Moleculaire Markers Flashcards
Drempelwaarde waarbij alles eronder ruis is
Analytische drempelwaarde (50RFU)
Drempelwaarde waarbij alles er boven homozygoot is
Stochastische drempelwaarde (250RFU)
Limiet voor CCD-camera genetic analyser
5000RFU
Stutter threshold
15%
Speciale software om gemengde STR-profiel te interpreteren
LRmix studio en STRmix
Gebieden Y-chromosoom
Pseudo autosomaal regio 1 en 2 (PAR 1 en 2) en niet recombinerend deel (NRY)
Nadelen Y-STR
- Duplicatie en mutaties maken analyse lastiger
- mannelijke familieleden lastig te onderscheiden
- kleine database
Y-STR die onderscheid kan maken tussen vaders en zonen
Rapidly mutating Y-STR
Waarde Y-STR
- uitsluiten van verdachte
- identificeren van een dader
- geografische voorspellingen
Rapidly mutating (RM) Y-STR kunnen
- onderscheid tussen niet-verwante mannen verbeteren
- scheiden van verwante mannen mogelijk maken
Welk gedeelte niet coderend DNA mitochondriën
Control loop (D-loop)
Welke mutatie soort mtDNA
Substituties
Waarom ontstaan mutaties in mtDNA
Blootstelling aan grote hoeveelheid vrije mutageen zuurstof radicalen, die vrijkomen bij oxidatieve fosforylering
Hoeveel varieert mtDNA tussen niet verwante personen
1-2,3 %
Welke regio’s bevatten de hoogste variatie binnen mtDNA en bevinden zich in D-loop
Hypervariabele sequentie regio’s I en II (HV-1 en HV-2)
Heteroplasmie
Voorkomen van twee of meer verschillende soorten/sequenties mtDNA in een persoon
Soort RNA die betrokken is bij het kopiëren van het DNA
Messenger RNA
Soort RNA wat aminozuren naar het ribosoom brengt
Transfer RNA
Soort RNA wat een sub-unit vormt van het ribosoom
Ribosomaal RNA
Soort RNA wat de genexpressie reguleert na transcriptie (silencing van mRNA)
Micro RNA
Hoe reguleer Micro RNA de genexpressie
- blokkeert aangezien het bindt aan een complementair stuk mRNA en het dubbelstrengs maakt
- degraderen van het mRNA
Waarom mRNA gewoonlijk geen FO-indicator
- vrij instabiel
- wordt snel afgebroken na overlijden (autolyse en microbiële compositie)
Toepassing mRNA binnen FO
- celspecifiek
- onderscheid tussen geslacht
- herkomst lichaamsvloeistoffen
- indicatie bloeddatering
Welke markers voor indicatie bloeddatering middels mRNA
11 mRNA. Combinatie PER3, MKNK2 en HSPA1B met melatonine en cortisol