quantification de l'expresion génique Flashcards
qu’est-ce que l’expression génique?
sa transcription en ARN suivi de sa traduction en protéines
propriété de la GFP
pas de dosage enzymatique ou de cofacteur,
prot. stable,
non-toxique
à quoi servent les gènes rapporteurs? 3
Déterminer le niveau d’expression,
Déterminer les conditions favorisant l’expression maximale,
Déterminer la localisation
À quoi sert l’analyse transcriptomique?
Caractériser, comparer et quantifier l’ensemble des ARN
Quel sont les avantage et les désavantage de la biopuce
Avantage: mesure simultanément l’expression de tous les gènes d’un organisme
Désavantage: dégradation de l’ARN, Marquage, interprétation
Quel est l’avantage des biopuces d’oligonucléotides à chevauchement?
Si on regarde le même gène, 2 amorces allument, si c’est 2 gènes différents, 1 amorce allume
Quelles sont les deux méthodes de profils d’expression globale de bactéries intracellulaires
- modèle avec peu de cellules hôtes (chambre à dialyse, liquide physiologique)
- Optimisation du modèle d’infection (lyse des cell eucaryotes, dose d’infecton de 100:1, opsonisation et grande quantité de cellule)
Quels sont les applications du SCOTS 5
- Donne un aperçu de l’interaction hôte-patho
- identification de gènes appropriés
- méthode applicable à tous les MO
- aucune nécessité de tech génétique spécialisée
- Détecte l’expression gènes à partir de peu de bac
à quoi setr le RNA-seq
permet de détecter la présence et la quantité de tous les ARN,
Caractérise les différentees populations d’ARN