur leur nature
- Il faut réussir à les prélever
- Il faut avoir conscience des erreurs possible à chaque étape
Citer différent type de traces
Sang
Sperme
Salive
Os et dents
Cheveux, poils
Urine
Ongles
Liquide amniotique
Quels paramètres limitent le succès des analyses?
- quantité d’ADN
- degré de dégradation
- présences de substances interférentes
Qu’est- ce qui constitue le sang?
Où se trouve l’ADN?
Globule blanc, globule rouge, plaquette
Dans les globules blancs