Punten Uit Eigen Samenvatting Flashcards

1
Q

Genen

A

Kleine eenheden op het DNA die coderen voor eiwitten en eigenschappen bepalen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

PCR-producten worden gescheiden op basis van

A

Lengte

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Specificiteit PCR-reactie wordt geregeld door aanpassing

A

Annealingtemperatuur (Ta)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Pull up/ bleed through

A

Wanneer capillaire elektroforese apparaat de kleur van een primer verkeerd interpreteert

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

PCR flashes ontstaan door

A

Luchtbellen en verontreinigingen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Waar bestaat een TAQMan probe uit

A
  • Reporter (fluorescerend molecuul) 5
  • quencher 3
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Pyrosequencing

A

Sequencing door het genereren van licht

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

NGS levert info op over

A

STR en SNP

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Analyse middels NGS kan informatie geven over

A
  • individuele identiteit
  • uiterlijke zichtbare kenmerken
  • biogeografische afstamming
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Wat veranderd wanneer een molecuul door de nanoporie beweegt bij FGS

A

Verandering in frequentie, duur en amplitude van ionenstroom

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Voordelen FGS

A
  • geen PCR stap nodig
  • lange DNA-lengtes in 1x sequencen
  • kunnen extreem lage DNA-niveau identificeren
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Nadelen FGS

A

Problemen omtrent repliceerbaarheid, moleculen bewegen snel door poriën hierom moeilijk basenvolgorden nauwkeurig vast te leggen

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Waarvoor is soort identificatie van belang

A
  • kijken of soort legaal verhandeld mag worden
  • bepalen of dierlijke producten verkeerd gelabeld of verontreinigd zijn
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Identificatie van dieren kan middels

A
  • fysieke technieken
  • moleculaire analyses
  • chemische analyses van biomarkers
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Fysieke waarnemingen identificatie van dieren

A

Bestuderen van kenmerken van het dier (uiterlijke eigenschappen)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Fysieke waarnemingen kunnen zorgen voor identificatie tot op welk niveau

A

Familie, geslacht en soort

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Moleculaire technieken voor identificatie dieren

A

Gebruik van DNA-sequencing of genetische analyses

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Moleculaire technieken kunnen tot op welk niveau identificatie van dieren bieden

A

Soortniveau en individualisatie

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Chemische technieken identificatie dieren

A

Info krijgen over soort, geografische herkomst, dieet en leefomgeving door middel van biomarkers

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

doden dieren kunnen aan de hand van welke lichaamsdelen tot soortniveau worden geïdentificeerd

A

Schedel en tanden

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Bij enkel de aanwezigheid van botten kunnen dieren morfologisch tot welk niveau geïdentificeerd worden

A

Geslacht of familie

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Taxidermie

A

Is legaal de huid van een dier prepareren om het levensecht te weergeven

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Mitochondriale genen die worden gebruikt voor soort identificatie dieren

