Regulação da expressão génica em eucariontes

Question 1

V ou F. Nos procariontes existe maior percentagem de genes relacionados com diferenciação do que proliferação e desenvolvimento

Answer 1

Falso

Question 2

Nos organismos multicelulares 20% dos genes estão relacionados com … enquanto que 40% estão relacionados com … e os restantes 40% com…

Answer 2

-Crescimento e proliferação
-Desenvolvimento
-Funções especializadas

Question 3

V ou F. Á medida que um organismo cresce, alguns genes são deletados de modo a permitir a diferenciação celular. Justifique.

Answer 3

Falso, os genes nunca são deletados mas sim silenciados através de modificações epigenéticas

Question 4

A regulação da expressão génica eucariota depende de 3 fatores:

Answer 4

-Sinal: hormonas, fatores de crescimento, stress ambiental…
-Nível de resposta: transcrição, processamento, tradução, estabilidade proteica etc…
-Mecanismos: proteínas reguladores, metilação e inativação

Question 5

O que são fatores de transcrição?

Answer 5

Fatores de transcrição são proteínas que se ligam a sequências específicas de DNA, geralmente em regiões promotoras, para controlar a transcrição de genes

Question 6

V ou F. A TATA box é exclusiva dos eucariotas.

Answer 6

Verdadeiro

Question 7

(RE) O que é a TATA box?

Answer 7

A TATA box é um elemento promotor específico que desempenha um papel crucial na iniciação da transcrição em eucariotas

Question 8

V ou F. Os fatores de transcrição ligam-se a sequências grandes de DNA.

Answer 8

Falso, pequenas (alta especificidade)

Question 9

Qual é a razão de muitos fatores de transcrição ou DNA binding proteins, terem resíduos laterais positivos?

Answer 9

Interagirem com a carga negativa do DNA

Question 10

Os fatores de transcrição são constitutivos, o que significa que…

Answer 10

Estão sempre a ser expressos

Question 11

Diga 4 exemplos de DNA binding proteins ou fatores de transcrição:

Answer 11

-Zinc-fingers
-Hélix-turn-helix
-Leucina-zipper
-Helix-loop-helix

Question 12

Nos zinc-fingers, o átomo de Zn está coordenado a …

Answer 12

2 histidinas e 2 cisteínas

Question 14

Como é constituida a Leucine-Zipper?

Answer 14

2 alfa-hélices enroladas de modo que as leucinas estejam voltadas para o mesmo lado interatuando.

Question 15

Como se dá a regulação negativa?

Answer 15

Proteina repressora liga-se inibindo a transcrição. Esta proteina pode ser ativada por um ligando ou este ligando pode inativa-la.

Question 16

Como se dá a regulação positiva?

Answer 16

Um ativador dà inicio à transcrição ligando-se ao complexo de pré-iniciação. Esta proteina pode ser ativada por um ligando ou este ligando pode inativa-la.

Question 18

Qual dos dois, enchancer ou promotor, tem distância fixa?

Answer 18

Promotor

Question 19

V ou F. O enhancer tem de estar obrigatoriamente em cis para a atuar

Answer 19

Falso

Question 20

V ou F. O promotor tem de estar em cis para atuar

Answer 20

Verdadeiro

Question 21

Para se ativar a transcrição, quando uma proteína ativadora se liga à cromatina, qual é o complexo que a modifica permitindo a sua acetilação?

Answer 21

Complexo remodelador de cromatina

Question 22

Qual é a enzima que faz a modificação epigenética nas histonas?

Answer 22

Histona-acetilase

Question 23

V ou F. É a acetilação de histonas que permite o início da transcrição.

Answer 23

Verdadeiro

Question 24

V ou F. Os fatores de transcrição já são sempre codificados na sua forma ativa. Justifique

Answer 24

Falso, alguns necessitam de um co ativador.

Question 25

Diga 4 modifcações pós-traducionais dos fatores de transcrição que determinam se estes estão ativos ou não.

Answer 25

-Ligação com um ligando, ativando-os
-Fosforilação, ativando-os
-Ligação de uma segunda subunidade
-Unmasking (retirar por fosforilação uma “capa” protetora, ativando-os)

Question 26

Porque é que o feto expressa hemoglobinas diferentes (yG, yA e E)?

Answer 26

Pois estas hemoglobinas têm mais afinidade para o O2, isto é importante pois ao feto só lhe chega o oxigénio dissolvido no plasma, não havendo altas pressões deste gás no sangue, sendo necessário obter o máximo possível, o que explica a alta afinidade

Question 27

Quais dos grupos de hemoglobinas,
a) yG, yA ou E
b) beta e delta
tem menos afinidade ao oxigénio e porquê?

Answer 27

b) pois existe mais pressão de oxigénio no sangue, não sendo necessária uma afinidade tão alta para este gás

Question 28

Quais dos grupos de hemoglobinas,
a) yG, yA ou E
b) beta e delta
é expressa pelo feto?

Answer 28

a)

Question 29

Quais dos grupos de hemoglobinas,
a) yG, yA ou E
b) beta e delta
se começa a produzir após o nascimento? Em resposta a quê?

