RNA NON-CODANTS Flashcards
un ARN non codant est une..
molécule d’ARN fonctionnelle qui est transcrite, mais pas TRADUITE en protéine
mRNA =
ARN messager
Code pour une protéine
ncRNA =
non-coding RNA
ARN non-codant
ne code pas pour une protéine
Les séquences d’ADN peuvent être classées en..
séquences “utiles” correspondant aux gènes (environ 10-20% du génome/EXONS - 1.5-2% du génome)
séquences intergéniques “inutiles/junk” (environ 80-90% du génome)
une large proportion des séquences intergéniques sont..
des séquences répétées
il y a 6 types d’ARN non-codant, nommez les 2 qu’on s’intéresse dans le cours
- ARN d’interférence
-miRNA (microARN)
-siARN (small interfering ARN) - Large non-coding ARN (LncARN)
Quels RNA non-codants régulent l’expression des gènes?
miRNA, siRNA, IncRNA
on peut classifier les ARN selon leur longueur, explication
plus de 200 nucléotides : long non-coding RNA
moins de 200 nucléotides : small non-coding RNA inclient miRNA et siRNA
les miRNA, siRNA, IncRNA régulent l’expression des gènes au niveau..
transcriptionnel, post-transcriptionnel et l’épissage du pré-ARNm
les miRNA, siRNA et IncRNA participent à quoi
formation d’hétérochromatine, modification d’histones, ciblage de la méthylation et silençage des gènes
Large ncRNAs ont combien de nucléotides
Plus de 200
Small non-coding RNAs ont combien de nucléotides et ils incluent quoi
Moins de 200
Micro-ARNs
Et small interfering ARN
Les micro-ARNs fonctionnent quand dans l’expression génique
Fonctionne dans la régulation POST-TRANSCRIPTIONNELLE DE L’EXPRESSION GÉNIQUE
Micro-ARNs caractéristiques
-22 nucléotides
-se trouvent chez les plantes, les animaux et certains virus
-sont abondants dans de nombreux types de cellules de mammifères
-semblent cibler environ 60% des gènes humains
-la plupart de ces miRNA sont conservés entre les espèces et ont des fonctions importantes
Fonctions de miRNAs
Poir la plupart, les miRNA inhibent l’expression génique en diblant des ARNm
Les miRNA fonctionnent via l’appariement de bases avec des séquences complémentaires au sein de molécules d’ARNm cibles
Les molécules d’ARNm ciblés par les miRNA sont silencées par un ou plusieurs des processus suivants
-clivage du brin d’ARNm en deux morceaux
-déstabilisation de l’ARNm par clivage de sa queue poly(A)
-réduction de l’efficacité de traduction de l’ARNm en protéine
Cmt ecq les miRNA inhibent l’expression génique
En ciblant des ARNm
Les miRNA fonctionnent via quoi au sein de molécules d’ARNm cibles
Via l’appariement de bases avec des séquences complémentaires au sein de molécules d’ARNm cibles
Biogenèse des miRNAs dans le noyau, les gènes miRNAs sont généralement transcrits par quoi
ARN polymérase II
Les arns d’interférence jouent un rôle dans quoi
Dans la défense des cellules contre les séquences nucléotidiques parasites - virus et transposons
iRNA est un processus biologique dans lequel..
Des molécules d’ARN inhibent l’expression ou la traduction des gènes en neutralisant les molécules d’ARNm ciblées
Que font les siRNA synthétiques introduits dans les cellules
Peuvent inhiber de manière sélective et robuste l’expression de gènes d’intérêt spécifiques
Biogenèse des miRNAs dans le noyau, quels arn poly
2 et 3
Les miRNA font partie d’un transcrit précurseur contenant un ou plusieurs miRNA appelé
Pri-miRNA
Un seul pri-miRNA peut contenir quoi
1 à 6 précurseurs de miRNA nommés pré-miRNA
Chaque structure à ARN double brin des épingles à cheveux dans un pri-miRNA est reconnue par une protéine nucléaire appelée
Dgcr8 ou pasha
Chaque pré-miRNA a
Une structure en tige-boucle composées d’environ 70-80 nucléotides
Pri-miRNA est reconnue par quoi
Par une protéine nucléaire appelée DGCR8 chez les vertébrés ou PASHA chez les invertébrés
Qu’est-ce qui forme le complexe microprocesseur
DGCR8 et DROSHA
Que fait drosha
L’activité enzymatique de drosha découpe les pré-miRNA à partir du pri-miRNA
CROPPING : drosha libère les pré-miRNA (épingles à cheveux) des pri-miRNA
Quel est le produit résultant du copping
Le pré-miRNA a deux nucléotides non-appariés à son extrémité 3’
DESCRIPTION EXPORT EN BIOGÉNÈSE
EXPORT
Les pré-miRNA sont exportés par exportin-5 qui reconnaît les 2 nucléotides laissés à son extrémité 3’ par drosha
Le transport de l’exportine-5 vers le cytoplasme est dépendent de quoi
