- RNA virussen Flashcards
- RNA
- geen startcodon
- geen IRES
- gesegmenteerd of niet
- helicaal capside
- envelopped (membraanfusie)
mononegavirales opsomming
- rhabdoviridae
- paramyxoviridae
- filoviridae
mononegavirales
- mono -> niet gesegmenteerd
- nega -> negatief RNA
rhabdoviridae verooraakt
VSV
rabiesvirus
paramyxoviridae veroorzaakt
- bof (rubulavirus)
- mazelen (morbillivirus)
filoviridae veroorzaakt
ebola virus
marburgvirus
opsomming andere -RNA virussen
- orthomyxoviridae
- bunyaviridae
- arenaviridae
- reoviridae
orthomyxoviridae veroorzaakt
- griepvirussen A, B & C (gesegmenteerd genoom)
negri bodies
- rabid virus
- karakteristieke inclusies in brein cellen
- hond moet dood om te bekijken brein
vorm rabdoviridae (tekening)
ppt2 dia 10&11
- tampon
- glycoproteine
- matrix proteine
- phosphoproteine
- ribonucleocapsid (RNP)
- nucleoproteine
- polymerase
samenstelling genoom rabdoviridae
- 3’OH
- Le
- N
- P
- M
- G
- L
- Tr
- 5’ P
=> panhandle tegen cell RNase - geen cap of poly a
structurele proteine
- M, G, N (nucleokaspied proteine
- M tss nucleokapside & enveloppe
- nucleocapside = -RNA + N, NS, L
- N : kapsomeren die kapsied vormen
- NS + L = RDRP
NS proteinen
P = deel RDRP
-RNA uiteinden complementeren bij rabdoviridae
pannesteel ‘panhandle’
stappen rabdoviridae in cel
1) opname via endocytose
2) enveloppe versmelt met membraan endosoom
3) naakt in cytoplasma
4) -RNA gerepliceerd tot enkele +RNA’s (viraal mRNA)
5) replicatie genoom na eiwitsynhtese (translatie N, P, M, G & L)
6) samenstelling & vrijstelling via knopvorming
gedetaileerd stappenplan RNA transcr& transl
1) - RNA + RDRP (N/P+L)
2) - RNA blijft intact & 5 virale mRNA met poly A
3) leader RNA (-RNA) afgesplitst
4) translatie: virale proteinen door ribosomen (N > NS > M > G > L = gen-dosage-effect)
5) voldoende N gekoppeld met leader -> volledig +RNA
6) RDRP -> -RNA
7) samenstelling nieuw virus
uitzicht paramyxoviridae
ppt2 dia 21
- dubbele fosfolipidelaag + fusie eiwit
- M-eiwit (tegen membraan/enveloppe)
- matrix proteinen
- polymerase
- fosfoproteine
- viraal genoom -RNA
- nukleokapsied uit kapsomeren
- hemagglutinine (spikes)
CD46
- op meeste cellen
- na reactie spike met CD46 membraanfusie
nodig voor replicatie viraal RNA
- RDRP (groot proteine)
- fosfoproteine
vermenigvuldiging filoviridae
= paramyxoviridae
uitzicht filoviridae (tekening)
ppt2 dia 26
- glycoproteine
- minor nucleoproteine
- VP24
- matrix proteine
- nucleoproteine
- polymerase complex
- polymerase (L)
- genomisch RNA
transcriptie & translatie -RNA
- RDRP
- 7 +RNA
- translatie
- 7viruseiwitten
marburg viraal genoom
- -RNA
- geen cap
- geen poly a
- 3’
- NP
- VP35
- VP40
- GP
- VP30
- VP24
- L
-5’
marburg virus beschadigt
- lever cellen
- milt cellen
- bloed cellen
- immuun cellen
hoe dood marburgvirus
- beschadiging bloedvaten door eiwitten/defensinen van immuuncellen
- na 1 week dood
cytokinen storm
- virus in immuuncel & repliceert
- cell reageert met grote hoeveelheid infectie vechtende proteines
- koorts, bloed klonters, shock & dood
orthomyxoviridae
- gesegmenteerd genoom
- influenza A,B, C
uitzicht orthomyxoviridae
ppt2 dia 31
- HA (bind receptor op gastheercel)
- M2
- NA (helpt initieren infectie
- 8 genomen
antigene shift
plotselinge verandering genetisch materiaal
antigene drift
- kleine geleidelijke verandering in genetisch materiaal
mexicaanse griep
- 2009
- influenza 1
uitzicht influenza
ppt2 dia 33
- NA: neuraminidase
- dubbelde lipide enveloppe
- polymerase complex
- nuclear export proteine NEP/NS2
- M1 matrix proteine 1
- nucleic acide
- HA: hemagglutinine
- HA 1: HA head domein
- HA2: HA systeem domein
- MS: matrix proteine 2
- M2e matrix proteine 2 ectodomein
- NP: nucleoproteine
genen in influena 1 dieren
- 5 zwijn
- 2 volgel
- 1 mens
stappen inflenzua 2 in cel
1) reactie spike & receptor
2) opname = endocytose
3) enveloppe versmelt met membraan endosoom
4) viraal -RNA naar kern
5) +RNA
6) viraal mRNA naar spikes & kapsomeren
7) knopvorming
inwerking virusremmers
- protease
- transcriptie
- knopvorming
neuraminidase
rol bij vrijstelling virus (knipt hechting)
tamiflu/oseltamivir
- verhinderd vrijstelling nieuwe virussen
- anti viraal middel
- uitbraak griepvirusdeeltjes uit gastheercel verhindert
- bootst siaalzuur na & bindt actieve centrum neuraminidase
- remt neuraminidase die siaalzuur suiker knipt
- viruspartikels -> aggregaten
uitzicht bunyaviridae
- ppt2 dia 40
- ribonucleocapside
- lipide enveloppe
- N-linked carbohydraten
- G1 & G2
- polymerase (L)
bunyaviridae
- gesegmenteerd
- soms ambisense RNA (+&-)
- bunyavirus
- hantavirus
- CCHFV (crimean-congo hemorrhagic fever)
- tomato spotted wilt virus
stappen bunyaviridae in cel
1) in cel door versmelting
2) primaire transcriptie
3) translatie -> RER
4) replicatie -RNA
5) naar golgie app opname spike & kapside (spikes via vesikel golgi naar celmembraan)
6) in elkaar steken virion
7) omgekeerde endocytose
8) ook zonder eerst nr golgi en zo omgekeerde endocytose (alternatieve installatie)
uitzicht arenaviridae
ppt2 dia 46
- N proteine (L & S)
- enveloppe van plasma membraan
- G1
- G2
arenaviridae
- robovirus
- gesegmenteerd
- ambisense (-&+)
reoviridae
- dubbelstrengig
- reovirus respiratory enteric orphan (z spec symptomen)
- respiratoire aandoening & diarree
- orthovirus
- orbivirus
- coltivirus
- rotavirus
- aquarevirus
- naakt icosahedraal (ingewikkelde opbouw)
uitzicht rotavirus
ppt2 dia 50&51
-> intermediate capsid
- VP1/3, RDRP
- VP2
- VP4
- VP5
- VP6
- VP7
- VP8
- ds RNA
-> inner capsid
- T=13
- T=2
stappen rotavirus in cel
1) vasthechting aan cel door spike & receptor
2) endocytose
3) proteolyse
4) memraan interactie
5) penetratie
6) primaire transcriptie
7) proteine synthese & -RNA synthese
8) kapside samenstellen
9) virion vrijgesteld (lyse gastcel)
vaccin rotavirus
- rotarix
- duovax
- infarix-hexa