Answer 29

b), em resposta a uma maior pressão de o2 no sangue

Question 31

Explique como é que o corticoesteroide pode influenciar na transcrição de genes?

Answer 31

É uma hormona esteroide que ao entrar no citoplasma se liga a recetores - GE- este vai se ligar o GRE (glucocorticoid responsive element) que por sua vez vai transportar este complexo para o núcleo permitindo a sua transcrição

Question 32

As hormonas esteróides podem inetragir com os… , induzindo a transcrição

Answer 32

Fatores de transcrição

Question 33

Como funciona a regulação da expressão génica por recetores específicos na membrana plasmática?

Answer 33

Moléculas ligam-se a estes recetores ativando-os, desencadeia uma série de respostas e reações que resulta num fator de transcrição livre - controla a transcrição

Question 34

Como funciona a o JAK/STAT pathway na expressão génica por citoquinas?

Answer 34

-Um citoquina liga-se ao recetor JAK
-JAK dimeriza fosforilando os STATs
-STATs dimerizam funcionando como fatores de transcrição, induzindo a expressão génica

Question 35

Na via JAK/STAT qual é a molécula que primeiro se liga ao JAK?

Answer 35

Citoquina

Question 36

V ou F. Na via NF-kB, o seu ativador é degradado e este liga-se ao gene controlando a expressão.

Answer 36

Falso, é o seu inibidor.

Question 37

Como é feita a regulação da tubulina?

Answer 37

a tubulina está sempre a ser produzida e funciona em heterodímero (α+β);
dímero em grande quantidade -> liga ao péptido em tradução -> ativa endonuclease -> para a síntese

Question 38

Em que consiste os estudos de promotores por deleção?

Answer 38

Remove-se diferentes partes do promotor e incorpora-se este em células de diferentes tecidos (plasmideo) para ver se o gene é expresso ou não. Assim com base no resultado, conseguem concluir se a parte retirada do promotor era essencial para a expressão ou não.

Question 39

O que é a Heat Shock Response?

Answer 39

Na resposta a stress, a transcrição global de um organismo vai alterar, passando-se a produzir proteínas, as Heat Shock Proteins, que vão tentar remediar a situação de stress.

Question 40

Um exemplo de Heat Shock Proteins são as …

Answer 40

Chaperones

Question 41

Os fatores e transcrição que atuam em situações de stress são os…

Answer 41

Heat Shock Factors (HSF)

Question 42

Os Heat Shock Factors ligam-se a que sequências do DNA para induzir a expressão das HSP?

Answer 42

HSCEs, heat shock consensus elements)

Question 43

V ou F. Os HSF (heat shock factors) atuam em monómeros.

Answer 43

Falso, atuam em dímeros/trímeros

Question 44

A HSCEs, heat shock consensus elements são sequências repetidas de que bases?

Answer 44

GAA

Question 45

V ou F. Os heat shock factors são constitutivos.

Answer 45

Verdadeiro

Question 46

Na regulação das leveduras, qual das enzimas, GAL-80 ou GAL-4 é a inibidora e ativadora?

Answer 46

GAL-80 é a inibidora e a GAL-4 é a ativadora

Question 47

Na regulação das leveduras, o que acontece quando não há glucose no meio? Porquê?

Answer 47

O complexo GAL-80 e GAL-4 permanece ligado, ligando-se ao UAS, impedindo a transcrição. Se não há substrato, não faz sentido haver transcrição.

Question 48

Na regulação das leveduras, o que acontece quando há glucose no meio?

Answer 48

A GAL-80 sai do complexo GAL-80/GAL-4, deixando só esta ultima ligada (ativadora), permitindo a transcrição.

Question 49

V ou F. A GAL-4 funciona também noutras espécies, desde que haja UAS.

Answer 49

Verdadeiro

Question 50

Existem sequências às quais se ligam proteinas na presença elevada de metais pesados, como se chamam estes genes?

Answer 50

Metal Response Elements (MRE)

Question 51

A associação de promotores à matriz nuclear dá origem a diversas estruturas:

Answer 51

-MAR (matriz attachmeent region)
-Scaffold
-Locais de ligação à matriz
-SAR (scaffold associated region)

Question 52

A matriz nuclear é solúvel ou insolúvel?

Answer 52

Insolúvel

Question 53

O que fazem os genes “insulators”?

Answer 53

Fazem com que a ação de um enhancer seja unidirecional

Question 54

A metilação das citosinas de um promotor pode ligar/desligar um gene

Answer 54

Desligar

Question 55

Os housekeeping genes normalmente têm uma alta percentagem em que bases?

Answer 55

C-G

Question 56

Em que consistiram os estudos de expressão génica na Drosophila.

Answer 56

Após a fertelização do oócito iniciam-se divisões do núcleo mas SEM citocinese. Depois cada núcleo migra para o córtex para formar um blastómero, por individualização de membranas à volta do núcleo. Quando se faz a individualização, as diferentes células, dependendo do local onde estão, aprisionam diferentes factores de transativação, que vão determinar uma expressão génica específica para esse local, pelo que essas células vão estar na origem das diversas estruturas do organismo adulto.