Moleculaire Markers

Question 1

Drempelwaarde waarbij alles eronder ruis is

Answer 1

Analytische drempelwaarde (50RFU)

Question 2

Drempelwaarde waarbij alles er boven homozygoot is

Answer 2

Stochastische drempelwaarde (250RFU)

Question 3

Limiet voor CCD-camera genetic analyser

Answer 3

5000RFU

Question 4

Stutter threshold

Answer 4

15%

Question 5

Speciale software om gemengde STR-profiel te interpreteren

Answer 5

LRmix studio en STRmix

Question 6

Gebieden Y-chromosoom

Answer 6

Pseudo autosomaal regio 1 en 2 (PAR 1 en 2) en niet recombinerend deel (NRY)

Question 7

Nadelen Y-STR

Answer 7

• Duplicatie en mutaties maken analyse lastiger
• mannelijke familieleden lastig te onderscheiden
• kleine database

Question 8

Y-STR die onderscheid kan maken tussen vaders en zonen

Answer 8

Rapidly mutating Y-STR

Question 9

Waarde Y-STR

Answer 9

• uitsluiten van verdachte
• identificeren van een dader
• geografische voorspellingen

Question 10

Rapidly mutating (RM) Y-STR kunnen

Answer 10

• onderscheid tussen niet-verwante mannen verbeteren
• scheiden van verwante mannen mogelijk maken

Question 11

Welk gedeelte niet coderend DNA mitochondriën

Answer 11

Control loop (D-loop)

Question 12

Welke mutatie soort mtDNA

Answer 12

Substituties

Question 13

Waarom ontstaan mutaties in mtDNA

Answer 13

Blootstelling aan grote hoeveelheid vrije mutageen zuurstof radicalen, die vrijkomen bij oxidatieve fosforylering

Question 14

Hoeveel varieert mtDNA tussen niet verwante personen

Answer 14

1-2,3 %

Question 15

Welke regio’s bevatten de hoogste variatie binnen mtDNA en bevinden zich in D-loop

Answer 15

Hypervariabele sequentie regio’s I en II (HV-1 en HV-2)

Question 16

Heteroplasmie

Answer 16

Voorkomen van twee of meer verschillende soorten/sequenties mtDNA in een persoon

Question 17

Soort RNA die betrokken is bij het kopiëren van het DNA

Answer 17

Messenger RNA

Question 18

Soort RNA wat aminozuren naar het ribosoom brengt

Answer 18

Transfer RNA

Question 19

Soort RNA wat een sub-unit vormt van het ribosoom

Answer 19

Ribosomaal RNA

Question 20

Soort RNA wat de genexpressie reguleert na transcriptie (silencing van mRNA)

Answer 20

Micro RNA

Question 21

Hoe reguleer Micro RNA de genexpressie

Answer 21

• blokkeert aangezien het bindt aan een complementair stuk mRNA en het dubbelstrengs maakt
• degraderen van het mRNA

Question 22

Waarom mRNA gewoonlijk geen FO-indicator

Answer 22

• vrij instabiel
• wordt snel afgebroken na overlijden (autolyse en microbiële compositie)

Question 23

Toepassing mRNA binnen FO

Answer 23

• celspecifiek
• onderscheid tussen geslacht
• herkomst lichaamsvloeistoffen
• indicatie bloeddatering

Question 24

Welke markers voor indicatie bloeddatering middels mRNA

Answer 24

11 mRNA. Combinatie PER3, MKNK2 en HSPA1B met melatonine en cortisol

Question 25

Toepassing rRNA binnen FO

Answer 25

Mate degradatie kan worden gebruikt voor indicatie post mortem interval

Question 26

Waar wordt naar gekeken bij rRNA voor PMI

Answer 26

28s rRNA sub-unit —> twee domeinen
Domein 8 en 5’ eind

Question 27

Welke knipplaats op welk domein van 28s rRNA wordt geactiveerd wanneer celdood intreed

Answer 27

Domein 8

Question 28

Toepassing miRNA binnen FO

Answer 28

• cel specifiek
• onderscheid tussen geslacht
• identificatie van orgaanweefsel

Question 29

Waar binden miRNA

Answer 29

3 UTR van het doelwit mRNA

Question 30

Waarom miRNA als potentie FO-indicator

Answer 30

• zeer klein
• minder gevoelig voor degradatie
• weefselspecifiek

Question 31

Tussen welke orgaanweefsels kan miRNA onderscheid maken

Answer 31

Hart, spier, nier, lever, huid, long, hersenen

Question 32

Ander woord huishoudgenen

Answer 32

Constitutieve genen

Question 33

Genen die continu dezelfde mate van mRNA-expressie hebben

Answer 33

Huishoudgenen

Question 34

Soorten huishoudgenen

Answer 34

ACTB en GAPDH

Question 35

Stappen creëren multiplex voor mRNA-profilering

Answer 35

1. Weefsel specifieke genen selecteren
2. Constitutieve genen selecteren
3. Primers designen
4. Korte fragmenten combineren met fluorchromen

Question 36

Wat geeft mRNA-profilering/ RNA- celtypering aan

Answer 36

Uit welk type cel een DNA-spoor afkomstig is