purificacion de proteinas Flashcards

1
Q

purificacion de una nueva proteina

A

se emplea la expriencia y el sentido comun
se emplea diferentes metodos secuenciales de forma epirica hasta encontrar la mejor forma
los metodos mas sofisticados y caros se reservan para el final

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2
Q

cromatografria

A

en papel
en capa fina
en columna
de intercambio ionico
de exclusion molecular
de afinidad
cromatografia liquida de alto rendimiento

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3
Q

cromatografia

A

tecnica para fraccionar mezclas organicas al desplazarla a traves de una matriz

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4
Q

metodo de separacion en el que se aprovechan las diferencias en el coeficiente de particion entre una fase movil y una fase estacionaria

A

cromatografia

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5
Q

coeficiente dee particion

A

es el coeciente entre las concentraciones de una sustancia en las dos fases formadas por dos disolventes inmiscibles en equilibrio

mide la solubilidad diferencial de una sustancia en esos dos disolventes

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6
Q

Un soporte (matriz) mantienen sostenida la fase

A

la fase estacionaria y la fase m6vil acarrea a la muestra.

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7
Q

Los componentes de la muestra que interaccionan fuertemente con la fase estacionaria

A

tendran un tiempo de retencion (desde la entrada hasta el detector/salida) mayor.

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8
Q

Retenci6n.

A

Efecto producido sobre los componentes
de la mezcla por una fase estacionaria, que puede ser un solido o un liquido anclado a un soporte solido.

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9
Q

Desplazamiento.

A

Efecto ejercido sobre los componentes de la mezcla por una fase movil (eluyente), que puede ser un liquido o un gas.

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10
Q

Elucion/eluir.

A

Migracion/migrar de los componentes de una
mezcla retenidos a lo largo de la fase estacionaria, impulsados por el desplazamiento ejercido por la fase m6vil.

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11
Q

Tipos de cromatograffa
Dependiendo de la naturaleza de las fases estacionaria y movil.

A
  • Solido-liquido.
  • liquido-liquido.
  • liquido-gas.
  • So1ido-gas. La fase estacionaria
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12
Q

Cromatografia

  • En papel.
A
  • Fase estacionaria: papel flltro.
  • Version primitiva de la capa fina.
  • Para aminoacldos individuales o dipeptidos.
  • Empleada por Sanger en la secuenclaclon de la lnsulina.
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13
Q
  • En capa fina.
A

Fase estacionarla: placa adsorbente, los mas usados silica gel y alumina, adherldo a un soporte de plastlco, vidrio o aluminio.

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14
Q

La fase estacionaria, se empaqueta en

A

una columna, evitando que el aire quede atrapado interrumpiendo la
continuidad de las fases.

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15
Q

Componentes que eluyen a diferentes velocidades podran ser

A

separados.

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16
Q

Cromatografia a en columna

A

Los componentes pueden ser colectados para su analisis posterior.

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17
Q

Cromatografia de intercambio ionico

A

Aprovecha las diferencias en signo y magnitud de las cargas que tienen las moleculas coma las proteinas a distintos pH.

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18
Q
  • El mecanismo basico de la cromatografia de intercambio ionica
A

el intercambio reversible de las iones en solucion con los grupos funcionales cargados
unidos covalentemente a una fase estacionaria insoluble llamada resina

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19
Q

lntercambio cationico (resina carga negativa).

A
  • Fuerte. Acido sulfonico.
  • Debil. Acido carboxilico.
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20
Q
  • lntercambio anionico (resina carga positiva).
A
  • Fuerte. Aminas cuaternarias.
  • Debil. Aminas secundarias o terciarias.
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21
Q

Cromatografia de intercambio anionico

A

molecula con carga negativa se unira a un intercambiador ionico con grupos cargados positivamente, pero eluira de la columna al incrementar la concentracion de sales.

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22
Q

lntercambio ionico de peptidos

A

La separacion se optimiza cambiando gradualmente el pH y/o la concentracion de sales de la fase movil para crear un gradiente.

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23
Q

Moleculas con carga opuesta a la de la matriz a donde migraran en el intercambio ionico de peptidos

A

mas lentamente que aquellas con carga del mismo signo que la fase estacionaria.