De l’énergie du GTP lié à la protéine Ran (RAN-GTP)
Description DICING
Dans le cytoplasme, l’épingle à cheveux pré-miRNA est processé par DICER
DICER est une endoribonucléase qui coupe la boucle reliant les bras de l’épingle à cheveux et donnant un duplex miARN:miARN* imparfait d’environ 22 nucléotides de long
DICER est une endo ou exonucléase et qu’est-ce qu’elle fait
DICER est une endoribonucléase qui coupe la boucle reliant les bras de l’épingle à cheveux et donnant un duplex miARN:miARN* imparfait d’environ 22 nucléotides de long
miRNA est nommé cmt
Brin guide
miRNA* est nommé cmt
Brin passager
Dans le duplex, quel brins peut potentiellement agir en tant que miRNA fonctionnel
LES 2
Argonaute choisi quoi
Un seul brin, le brin guide
Le brin guide et ago forment quoi
Le brin guide avec ago et d’autres protéines forment RISC (complexe silencing induit par l’ARN) dans lequel le miRNA et sa cible d’ARNm interagissent
Le miRNA fait parti de quoi
Du RISC contenant argonaute et de nombreuses protéines associées
RISC est aussi appelé cmt
Complexe miRNA ribonucléoprotéine
Les argonautes jouent un rôle central dans la fonction de quoi
Risc
Les ago lient quoi
Le miRNA mature et le guide pour une interaciton avec ARNm cible
Définir SLICING
Si l’appariement entre miRNA et le mRNA est étendu (presque parfait) le mRNA cible est clivé puis dégradé
Si l’appariement de bases n’est pas extensif, que ce passe-t-il
Si l’appariement de bases n’est pas extensif, argonaute ne slice pas, la traduction est inhi(partiel)bée et le mRNA déstabilisé
Les mRNAs sont séquestrés dans des structures cytosoliques dites P-bodies où a lieu la dégradation des mRNAs
Définir p-bodies
Des structures dynamiques contenant l’enzyme dcp1 (decaping) ainsi que des enzymes de dégradation de mRNAs
Les miRNA partiellement complémentaires peuvent faire quoi
Inhiber l’initiation de la traduction de l’ARNm cible en se liant au début du ARNm
Accélérer la déadénylation entraînant la dégradation préoce des ARNm
Les miRNA provoquent parfois quoi
La modification d’histones et la méthylation de l’ADN des sites promoteurs, ce qui affecte l’expression des gènes cibles
Rapport mirna et cancer
Le suppresseur de tumeurs p53 dans le cancer du sein
miRNA régulent p53
La majorité des miRNA sont..
Intracellulaires
Définition de lncRNA
Permet de distinguer les lncRNA des petits ARN régulateurs tels que les miRNA et les autres petits ARN nucléaires
Les lnRNA sont exprimés plus fortement ou plus faiblement que les gènes codants pour des protéines
Plus faiblement
Caractéristiques des lnRNA
-leur expression est remarquablement spécifique dans certains tissus
-sont généralement enrichis dans le noyau
-montrent une plus faible conservation de séquence, bien que certains d’entre eux soient fortement conservés
Les gènes de lncRNA sont définis par quoi
Leur positive relative aux gènes codants qui sont situées à leur proximité
lncRNA intergéniques veut dire
Des lncRNA localisés dans une région entre gènes
Les lncRNA antisens sont..
Des lncRNA transcrits dans la direction opposée d’un gène codant et dont la séquence chevauche en partie ou totalement le gène codant lui étant associé
Les lncRNA introniques sont quoi
Des lncRNA contenus dans un intron d’un gène codant
Les lncRNA divergents sont..
Transcrits de façon divergente au promoteur d’un gène codant
Les lncRNA peuvent contrôler l’expression des gènes explication
- Des voisins (en cis, action locale)
- Indépendamment de la localisation de leurs gènes cibles (en trans, action distale)
Ce contrôle peut avoir un impact positif ou négatif sur l’expression des gènes cibles (repression ou activation)
Rôles des longs ARN non codants
Les lncRNAs agissent à travers divers mécanismes pour réguler l’expression des gènes codants :
-dirigent des modificateurs de la chromatine vers des gènes cibles spécifiques
-déplacent des régulateurs de l’expression (activateurs ou répresseur) des séquences régulatrices de l’expression
-entrent en compétition avec des miRNA et protègent des ARN messagers de la dégradation par ces miRNA (fonction éponge)
-modulent des évènements d’épissage et interfèrent avec la traduction
-promeuvent l’association à des séquences amplificatrices et promotrices pour initier la transcription