A

Cytochroom b-gen
12 S rRNA
16 S rRNA
Hyper-variabele D-loop

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Bushmeat

A

Vlees van wilde landdieren die normaal gesproken niet worden beschouwd als wild

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Wildbraad
Vlees van wild (jacht is gereguleerd)
26
Nadelen bushmeat
- worden zelden volgens hygiëneregels vervoerd - overdracht van zoönosen (infecties van dieren op mensen) en virale infecties
27
Handel bushmeat gevolgen voor
- grote economische gevolgen - bedreigt biodiversiteit - volksgezondheid en welzijn van dieren
28
Ivoor van Afrikaanse en Aziatische olifanten kan aan de hand van welke marker geïdentificeerd worden
- SNP in cytochroom b gen - 16 STR loci (geografische allelfrequentiekaart)
29
Waarom is moleculaire analyse niet betrouwbaar voor analyseren mamoetivoor
- vanwege ernstige degradatie - mogelijke afwezigheid van DNA
30
DNA biochip kit
Kan de aanwezigheid van 24 soorten huisdieren detecteren (maakt gebruikt van mtDNA 16S rRNA
31
Welke technieken bieden mogelijkheid om geografische oorsprong van biologisch materiaal te bepalen
Stabiele isotoopanalyse STR (16 nucleaire)
32
Short tandem repeats
Korte stukjes niet-coderend DNA bestaande uit minder dan 400bp, 3-15 herhalende delen van 3-7 basenparen lang
33
STR ontstaan door
- mutatie - chromosomale variatie - recombinatie
34
Diversiteit Y-STR
Enkel door mutatie
35
Amelogenine locus
Wordt gebruikt om geslacht te bepalen en is betrokken bij de tandglazuur en ontwikkeling van de tanden
36
Hoeveel bp korter is het amelogenine locus op X dan op Y-chromosoom
6
37
Voordelen STR
- uitsluiten van verdachten - DNA-profielen verkrijgen uit kleine hoeveelheden DNA en oudere sporen
38
Gebruik Y-STR
- mengprofielen mannelijk en vrouwelijk DNA - DNA-profielen van mannen die geen sperma produceren
39
SNP
- meest voorkomende vorm genetische variatie - komen voor op het gehele genoom - iedereen uniek SNP-patroon
40
Nadeel SNP
- lastig in gemengde monsters, moeilijk bepalen welke SNP bij welke persoon hoort - lagere discriminatie dan STR
41
DNA-degradatie zichtbaar in analyse
Aan afname van piekhoogten bij toename cycli
42
Etniciteit uit spoor bepalen is handig
- identificatie ontbindend lichaam - verdachte die niet in database staat
43
Gebruik STR voor bepalen etniciteit niet betrouwbaar
Aangezien alle etnische groepen dezelfde allelen delen die worden gebruikt in 17-plek
44
Waarom gebruik commerciële kits voor afkomst minder goed?
- gevaar voor raciale zuiverheid - veel bedrijven vermelden niet welke markers ze gebruiken, hierdoor kan hetzelfde monster verschillende afkomsten opleveren
45
De mogelijkheid om eigenschappen te voorspellen op basis van DNA is afhankelijk van
- betrouwbaarheid markers - gebruikte database
46
Fenotypen kan worden beïnvloed door
- genen - leeftijd - omgeving - ziekte - dieet
47
Voorspellen fysieke kenmerken gebaseerd op
SNP analyse en statistische modellen
48
Techniek die huid, haar, oogkleur, geslacht, sproeten, gezichtshoeken en genetische afkomst kan voorspellen
SNapShot
49
Wat is niet te voorspellen middels SNapShot
Leeftijd, gewicht en lengte (deze zijn afhankelijk van omgeving en voeding)
50
Microbioom analyse kan info opleveren over
- geslacht - gezondheid - dieet - recente reisgeschiedenis
51
Bodemanalyse is nuttig om
Personen, dier of object aan geografische locatie te koppelen
52
Welke techniek voor bodemmonsteranalyse
FTIR-analyse
53
Door welke omstandigheden blijft dood menselijk lichaam beter in tact
- zeer droge omgeving met sterke luchtstromen - extreme hitte of jou
54
Welke omstandigheden versnellen ontbinding
- warme en vochtige omgevingen - aanwezigheid van detritivoren
55
PMI kan bepaald worden aan de hand van
- rRNA (28s sub-unit) - Microbioom
56
Wat kan naast STR en isootoopanalyse land of regio van donor suggereren
Genotypering van JCV en BKV (detecteerbaar in sperma en urine)
57
Wat is onmogelijk vast te stellen bij HIV
De richting van overdracht wie heeft wie besmet
58
C botulium voor bioterrorisme brengt problemen met zich mee namelijk
1. Lastig verkrijgen van stam die toxine produceert 2. Kweken van bacterie moet onder anaerobe omstandigheden 3. Uiteindelijke verspreiding lastig
59
Waarom is B. Anthracis (antrax) bacterie goede kandidaat bioterrorisme
- overleven jarenlang - mogelijkheid bacterie genetisch te manipuleren (om pathogeniteit te versterken)
60
Identificatie van antrax bacterie en pokken kan aan de hand van
- immunoassays - massaspectrometrie (MALDI-TOF-MS) - PCR - lab-on-a-chip apparaat