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24
Q

Cromatografia de exclusion molecular

A

Separacion del soluto segun su tamano y estructura molecular.

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25
Q

q pasa con las moleculas pequeñas en la cromatografia de la exclusion molecular

A

entran en el laberinto de los espacios dentro
de la matriz y son retrasadas.

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26
Q

q pasa con las moleculas grandes en la cromatografia de la exclusion molecular

A

no entran dentro de las cavidades de la
matriz y atraviesan mas libremente
recuperandose en las primeras
fracciones.

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27
Q

las dlferentes fases m6viles pueden afectar al orden de elucion debido a

A

los cambios de tamaiio en disoluci6n (radio hidrodinamico o radio de giro).

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28
Q

Cromatografia de afinidad

A

Es la cromatografia de mayor especificidad y selectividad para la purificacion de biomoleculas.

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29
Q

fases de la cromatografia de afinidad

A
  1. Se basa en la interacci6n especifica de dos moleculas
  2. Una de ellas se une covalentemente a la fase estacionaria
  3. moleculas que han quedado por su afinidad por la fase estacionaria se liberan por un cambio del medio eluyente
30
Q

a condiciones en las que la interacci6n se
debilite:

A
  • pH (lo que afecta al estado de ionizacion de las biomoleculas).
  • Fuerza ionica
  • Polaridad. (solubilidad).
  • Solucion de las moleculas inmovilizadas.
31
Q

Etiquetas terminales

A
  • varias proteinas no se unen a un ligando
    permitiendo su purificacion por afinidad.
  • Se expresa una proteina recombinante de fusion con un peptide que une con alta afinidad y especificidad a un ligando.
  • La etiqueta se remueve despues con una proteasa que corta cerca de la union entre la proteina de interes y la etiqueta.
32
Q

High-Performance Liquid Chromatography (HPLC)

A

*Cromatografia liquida de alto rendimiento.
liquido - liquido.
uso de bombas de alta presion para mover las moleculas a traves de la columna.
para analizar componentes no volatiles como tambien azucares, vitaminas, drogas y metabolitos.

33
Q

HPLC analitica

A

Determinar la composicion de la mezcla.

34
Q

HPLC Preparativa.

A

Se pueden recuperar los componentes posteriormente a su analisis para estudios posteriores

35
Q

El area bajo la curva de cada pico es proporcional a

A

a la cantidad/concentraciOn de cada componente en la mezcla analizada.

36
Q

Electroforesis

A

fundamentales para aislar y purificar macromoleculas en base a su movilidad dentro de un soporte o matriZ solida en un campo electrico.

37
Q

EN LA ELECTROFORESIS PUEDEN SER ANALIZADOS

A

ACIDOS NUCLEICOS Y PROTEINAS

38
Q

Electroforesis en gel

A

El medio de soporte solido es un gel.

39
Q

geles en la electroforesis

A

geles de agarosa y geles de poliacrilamida

40
Q

Geles de poliacrilamida.

A

Analisis principalmente de muestras de
proteinas, aunque tambien para acidos nucleicos es posible en caso de que se requiera mayor resoluci6n que la que brinda la agarosa.

41
Q

Geles de agarosa.

A

Analisis de muestras de acidos nucleicos. En agarosa no pueden ser observadas difeerencias pequeñas en pesos moleculares de las moleculas analizadas.

42
Q

Movilidad electroforetica

A

movilidad de la molecula esta en funci6n de su
peso molecular y su carga electrica
las diferentes movilidades que exhiben las diferentes macromoleculas las que permiten su separacion.

43
Q

Las moleculas siempre se mueven hacia el

A

el electrodo de polaridad opuesta a la carga neta de la molecula los cationes se mueven hacia el catodo y los aniones hacia el anodo).

44
Q

Factores intrinsecos de la molecula.

A
  • Carga electrica.
  • Peso molecular.
45
Q

Factores extrinsecos a la molecula.

A
  • Concentracion del gel (agarosa principalmente).
  • Voltaje aplicado.
  • Tiempo de corrida.
  • Temperatura.
46
Q

Factores intrinsecos de la molecula.
- Relacion carga electrica/peso molecular.

