Replicação de DNA Flashcards
Quem estabeleceu o dogma central da biologia molecular em 1958?
Francis Crick
Segundo o dogma central da biologia molecular, o fluxo de informação é unidirecional/bidirecional, sendo este processo reversível/irreeversível
Unidirecional/irreversível
Como é que o dogma central da biologia molecular define genótipo de fenótipo?
Genótipo - capacidade genética total do organismo
Fenótipo - características que são exprimidas pelo organismo
Na experiência de Meselsohm e Stahl, chegou-se à conclusão que a replicação de DNA era…
Semiconservativa
Como é que, na experiência de Meselsohm e Stahl, se distinguiu que as duas cadeias de DNA produzidas eram diferentes?
Utilizou-se um isótopo diferente de azoto.
Na replicação do DNA o que são as origens de replicação são as posições…
Onde a hélice inicialmente é aberta
O que é um replicão?
Unidade de replicação que começa num conjunto de pares de bases e se estende bidirecionalmente a partir desse ponto até as duas forquilhas de replicação se se encontrarem
O que é o ARS (autonomously replicating sequence)?
Replicão com cerca de 245 pares de bases e rico em AT das leveduras
V ou F. As zonas onde normalmente se inicia a replicação do DNA são ricas em C-G.
Falso
V ou F. As bactérias têm ASR.
Falso, têm ORI
V ou F. As leveduras contêm ARS enquanto que as bactérias contêm ORI.
Verdadeiro
Se colocarmos na E.coli um plasmídeo que contenha ASR, este vai se replicar?
Não, as sequências ORI e ASR são altamente específicas para a sua espécie
Quantos replicões têm as bactérias?
1
V ou F. As bactérias têm mais replicões que as leveduras
Falso
Em qual dos organismos, eucariotas ou procariotas, a velocidade de replicação é maior?
Procariotas
A replicação é uni ou bidirecional?
Bidirecional
Em organismos mais simples/complexos há 3 tipos de iniciação da replicação: cedo, médio ou tardio.
Complexos
Quais genes iniciam a sua replicação mais cedo nos eucariontes? Os altamente repetitivos, ou de cópia única e porquê?
Os de cópia única de modo a não haver erros.
Quais genes iniciam mais tardiamente a sua replicação em eucariontes?
Sequências altamente repetitivas
V ou F. As sequências de genes moderadamente repetitivas iniciam a sua replicação a meio da fase S nos eucariontes.
Verdadeiro
Qual das cromatinas, eucromatina ou heterocromatina, inicia asua replicação mais cedo, nos eucariontes?
Eucromatina
Porque é que nos eucariontes, a heterocromatina é mais tardiamente replicada?
Por ser muito condesnada os seus genes não são expressos, sendo por isso menos alarmante a existência de erros.
O que são as ORC (origen recognition complex)?
Proteínas sempre ligadas ao DNA que quando ativadas por fosforilação deixam ocorrer a replicação.
Qual é a enzima que sintetiza a cadeia complementar na replicação de DNA?
DNA polimerase
A enzima DNA polimerase atua em que sentido?
5’-3’
Quantos tipos de DNA polimerases existem?
3
Quais são as DNA polimerases mais importantes?
I e III
A DNA polimerase não consegue iniciar a nova cadeia por elas próprias, é necessário um pequeno…
primer de RNA
Para que serve o primer de RNA?
Serve como molde para a DNA polimerase elongar a nova cadeia
A DNA polimerase também pode servir como exonuclease e realizar um “proof-reading” que é…
Corrigir os erros que fizeram.
Nos eucariotas, a DNA polimerase não se classifica como I, II e III mas como…
alfa, beta e gama
A DNA polimerase λ, está associada a que organelo?
Mitocôndrias
Que enzima catalisa a abertura da dupla-hélice?
Helicase
V ou F. O processo de abertura das cadeias de DNA pelas helicases envolve o consumo de ATP.
Verdadeiro
Na replicação de DNA, aos nucleótidos expostos que estão a sofrer replicação ligam-se proteínas estabilizadoras, as …
SBB (simple strand binding proteins)
As SBB são importantes na laggin ou leading strand? Porquê?
Lagging. Pois esta tem o DNA mais tempo exposto
Em qual nas cadeias, leading strand ou lagging strand é que são colocados primers espaçados para a DNA polimerase realizar a enlongação dos mesmos criando os fragmentos de Okazaki?
Lagging strand
Porque é que na lagging strand é necessária a colocação constante de primers espaçados?
Pois como esta cadeia é antiparalela da leading strand, a DNA polimerase faz a sua construção para o lado inverso do corte (para trás). Por isso é necessária a constante colocação de primers para a DNA polimerase poder realizar a construção entre estes.
V ou F. Os fragmentos de okazaki estão relacionados com a leading strand
Falso
O que são os fragmentos de Okazaki?
Fragmentos de DNA intercalados com primers que ocorrem na replicação da lagging strand
Qual é a enzima que coloca os primers?
Primase
Como se chama o complexo subproteico onde estão as duas DNA polimerases necessárias para a replicação de DNA?
