Expresión génica Flashcards
El grupo de genes expresados en una
célula determina
el grupo de proteínas y
de ARN funcionales que contiene.
Regulación en cis
Una secuencia contigua a un gen que tenga un
efecto regulador sobre la tasa de transcripción de ese gen.
Potenciadores y Silenciadores
Regulación en trans
Factores de transcripción
Los dominios de unión al DNA ayudan a que
Las proteínas puedan reconocer el DNA
Donde mejor se puede reconocer la secuencia de nucleótidos es en el surco menor de DNA. V/F
Es en el surco menor
Motivo hélice-giro-hélice TF
Proteínas de dos α hélice
conectadas por un
cadena corta de a.a
◦ Desarrollo embriónico
Motivo zipper de Leucina TF
2 α hélices
Motivo dedos de Zn TF
α hélice unida β hélice
por Zn
◦ Receptores de hormonas
esteroideas
Hélice asa hélice (HLH)
TF
α hélice conectada por una
asa a otra α hélice
Promotor
Sitio en donde los factores de transcripción y la RNA polimerasa se ensambla
SECUENCIAS REGULATORIAS
Donde las proteínas reguladoras se unen para
controlar el proceso de ensamblaje en el promotor
POTENCIADORES
◦ Atraer, posicionar y modificar los factores de
transcripción, Mediador y la RNA Pol II hacia el
promotor.
Activadores
Actúan directamente con los factores de transcripción y pueden regular la actividad de la RNA POL II.
La unión de TF a los potenciadores controla la expresión génica:
- desarrollo
◦ diferenciación
◦ respuesta de las células a las hormonas y los factores de crecimiento.
Represores
Se unen a secuencias específicas dentro del DNA (silenciadores) para inhibir la transcripción ()
La descondensación de la cromatina no es suficiente para convertir el ADN en una plantilla
accesible para la transcripción. V/F
V
Después de que se descondensa la cromatina los genes permanecen unidos a
histonas y empaquetados en nucleosomas
Más metilación=
Menos expresión génica
Adición de un grupo metilo al carbono
5 de la citosina (5mC)
Siempre en citosinas que van después de una guanina
Metiltransferasas
Actua en secuencias CG que estan pareada con una secuencia CG metilada
Eucromatina
Regiones relativamente dispersas poco
condensadas que ocupan la mayor parte
del núcleo.
◦ Niveles alto de acetilación
◦ Cromatina activa transcripcional
Heterocromatina
◦ Regiones de la cromatina densamente empaquetadas
◦ Inactivas, no se expresan
◦ Niveles altos de metilación
Los telómeros y centrómeros tienen altos niveles de
Heterocromatina constitutiva
Tipos de heterocromatina
Facultativa y constitutiva
H. facultativa
◦ Se expresan durante el desarrollo y/o diferenciación y posteriormente
se silencian.
H. constitutiva
◦ Siempre permanecen condensados y se encuentran silenciados
◦ Telomeros y centromeros.
Las histonas tienen dos dominios:
- unirse a otras histonas y unirse al DNA
- amino terminal que se encuentra fuera del DNA y sufre modificaciones
ACETILACION DE HISTONAS añade:
Cargas negativas a las histonas
Lisinas (H3K56)
◦ Acetiltransferasas de histonas (HAT)
◦ Deacetilasas de histonas (HDAC)
◦ Acetiltransferasas de histonas (HAT)
◦ Promueve la transcripción
◦ Deacetilasas de histonas (HDAC)
◦ Represores transcripcionales
FOSFORILACIÓN DE HISTONAS
Serinas, treoninas y tirosinas
Incrementa la carga negativa a la histona
Favorece la transcripicón
METILACIÓN DE HISTONAS
◦ Metiltransferasas de Lisina (HKMT)
◦ Metiltransferasas de Arginina
◦ DEMETILASAS DE HISTONAS
◦ Metiltransferasas de Lisina (HKMT)
◦ Lisina (H3K9)
◦ Puede activar o reprimir la transcripción de un gen
◦ Metiltransferasas de Arginina
◦ Argininas
◦ Activación transcripcional
EPIGENÉTICA
abarca todos los procesos y
mecanismos moleculares que afectan a la
regulación y expresión de los genes y que
son heredables de unos organismos a
otros.
Los mecanismos de regulación epigenética
más comunes en humanos son
la metilación del ADN y las modificaciones
post-traduccionales de las histonas
(fosforilación, la metilación y la acetilación).
Acetilación de histonas
◦ Añade carga negativa a las histonas
◦ Descompactación de la cromatina
◦ Facilita el acoplamiento de los factores de
transcripción
()Enzimas que participan en la acetilacion de histonas
◦ ACETILTRANSFERASAS
◦ DEACETILASAS (HDAC)
Proteína p53
desencadena una serie de respuestas celulares que incluyen la reparación del ADN, la detención del ciclo celular para permitir la reparación o la inducción de la muerte celular programada (apoptosis) si el daño es demasiado grave para repararlo.
Deacetilasas de histonas CLASE I
-represión de la transcripción, regulacion epigenetica, regulacion del ciclo celular
HDAC 1, 2, 3, 8
Deacetilasas de histonas CLASE II
regulan el trafico de proteínas, adhesión, movilidad celular
◦ HDAC II A 4,5, 7 y 9
◦ HDAC II B 6 y10
HDAC CLASE III
formacion de memoria, represion de la transcripcion,
regulacion epigenetica
◦ sirtuinas
Expresión aberrante:
HDAC1.- Cancer de prostata, colon y
mama
HDAC 2.- Carcinoma gastrico y Cancer de
cuello uterino
Carcinoma colorectal
Displasia cervical
Sarcomas endometriales
HDAC 8.- neuroblastoma y glioma
Inhibidores HDAC
Vorinostat
Romidepsin
Belinostat
Panobinstat