A
  • A mayor relacion carga electrica/peso molecular, mayor movilidad
  • Proteinas: esta relacion no es constante.
  • Acidos nucleicos: esta relacion es constante.
47
Q

Si la relacion carga electrica/peso molecular es
constante, la movilidad «queda

A

«queda en funcion del peso molecular», si este se incrementa la movilidad disminuye y viceversa.

48
Q

Movilidad electroforetica en gel

A

En base al peso molecular de la macromolecula.

49
Q

Electroforesis de protef nas en gel

A
  • Electroforesis en 1 Dimension (PAGE).
  • Electroforesis en 2 Dimensiones (2D).
50
Q

niveles de organizacion de las proteinas

A
  1. AA
  2. interactuan con enlaces de hidrogeno
    3.atracciones entre helices alfa y hojas plegadas
  3. mas de una cadena de aa
51
Q

Geles de poliacrilamida

A
  1. Acrilamida
    Formacion de polfmeros.
  2. bisacrilamida
    Entrecruzamiento entre las cadenas de polimeros.
52
Q

Las proteinas no tienen una relacion carga electrica/peso molecular constante.
2. La forma de la protelna influye en la movilidad presentan mayor movilidad.
* Por lo tanto si las proteinas se analizan asi nada mas, se obtiene un fraccionamiento q no obedece a la diferencia del peo molecular

A

Emplear SOS en la preparacion del gel de poliacrilamida.

53
Q

El corrimiento electroforetico observado puede representar a mas de una cadena polipeptfdica.

A

Emplear agentes desnaturalizantes reductores.

54
Q

SDS sobre la relacion carga electrica/peso molecular.

A

Se une a las zonas apolares del polipeptido.

55
Q

SDS sobre la estructura proteica.

A

Agente desnaturalizante.
la repulsion electrostatica por la union del SDS rompe los enlaces no covalentes hacienda que la proteina pierda su conformacion.
Se eliminan las diferencias en conformacion y su influencia sobre la movilidad de las diferentes proteinas que han de ser
separadas en el gel.

56
Q

las cisteinas en las proteinas pueden formar

A

enlaces puentes de disulfuro.

57
Q

Puentes disulfuro en las protef nas

A

Ayudan a estabilizar estructuras terciarias y cuaternarias y mantienen cierto plegamiento en las proteinas

58
Q

Ditiotreitol (DTT) o P-Mercaptoetanol.

A

Agentes desnaturalizantes reductor.

59
Q

Se puede determinar el numero y
tamaño de subunidades proteicas
comparando

A

la electroforesis bajo condiciones reductoras y no reductoras.

60
Q

Azul de Bromofenol

A

Se adiciona al buffer de carga de la muestra.
Permite visualizar el corrimiento electroforetico.
* Carga negativa por encima de pH 4.6.
* Peso molecular menor que cualquier proteina.

61
Q

Protelnas con diferentes pesos
moleculares poseen diferente

A

Relacl6n de Frente (RF).

62
Q

Revelado del gel. Metodos de Tinci6n

A

azul d coomassie y tincion de plata

63
Q

Azul de Coomassle

A

Puede detectar bandas de hasta SO ng.

64
Q

Tincion de plata.

A

lncrementa la senslbilidad de deteccl6n

65
Q

Electroforesis en 2 Dimensiones

A

1 Dimension.
- Separacion por punto isoelectrico.
2da. Dimension.
- Separacion por tamaño.

66
Q

Punta isoelectrico

A

Es el pH al que un polianfolito tiene carga neta cero.

67
Q

Los polianfolitos son

A

moleculas grandes como las proteinas
que tienen muchos grupos acidos o basicos

68
Q

molecula con un Pl bajo tendra

A

grupos acidicos

69
Q

pl alto

A

grupos basicos.

70
Q

Proteinas expresadas en dos tejidos humanos

A

Las diferencias entre las dos muestras de tejido superan sus similitudes: incluso para proteinas que se comparten entre los dos tejidos, sus abundancias relativas son
generalmente diferentes.