Reparación Flashcards
Cuáles son los principales mecanismos de reparación:
Escición de bases (BER)
Escición de nucleótidos (NER)
Mismatch (MMR)
Recombinación homóloga (HR)
Unión de extremos no homóloga (NHEJ)
Reparación por escición de bases
Elimina los nucleótidos alterados generados por los reactivos químicos presentes en la dieta o por el metabolismo: (Desaminaciones, alquilaciones, respecies reactivas de O2)
Que ocurre en la escición de bases
-Si la desaminación convierte una citosina en uracilo
-Se detecta y elimina uracilo dejando el nucleótido sin base
-El nucleótido sin base se elimina dejando un hueco en el ADN
-ADN polimerasa beta llena el agujero con la base correcta
-Ligasa cierra la brecha
DNA-glucosilasa
Detecta que la base está mal apareada e hidroliza el enlace N-glucosídico (entre la base nitrogenada y el azúcar)
Hay 8 tipos diferentes
Endonucleasa
Quita los enlaces fosfodiester dejando un hueco en la cadena
Diferencia entre endonucleasa y exonucleasa
Endonucleasa- rompe enlaces fosfodiester dentro (en medio) de la cadena
Exonucleasa- rompe enlaces fosfodiester en los extremos de la cadena
Ejemplo de una molécula capaz de generar dímeros de nucleótidos
Especies reactivas de oxígeno, radiación
Vía genómica global que corrige las cadenas de DNA en el resto del genoma
Reparación por escición de nucleótidos
La reparación por escición de nucleótidos ocurre cuando hay:
Dímeros
Uniones interhebras
Distorsión de la hebra
Proceso de escición de nucleótidos
-XPC reconoce el daño por medio del enlace covalente entre los nucleótidos, se le une XPA
-xpd, xpb y TF2H rompen los puentes de hidrógeno del fragmento escindido, función helicasa
-RPA evita la formación de puentes de hidrógeno durante la reparación
-Endonucleasas: xpf y xpg cortan los enlaces fosfodiester a cada lado y varios pares de bases de distancia
-DNA pol delta y epsilon- ponen nucleótido correcto
-Ligasa
Bases mal apareadas:
metiladas, alquiladas y oxidadas. Guanina—->8-oxoguanina
El mismatch se usa cuando
estamos en replicación
El proceso de escición se usa cuando
no estamos en replicación
Mismatch– por especie oxidativa
DNA OGG1 (oxoguanina glucosilasa)
reconoce a la adenina unida con una guanina oxidada (8-oxoguanina)
Metil-directed mismatch repair (mutM y mutY) eliminan la adenina y la sustituyen por una citosina
Mismatch
-DNA pol se detiene cuando hay una base mal apareada
-MSH: reconoce base mal apareada
-MLH. permite formar complejo de reparación:
-Exonucleasas (Exo7 en 5’, Exo 1 y 10 en 3’): Quitan la base mal apareada
-DNA alfa- pone las bases correctas
-ligasa
Reparación por recombinación homóloga que pasa con la información
No se pierde información, se copia completa
Proceso de reparación por recombinación homóloga (HR)
-gen ATM (Ataxia telangiectasia mutado) va identificar que hay ruptura de la hebra de DNA
-ATM recluta al complejo MRE11 (meiotic recombination) que expone los extremos 3’
-RPA (proteína de replicación A) se une a la cadena sencilla para evitar que se -formen otros puentes de hidrógeno
-llega RAD51 junto con otras proteínas RAD51, RAD52 y BRCA2 van a movilizar la hebra que se rompió hacia nuestro cromosomas homólogo (en fase S)
y con una DNA polimerasa empezamos a copiar
Uniones holiday– dejan parches
MRE11 es una exonucleasa formada por 3 proteínas
MRE11, RAD 50 y NBS1
Uniones Holliday
estructura compuesta por el cruce de dos cadenas de ADN durante el proceso de recombinación homóloga entre dos cromosomas homólogos. Esta unión puede moverse a lo largo del ADN y delimita la longitud de ADN intercambiado entre los dos cromosomas.
Los genes mutados en el cancer de mama son
BCRA1 y 2
Que pasa con la información en la Reparación por recombinación no homóloga
No es una copia, se pierde información
Proceso de recombinación no homóloga
-la proteína de cinasa dependiente de ADN (ADN-PKcs), que consta de tres subunidades: KU70, KU80 y ADN-PKcs reconocen los cortes en el ADN y mantienen los extremos en proximidad para su procesamiento y reunión.
-el complejo ARTEMIS/ADN-PKcs alinea los extremos y actua como nucleasa
-el complejo XRCC4/ligasaIV, que se encarga del paso final de la ligación
Cuando ocurre recombinación no homologa
uando se producen roturas en la doble cadena de ADN.