Replissoma
Após a replicação, qual é a enzima que remove os primers, deixando falhas entre os fragmentos de Okazaki? Que enzima repara estas falhas?
RNAse H, DNA Ligase ou DNA polimerase I/alfa
A sliding clamp possui duas estruturas, quais?
O grampo carregador e o grampo deslizante
Qual é a função do grampo carregador ou clamp loader na teoria sliding clamp?
Com gatso de ATP este liga as duas subunidades do grampo deslizante e posiciona-o no zona do DNA onde a polimeração deve ocorrer
V ou F. Durante a engolação das cadeias, o clamp loader não está presente.
Verdadeiro
O primossoma é composto por quais 2 proteínas?
Primase + SSB
V ou F. O replissoma é móvel, estando o DNA fixo.
Falso, o DNA é que se move
O proofreading deteta um comprimento/diâmetro anormal na dupla hélice, corrigindo a existência de erros.
Diâmetro
Quais são as enzimas que evitam o supercoiling enquanto se dá a replicação do DNA?
Topoisomerases
Que ligações é que as topoisomerases quebram?
Ligações fosfodiéster
V ou F. A topoisomerase funciona como uma nuclease irreversível.
Falso
Qual é a função das topoisomerases?
Hidrolisar ligações fosfodiester, cisando uma ou as duas cadeias de forma temporária e local, de modo a libertar a tensão acumulada, evitando o supercoiling do DNA.
Qual das topoisomerases, I ou II, consegue hidrolisar as duas cadeias, formando uma ligação covalente com ambas as fitas da hélice ao mesmo tempo?
II
V ou F. A toposimerase I só corta uma das cadeias durante a replicação.
Verdadeiro
Para haver replicação, o DNA tem de estar metilado:
a) apenas de um lado
b)em ambos os lados
b)
As cadeias hemimetiladas podem ser usadas para replicar?
Não, pois tem de haver metilação em ambos os lados.
Qual é enzima que catalisa a metilação do DNA hemimetilado? Em que sequência de bases é que isso acontece?
Dam metilase (ADN adenina metilase), GATC (na adenina)
Descreve o método de replicação por circulo rolante.
Modo de replicação de plasmídeos em que uma endonuclease cisa a cadeia mais externa destes, e usando a cadeia interna como molde, replica o plasmídeo atarvés da síntese da sua cadeia complementar (unidirecionalmente) pela DNA polimerase.
Os fagos, inicialmente, têm moléculas de DNA linear ou circular?
Linear
O DNA mitocondrial é linear ou circular?
Circular
V ou F. A replicação do DNA mitocondrial é dependente do DNA do núcleo.
Falso
Porque é que a replicação de DNA mitocondrial leva o dobro do tempo do que o DNA nuclear?
Pois as suas cadeias são replicadas uma de cada vez
Na replicação de DNA mitocondrial, esta começa na cadeia exterior(H) ou na interior (L)? Qual é o nome da estrutura que se forma inicialmente nesta replicação?
Cadeia exterior,D-loop
Explique suncintamente o processo de replicação de DNA mitocondrial.
A cadeia externa, H do DNA circular das mitocondrias é a primeira a ser replicada, começando esta replicação com a formação de um D-loop na origem de replicação. Começa então a elongação da cadeia complementar à H pela DNA polimerase beta. Quando a cadeia complementar atinge a origem de replicação da cadeia interna, a L, esta começa-se então a replicar também, sendo esta libertada em primero lugar. Como a cadeia H ainda não foi replicada inteiramente, a DNA polimerase, termina esse trabalho.
Os telómeros são sequências pouco ou muito repetitivas?
Muito
Qual é o problema da replicação de DNA dos telómeros relacionado com a lagging strand? Qual é a enzima que resolve este problema?
Na lagging strand, ao chegar à extremidade dos cromossomas, deixa de haver espaço para outro primer necessário para o último fragmento de Okazaki, ficando esta em cadeia simples. Ou seja, a cada replicação uma cadeia fica mais curta o que se pode traduzir em morte celular. A enzima telomerase resolve este problema
Como atua a telomerase?
A telomerase adiciona DNA à cadeia que está a ser replicada, de modo a haver espaço para a primase colocar um primer de RNA e já ser possível completar a replicação.
V ou F. Uma não expressão da telomerase pelas células somáticas resulta num aumento do comprimento dos telómeros.
Falso
A telomerase contêm uma sequência de RNA/DNA, que vai servir de molde para elongar a cadeia original da lagging strand.
RNA
V ou F. Nos tumores, os telómeros são de grandes dimensões, de modo a permitir uma rápida divisão celular
Verdadeiro
V ou F. Aas leveduras tendem a controlar o tamanho dos telómeros.
Verdadeiro
A DNA polimerase I pode fazer proof-reading em que sentido?
Nos dois
Em que sentidos as DNA polimerases I, II e III fazem proof-reading (ação exonucleásica)?
I: Nos dois
II: 3’-5’
III: 3’-5’
